• 제목/요약/키워드: Line-Clustering

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Discrimination of Korean Native Chicken Lines Using Fifteen Selected Microsatellite Markers

  • Seo, D.W.;Hoque, M.R.;Choi, N.R.;Sultana, H.;Park, H.B.;Heo, K.N.;Kang, B.S.;Lim, H.T.;Lee, S.H.;Jo, C.;Lee, J.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권3호
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    • pp.316-322
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    • 2013
  • In order to evaluate the genetic diversity and discrimination among five Korean native chicken lines, a total of 86 individuals were genotyped using 150 microsatellite (MS) markers, and 15 highly polymorphic MS markers were selected. Based on the highest value of the number of alleles, the expected heterozygosity (He) and polymorphic information content (PIC) for the selected markers ranged from 6 to 12, 0.466 to 0.852, 0.709 to 0.882 and 0.648 to 0.865, respectively. Using these markers, the calculated genetic distance (Fst), the heterozygote deficit among chicken lines (Fit) and the heterozygote deficit within chicken line (Fis) values ranged from 0.0309 to 0.2473, 0.0013 to 0.4513 and -0.1002 to 0.271, respectively. The expected probability of identity values in random individuals (PI), random half-sib ($PI_{half-sibs}$) and random sibs ($PI_{sibs}$) were estimated at $7.98{\times}10^{-29}$, $2.88{\times}10^{-20}$ and $1.25{\times}10^{-08}$, respectively, indicating that these markers can be used for traceability systems in Korean native chickens. The unrooted phylogenetic neighbor-joining (NJ) tree was constructed using 15 MS markers that clearly differentiated among the five native chicken lines. Also, the structure was estimated by the individual clustering with the K value of 5. The selected 15 MS markers were found to be useful for the conservation, breeding plan, and traceability system in Korean native chickens.

K-562 백혈병 세포주에서 저근백피와 Gleevec을 처리에 의한 유전자 발현 비교 분석 (Analysis of Gene Eexpression Pattern of Ailanthus altissima Extract and Gleevec on K-562 Leukemia Cell Line)

  • 차민호;안원근;전병훈;윤용갑;윤유식
    • 동의생리병리학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.913-921
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    • 2005
  • In this study, we investigated gene expression patterns induced by Ailanthus altissima extract and compared it with Gleevec, a well-known anti-leukemia drug, in K562 chromic leukemia cells. Ailanthus altissima extract(100 ug/ml) and Gleevec(50 ug/ml) were treated to cells for 1h, 2h, 4h, and 16h and total RNA was extracted. Gene expressions were evaluated using cDMA microarray, in which 24,000 genes were spotted. Hierarchical clustering analysis showed that expression of genes included in two clusters were increased or decreased time dependently by both Ailanthus altissima extract and Gleevec. Genes included in another cluster were induced by Ailanthus altissima extract but not by Gleevec. In biological process analysis, expression of genes involved in apoptosis, growth arrest and DNA-damage were increased, but genes stimulating cell cycle were decreased. This study provides comprehensive comparison of the patterns of gene expression changes induced by Ailanthus altissima extract and Gleevec in K-562 leukemia cells.

Ape1/Ref-1 Stimulates GDNF/GFR ${\alpha}$ 1-mediated Downstream Signaling and Neuroblastoma Proliferation

  • Kang, Mi-Young;Kim, Kweon-Young;Yoon, Young;Kang, Yoon-Sung;Kim, Hong-Beum;Youn, Cha-Kyung;Kim, Dong-Hui;Kim, Mi-Hwa
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제13권5호
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    • pp.349-356
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    • 2009
  • We previously reported that glial cell line-derived neurotropic factor (GDNF) receptor ${\alpha}$ 1 (GFR ${\alpha}$ 1) is a direct target of apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 (Ape1/Ref-1). In the present study, we further analyzed the physiological roles of Ape1/Ref-1-induced GFR ${\alpha}$ 1 expression in Neuro2a mouse neuroblastoma cells. Ape1/Ref-1 expression caused the clustering of GFR ${\alpha}$ 1 immunoreactivity in lipid rafts in response to GDNF. We also found that Ret, a downstream target of GFR ${\alpha}$ 1, was functionally activated by GDNF in Ape1/Ref-1-expressing cells. Moreover, GDNF promoted the proliferation of Ape1/Ref-1-expressing Neuro2a cells. Furthermore, GFR ${\alpha}$ 1-specific RNA experiments demonstrated that the downregulation of GFR ${\alpha}$ 1 by siRNA in Ape1/Ref-1-expressing cells impaired the ability of GDNF to phosphorylate Akt and PLC ${\gamma}$-1 and to stimulate cellular proliferation. These results show an association between Ape1/Ref-1 and GDNF/GFR ${\alpha}$ signaling, and suggest a potential molecular mechanism for the involvement of Ape1/Ref-1 in neuronal proliferation.

강화학습의 학습 가속을 위한 함수 근사 방법 (Function Approximation for accelerating learning speed in Reinforcement Learning)

  • 이영아;정태충
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제13권6호
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    • pp.635-642
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    • 2003
  • 강화학습은 제어, 스케쥴링 등 많은 응용분야에서 성공적인 학습 결과를 얻었다. 기본적인 강화학습 알고리즘인 Q-Learning, TD(λ), SARSA 등의 학습 속도의 개선과 기억장소 등의 문제를 해결하기 위해서 여러 함수 근사방법(function approximation methods)이 연구되었다. 대부분의 함수 근사 방법들은 가정을 통하여 강화학습의 일부 특성을 제거하고 사전지식과 사전처리가 필요하다. 예로 Fuzzy Q-Learning은 퍼지 변수를 정의하기 위한 사전 처리가 필요하고, 국소 최소 자승법은 훈련 예제집합을 이용한다. 본 논문에서는 온-라인 퍼지 클러스터링을 이용한 함수 근사 방법인 Fuzzy Q-Map을 제안하다. Fuzzy Q-Map은 사전 지식이 최소한으로 주어진 환경에서, 온라인으로 주어지는 상태를 거리에 따른 소속도(membership degree)를 이용하여 분류하고 행동을 예측한다. Fuzzy Q-Map과 다른 함수 근사 방법인 CMAC와 LWR을 마운틴 카 문제에 적용하여 실험 한 결과 Fuzzy Q-Map은 훈련예제를 사용하지 않는 CMAC보다는 빠르게 최고 예측율에 도달하였고, 훈련 예제를 사용한 LWR보다는 낮은 예측율을 보였다.

초기 창업기업의 자금투자유치를 위한 온라인 클러스터링 플랫폼 연구 (How to inflow the Fund for Initial Start-Up Companies using the On-Line Clustering Platform)

  • 유순덕;최광돈
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제15권3호
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    • pp.181-189
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    • 2015
  • 본 연구의 목적은 초기 창업기업에게 민간자금이 유입되게 하는 방안 연구이다. 정부지원 자금 신청 시 수집된 기업정보의 활용방안 및 기업에게 민간자금이 유입할 수 있도록 생산자인 기업과 소비자인 투자자들을 연결하는 정보공유의 장인 플랫폼을 제시하였다. 경제 활성화 방안 중의 하나인 창업지원정책은 정부의 지원 자금 규모의 한계를 때문에 적극적인 민간의 자금 유입을 통한 지속적인 성장지원이 필요하다 이를 위해 본 연구는 정부가 보유한 기업정보와 기업에 투자하는 창업투자자가 교류할 수 있는 장을 마련하는 것으로 민간자금이 우수한 창업기업에게 흘러 들어 갈 수 있는 환경을 제공하는 플랫폼을 제안 하였다. 본 연구는 창업지원 등 관련연구 및 창업활성화에 기여할 것이다. 향후 연구방향은 창업기업 지원을 위한 자금지원이외의 다양한 지원 방안연구가 필요하다.

모바일 시스템 응용을 위한 실외 한국어 간판 영상에서 텍스트 검출 및 인식 (Text Detection and Recognition in Outdoor Korean Signboards for Mobile System Applications)

  • 박종현;이귀상;김수형;이명훈
    • 전자공학회논문지CI
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    • 제46권2호
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    • pp.44-51
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    • 2009
  • 자연 영상에서의 텍스트 이해는 지난 수년간 매우 활발한 연구 분야로 자리하고 있다. 논문에서 우리는 한국어 간판 영상으로부터 자동으로 텍스트를 인식하는 방법을 제안한다. 제안된 방법은 상호명의 인식을 위한 텍스트 영역의 검출 및 이진화를 포함하고 있다. 먼저 수직, 수평 방향의 에지 히스토그램을 이용하여 텍스트 영역의 정교한 검출을 수행하였다. 두 번째 단계는 검출된 텍스트 영역에 대해서 연결요소 기법을 적용하여 각각의 독립된 한 개의 문자 영역으로 분할되어지고, 마지막으로 최소 거리 분류법에 의해 각각의 글자를 인식한다. 각각의 문자 인식을 위해 모양 기반 통계적 특징을 추출한다. 실험에서 제안된 전체적인 효율성 및 정확성을 분석하였으며, 현재 구현된 모바일 시스템의 실용성을 확인할 수 있었다.

Phosphatidylcholine의 분해에 의한 Hela 세포와 Gelatin 기질과의 상호작용의 유도 (Hydrolysis of Phosphatidyicholine to Initiate HeLa Cell Adhesion to a Gelatin Substratum)

  • 전장수;이영섭;하만준;김찬길;강신성
    • 한국동물학회지
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    • 제38권4호
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    • pp.457-464
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    • 1995
  • 인간의 상피세포로부터 유래된 암세포의 일종인 HeLa 세포는 거의 모든 기질분자에 부착하지만 spreading은 오직 collagen 혹은 gelatin에서만 일어난다. HeLa 세포의 spreading은 오직 collagen 결과 활성화된 phosphoipase $A_2$(PLA$_2$)에 의한 arachidonic acid(AA)의 형성으로 유도된다. PLA$_2$에 의해 분해되는 인지질을 확인하기 위해 각종 인지질의 농도변화를 spreading 과정에서 측정한 결과 단지 phosphatidylcoline 만이 감소하였으며, 또한 다양한 lysophospholipids 중 lysophosphatidylcholine 만이 spreading 과정에 생성되는 것으로 보아 phosphatidylcoline이 PLA$_2$에 의해 분해되어 AA가 형성되는 것으로 보인다. PLA$_2$의 활성화는 세포질 CA$_2$+의 농도변화 및 세포질 pH의 알칼리화에 기인하지 않으며, 또한 pertussis 혹은 cholera toxin-sensitive G protein 역시 PLA$_2$활성화와는 무관한 것으로 나타났다.

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소비자의 가격민감도에 따른 상품특성별 멀티채널 선택에 관한 연구 -경험재로서의 의류상품과 탐색재로서의 디지털 가전제품을 중심으로- (A Study on Multichannel Selection according to Consumer's Price Sensitivity -Focusing on Fashion Products as Experience Goods and Digital Appliances as Search Goods-)

  • 안현아;김지은;이진화
    • 한국의류학회지
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    • 제40권6호
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    • pp.967-978
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    • 2016
  • This study examines consumers' multi-channel choices in the search phase and purchasing phase stage according to price sensitivity and product characteristics in order to propose a multichannel strategy. For the research, one-way ANOVA, t-test, clustering analysis, and crosstabs are used for the descriptive analysis of 317 surveys on men and women conducted in 2014. The findings are as follows. First, consumers that both experience goods and search goods rely on surrounding advice as well as a search channel regardless of price sensitivity. Second, channel selection differs by price sensitivity when it comes to purchasing phase. Consumers with high price sensitivity tend to purchase from online channels; however, consumers with low price sensitivity tend to purchase from off line channels in cases of search goods. Meanwhile, cases of experience goods have no meaningful result. Third, consumers are divided into 3 groups by the tendency of channel selection. In case of experience goods, search channel choice is aligned with purchasing channel; however, search channel choice is not aligned with purchasing channel in search goods. This study provides clear information on fashion consumers' behavior on multi-channel choices compared to ones for search goods consumers on strategic strategies for fashion companies.

PC 클러스터링을 이용한 병렬 최적조류계산에 관한 연구 (Parallel Optimal Power Flow Using PC Clustering)

  • 김철홍;문경준;김형수;박준호;김진호;이화석
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2004년도 추계학술대회 논문집 전력기술부문
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    • pp.190-193
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    • 2004
  • Optimal Power Flow (OPF) is becoming more and more important in the deregulation environment of power pool and there is an urgent need of faster solution technique for on-line application. So this paper presents parallel genetic algorithm-tap search for the solution of the OPF. The control variables modeled unit active power outputs, generator-bus voltage magnitudes and transformer-tap settings. A number of functional operating constraints, such as branch flow limits, load bus boltage magnitude limits and generator reactive capabilities are included as penalties in the fitness function. In parallel GA-TS, GA operators are executed for each process. If best fitness of the GA is not changed for several generations, TS operators are executed for the upper three populations to enhance the local searching capabilities. With migration operation, best string of each node is transferred to the neighboring node after predetermined iterations are executed. For parallel computing, we developed a PC-cluster system consisting of 8 PCs. Each PC employs the 2 GHz Pentium IV CPU and is connected with others through ethernet switch based fast ethernet. To show the usefulness of the proposed method, developed algorithm has been tested and compared on an IEEE 30-bus system in the reference paper. From the simulation results, we can find that the proposed algorithm is efficient for the OPF.

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곤충 발자국 패턴 인식을 위한 Trace Transform 기반의 특징값 추출 (Feature Extraction Using Trace Transform for Insect Footprint Recognition)

  • 신복숙;조경원;차의영
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제12권6호
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    • pp.1095-1100
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    • 2008
  • 이 논문에서는 곤충 발자국의 패턴을 인식하기 위해, 인식의 기본 단위인 세그먼트를 자동 추출하는 기법과 Trace transform을 이용하여 발자국 인식에 필요한 특징을 추출하는 기법을 제안하였다. Trace transform 방법을 이용하면 패턴의 이동, 회전, 반사에 불변하는 특징 값을 얻을 수 있다. 이러한 특징 값들은 곤충 발자국과 같이 다양한 변형이 존재하는 패턴을 인식하는 데에 적합하다. 특징 값을 도출하기 위한 첫 번째 단계로는 추출된 세그먼트에 대한 Trace transform을 통해 새로운 Trace 이미지를 생성시킨다. 그런 다음, 병렬로 표현되는 trace-line을 따라 특성 함수에 의해 특징들이 일차적으로 도출되고, 또 다시 도출된 특징들은 diametric, circus 단계의 함수를 거치면서 새로운 특징값으로 재구성된다. 2가지 서로 다른 곤충의 발자국 패턴을 이용하여 실험한 결과 곤충 발자국의 이동, 회전, 반사에 관계없이 인식에 적합한 특징 값들이 추출됨을 확인할 수 있었다.