Kim, Eun-Hye;Lee, Sunghoon;Park, Jongsun;Lee, Kyusang;Bhak, Jong;Kim, Byung Chul
Genomics & Informatics
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v.12
no.2
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pp.50-57
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2014
We present a new next-generation sequencing-based method to identify somatic mutations of lung cancer. It is a comprehensive mutation profiling protocol to detect somatic mutations in 30 genes found frequently in lung adenocarcinoma. The total length of the target regions is 107 kb, and a capture assay was designed to cover 99% of it. This method exhibited about 97% mean coverage at $30{\times}$ sequencing depth and 42% average specificity when sequencing of more than 3.25 Gb was carried out for the normal sample. We discovered 513 variations from targeted exome sequencing of lung cancer cells, which is 3.9-fold higher than in the normal sample. The variations in cancer cells included previously reported somatic mutations in the COSMIC database, such as variations in TP53, KRAS, and STK11 of sample H-23 and in EGFR of sample H-1650, especially with more than $1,000{\times}$ coverage. Among the somatic mutations, up to 91% of single nucleotide polymorphisms from the two cancer samples were validated by DNA microarray-based genotyping. Our results demonstrated the feasibility of high-throughput mutation profiling with lung adenocarcinoma samples, and the profiling method can be used as a robust and effective protocol for somatic variant screening.
Kim, Dongbum;Maharjan, Sony;Kim, Jinsoo;Park, Sangkyu;Park, Jeong-A;Park, Byoung Kwon;Lee, Younghee;Kwon, Hyung-Joo
BMB Reports
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v.54
no.8
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pp.425-430
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2021
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) induces coronavirus disease 2019 (COVID-19) and may increase the risk of adverse outcomes in lung cancer patients. In this study, we investigated the expression and function of mucin 1 (MUC1) after SARS-CoV-2 infection in the lung epithelial cancer cell line Calu-3. MUC1 is a major constituent of the mucus layer in the respiratory tract and contributes to pathogen defense. SARS-CoV-2 infection induced MUC1 C-terminal subunit (MUC1-C) expression in a STAT3 activation-dependent manner. Inhibition of MUC1-C signaling increased apoptosis-related protein levels and reduced proliferation-related protein levels; however, SARS-CoV-2 replication was not affected. Together, these results suggest that increased MUC1-C expression in response to SARS-CoV-2 infection may trigger the growth of lung cancer cells, and COVID-19 may be a risk factor for lung cancer patients.
The anti-tumor effect of monocyte-derived DC (MoDC) vaccine was studied in lung cancer model with feasible but weak Ag-specific immune response and incomplete blocking of tumor growth. To overcome this limitation, the hematopoietic stem cell-derived DC (SDC) was cultured and the anti-tumor effect of MoDC & SDC was compared in mouse lung cancer minimal residual model (MRD). Therapeutic DCs were cultured from either $CD34^+$ hematopoietic stem cells with GM-CSF, SCF and IL-4 for 14 days (SDC) or monocytes with GM-CSF and IL-4 for 7 days (MoDC). DCs were injected twice by one week interval into the peritoneum of mice that are inoculated with Lewis Lung Carcinoma cells (LLC) one day before the DC injection. Anti-tumor responses and the immune modulation were observed 3 weeks after the final DC injection. CD11c expression, IL-12 and TGF-${\beta}$ secretion were higher in SDC but CCR7 expression, IFN-${\gamma}$ and IL-10 secretion were higher in MoDC. The proportion of $CD11c^+CD8a^+$ cells was similar in both DC cultures. Although both DC reduced the tumor burden, histological anti-tumor effect and the frequencies of IFN-${\gamma}$ secreting $CD8^+$ T cells were higher in SDC treated group than in MoDC. Conclusively, although both MoDC and SDC can induce the anti-tumor immunity, SDC may be better module as anti-tumor vaccine than MoDC in mouse lung cancer.
Objectives : This experiment was conducted to evaluate the inhibitory effects against lung metastasis and promotion of splenocytes by water-soluble components from five mushrooms extracts (WEFM): Garnoderma frondosa, Corious versicolor, Codyceps militaris, Hericium erinaceus and Lentinula edodes. Methods : Colon 26-L5 carcinoma cells were injected through the tail vein to induce lung metastatic cancer. Changes in weight of lung were observed and cytokine level was analyzed to evaluate immunological changes. Results : Oral administration of WEFM resulted in a significant inhibition of lung metastasis after intravenous injection of colon 26-L5 cells in a dose-dependent manner. There was also a significant increase in T cell and B cell mitogenic stimuli and production of IFN-g by splenocytes stimulated with Con A compared to untreated controls. Conclusion : WEFM may have anti-tumor activities via Th1-type dominant immune responses.
Background: Tumor metastases are the main reasons for oncotherapy failure. Paris polyphylla (Chinese name: Chonglou) has traditionally been used for its anti-cancer actions. In this article, we focus on the regulation of human lung cancer A549 cell metastases and invasion by Paris polyphylla steroidal saponins (PPSS). Materials and Methods: Cell viability was evaluated in A549 cells by MTT assay. Effects of PPSS on invasion and migration were investigated by wound-healing and matrigel invasion chamber assays. Adhesion to type IV collagen and laminin was evaluated by MTT assay. Expression and protease activity of two matrix metalloproteinases (MMPs), MMP-2 and MMP-9, were analyzed by Western blotting and gelatin zymography, respectively. Results: PPSS exerted growth inhibitory effects on A549 cells, and effectively inhibited A549 cell adhesion, migration and invasion in a concentration-dependent manner. Western blotting and gelatin zymography analysis revealed that PPSS inhibited the expression and secretion of MMP-2 and MMP-9 in A549 cells. Conclusions: PPSS has the potential to suppress the migration, adhesion and invasion of A549 cells. PPSS could be a potential candidate for interventions against lung cancer metastases.
Objectives : Recent studies have suggested that Platycodonis Radix has various pharmacological effects such as anti-cancer, antioxidant, anti-asthma, anti-diabetes, anti-obesity, hepatoprotective, and cardiovascular protection effects. The aim of this study was to investigate the role of water extract of Platycodonis Radix (WPR)-induced autophagy in H460 human lung cancer cells. Methods : H460 cells were treated with WPR and cell viability was calculated by an MTT assay. To evaluate changes in apoptosis- and autophagy-related genes, Western blotting was performed. Two kinds of autophagy inhibitors, 3-Methyladenine (3-MA) and bafilomycin A1, were pretreated to confirm the role of WPR-induced autophagy. Results : WPR reduced the viability of H460 cells in a treatment concentration-dependent manner, which was associated with induction of apoptosis. It was also confirmed that WPR induced autophagy based on the formation of specific intracellular vacuoles and changes in the expression of autophagy-related genes. Interestingly, pretreatment with 3-MA and bafilomycin A1 increased WPR-induced cytotoxicity and apoptosis. Conclusions : WPR induced autophagy at low concentrations and early stages of treatment, but promoted apoptosis at high concentrations and late stages. Moreover, WPR-induced autophagy had a cytoprotective role in H460 cells.
H9 is an ethanol extract prepared from nine traditional/medicinal herbs. This study was focused on the anticancer effect of H9 in non-small-cell lung cancer cells. The effects of H9 on cell viability, apoptosis, mitochondrial membrane potential (MMP; ${\Delta}\psi_{m}$), and apoptosisrelated protein expression were investigated in A549 human lung cancer cells. In this study, H9-induced apoptosis was confirmed by propidium iodide staining, expression levels of mRNA were determined by reverse transcriptase polymerase chain reaction, protein expression levels were checked by western blot analysis, and MMP (${\Delta}\psi_{m}$) was measured by JC-1 staining. Our results indicated that H9 decreased the viability of A549 cells and induced cell morphological changes in a dose-dependent manner. H9 also altered expression levels of molecules involved in the intrinsic signaling pathway. H9 inhibited Bcl-xL expression, whereas Bax expression was enhanced and cytochrome C was released. Furthermore, H9 treatment led to the activation of caspase-3/caspase-9 and proteolytic cleavage of poly(ADP-ribose) polymerase; the MMP was collapsed by H9. However, the expression levels of extrinsic pathway molecules such as Fas/FasL, TRAIL/TRAIL-R, DR5, and Fas-associated death receptor were downregulated by H9. These results indicated that H9 inhibited proliferation and induced apoptosis by activating intrinsic pathways but not extrinsic pathways in human lung cancer cells. Our results suggest that H9 can be used as an alternative remedy for human non-small-cell lung cancer.
Radix Tetrastigma Hemsleyani Flavone (RTHF) is widely used as a traditional herb for its detoxification and anti-inflammation activity. Recently, several studies have shown that RTHF can inhibit growth and induce apoptosis in human cancer cell lines. However, the mechanisms are not completely understood yet. In this study we investigated the potential effects of RTHF on growth and apoptosis in human lung adenocarcinoma A549 cells as well as its mechanisms. A549 cells were treated with RTHF at various concentrations for different times. In vitro the MTT assay showed that RTHF had obvious anti-proliferation effects on A549 cells in a dose- and time-dependent manner. Cell morphological changes observed by inverted microscope and Hoechst33258 methods were compared with apoptotic changes observed by fluorescence microscope. Cell apoptosis inspected by flow cytometry showed significant increase in the treatment group over the control group (P<0.01). Expression of apoptosis related Bax/Bcl-2, caspases and MAPK pathway proteins were detected by Western blotting. The results showed that RTHF up-regulated the Bax/Bcl-2 ratio and cle-caspase3/9, cle-PARP expression in a dose-dependent manner. Expression of p-p38 increased, p-ERK decreased significantly and that of p-JNK was little changed in the RTHF group when compared with the control group. These results suggest that RTHF might exert anti-growth and apoptosis activity against lung cancer A549 cells through activation of caspases and Bcl-2 family proteins and the MAPK pathway, therefore presenting as a promising therapeutic agent for the treatment of lung cancer.
Sesamin, a lipid-soluble lignin originally isolated from sesame seeds, which induces cancer cell apoptosis and autophagy. In the present study, has been reported that sesamin induces apoptosis via several pathways in human lung cancer cells. However, whether mitophagy is involved in sesamin induced lung cancer cell apotosis remains unclear. This study, the anticancer activity of sesamin in lung cancer was studied by reactive oxygen species (ROS) and mitophagy. A549 cells were treated with sesamin, and cell viability, migration ability, and cell cycle were assessed using the CCK8 assay, scratch-wound test, and flow cytometry, respectively. ROS levels, mitochondrial membrane potential, and apoptosis were examined by flow cytometric detection of DCFH-DA fluorescence and by using JC-1 and TUNEL assays. The results indicated that sesamin treatment inhibited the cell viability and migration ability of A549 cells and induced G0/G1 phase arrest. Furthermore, sesamin induced an increase in ROS levels, a reduction in mitochondrial membrane potential, and apoptosis accompanied by an increase in cleaved caspase-3 and cleaved caspase-9. Additionally, sesamin triggered mitophagy and increased the expression of PINK1 and translocation of Parkin from the cytoplasm to the mitochondria. However, the antioxidant N-acetyl-L-cysteine clearly reduced the oxidative stress and mitophagy induced by sesamin. Furthermore, we found that cyclosporine A (an inhibitor of mitophagy) decreased the inhibitory effect of sesamin on A549 cell viability. Collectively, our data indicate that sesamin exerts lethal effects on lung cancer cells through the induction of ROS-mediated mitophagy and mitochondrial apoptosis.
Objective: Anthocyanins belong to a class of flavonoids, exhibiting antioxidant and anti-inflammatory actions have been reported to have anti-cancer effects. Here, we investigated whether anthocyanins can inhibit cancer cell proliferation, invasion, and angiogenesis in human lung cancer A549 cells, which are critically involved in cancer metastasis. Methods: We used anthocyanins from fruits of Vitis coignetiae Pulliat (AIMs) which has been used in Korean folk medicine for the treatment of inflammatory diseases and cancers. We have performed cell proliferation assays, cell invasion assay, gelatin zymography, wound healing assay and western blotting to examine whether anthocyanins can inhibit cancer cell proliferation, invasion, and angiogenesis in A549 cells. Result: AIMs did not inhibit cancer cell proliferation on A549 cells. Also, AIMs suppressed cancer migration, and invasion by supressing MMP-2 and MMP-9 expression. The Immuno-blotting results also revealed that AIMs suppressed the proteins involved in cancer proliferation (COX-2, C-myc, cyclin D1), migration and invasion (MMP-2, MMP-9), anti-apoptosis (XIAP, and c-IAP2), adhesion and angiogenesis (ICAM-1, VEGF). Conclusion: This study demonstrates that the anthocyanins isolated from fruits of Vitis coignetiae Pulliat inhibit cancer proliferation, cancer migration, and invasion that is involve in cancer-metastasis. This study provides evidence that AIMs might have anti-cancer effects on human lung cancer.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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