• 제목/요약/키워드: M13 DNA

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이종(異種) Plasmid에 의한 Saccharomyces cerevisiae의 동시형질(同時形質) 전환(轉換) (Cotransformation of Saccharomyces cerevisiae with Heterogenous Plasmids)

  • 강병태;박종성;이인구
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제5권
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    • pp.52-58
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    • 1987
  • 효모(酵母)와 대장균(大腸菌)의 셔틀 벡터인 YIp5, YRp7, YEp13플라스미드를 S. cerevisiae DBY747을 수용세포(受容細胞)로 하여 원형질체 방법(方法)에 의해 형질전환(形質轉換)시킨 결과(結果), YIp5플라스미드는 형질전환체가 나타나지 않았으며, YEp13플라스미드는 DNA $10{\mu}g$ 당(當) $1.2{\times}10^3$, YRp7은 $1.0{\times}10^2$ 개(個)의 형질전환체를 얻었다. YIp5플라스미드와 YEp13플라스미드, 그리고 YIp5플라스미드와 YRp7플라스미드를 환상(環狀)플라스미드 상태(狀態)로 동시형질전환(同時形質轉換) 시켰을 때 각각 DNA $10{\mu}g$ 당(當) 210 및 95개(個)의 형질전환체를 얻었으며, 동일(同一) 부위(部位) 또는 다른 부위(部位)를 절단(切斷)한 선상(線狀)플라스크를 앞서와 같이 동시형질전환(同時形質轉換)시켰을때, 서로 비슷하게 DNA $10{\mu}g$당(當) 15~85개(個)의 형질전환체를 얻을 수 있었다. 이러한 결과(結果)에서 볼때 수용세포(受容細胞)를 S. cerevisiae DBY747로한 동시형질전환(同時形質轉換)에서 환상(環狀)플라스미드간(間)의 형질전환(形質轉換)이 선상(線狀)플라스미드간(間)의 형질전환(形質轉換)보다 빈도(頻度)가 높으며 선상(線狀)플라스미드간(間)의 형질전환(形質轉換)에서 미단(未端) 부위(部位)의 상이(相異)함이 큰 영향을 주지 않는 것으로 나타났다. 형질전환체의 안정성(安定性)에 있어서는 YIp5플라스미드와 YEp13플라스미드간(間)의 형질전환체가 YIp5플라스미드와 YRp7플라스미드간(間) 형질전환체에 비(比)해 안정(安定)하게 나타났는데, 이는 stringent control을 받는 ARS유전자(遺傳子)를 가진 YRp7플라스미드보다 $2{\mu}m$ DNA 복제(複製) 기점(起點)을 가진 YEp13플라스미드의 복제수(copy number)가 많기 때문인 것으로 생각된다.

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미선나무 잎 추출물의 항산화 및 산화적 DNA 손상억제 활성 (Antioxidant Activities and Inhibitory Effect on Oxidative DNA Damage of extracts from Abeliophylli distichi Folium)

  • 박재호
    • 대한본초학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.95-99
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    • 2011
  • Objective : In this study, we demonstrate the protective effect on oxidative DNA damage of leaf extracts from Abeliophylli distichi Folium via its antioxidant activity for the establishment of new value for the herbal medicine. Methods : Abeliophylli distichi Folium leaves were extracted with hot-water and ethylacetate (EtOAC). The 1,1-diphenyl-2- picrylhydrazyl (DPPH) radical and hydroxyl scavenging assay and $Fe^{2+}$ chelating assay were performed for antioxidative effect and ${\varphi}$X-174 RF I DNA cleavage assay and intracellular DNA damage assay were used for inhibitory effect of intracellular DNA damage. Results : In DPPH, Hydroxyl radical scavenging activity and $Fe^{2+}$ chelating activity of EtOAC extracts were 94.72%, 62.88%, 41.13%, and hot-water extracts were 88.86%, 56.7%, 37.4% at 200 ${\mu}g/m{\ell}$, respectively. Also, those extracts showed protective effect of DNA damage against the oxidative stress. Conclusion : These results indicated that the leaf extracts of Abeliophylli distichi Folium can be used as a natural antioxidants, which effectively inhibits the oxidative DNA damage.

Biodistribution and Genotoxicity of Transferrin-Conjugated Liposomes/DNA Complexes in Mice

  • Lee Sang Mi;Kim Jin-Seok;Oh Yu-Kyoung;Lee Yong-Bok;Sah Hongkee
    • Macromolecular Research
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    • 제13권3호
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    • pp.218-222
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    • 2005
  • Transferrin-conjugated liposomes ($T_f$-liposomes) were made and formulated with pCMVluc DNA to form a lipoplex. Among the various formulations studied, the $T_f$-liposome: pCMVluc DNA complex at a ratio of 5: 1 (wt/wt) showed the highest transfection efficiency, which was twice that of $Lipofectin^{TM}$ on HeLa cells. The maxi-mum tolerated dose (MTD) of this lipoplex formulation from a single intravenous injection was over 10 mg/kg in healthy ICR mice. The RT-PCR results showed that the highest level of luciferase mRNA was detected in the lungs, followed by the liver, spleen, heart and kidneys, after an intravenous injection into mice. Two weeks after the injection, the levels of luciferase mRNA decreased gradually in the liver, spleen, heart, and kidney, but not in the lungs. The micro-array study showed that the cancer-related genes, including the bcl 6 gene, were highly up-regulated by the treatment with $T_f$-liposome/ pCMVluc DNA complex on HeLa cells, indicating that there were possible interactions between the host chromosomal DNA and the $T_f$-liposome within the cells. The results obtained from this study are expected to be useful for designing a safe and efficient gene delivery system using transferrin-conjugated liposomes.

한국산 박새속 4종의 미토콘드리아 DNA 분석 (Mitochondrial DNA analysis on 4 species of the genus Parus (Passeriformes: Paridae) in Korea)

  • 민미숙
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제13권2호
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    • pp.73-81
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    • 1997
  • 한국산 조류 중 박새속(genus Parus)에 속하는 4종 Parus major wladiwostokensis (박새), P. ater amurensis(진박새), P. palustrius hellmayri(쇠박새) 및 P. varius varius(곤줄 박이)를 대상으로 이들의 계통적 유연관계를 구명하기 위하여 mtDNA분석을 실시하였다. 6 base를 인지하는 10개의 제한효소를 처리하여 얻어진 mtDNA의 크기는 16.6~17.0Kb였으며 Pst I과 Pvu II는 종간 차이가 뚜렷하였다. 각 종간의 절편양상을 비교하여 Parus속의 종 간 분화정도를 비교한 결과 P. m. wladiwostokensis와 P. a. amurensis의 유전적 근연관계 가 가장 가까웠고(p=0.073, F=0.294) P. a. amurensis와 P. v. varius는 비교적 현저한 유전 적 차이를 보였다.(p=0.119, F=0.143). Brown 등 (1979)의 공식을 이용하여 박새속 4종의 분 화시기를 추정한 결과 이들은 후기 선신세(Pliocene)와 초기 홍적세(Pleistocene) 사이에 분 화된 것으로 추정되었다.

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기주식물 종류에 따른 복숭아혹진딧물(Myzus persicae)의 DNA Polymorphism 비교 (Absence of DNA Polymorphisms in Myzus persicae (Homoptera: Aphididae) in Relation to their Host Plants)

  • H. J. Kim;K. S. Boo;K. H. Cho
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.209-215
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    • 1996
  • 복숭아혹진딧물(Myzus persicae Sulzer)은 두가지 서로 다른 기주선호성을 가지는데 이 기주선호성과 형태적 특징에 기초하여 담배진닷물(Myzus nicotinae Blackman)과 담배 이외의 다른 채소류에 서식하는 복숭아 혹진딧물(M. persicae)로 분류하였지만(Blachmean, 1987) 이 분류 방법에 동의하지 않는 학자들도 많다. 이런 이유로 RAPD-PCR 기법을 이용하여 한국에 서식하는 복숭아혹진딧물에 대하여 그들의 2차 숙주선호성에 따른 DNA의 변이 정도를 살펴보았다. 실험곤충으로는 담배와 배추에서 채집하여 사육한 진딧물 각 4 clones 씩을 사용하였다. 각 clone은 한 개체를 사육하여 얻은 자손들과 그들의 후손으로 이루어졌으며, 사육한 진딧물에서 핵 DNA를 추출하고, 10개 nucleotide 길이의 random primer 100가지를 사용하여 PCR한 후 1 % agarose gel 전기영동법으로 분석하였다. 사용한 100종류의 random primer 중 83가지에서 DNA 단편이 합성되었다. 증폭된 1개의 primer당 단편의 수는 1개에서 22개였고 평균 단편 수는 약 13개였으며, 각 각 단편의 길이는 500에서 20,000 base pair사이에 분포하였다. 82가지 primer의 경우에 일부 단편의 짙기에는 차이가 있었으나 단편종류의 분포는 동일하게 나타났다. 한가지 primer경우에만 담배섭식형 1개 c clone에서 다른 7가지 clones에 없는 band가 1개 나타났다. 이때 나머지 7 clones의 단편 분포 형태는 모두 동일하였다. 따라서 이 band는 숙주 선호성과는 무관한 것으로 보인다. 결국 이 실험에 사용한 100종류의 primer에 기초하여 RAPD-PCR기법으로 DNA를 증폭한 결과 복숭아혹진딧물의 숙주선호성이 개체군간의 유전적인 차이점에 기인한다는 가설을 뒷받침할 만한 증거를 찾지 못하였다.

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Toll-like receptor 9-매개에 의한 matrix metalloproteinase-9 발현에서 NF${\kappa}B$의 역할 (ROLE OF NF${\kappa}B$ IN TOLL-LIKE RECEPTOR 9-MEDIATED MATRIX METALLOPROTEINASE-9 EXPRESSION)

  • 이상훈;진병로;백석환
    • Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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    • 제33권6호
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    • pp.636-642
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    • 2007
  • Background: CpG DNA plays an important role in immune cell function. This study examined whether the temporal control of toll-like receptor (TLR)9 by CpG DNA can regulate the expression of matrix metalloproteinase-9(MMP-9). Methods and materials: Macrophages were cultured in the presence of 10% FBS. For the various MMP genes analysis, RT-PCR and real-time PCR were performed. In addition, zymography assay performed for the MMP activity. The phosphorylation assay did for the ERK1/2 and NF${\kappa}B$ activation, and luciferase promoter assay was for the NF${\kappa}B$ activity. Results: CpG DNA induced the mRNA expression of MMP-2, MMP-9, and MMP-13, but not of MMP-7, MMP-8, and MMP-12, in a time-dependent manner. Especially, the mRNA expression of MMP-9 was strongly induced by CpG DNA using real-time RT-PCR. The TLR9 inhibitor, chloroquine, suppressed CpG DNA-induced MMP-9 expression and its activity. Moreover, CpG DNA induced the phosphorylation of ERK and the inhibition of ERK by U0126 suppressed CpG DNA-induced MMP-9 expression and its activity. CpG DNA stimulated $I{\kappa}B-{\alpha}$ degradation and luciferase activity. In addition, pretreatment of SN-50, the inhibitor of NF${\kappa}B$, strongly blocked the CpG DNA-induced MMP-9 expression and activity. Conclusion: These observations suggest that CpG DNA may play important roles in the activation of macrophages by regulating the production of MMP-9 via the sequential TLR9-ERK-NF${\kappa}B$ signaling pathway.

Cloning and Expression of β1-Adrenergic Receptor Genes in Adipose Tissues from Korean Native Cattle (Hanwoo)

  • Ha, S.H.;Chung, M.I.;Baik, M.G.;Choi, Y.J.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제14권1호
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    • pp.13-16
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    • 2001
  • Bovine ${\beta}1$-adrenergic receptor (AR) cDNA was cloned using degenerative primers. Bovine ${\beta}1$-AR coded for 467 amino acids and the comparison of the deduced amino acid sequence with that of sheep showed 93.4% identity. Northern blot analysis indicated that transcript size for the bovine ${\beta}1$-AR was 3.6 kb in the adipose tissue. The expression level of three $\beta$-ARs (1, 2, and 3) in bovine abdominal, subcutaneous, and perirenal adipose tissues were examined using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), and the levels of ${\beta}1$- and ${\beta}3$-AR mRNA were found to be lower in the subcutaneous adipose tissue than in the abdominal and perirenal adipose tissues. These results suggest that the expression of $\beta$-ARs mRNA are differentially regulated among the adipose tissues.

울릉도 연안 수심 1500 m에 서식하는 해양미생물군집의 분포 (Marine Prokaryotic Diversity of the Deep Sea Waters at the Depth of 1500 m Off the Coast of the Ulleung Island in the East Sea (Korea))

  • 김미경;강용호
    • 미생물학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.328-331
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    • 2012
  • 울릉도 연안의 심해(1500 m)에 서식하는 미생물의 다양성을 조사하였다. Ultramembrane filter를 사용하여 해양미생물을 여과한 다음 미생물군집 DNA를 정제하여 16S rDNA를 증폭하였다. Pyrosequencing 방법으로 염기서열을 분석한 결과 총 13,029 reads를 얻었으며, 이중에 54.1%가 uncultured bacteria, 23.4%가 alphaproteobacteria, 22.3%가 gammaproteobacteria이었고 flavobacteria, actinobacteria, epsilonproteobacteria 등이 0.2%이내에서 분포하고 있었다. 울릉도 지역의 해양심층수에서 배양이 가능한 것으로 알려진 미생물로서는 alphaproteobacteria의 Rhodobacteraceae과 (family), gammaproteobacteria의 Alteromonadaceae, Halomonadaceae, Piscirickettsiaceae과가 주로 분포하였다.

Distribution Status of Hybrid Types in Large Liver Flukes, Fasciola Species (Digenea: Fasciolidae), from Ruminants and Humans in Vietnam

  • Nguyen, Thi Bich Nga;De, Nguyen Van;Nguyen, Thi Kim Lan;Quang, Huynh Hong;Doan, Huong Thi Thanh;Agatsuma, Takeshi;Le, Thanh Hoa
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제56권5호
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    • pp.453-461
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    • 2018
  • The aim of this study is to delineate 'admixed hybrid' and 'introgressive' Fasciola genotypes present in the Fasciola population in Vietnam. Adult liver flukes collected from ruminants in 18 Provinces were morphologically sorted out by naked eyes for small (S), medium (M) and large (L) body shapes; and human samples (n=14) from patients. Nuclear ribosomal (rDNA) ITS1 and ITS2, and mitochondrial (mtDNA) nad1 markers were used for determination of their genetic status. Total 4,725 worm samples of ruminants were tentatively classified by their size: 6% (n=284) small (S)-, 13% (n=614) medium (M)-, and 81% (n=3,827) large (L)-forms. All the representative (n=120, as 40 each group) and 14 human specimens, possessed maternal mtDNA of only F. gigantica and none of F. hepatica. Paternally, all (100%) of the L-(n=40) and 77.5% (n=31) of the M-flukes had single F. gigantica rDNA indicating 'pure' F. gigantica. A majority (90%, n=36) of the S- and 15% (n=6) of the M-worms had single F. hepatica rDNA, indicating their introgressive; the rest (10%, n=4) of the S- and 7.5% (n=3) of the M-flukes had mixture of both F. gigantica and F. hepatica rDNAs, confirming their admixed hybrid genetic status. Fourteen human samples revealed 9 (64%) of pure F. gigantica, 3 (22%) of introgressive and 2 (14%) of admixed hybrid Fasciola spp. By the present study, it was confirmed that the small worms, which are morphologically identical with F. hepatica, are admixed and/or introgressive hybrids of Fasciola spp., and able to be the pathogens of human fascioliasis.

웅성호르몬에 의한 무지개송어의 vitellogenin 유전자 발현 (Expression of Vitellogenin Gene by Androgens in Rasinbow Trout, Oncorhynchus mykiss)

  • 권혁추;윤종만;이종영
    • 한국양식학회지
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    • 제13권1호
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    • pp.79-85
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    • 2000
  • 자성 및 웅성스테로이드 호르몬들이 Vg 유전자발현에 영향을 미치는지를 미성숙 무지개송어의 배양간세포 막간을 이용하여 조사하였다. 이미 보고된 송어의 Vg gene의 염기배열을 참고로 Vg cDNA 단편(600 bp)을 증폭시킬 수 있는 primer들을 작성하였다. 이들 primer를 이용하여 증폭된 PCR 산물의 염기배열을 결정하여 송어의 Vg cDNA임을 확인하였고, RT-PCR법을 이용하여 배양간세포 그리고 E$_2$ 및 MT 처리된 송어의 간으로부터 Vg mRNA의 전사량 변화를 조사하였다. 호르몬 처리된 간세포 및 송어의 간에서 추출한 total RNA를 이용하여 RT-PCR법으로 분석한 결과 in vivo, in vitro 실험 모두에서 E$_2$ 또는 MT처리된 간세포 및 송어의 간으로부터 Vg mRNA와 Vg 단백질합성이 유도되었고, 이들의 증가 경향은 처리된 호르몬 농도 및 시간에 의존하고 있음이 밝혀졌다. 또한 progesterone, androsterone 그리고 testosterone 등의 웅성호르몬들도 Vg mRNA의 전사를 유도하고 있다는 것이 시사되었다. 이와 같은 결과로부터E$_2$ 뿐 아니라 웅성스테로이드들도 Vg mRNA의 발현을 유도하고 있음이 송어의 in vivo 또는 in vitro 실험에 의해서 확인되었다.

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