• KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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• 제6권10호
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• pp.2679-2691
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• 2012

In this paper, a high accuracy stereo reconstruction method for surgery instruments positioning is proposed. Usually, the problem of surgical instruments reconstruction is considered as a basic task in computer vision to estimate the 3-D position of each marker on a surgery instrument from three pairs of image points. However, the existing methods considered the 3-D reconstruction of the points separately thus ignore the structure information. Meanwhile, the errors from light variation, imaging noise and quantization still affect the reconstruction accuracy. This paper proposes a method which takes the structure information of surgical instruments as constraints, and reconstructs the whole markers on one surgical instrument together. Firstly, we calibrate the instruments before navigation to get the structure parameters. The structure parameters consist of markers' number, distances between each markers and a linearity sign of each instrument. Then, the structure constraints are added to stereo reconstruction. Finally, weighted filter is used to reduce the jitter. Experiments conducted on surgery navigation system showed that our method not only improve accuracy effectively but also reduce the jitter of surgical instrument greatly.

• 한국균학회지
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• 제21권4호
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• pp.323-331
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• 1993

The protoplast formation and intergeneric protoplast fusion between Gliocladium virens and Trichoderma harzianum were attempted to obtain fusants. Protoplast formation was the most effective when the strains were treated with concentration of 5 mg/ml of Novozyme 234 and Cellulase at $25^{\circ}C$ for 3 hours in phosphate buffer, pH 6.5, supplemented with 0.6 M sorbitol as osmotic stabilizer. Auxotrophic mutants of G. virens G88 did not grow in minimal medium and benomyl resistant T. harzianum T95 from wild types, however, was selected by treatment with UV light as genetic marker to isolate fusants. When the intergeneric protoplast fusion between G. virens G88 and T. harzianum T95 was carried out using 30% PEG 4000 containing 10 mM $CaCl_{2}$, and 50 mM glycine (pH 8.5) as fusogenic agent at $25^{\circ}C$ for 10-15 min, the fusion frequency was $0.8{\times}10^{-4}$. Fusants obtained from intergeneric protoplast fusion were spontaneously segregated into va rious strains by continous culture on complete medium. Several intergeneric hybrids were classified into three types: parent-like hybrids, segregants, and recombinants.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제22권5호
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• pp.384-389
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• 2014

Adiponectin, an adipokine predominantly secreted from adipose tissue, exhibits diverse biological responses, including metabolism of glucose and lipid, and apoptosis in cancer cells. Recently, adiponectin has been shown to modulate autophagy as well. While emerging evidence has demonstrated that autophagy plays a role in the modulation of proliferation and apoptosis of cancer cells, the role of autophagy in apoptosis of cancer cell caused by adiponectin has not been explored. In the present study, we demonstrated that globular adiponectin (gAcrp) induces both apoptosis and autophagy in human hepatoma cell line (HepG2 cells) and breast cancer cells (MCF-7), as evidenced by increase in caspase-3 activity, Bax, microtubule-associated protein light chain 3-II (LC3 II) protein levels, and autophagosome formation. Interestingly, gene silencing of LC3B, an autophagy marker, significantly enhanced gAcrp-induced apoptosis in both HepG2 and MCF-7 cell lines, whereas induction of autophagy by rapamycin, an mTOR inhibitor, significantly prevented gAcrp-induced apoptosis in hepatoma cells HepG2. Furthermore, modulation of autophagy produced similar effects on gAcrp-induced Bax expression in HepG2 cells. These results implicate that induction of autophagy plays a regulatory role in adiponectin-induced apoptosis of cancer cells, and thus inhibition of autophagy would be a novel promising target to enhance the efficiency of cancer cell apoptosis by adiponectin.

• 한국수정란이식학회지
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• 제32권3호
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• pp.105-109
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• 2017

Autophagy is an intracellular degradation and recycling system. Oocyte maturation is dynamic process, in which various proteins should be synthesized and degraded. In our previous study, we reported the loci of autophagosome and dynamics of autophagic activity in porcine oocytes during in vitro maturation. In this study, we verified loci of autophagosome in porcine follicular cumulus-oocyte complex by detection of microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3 (LC3) which is the reliable marker of autophagosome. Porcine ovary including various sizes of follicles was fixed within 1 hour after collection from slaughterhouse. After fixation, immunohistochemistry was conducted on sliced ovary tissue containing various sizes of follicles by using LC3 antibody. As a result, LC3 signal was clearly detected in both cumulus and oocytes of various sizes of follicles. We also found ring shaped signal which represent autophagosome near oocyte membrane. Most of the signals in oocytes were localized nearby cellular membrane while evenly dispersed in cumulus cells. Therefore, this result suggests that autophagy occurs in porcine COCs (cumulus-oocyte complexes) at follicular stage.

• 생명과학회지
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• 제16권4호
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• pp.626-631
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• 2006

밀양 토종개의 일반적인 특징을 구명할 수 있는 기초자료를 확보하고자 밀양 토종개 44두를 대상으로 형태학적 특징 및 microsatellite DNA형의 유전적 다양성의 출현빈도에 기초한 유전적인 특징을 조사한 결과 밀양 토종개의 체고는 43-55 cm(평균 49.5 cm)로서 수캐는 44-55 cm(평균 50.3 cm), 암캐는 43-52 cm(평균 48.1 cm)로 나타났고 체장은 45-60 cm(평균 54.3 cm)로서 수캐는 45-60 cm(평균 55.9 cm), 암캐는 45-57 cm(평균 52.6 cm)였다. 또한 가슴둘레는 수캐가 51-64 cm(평균 59.2 cm), 암캐는 50-62 cm(평균 56.3 cm)로 측정되었다. 머리의 형태는 정면에서 보았을 때 44두 모두에서 역삼각형 형태를 가지고 있었으며, 눈의 모양은 삼각형 형태가 40두(90.9%)였고 초승달 모양이 4두(9.1%)로 관찰되었다. 모색은 백색이 41두(93.2%), 황색이 3두(6.8%)로 나타나 두 색깔을 가지고 있었다. 혀와 발톱의 색깔은 전 두수에서 각각 연분홍색과 분홍색이 관찰되었고 항문의 색깔은 연한 흑색이 40두(90.9%), 연분홍색이 4두(9.1%)로 나타났다. 그리고 귀의 형태는 전 두수가삼각형의 곧게 서 있는 형태였으며, 꼬리의 형태는 반말린 꼬리가 25두(56.8%)로 가장 많았고 선꼬리(장대꼬리)가 15두(34.1%), 말린 꼬리가 4두(9.1%)로 나타났다. 15개의 marker로 분석한 microsatellite DNA 다형의 유전자 빈도에 기초하여 heterozygosity, PIC 그리고 PE를 분석한 결과 대립유전자의 수는 $2{\sim}14$개(평균 6.13개)로 검출되었으며 expected heterozygosity와 PIC는 각각 $0.455{\sim}0.863$ (평균 0.635), $0.348{\sim}\;0.837$(평균 0.570)으로 나타났고 PEZ 10, PEZ 13, PEZ 17, FHC 2054의 marker는 PIC 0.7이상으로 관찰되었다. PE 1은 $0.101{\sim}\;0.548$으로서 15개 marker를 조합시 0.9895, PE 2는 $0.174{\sim}\;0.710$으로서 전체 조합시 0.9996으로 나타났다.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제6권1호
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• pp.45-48
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• 2003

We have previously cloned and characterized the complete fibroin L-chain gene from one of the silkworm races Baekok-Jam (Bombyx mori) and found two variable regions (I, intron 2 ~ exon 3; II, intron 6) with the primer sets designed to cover these variable regions. We tested the utility of these regions as genetic markers among silkworm races. For the purpose of study, Japanese race (Jam 123), Chinese race (Jam 124) and their F$_1$hybrid Baekok-Jam were used. The PCR product size of region I was 787 bp in Jam 123, 770 bp in Jam 124 and 768 bp in Baekok-Jam. The size of region II was 470 bp in Jam 123, 428 bp in Jam 124 and 429 Up in Baekok-Jam. In the extended experiment, Jam 125 (Japanese race), Jam 126 (Chinese race) and their F$_1$hybrid Daeseong-Jam were also analyzed. The sizes of region I and II in Jam 125, Jam 126 and Daeseong-Jam were similar to those of Jam 123, Jam 124 and Baekok-Jam. DNA sequence divergence between the two geographic races of Jam 123 or Jam 125 and Jam 124 or Jam 126 was substantial. The result suggests that the fibroin L-chain gene of F$_1$hybrids were inherited from Chinese races. These results are concordant with cocoon shapes of tested animals, and suggested that Baekok-Jam or Daeseong-jam is more closely related to Jam 124 or Jam 126 than to Jam 123 or Jam 125. Taken these data together, the primer sets designed from two variable regions of fibroin L-chain gene would be highly useful, as the genetic markers for silkworm races, at least in Japanese and Chinese races, although an extended study including more geographic races is required.

• 생명과학회지
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• 제25권11호
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• pp.1204-1213
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• 2015

도루묵은 우리나라 동해에서 어획되는 상업적으로 중요한 수산자원으로 동해안의 자원회복관리 대상어종이며, 자원량의 회복 및 보전과 관리가 필요한 어종이다. 하지만 우리나라 도루묵 자원의 관리를 위한 유전학적 분석에 따른 연구는 매우 미비한 실정이다. 따라서 본 연구는 mitochondrial DNA의 Cytochrome b (Cyt b) 유전자 서열과 5개의 microsatellite marker의 유전자형을 토대로 우리나라 동해안 도루묵과 일본 도루묵의 유전적 다양성과 집단 구조를 분석하여 유전학적 유연관계를 파악하고, 도루묵 자원의 보전과 관리를 위한 과학적 자료를 제공하기 위해 실시하였다. 한국 3개 지역(독도, 동해, 감포)과 일본의 2개 지역(북해도와 에리모)에서 채집된 총 83개 개체의 mtDNA Cyt b 영역을 분석하여 27개의 haplotype을 확인하였다. 유전적 다양성은 에리모에서 가장 높고 감포에서 가장 낮았다. Pairwise F_ST값과 유전적 거리, UPGMA와 주성분분석, AMOVA test 및 structure 분석 결과, 한국의 동해안 도루묵 집단 간 유전적 차이는 거의 없었으나 일본 도루묵 집단과는 유의적인 차이가 나타났으며(p<0.05), 한국의 동해안 집단과 일본의 집단으로 그룹을 형성하며 구분되는 유연관계를 확인하였다. 본 연구에서 확인된 도루묵의 유전적 특성 및 집단 간 유연관계는 중요한 수산유전자원으로서의 도루묵에 대한 중요한 과학적인 근거자료가 될 것이며, 앞으로 도루묵의 보존, 평가 및 이용에 활용 가능한 정보를 제공할 것이라 사료된다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제40권2호
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• pp.160-168
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• 2016

Background: Ginseng (Panax ginseng Meyer) is a well-characterized medicinal herb listed in the classic oriental herbal dictionary as "Shin-nong-bon-cho-kyung." Ginseng has diverse pharmacologic and therapeutic properties. Black ginseng (BG, Ginseng Radix nigra) is produced by repeatedly steaming fresh ginseng nine times. Studies of BG have shown that prolonged heat treatment enhances the antioxidant activity with increased radical scavenging activity. Several recent studies have showed the effects of BG on increased lipid profiles in mice. In this study report the effects of water and ethanol extracts of BG on hypercholesterolemia in rats. To our knowledge, this is the first time such an effect has been reported. Methods: Experiments were conducted on male Sprague Dawley rats fed with a high-cholesterol diet supplemented with the water and ethanol extracts of BG (200 mg/kg). Their blood cholesterol levels, serum white blood cell levels, and cholesterol-metabolizing marker genes messenger RNA (mRNA) expression were determined. Liver and adipose tissues were histologically analyzed. Results: We found that BG extracts efficiently reduced the total serum cholesterol levels, low-density lipoprotein (LDL) levels with increased food efficiency ratio and increased number of neutrophil cells. It also attenuated the key genes responsible for lipogenesis, that is, acetyl-coenzyme A (CoA) acetyltransferase 2, 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase, and sterol regulatory element-binding protein 2, at the mRNA level inside liver cells. Furthermore, the BG extract also reduced the accumulation of fat in adipose tissues, and inhibited the neutral fat content in liver cells stained with hematoxylin and eosin and oil red O. Conclusion: Administration of BG extracts to Sprague Dawley rats fed with high-cholesterol diet ameliorated hypercholesterolemia, which was mediated via modulation of cholesterol-metabolizing marker genes. This data throw a light on BG's cardioprotective effects.

• 한국도로학회논문집
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• 제8권4호
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• pp.1-11
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• 2006

현재 국도개량사업으로 국도의 이동성이 향상되었으나 유출부에 설치된 도로안전시설인 시선유도시설은 일관성 없이 설치되거나 미설치된 경우가 많다. 유출부의 시선유도시설은 유출부의 안전성을 높이는 시설임에도 불구하고 각 유출부마다 서로 다른 유형으로 설치되어 그 기능적 검토가 필요할 것으로 판단하였다. 이에 본 연구에서는 현장조사를 통하여 조사된 시설유형별로 설치기준의 적합성을 검토한 후 운전자 인지특성을 고려한 효과적인 시설유형을 제시하고자 하였다. 이를 위하여 3D-시뮬레이션을 개발하여 보다 객관적인 비교실험을 수행하였다. 시설유형 간 비교변수는 운전자 인지특성을 대변할 수 있는 현저성, 시인성으로 선정하여 시설유형에 대한 각각의 특성실험을 수행하였으며 인지 특성변수로 채택된 시인성의 실험에 대한 피 실험자의 측정오차를 줄이기 위하여 초점기록계(Eye Marker Recorder)를 이용하여 실험함으로서 보다 정량적이고, 객관적인 주시빈도를 측정할 수 있었다. 각각의 측정 변수들에 대한 시설유형 간 유의성을 검증하기 위하여 분산 분석으로 검토하였다. 그 결과 현저성은 시설유형 간 유의미한 차이를 나타냈으며, 유출부를 인지하는데 안전표지, 장애물표적표지, 시선유도등, 시선유도봉이 설치된 시설유형이 가장 유리한 것으로 평가되었다. 또한 시인성의 효과척도로 주시빈도를 측정한 결과 시설유형 간 유의미한 차이를 알 수 있었으며, 현저성과 동일한 시설유형이 설치되었을 때 유출부를 인지하는데 유리한 것으로 평가되었으며 전체적인 결과를 종합하여 볼 때 안전표지, 장애물표적표지, 시선유도등, 시선유도봉의 시설이 가장 유리한 것임을 알 수 있었다.

• 한국육종학회지
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• 제41권4호
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• pp.568-573
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• 2009

신강은 콩나물 적성이 뛰어나고 농업형질이 우수하나 콩모자이크병에 약한 소원콩을 반복친으로, 콩모자이크병 저항성 유전자 Rsv3을 보유한 L29를 일회친으로 사용하여 육성된 품종이다. 육성기간의 단축을 위하여 분자표지선발법을 사용하여 목표유전자의 도입과 반복친의 회복정도를 신속히 확인함으로써 품종 개발에 소요되는 기간을 7년으로 단축하였다. 신강의 주요 특성을 요약하면 다음과 같다. 1. 유한신육형이며, 꽃색은 자색이고 엽형은 피침형이다. 입형은 구형이고 종피색은 황색, 배꼽색은 담갈색이며 100립중은 11.0 g으로 다소 가볍다. 2. 개화기는 7월 30일, 성숙기는 10월 7일로 풍산나물콩에 비하여 다소 빠른 중만생종이다. 3. 콩 모자이크병, 미이라병 및 노균병에 대해 강한 저항성을 보였다. 4. 콩나물 재배 특성으로는 부패립 발생이 거의 없고, 콩나물 수율은 635%로 풍산나물콩에 비해 다소 높다. 5. 3개년간의 지역적응시험 결과 풍산나물콩 대비 동등한 수량을 나타내었다.