섬유성 가수분해물로부터 효율적으로 ethanol을 생산하는 세 가지 균주를 밀기울 당화액에서의 집적배양에 의해 토양에서 분리하였다. 효모인 KM-09와 KM-402 및 세균인 HG-225의 생리학적 및 생화학적 특성은 각각 Candida sp. 및 Klebsiella sp.과 거의 유사하였다. KM-09와 HG-225 균주는 발효당으로 xylose와 cellobiose를 이용하였고 HG-225는 발효시 넓은 당 이용성을 가졌다.
본 연구는 음식물 쓰레기 내 질소농도에 따른 발효과정에서 수소생성 특성과 미생물의 군집변화를 살펴보았다. 음식물 쓰레기 내 질소의 함량이 200 mg/L일 때 가장 높은 수소생산 효율을 보여주었으며, 이 때 수소생산율은 83.43 mL/g dry wt biomass/hr이였다. 질소의 함량이 600 mg/L 이상이 되면 수소생산이 저해되는 것으로 나타났으며 수소생산량과 B/A ratio (Butric acid/Acetic acid)의 비례적 상관관계는 관찰되지 않았다. 16S rDNA의 PCR-DGGE결과 대부분 군집은 Clostridium sp. 미생물로 규명되었으며 수소생성에 기여도가 큰 미생물은 Enterococcus faecium partial, Klebsiella pneumoniae strain ND6, Enterobacter sp. NCCP-231, 그리고 Clostridium algidicarnis strain E107 등으로 판명되었다.
This paper reported the use of real-time polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), and the culture-based method in the intrinsic bioremediation study at a petroleum contaminated site. The study showed that phenol hydroxylase gene was detected in groundwater contaminated with benzene, toluene, ethylbenzene, xylene isomers (BTEX) and methyl tert-butyl ether (MTBE). This indicated that intrinsic bioremediation occurred at the site. DGGE analyses revealed that the petroleum-hydrocarbon plume caused the variation in microbial communities. MTBE degraders including Pseudomonas sp. NKNU01, Bacillus sp. NKNU01, Klebsiella sp. NKNU01, Enterobacter sp. NKNU01, and Enterobacter sp. NKNU02 were isolated from the contaminated groundwater using the cultured-based method. Among these five strains, Enterobacter sp. NKNU02 is the most effective stain at degrading MTBE without the addition of pentane. The MTBE biodegradation experiment indicated that the isolated bacteria were affected by propane. Biodegradation of MTBE was decreased but not totally inhibited in the mixtures of BTEX. Enterobacter sp. NKNU02 degraded about 60% of MTBE in the bioreactor study. Tert-butyl alcohol (TBA), acetic acid, 2-propanol, and propenoic acid were detected using gas chromatography/mass spectrometry during MTBE degraded by the rest cells of Enterobacter sp. NKNU02. The effectiveness of bioremediation of MTBE was assessed for potential field-scale application.
부산시내 주택단지의 하수나 토양에서 LAS 분해능이 우수한 균주를 유일한 탄소원으로서 sodium dodecylbenzenesulfonate(SOBS, soft type)를 포함하는 agar plate를 사용하여 분리히였다 이들 분리균중 2균주가. SOBS를 0.1% 함유한 완전배지에서 30$^{\circ}$C 24시간 배양했을 때' SOBS분해율이 최고 59% 정도까지 냐타내였다 긍속이온에 대한 이들 분리 균의 내성조사결과 대부분 $CdCl^{2}$,와 $ZnCl^{2}$에 비교적 내성이 큰 것으로 나타났으며 분리균의 항생제 내성시험에서는 ampicillin 에 대하여 내성을 나타내었다. 특히 분리균중 1개는 ampicillin에 대해 1,550mg/ml 이상에서도 내성을 나타내었으며 이 분리균주는 Klebsiella 속으로 동정되었다. 이 균주는 5kb와 4kb의 2개의 plasmid를 가지고 있었으며 이들은 E. coli C600 plasmic 균주에 형질전환시켰을 때 SDBS분해능을 나타내었으므로 SDBS분해능은 plasmid에 존재하는 유전인자에 의한 것임을 알 수 있었다.
Purified melanin pigment from Klebsiella sp. GSK was characterized by thermogravimetric, differential thermal, X-ray diffraction and elemental analysis. This melanin pigment is structurally amorphous in nature. It is thermally stable up to $300^{\circ}C$ and emits a strong exothermic peak at $700^{\circ}C$. Its carbon, hydrogen and nitrogen composition is 47.9%, 6.9% and 12.0%, respectively. It was used to scavenge metal ions and free radicals. After immobilizing the pigment and using it to adsorb copper and lead ions, the metal ion adsorption capacity was evaluated by atomic absorption spectroscopy (AAS) and the identity of melanin functional groups involved in the binding of metal ions was determined by Fourier transform infrared (FT-IR) spectroscopy. Batch adsorption studies showed that 169 mg/g of copper and 280 mg/g of lead were adsorbed onto melanin-alginate beads. The metal ion adsorption capacity of the melanin-alginate beads was relatively significant compared to alginate beads. The metal ion desorption capacity of HCl was greater (81.5% and 99% for copper and lead, respectively) than that of EDTA (80% and 71% for copper and lead, respectively). The ability of the melanin pigment to scavenge free radicals was evaluated by inhibition of the oxidation of 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) and 2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid) (ABTS) and was shown to be about 74% and 98%, respectively, compared with standard antioxidants.
Microbial fuel cell (MFC) wes enriched using sludge in wastewater treatment. The microbial community of activated sludge and enriched MFC were analyzed by FISH (fluorescent in situ hybridization) and 16S rDNA sequencing. Bacteroidetes group were pre-dominant in activated sludge by FISH. ${\alpha}$ group, ${\gamma}$ group and Acintobacter group were dominant and they were similar to distribution. The average value of 10 peak of MFC is 0.44C. When MFC wase enriched by sludge, ${\gamma}$-Proteobacteria, Plantomycetes group increased 70% and 60%, respectively. In results of 16S rDNA sequencing, Sphiringomonas sp. was comprised in ${\alpha}$ proteobacteria and Enterobacter sp., Klebsiella sp., Acinetobacter sp., Bacillus sp. were comprised in ${\gamma}$ proteobacteria and Chryseobacterium sp. was comprised in Flavobacteria were isolated from sludge.
The degradative pathway of homoprotocatechuate (HPC) is the bacterial routhe wherby 3,4-dihydrox-yphenylactic acid is catabolized to pyruvate and succinate by a series of sequential reactions . The HPC is catalzed by homoprotocatechuate 2, 3-dioxygenase(HPC-2,3O) to from 5-carboxymethy1-2-hydroxy-muco semialdehyde. In this study, the hha D gene encoding. HPC, 2, 3O was Cloned from the chromo-somal DNA of Pseudomonas sp. DJ-12 and its nucleotide sequence was analyzed. The open reding frame of hpaD gene was found to be composed of 864 nucleotide pairs and to encode a poypetide with 287 amino acide residues. The deduced amino acid sequence of the HPC-2,3O from Pseudomonas. sp. DJ-12 exhibited 60~64% homology with those of the corresponding enzymes from E. coli. Salmonella enterica, and Klebsiella pneumoniae.
This study aimed to identify and characterize the antimicrobial activity of prodigiosin produced by Serratia sp. $PDGS^{120915}$ isolated from stream water in Busan, Korea; the identification was performed using phonological, biochemical, and molecular techniques, including 16S rRNA sequence analysis. Prodigiosin from the bacterial culture was purified by high-performance liquid chromatography (HPLC), and its antimicrobial activity and minimum inhibitory concentrations (MICs) were evaluated against 10 intestinal pathogenic gram-positive and negative bacteria. The results revealed that the isolated prodigiosin exhibited high antimicrobial activity against Listeria monocytogenes, Bacillus cereus, Pseudomonas aeruginosa, Salmonella typhimurium, Staphylococcus aureus, and Vibrio parahaemolyticus; further, the isolated prodigiosin showed minimum inhibitory concentrations (MICs) between $3{\mu}g/ml$ and 30 mg/ml, but they were not active against Bacillus subtilis, Enterococcus faecalis, Klebsiella pneumonia, and Escherichia coli. In conclusion, prodigiosin isolated from Serratia sp. $PDGS^{120915}$ showed high antimicrobial activity against intestinal pathogenic bacteria and has potential applications in the development of new antimicrobial agents.
Histamine은 적색육 어류의 histidine이 어육 중의 Morganella morganii, Hafnia alvei 및 Klebsiella pneumoniae와 같은 부패세균에 의해 탈탄산 되어 초기에 형성되는 것으로 allergy성 식중독을 일으킬 수 있다. 이는 적색육 어류인 고등어의 선도저하 시에 많이 생성된다. 그리고 부패 후기에는 histamine을 분해하는 세균도 존재하는 것으로 알려져 있다. 그러므로, histamine 식중독의 잠재력을 지닌 자반고등어로 인한 식중독 사고 예방과 그 위생 대책을 수립하는데 필요한 자료를 얻고자 자반고등어에서 histamine 분해능을 가진 균을 분리, 동정하였다. 시료는 대형마트에서 시판되는 상태로 구입하였다. 질소원과 탄소원으로써 histamine만을 첨가한 제한배지를 사용하여 histamine 분해능을 가진 균을 분리하였다. 그리고 Cram staining, oxidase, catalase, citrate, TSI test, $H_{2}S$ reaction 및 indole 생성 등의 기본적인 생화학적 동정시험을 거쳐 10종의 시험균주를 선택하였다. 이 균주들을 16SrRNA gene 염기서열 비교에 의한 계통발생학적 분석을 이용하여 동정 하였다. 그 결과, Pseudomonas putida strain RA2, Halomonas marina, Uncultured Arctic sea ice bacterium clone ARKXV1/2-136, Halomonas venusta, Psychrobacter sp. HS5323, Pseudemonas putida KT2440, Rhodococcus erythropolis, Klebsiella terrigena (Raoultella terrigena), Alteromonadaceae bacterium T1, Shewanella massilia의 10종이 모두 동정 되 었으며, 각각 $100\%,{\;}100\%,{\;}99\%,{\;}99\%,{\;}99\%,{\;}99\%,{\;}100\%,{\;}95\%,{\;}99\%,{\;}100\%$의 상동성을 보였다. Histamine분해능의 존재를 탁도측정법과 효소법에 의해 확인한 결과, 분리된 10종 모두의 histamine 분해능이 재확인 되었고, 그 중 Shewanella massilia가 최대의 histamine 분해능을 보이는 것으로 확인되었다. 이 결과로 자반고등어 시판 제품에는 다수의 histamine 분해 세균이 존재하는 것을 확인할 수 있었으며, 이 세균을 활용한다면 식품 내 존재하는 histamine을 효과적으로 분해할 수 있을 것이라 예상된다.
광주시 지역에서 사육하고 있는 젖소 1,614두중 유방염으로 의심되는 730분방 중에서 170분방을 검사분석하여 유방률, 균의 분리와 간이검사법과의 관계, 계절별 분리균의 분포, 항균 요법제에 대한 감수성 등을 검사하였다. 본 원인균은 730분방 중 134분방(18.4%)에서 분리되었으며 체세포 숫자는 평균 $1.620 imes 10^6pm 1.167 imes 10^6/ml$(C.V. 72.0%)이었다. CMT 반응치는 평균 $2.9pm 1.2$(C.V. 41.4%)이었으며 WT 반응치는 평균 $2.8pm 1.2$(C.V. 42.9%)이었다. RBVT와 CMT의 상관계수는 0.82(P<0.001)이었고 RBVT와 WT의 상관계수는 0.75 (P<0.001)이었으며 CMT와 WT의 상관계수는 0.93 (P<0.001)이었다. 체세포 숫자를 기준으로 하여 CMT 및 WT의 양성율을 비교하여 보면 원인균이 분리된 경우에는 체세포 숫자가 $0.49 imes 10^6$ 이하/ml의 경우에 반응치가 1+일때의 CMT는 72.4%, WT는 42.1%이었고 체세포 숫자가 $0.50 imes 10^6~1.00 imes 10^6/ml$의 경우에 반응치가 2+일 대의 CMT는 45.5%, WT는 48.8%이었으며, 체세포 숫자가 $3.01 imes 10^6$ 이상/ml의 경우에 반응치가 3+일 때의 CMT는 73.7%, WT는 92.3%이었다. 원인균의 월별 분리 빈도를 보면 8월 (17.9%)이 가장 높았고 다음은 9월(16.4%), 7월 (12.7%), 6월 (11.2%), 1월 (9.0%)의 순이었다. 원인균의 분리 빈도를 보면 Staphylococcus sp. (51.4%)가 가장 높았고 다음은 Escherichia coli(23.9%), Pseudomonas sp. (11.2%). Streptococcus sp. (6.7%)의 순이었다. 항균 요법제에 대한 감수성은 trimethoprim/sulfamethoxazole은 Streptococcus sp., Staphylococcus epidermidis, Proteus sp., Salmonella sp. 등에 높았고 gentamycin은 Streptococcus sp., Staphylococcus aureus, Enterobacteriaceae, Klebsiella sp., Proteus sp., Salmonella sp. 등에 높았으며 enrofloxacin은 일반적으로 거의 모든 균에서 감수성이 높았다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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