• 한국토양비료학회지
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• 제43권5호
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• pp.705-715
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• 2010

기후변화협약과 탄소배출권문제 등 환경에 관한 관심과 규제 등이 국제적 주요 관심 사항이 되고 있는 상황에서 농업생산에 대한 환경영향평가의 필요성이 대두되고 있다. 현재 우리나라는 환경부에서 시행하는 탄소성적표지제도 도입에서 농업분야의 LCI (Life Cycle Invemtory)database 부재를 이유로 1차 농산물을 대상에서 제외하고 있다. 따라서 농산물 탄소성적표지제도 도입을 위한 농업분야 LCI database에 대한 연구와 구축이 시급한 실정이다. 따라서 본 연구는 농업생산체계에 대한 LCA 적용을 위하여 시설상추를 대상으로 LCI 구축과 LICA 수행을 위한 방법론을 고찰하였다. LCA의 방법론은 ISO 14040 규격에 의거하여 연구 목적 및 범위, LCI분석 (전과정 목록분석), LCIA(전과정 영향평가), 해석의 단계로 구성되었다. 연구 목적은 시설 상추재배체계에 대한 LCA 방법론 적용이며, 기능단위는 상추 1 kg 생산으로 하였다. LCI 구축을 위한 영농 투입물과 산출물에 대한 데이터 수집은 농진청의 농축산물소득자료를 중심으로 관련 통계, 문헌자료를 통하여 수집하였다. LCI 구축을 위한 자료 수집결과 상추를 재배할 때 투입되는 물질 중 유기질 비료와 무기질 비료의 시용과, 식물보호제의 투입이 주요배출인자로 분석되었다. 농업활동으로 배출되는 주요 환경부하물질은 비료가 시용된 토양으로부터 대기로 발생되는 $N_2O$와 수계로 배출되는 ${NO_3}^-$, ${PO_4}^-$과 농약잔류물질로부터 발생되는 유기화학물질, 농기계에 쓰이는 화석연료 연소에 의한 대기오염물질 등 이었다. LCIA는 해외의 LCA 방법론과 LCA적용사례를 조사하여 농업분야 LCIA 방법론에 대하여 고찰하였다. LCIA는 분류화, 특성화, 정규화(일반화), 가중화의 4단계로 이루어지며, 이 중 분류화와 특성화는 의무절차이고, 정규화와 가중화는 선택사항이다. 해석단계는 LCI 분석결과와 LCIA 결과에 대하여 검증하고, 결과로부터 도출된 환경적 문제점과 개선안 등을 제시한다. LCA 수행에 사용하는 국내 소프트웨어는 지경부와 환경부에서 개발하여 보급하고 있는 'PASS'와 'TOTAL' 이다. 그러나 국내 프로그램에 적용되고 있는 환경영향평가 모델은 국외에서 개발한 기존모델들이다. 그러므로 보다 정확한 농업분야 LCA 분석이 가능하도록 추후 국내 농업환경에 적합한 영향평가 모델 및 특성화, 일반화, 가중화 계수의 선정 등이 이루어져야 할 것이다.

• 정보과학회 논문지
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• 제44권1호
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• pp.1-12
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• 2017

지속적으로 증가하는 인터넷 서비스 요구사항을 만족하기 위하여 인터넷 서비스를 제공하는 시스템은 웹 서버와 DB(database) 서버로 구성된 multitier 구조로 변화되어왔다. 이러한 multitier 웹 어플리케이션 환경에서 기존의 IDS(intrusion detection system)는 웹 서버와 DB 서버에서 misused traffic pattern들이나 signature들을 매칭하여 이미 알려진 공격을 검출하고 해당 접속을 차단하는 방식으로 동작한다. 하지만 이러한 방식의 IDS는 정상적인 HTTP(hypertext transfer protocol) request를 이용하여 악의적으로 DB 서버의 내용의 변조를 시도하는 attacker의 공격을 DB 서버단에서 제대로 검출하지 못한다. 그 이유는 DB 서버는 웹 서버로부터 받은 SQL(structured query language) query가 어떤 사용자의 HTTP request에 의해 발생한 것인지 알지 못하는 상태에서 처리하며, 웹 서버는 SQL query 처리 결과 중 어떤 것이 악의적으로 DB 서버 변조를 시도한 SQL query에 의한 결과인지 알 수 없기 때문이다. 이런 공격을 검출하기 위해서는 HTTP request와 SQL query 사이의 상호작용관계를 명확히 파악하고, 이를 이용하여 악의적인 SQL query를 발생시킨 사용자를 추적해야 한다. 이를 위해서는 해당 시스템의 소스코드를 분석하거나 application logic을 완벽하게 파악해야 하므로 현실적으로 불가능하다. 본 논문에서는 웹 서버와 DB 서버에서 제공하는 로그만을 이용하여 모든 HTTP request와 SQL query간의 mapping 관계를 찾아내고, 이를 이용하여 특정 SQL query를 발생시킨 HTTP request를 추정하는 기법을 제안한다. 모의실험을 통하여 94%의 정확도로 HTTP request를 추정할 수 있음을 확인하였다.

• 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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• 제14권2호
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• pp.130-142
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• 2008

토픽맵은 기존의 온톨로지 언어와는 달리 위치정보를 이용하여 형태를 변환하지 않고도 많은 양의 이종 정보 자원을 통합할 수 있는 온톨로지 언어이다. 지금까지 토픽맵 구축을 위한 여러 편집기등이 개발되어 있으나, 이들은 XTM 문서를 독자 방식으로 처리하고 있다. 따라서 대용량 자료를 처리하는 데 많은 시간이 소요되고, 현재 RDB 기반에서 운영되고 있는 레거시 시스템에 적용하여 실용화하기에는 많은 문제가 있다. 본 논문에서는 XTM 1.0 규격 기반의 대용량 토픽맵을 RDB 구조로 모델링하여, 처리시간을 최소화하고 레거시 시스템 상에서 온톨로지 구축이 가능하도록 하였다. 기존에 사용하고 있는 SQL 도구와 어플리케이션 개발 도구를 토픽맵 온톨로지 구축에 활용할 수 있도록 하여, 온톨로지 구축의 효율성을 높이고 XTM 문서와 데이타베이스간의 상호 호환이 가능한 토픽맵 플랫폼 X-TOP을 설계하고 구현하였다. X-TOP은 향후 사용자 인터페이스 변경과 다양한 DBMS를 지원할 수 있도록 3계층 구조를 갖고 있다. 헬스케어의 암 온톨로지 관리에 X-TOP을 적용하여 기존 시스템과의 성능 비교와 실무 응용의 유효성을 보였다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권6호
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• pp.2333-2340
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• 2015

Background: Due to the strong inhibitory effects of $PPAR{\gamma}$ gene on the growth of cancer cells, the role of Pro12Ala polymorphism in $PPAR{\gamma}$ gene has been extensively investigated in cancer recently. However, the results were inconsistent according to cancer type. The aim of this study was to comprehensively evaluate the $PPAR{\gamma}$ Pro12Ala polymorphism and gastric cancer susceptibility. Materials and Methods: Search strategies were conducted in Pubmed, Medline (Ovid), Chinese biomedical database (CBM), China national knowledge infrastructure (CNKI), VIP, and Wanfang database, covering all publications, with the last search up to November 01, 2014. The strength of association between $PPAR{\gamma}$ Pro12Ala polymorphism and gastric cancer risk was assessed by OR with 95%CI. Results: A total of 546 cases and 827 controls in 5 case-control studies were included in this meta-analysis. The results indicated that the variant G allele carriers (CG+GG) had a 2.31 times higher risk for gastric cancer when compared with the homozygote CC (odds ratio (OR)=2.31, 95% confidence interval (CI)=1.67-3.21 for CG+GG vs. CC). In the subgroup analysis by ethnicity, significantly elevated risks were both found in Asians (OR=2.56, 95% CI=1.42-4.64) and Caucasians (OR=2.20, 95% CI=1.48-3.25). Similarly, in the subgroup analysis by H. pylori status, a significantly increased risk was identified in H. pylori (+) populations (OR=3.68, 95%CI=2.07-6.52), but not in H. pylori(-) populations (OR=1.17, 95%CI=0.58-2.39). Conclusions: This pooled analysis suggested that the $PPAR{\gamma}$ Pro12Ala polymorphism could be an independent predictive risk factor for gastric cancer especially in H. pylori infected populations in Asians and Caucasians. Nevertheless, prospectively designed cohort studies are needed to further investigate gene-gene and gene-environment interactions to confirm the combined effects of $PPAR{\gamma}$ Pro12Ala polymorphisms and H. pylori infection on gastric cancer risk.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제17권11호
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• pp.716-723
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• 2016

국가 주요 사회기반시설물로서 전국 도로 교량의 현황 데이터를 효과적으로 수집하고, 데이터의 신뢰도를 증진시키며, 축적된 데이터를 분석하여 정책수립 지원을 위한 기초자료로 활용하기 위하여 전산화된 정보관리시스템이 필요하다. 데이터베이스와 GIS(Geographic Information Systems)를 포함하는 인터넷 기반 교량정보시스템(Bridge Information System; BIS)을 설계하고, GIS 기반 위치좌표와 교량 상태등급 정보 등 관리를 위한 필수 정보로 데이터 항목을 구성하였다. BIS는 관련 정보시스템과의 정보 연계가 가능하며, GIS 도입을 통해 교통량, 주소 정보 등의 현행화가 용이하도록 개발하였다. 현황정보의 신뢰도 향상을 위하여 입력 오류를 사전에 방지하기 위한 정보 검증 기능을 통해 데이터의 신뢰도를 향상시킬 수 있도록 하였다. 또한 축적된 데이터 분석을 바탕으로 기존에 불가능하던 다양한 지식정보를 제공하여 정책수립 지원이 용이하도록 하였으며, GIS를 바탕으로 직관적인 현황파악과 분석이 가능하도록 하였다. BIS의 현황정보 관리를 통해 유지관리 업무 효율성 향상, 정보 정확도 향상, 시계열에 따른 정보분석 등이 가능하여, 장래의 합리적인 국가 유지관리 정책 수립에 효과적으로 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권1호
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• pp.515-521
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• 2013

Purpose: To evaluate the efficacy and toxicity of induction chemotherapy followed by concurrent chemoradiotherapy (the treatment group) versus concurrent chemoradiotherapy with or without adjuvant chemotherapy (the control group) for locoregionally advanced nasopharyngeal carcinoma. Methods: The search strategy included Pubmed, Embase, the Cochrane Library, China National Knowledge Internet Web, Chinese Biomedical Database and Wanfang Database. We also searched reference lists of articles and the volumes of abstracts of scientific meetings. All randomized controlled trials were included for a meta-analysis performed with RevMan 5.1.0. The Grading of Recommendations Assessment, Development, and Evaluation system (GRADE) was used to rate the level of evidence. Results: Eleven studies were included. Risk ratios of 0.99 (95%CI 0.72-1.36), 0.37 (95%CI 0.20-0.69), 1.08 (95%CI 0.84-1.38), 0.98 (95%CI 0.75-1.27) were observed for 3 years overall survival, 3 years progression-free survival, 2 years loco-regional failure-free survival and 2 years distant metastasis failure-free survival. There were no treatment-related deaths in either group in the 11 studies. Risk ratios of 1.90 (95%CI 1.24-2.92), 2.67 (95%CI 0.64-11.1), 1.04 (95%CI 0.79-1.37), 0.98 (95%CI 0.27-3.52) were found for grade 3-4 leukopenia, grade 3-4 thrombocytopenia, grade 3-4 mucous membrane, and grade 3-4 hepatic hematologic and gastrointestinal toxicity, the most significant toxicities for patients. Conclusion: Compared with the control group, induction chemotherapy followed by concurrent chemoradiotherapy was well tolerated but could not significantly improve prognosis in terms of overall survival, loco-regional failure-free survival or distant metastasis failure-free survival.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권1호
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• pp.189-193
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• 2013

Many epidemiological studies in Asian populations have investigated associations between the Arg399Gln gene polymorphism of X-ray repair cross complementing gene 1 (XRCC1) and risk of cervical carcinoma, but no conclusions have been available because of controversial results. Therefore a meta-analysis was conducted for clarification. Relevant studies were identified by searching the Pubmed, Embase, the Web of Science, Cochrane Collaboration's database, Chinese National Knowledge Infrastructure (CNKI), Wanfang database and China Biological Medicinse (CBM) until September, 2012. A total of eight studies were included in the present meta-analysis, which described 1,759 cervical carcinoma cases and 2,497 controls. Odds ratios (ORs) and corresponding 95% confidence intervals (95%CIs) as effect size were calculated by fixed-effect or random-effect models. The overall results indicated that the XRCC1-399G/A polymorphism was marginally associated with cervical carcinoma in Asians: OR (95%CI): 1.16 (1.07, 1.26) in the G/A vs G/G inheritance model, 1.24 (0.87, 1.76)in A/A vs G/G inheritance model, 1.13 (1.01, 1.27) in the dominant inheritance model and 1.18 (0.94, 1.47) in the recessive inheritance model. Subgroup analyses on sample size showed no significant correlation in the small-sample size group but the large-sample size group was consistent with the outcomes of overall meta-analysis. In the subgroup analysis by regions, we only found significant association under the G/A vs G/G inheritance model in the Chinese population. For the non-Chinese populations, no correlation was detected in any genetic inheritance model. In the Asian populations, XRCC1-399G/A gene polymorphism was implied to be associated with cervical carcinoma.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제17권8호
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• pp.3945-3951
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• 2016

Background: Whether concurrent chemotherapy treatment is superior to radiotherapy alone as an adjuvant regimen for postoperative cervical carcinoma with risk factors remains controversial. Materials and Methods: A literature search strategy examined Pubmed, Embase, the Cochrane Library, the China National Knowledge Internet Web, the Chinese Biomedical Database and the Wanfang Database. Article reference lists and scientific meeting abstracts were also screened. Controlled trials comparing concurrent chemoradiotherapy versus radiotherapy alone in postoperative cervical cancer were included. The methodological quality of non-randomized controlled trials was evaluated using the Newcastle-Ottawa Scale. Randomized controlled studies were evaluated with the Cochrane handbook. A meta-analysis was performed with RevMan 5.3. Results: A total of 1,073 patients from 11 clinical trials were analysed, with 582 patients in the concurrent chemoradiotherapy group and 491 patients in the radiotherapy group. Hazard ratios (HR) of 0.47 (95% CI 0.31-0.72) and 0.50 (95% CI 0.35-0.72) were observed for overall survival and progression-free survival, indicating a benefit from the additional use of concurrent chemotherapy. Subgroup analyses demonstrated that cervical cancer with high risk factors significantly benefitted from concurrent chemotherapy when examining overall survival (HR 0.44, 95% CI 0.28-0.67) and progression-free survival (HR 0.48, 95% CI 0.33-0.70), but patients with intermediate risk factors showed no benefit from concurrent chemotherapy in overall survival (HR 1.72, 95% CI 0.28-10.41) and progression-free survival (HR 1.09, 95% CI 0.19-6.14). No significant differences were observed for grade 3-4 anaemia (risk ratio (RR) 3.87, 95% CI 0.69-21.84), grade 3-4 thrombocytopenia (RR 3.04, 95% CI 0.88-10.58), grade 3-4 vomiting or nausea (RR 1.71, 95% CI 0.27-10.96), or grade 3-4 diarrhoea (RR 1.40, 95% CI 0.69-2.83). Significant differences were observed for grade 3-4 neutropenia in favour of the radiotherapy group (RR 7.23, 95% CI 3.94-13.26). Conclusions: In conclusion, concurrent chemoradiotherapy improves survival in postoperative cervical cancer with high risk factors but not in those with intermediate risk factors.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
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• 한국정보통신학회 2015년도 춘계학술대회
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• pp.768-770
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• 2015

유전체 염기서열 분석비용이 크게 감소하면서 유전체 정보 생산이 본격화됨에 따라 시스템 생물학 기반의 통합 및 표준화된 오믹스 데이터베이스 구축이 필요하다. 이에 따라 현재 진행중인 연구 수행의 결과로 얻어진 차세대유전체서열(NGS) 및 전사체(transcriptome) 등의 대용량 정보를 수집하였고 이를 표준화 형식에 맞춰 농업생명공학정보센터(NABIC)에 등록하였다. 또한 농업생명자원 생물정보를 품목별, 개체별로 통합 저장소를 구축하였으며 농업생명자원 생물정보를 품목별, 개체별로 통합 저장소를 구축하였다. 농업생명공학정보센터 오믹스 정보등록시스템 서비스와의 연계 및 확충작업을 하기위해 시스템 기능 개선 및 유지보수 작업을 수행하였다.

• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2000년도 International Symposium on Bioinformatics
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• pp.21-22
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• 2000

Expressed sequence tags (EFTs) are the partial segments of cDNA produced from 5 or 3 single-pass sequencing of cDNA clones, error-prone and generated in highly redundant sets. Advancement and expansion of Genomics made biologists to generate huge amount of ESTs from variety of organisms-human, microorganisms as well as plants, and the cumulated number of ESTs is over 5.3 million, As the EST data being accumulate more rapidly, it becomes bigger that the needs of the EST analysis tools for extraction of biological meaning from EST data. Among the several needs of EST analyses, the extraction of protein sequence or functional motifs from ESTs are important for the identification of their function in vivo. To accomplish that purpose the precise and accurate identification of the region where the coding sequences (CDSs) is a crucial problem to solve primarily, and it will be helpful to extract and detect of genuine CD5s and protein motifs from EST collections. Although several public tools are available for EST analysis, there is not any one to accomplish the object. Furthermore, they are not targeted to the plant ESTs but human or microorganism. Thus, to correspond the urgent needs of collaborators deals with plant ESTs and to establish the analysis system to be used as general-purpose public software we constructed the pipelined-EST analysis system by integration of public software components. The software we used are as follows - Phred/Cross-match for the quality control and vector screening, NCBI Blast for the similarity searching, ICATools for the EST clustering, Phrap for EST contig assembly, and BLOCKS/Prosite for protein motif searching. The sample data set used for the construction and verification of this system was 1,386 ESTs from human intrathymic T-cells that verified using UniGene and Nr database of NCBI. The approach for the extraction of CDSs from sample data set was carried out by comparison between sample data and protein sequences/motif database, determining matched protein sequences/motifs that agree with our defined parameters, and extracting the regions that shows similarities. In recent future, in addition to these components, it is supposed to be also integrated into our system and served that the software for the peptide mass spectrometry fingerprint analysis, one of the proteomics fields. This pipelined-EST analysis system will extend our knowledge on the plant ESTs and proteins by identification of unknown-genes.