• 제목/요약/키워드: L -Diversity

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DGGE 방법과 Pyrosequencing 방법을 이용한 지렁이 장내미생물의 다양성 분석 (Comparative Analysis of Bacterial Diversity in the Intestinal Tract of Earthworm (Eisenia fetida) using DGGE and Pyrosequencing)

  • 김은성;홍성욱;정건섭
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.374-381
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    • 2011
  • 미생물과의 상호작용을 통하여 토양의 특성을 변화시킬 수 있는 지렁이 Eisenia fetida의 장내미생물 군집을 조사하기 위하여, 배양방법과 비배양방법인 DGGE와 pyrosequencing을 이용하여 8주와 16주 사육 지렁이의 장내미생물 군집을 분석하였다. 배양방법에서는 L. fusiformis(51%), B. cereus(30%), E. aerogenes(21%), 그리고 L. sphaericus (15%) 등이 우점미생물로 확인되었다. DGGE 분석에서는 B. cereus(15.1%), Enterobacter sp.(13.6%), uncultured bacterium (13.1%), 그리고 B. stearothermophilus(7.8%)가 우점미생물로 확인되었다. Pyrosequencing 분석에서는 Microbacterium soli(26%), B. cereus(10%), M. esteraromaticum(6%), 그리고 Frigoribacterium sp.(6%)가 우점미생물로 확인되었다. 그외에도 Aeromonas sp., Pseudomonas sp., Borrelia sp., Cellulosimicrobium sp., Klebsiella sp., and Leifsonia sp. 등의 미생물도 확인이 되었으며, 비배양 방법을 이용한 장내 미생물 군집 조사는 배양이 불가능한 미생물을 확인할 수 있을 뿐만 아니라 더 다양한 미생물 군집도 확인할 수 있었다.

화순 조간대 저서 대형무척추동물의 공간적 종다양성에 관한 연구 (Spatial Species Diversity of Macrobenthos in the Intertidal Zone of Hwasoon, Jeju Islands)

  • 이정재;강경철;김종철
    • 한국패류학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.63-70
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    • 2001
  • 1999년 9월부터 2000년 8월까지 제주도 안덕면 화순리 화순화력발전소 인접 5개 지점 조간대의 대형저서무척추동물의 분포와 군집구조에 관한 연구결과는 다음과 같다. 화순화력발전소 인접 조간대에 분포하는 대형무척추동물은총 6 문, 13 강, 24 목, 49 과, 97 종이 출현하였다. 조간대 상부구역의 제 1 우점종은 좁쌀무늬총알고둥, 제 2우점종은 군부 (Liolophura japonica), 테두리고등 (Patelloida saccharina), 배무래기 (Notoarmea schrenckii) 이였다. 중부구역의 제 1 우점종은 울타리고등 (Monodonta labio), 작은조무래기따개비 (Chthamalus challengeri), 고랑딱개비 (Siphonalia japonica), 군부 (L. japonica), 울타리고등 (M. labio)이였으며, 제 2 우점종은 배무래기 (N.schrenckii), 울타리고등 (M. labio), 진주담치 (Mytilus edulis), 거북손 (Mitella mitella), 군부 (L. japonica) 이였다. 하부구역의 제 1 우절종은 꽃고랑딱개비 (Siphonalia sirius), 작은조무래기따개비 (C. challengeri), 해변말미잘(Actinia mesembryanthemum), 테두리고등 (P. saccharina), 울타리고등 (M. labio) 이였으며, 제 2 우점종은 배무래기 (N. schrenckii), 군부 (L. japonica), 석회관갯지렁이(Serpula vermicularis), 울타리고등 (M. labio)이였다. 조간대 종다양도지수나 균등도, 풍부도는 하부구역이 상부구역이나 중부구역에 비하여 컸다.

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Dietary lysophospholipids supplementation inhibited the activity of lipolytic bacteria in forage with high oil diet: an in vitro study

  • Kim, Hanbeen;Kim, Byeongwoo;Cho, Seongkeun;Kwon, Inhyuk;Seo, Jakyeom
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권10호
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    • pp.1590-1598
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    • 2020
  • Objective: The objective of this study was to evaluate the effects of lysophospholipids (LPL) supplementation on rumen fermentation, degradability, and microbial diversity in forage with high oil diet in an in vitro system. Methods: Four experimental treatments were used: i) annual ryegrass (CON), ii) 93% annual ryegrass +7% corn oil on a dry matter (DM) basis (OiL), iii) OiL with a low level (0.08% of dietary DM) of LPL (LLPL), and iv) OiL with a high level (0.16% of dietary DM) of LPL (HLPL). An in vitro fermentation experiment was performed using strained rumen fluid for 48 h incubations. In vitro DM degradability (IVDMD), in vitro neutral detergent fiber degradability, pH, ammonia nitrogen (NH3-N), volatile fatty acid (VFA), and microbial diversity were estimated. Results: There was no significant change in IVDMD, pH, NH3-N, and total VFA production among treatments. The LPL supplementation significantly increased the proportion of butyrate and valerate (Linear effect [Lin], p = 0.004 and <0.001, respectively). The LPL supplementation tended to increase the total bacteria in a linear manner (p = 0.089). There were significant decreases in the relative proportions of cellulolytic (Fibrobacter succinogenes and Ruminococcus albus) and lipolytic (Anaerovibrio lipolytica and Butyrivibrio proteoclasticus) bacteria with increasing levels of LPL supplementation (Lin, p = 0.028, 0.006, 0.003, and 0.003, respectively). Conclusion: The LPL supplementation had antimicrobial effects on several cellulolytic and lipolytic bacteria, with no significant difference in nutrient degradability (DM and neutral detergent fiber) and general bacterial counts, suggesting that LPL supplementation might increase the enzymatic activity of rumen bacteria. Therefore, LPL supplementation may be more effective as an antimicrobial agent rather than as an emulsifier in the rumen.

비룡산 신갈나무림의 식물 다양성 (Plant Diversity of Qurecus mongolica Forest in Mt. Biryong)

  • 김준수;홍진기;김경수;조용찬;배관호
    • 농업생명과학연구
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    • 제45권3호
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    • pp.9-18
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    • 2011
  • 본 연구는 경상북도 봉화군 비룡산 일대의 신갈나무림을 대상으로 하층수관층에 출현하는 식물 다양성을 파악하기 위해 수행되었다. 종-면적 곡선의 분석결과 신갈나무림 내의 식물다양성의 분석에 적정 크기의 방형구를 설치한 것으로 판단되었다. 5개 조사구 전체의 소산식물은 47과 80속 91종 11변종 2아종 3품종으로 총 107분류군이다. 본 조사에서 기록한 식물종 중 우리나라의 특산식물은 지리대사초, 고광나무, 병꽃나무로 총 3종이다. 한편 희귀식물로는 꼬리진달래 1종 뿐이다. 생육형은 광엽초본에 해당하는 식물종이 가장 높게 나타났고, 관목, 교목 순이었다.

Status, Distribution and Diversity of Invasive Forest Undergrowth Species in the Tropics: a Study from Northeastern Bangladesh

  • Rahman, Md. Habibur;Khan, Mohammed Abu Sayed Arfin;Fardusi, Most. Jannatu;Roy, Bishwajit
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제26권3호
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    • pp.149-159
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    • 2010
  • This paper analyzes data on the composition, status, diversity, and distribution pattern of invasive forest undergrowth in a protected area (Khadimnagar National Park) of Northeastern Bangladesh. Assessment was done by means of stratified random sampling to diversify the invasive forest undergrowth species. For vegetation survey, 45 plots were taken randomly in ($2m{\times}2m$) circular plot from three topographical regions namely top of the hill, middle slope and plain land (15 plots from each region) and a total of 715 individuals, 22 invasive species belonging to 17 families were recorded from the study site. Among invasive species, shrubs constitute 10 species, herbs 9 species, and vines 3 species respectively. Mass number of invasive undergrowth species was grows in plain land (45.45%) followed by middle slope (31.82%). Based on the survey, invasive undergrowth plants of study areas were also categorized into three degrees of invasiveness e.g., highly invasive, moderately invasive and potentially invasive. Herbs, shrubs, and vines constitute the highest density at Chromolaema odorata (Linn.) King. (1.09), relative density at Chromolaema odorata (Linn.) King. 6.85%; highest and lowest frequency was calculated at Cassia alata L. (64.44%) and Diplazium esculentum (24.44%); for relative frequency the highest was Cassia alata L., which occupies 6.64%. Determination of the abundance of the different species revealed that Cassia alata L., constitutes (3.36) followed by Pteris cretica Wilsonii (3.14) of the area. The presence of invasive undergrowth species always reduced the number of associated species. Therefore, an extensive in-depth long-term investigation, proper policy formulation and management interventions and further study and continuous monitoring on their impacts need to be triggered targeting the control of the invasive undergrowth species of this protected area. In this aspect, national and international organization could help to conserve its biodiversity.

Further Analysis on Selective Diversity Reception for Detection of M-ary Signals Over Nakagami Fading Channels

  • Na, Seung-Gwan;Kim, Chang-Hwan;Chin, Yong-Ohk
    • 한국통신학회논문지
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    • 제30권11C호
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    • pp.1045-1052
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    • 2005
  • The symbol error probability of M-ary PSK (MPSK) and QAM (MQAM) systems using the branch with the largest signal-to-noise ratio (SNR) at the output of L-branch selection combining (SC) in frequency-nonselective slow Nakagami fading channels with an additive white Gaussian noise (AWGN) is derived theoretically For integer values of the Nakagami fading parameter m, the general formula for evaluating symbol error rate (SER) of MPSK signals in the independent branch diversity system comprises numerical analyses with the integral-form expressions. An exact closed-form SER performance of MQAM signals under the effect of SC diversity via numerical integration is presented. These performance evaluations allow designers to determine M-ary modulation methods for Nakagami fading channels.

Evaluation on MRC Diversity Reception of M-ary PSK and DPSK Signals on Wireless Fading Channels

  • Kim, Chung-Sock;Kim, Chang-Hwan;Jin, Yong-Ok
    • Journal of electromagnetic engineering and science
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    • 제7권3호
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    • pp.109-115
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    • 2007
  • The performances of M-ary PSK(MPSK) systems using L-branch maximum ratio combining(MRC) diversity reception in frequency-nonselective slow Rician fading channels are derived theoretically. Especially we investigate the effect of number of symbols on the difference between the approximation to bit error probability and the exact bit error rate(BER) in evaluating the performance of MPSK signals through numerical analyses. On the other hand, when M-ary DPSK(MDPSK) signals experience the Rician fading channels, the general formula for evaluating BER of MDPSK signals in the independent branch diversity system is presented using the integral-form expressions.

Array 안테나와 최대비 합성 다이버시티를 채용한 비동기식 IMT-2000 시스템의 수신성능 분석 (Performance Analysis of the Asynchronous IMT-2000 System Receiver with Array Antenna and MRC-Diversity)

  • 왕용철;우병훈;강희조
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국해양정보통신학회 2001년도 춘계종합학술대회
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    • pp.191-196
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    • 2001
  • 본 논문은 광대역 무선통신환경에서 3GCPP(3.4 Generation Partnership proiect)에 기반한 비동기 IMT-2000 시스템의 송수신 시스템을 구성하여 기지국의 수신성능을 분석하였다. 적용된 시스템은 이동국과 기지국간의 Uplink 채널 환경을 고려하였으며, 기지국의 수신신호는 다중경로 페이딩(Multi-path Fading)과 다중접속간섭(Mult Access Interference : MAI)의 영향으로 성능이 열화되며 이에 대한 대책으로 Array 안테나를 채용하였을 경우와 MRC-Diversity(Maximal Combing Diversity)를 채용하였을 경우의 수신성능을 동일한 환경에서 비교 분석하였다. 본 논문에서 적용한 Array 안테나는 수신 신호의 방향에 파라 적응적으로 추적하여 수신 SNR(Singnal-to-Noise power Ratio)을 최대로 형성하여 시스템의 성능을 개선하는 기법이며, 안테나의 방향성(Directivity : =2.67을 이용하는 3-element Array 안테나를 채용하였다. 최대비 합성 다이버시티 기법은 다이버시티 기법 중 수신효율이 가장 좋으며 가지수(L=2)를 함수로 사용하였다. 성능분석 결과 다중경로 페이딩과 다중접속간섭 환경에서 최대비 합성 다이버시티 기법이 Array 안테나보다 약 Eb/No=4[dB]정도 수신효율이 우수하였다.

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동일 채널 간섭이 존재하는 나카가미 채널에서 임의 직사각 QAM 신호의 MRC 다이버시티 수신 성능 (Performance Analysis of Arbitrary Rectangular QAM over Nakagami Fading Channels with MRC in the Presence of Co-channel Interference)

  • 현광민;윤동원;박상규
    • 한국통신학회논문지
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    • 제29권3A호
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    • pp.257-265
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    • 2004
  • MRC 다이버시티 수신 시스템에서 상호 독립적이고 동일한 전력을 갖는 동일 채널 간섭자들이 존재할 경우, Gray 부호화된 임의 직사각 QAM 신호의 성능을 분석하였다. 본 논문에서는 L개의 수신안테나를 갖는 MRC 수신 다이버시티 시스템에서 N명의 서로 독립적이고 동일한 나카가미 분포를 갖는 동일 채널 간섭자들의 신호가 수신되는 경우의 폐쇄형 (closed-form) 평균 비트 오류 확률 수식을 유도하였다. 이 수식은 수치 계산에 의해 쉽게 계산되는 초기하 함수를 이용하여 표현되었다.

Effects of Organic Farming on Communities of Arbuscular Mycorrhizal Fungi

  • Lee, Si-Woo;Lee, Eun-Hwa;Eom, Ahn-Heum
    • Mycobiology
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    • 제36권1호
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    • pp.19-23
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    • 2008
  • Red pepper (Capsicum annum L.) roots and soils representing different agricultural management practices such as conventional (CON), no-chemical (NOC), and organic farming systems (ORG) were collected from 32 farm field sites in Kyunggi, Korea to investigate the effects of these agricultural practices on arbuscular mycorrhizal (AM) symbiosis. ORG inoculum significantly increased plant growth compared to inoculum from CON and NOC. A community analysis of AM fungi (AMF) using morphological features of spores revealed that AMF spore abundance and species diversity were significantly higher in ORG than in CON. Additionally, a community analysis of AMF colonizing roots using a molecular technique revealed higher AMF diversity in ORG than in CON. These results suggest that agricultural practices significantly influence AM fungal community structure and mycorrhizal inoculum potential.