• 제목/요약/키워드: KLP

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Expression and cDNA Cloning of klp-12 Gene Encoding an Ortholog of the Chicken Chromokinesin, Mediating Chromosome Segregation in Caenorhabditis elegans

  • Ali, M. Yusuf;Khan, M.L.A.;Shakir, M.A.;Kobayashi, K. Fukami;Nishikawa, Ken;Siddiqui, Shahid S.
    • BMB Reports
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    • 제33권2호
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    • pp.138-146
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    • 2000
  • In eukaryotes, chromosomes undergo a series of complex and coordinated movements during cell division. The kinesin motor proteins, such as the chicken Chromokinesin, are known to bind DNA and transport chromosomes on spindle microtubles. We previously cloned a family of retrograde C-terminus kinesins in Caenorhabditis elegans that mediate chromosomal movement during embryonic development. Here we report the cloning of a C. elegans klp-12 cDNA, encoding an ortholog of chicken Chromokinesin and mouse KIF4. The KLP-12 protein contains 1609 amino acid and harbors two leucine zipper motifs. The insitu RNA hybridization in embryonic stages shows that the klp-12 gene is expressed during the entire embryonic development. The RNA interference assay reveals that, similar to the role of Chromokinesin, klp-12 functions in chromosome segregation. These results support the notion that during mitosis both types, the anterograde N-terminus kinesins such as KLP-12 and the retrograde C-terminus kinesins, such as KLP-3, KLP-15, KLP-16, and KLP-17, may coordinate chromosome assembly at the metaphase plate and chromosomal segregation towards the spindle poles in C. elegans.

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냉각탑수에서 분리한 Pseudomonas aeruginosa KLP-2 배양여액의 Legionella Pneumophila에 대한 항균활성 (Antimicrobial Activity of Culture Filtrates from Pseudomonas aeruginosa KLP-2 Isolated from Cooling Tower-Water against Legionella pneumophila)

  • 박은희;차인호;이상준
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.127-133
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    • 2001
  • 냉각탑수 중의 Legionella 속 균을 저감시킬 수있는 방법개발의 일환으로 L. pneumophila에 강한 항균성물질을 생산하는P. seruginosa KLP-2 균주를 냉각탑수로부터 분리 동정하였다 P.aeruginosa KLP-2 균주를 냉각탑수로부터 분리 동정하였다. P. aeruginosa KLP-2 균주의 배양여액은 L. pneumophila의 Vibro cholerae non-Ol Bacillus cereus, Bacillus subtilis 및 Staphylococcus aureus에 대해서도 항균성을 나타내었다. P. seruginosa KLP-2 균주 배양여액의 항균활성을 증가시키기 위한 최적조건은 0.1%의 $K_2$$HPO_4$와 0.05%의 $MgSO_4$$7H_2$O로 조성되 무기염배지에 탄소원으로써 1%의 glycerol, 질소원으로써, 0.6%의 proteose peptone이 첨가된 pH 7.0의 배지 조건에서 가장 높은 항균 활성을 나타내었으며 $35^{\circ}C$에서 20시간 진탕배양(50 rpm)한 후 4일간 정치 배양하였을 때 최대의 항균활성을 나타내었다.

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DMD기반 Kirchhoff-Love 판의 모드 분석과 수치해 예측 (DMD based modal analysis and prediction of Kirchhoff-Love plate)

  • 신성윤;조광현;배석찬
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제26권11호
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    • pp.1586-1591
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    • 2022
  • Kirchhoff-Love 판 (KLP) 방정식은 특정 외력이 얇은 막에 끼치는 변형을 기술하는 잘 알려진 이론이다. 한편, frequency 도메인에서 진동하는 판을 해석하는 것은 주요 진동 주파수와 고유함수들을 구하는 것과 판의 진동을 예측하는데 중요하다. 다양한 모드 분석 방법들 중 dynamic mode decomposition (DMD)는 효율적인 data 기반 방법이다. 이 논문에서 우리는 DMD를 기반으로 sine 유형 외력의 영향력 안에 있는 KLP의 모드 분석을 수행한다. 우리는 먼저 유한차분법을 사용하여 이산적으로 표현된 시계열 형식의 KLP 해를 구한다. 720,00개의 FDM으로 생성된 해중에서, 오직 500개의 해만을 DMD의 구현을 위해 선택한다. 우리는 결과적으로 얻어진 DMD-mode를 보고한다. 또한, DMD를 통하여 KLP의 해를 예측하는 효율적인 방법을 소개한다.

Energy-Efficient and High Performance CGRA-based Multi-Core Architecture

  • Kim, Yoonjin;Kim, Heesun
    • JSTS:Journal of Semiconductor Technology and Science
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    • 제14권3호
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    • pp.284-299
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    • 2014
  • Coarse-grained reconfigurable architecture (CGRA)-based multi-core architecture aims at achieving high performance by kernel level parallelism (KLP). However, the existing CGRA-based multi-core architectures suffer from much energy and performance bottleneck when trying to exploit the KLP because of poor resource utilization caused by insufficient flexibility. In this work, we propose a new ring-based sharing fabric (RSF) to boost their flexibility level for the efficient resource utilization focusing on the kernel-stream type of the KLP. In addition, based on the RSF, we introduce a novel inter-CGRA reconfiguration technique for the efficient pipelining of kernel-stream on CGRA-based multi-core architectures. Experimental results show that the proposed approaches improve performance by up to 50.62 times and reduce energy by up to 50.16% when compared with the conventional CGRA-based multi-core architectures.

Pseudomonas aeruginosa KLP-2가 생산한 Pyocyanine의 항균활성 및 생리화학적 성상 (Physico-Chemical Properties and Antimicrobial Activity of Pyocyanine Produced by Pseudomonase aeruginosa KLP-2)

  • 박은희;이상준;차인호
    • 생명과학회지
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    • 제11권5호
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    • pp.483-488
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    • 2001
  • 최근 다양한 분야에서 생물학적 제제개발에 관한 연구가 활발한다. 본 연구에서는 생물학적 제제개발을 위한 일련의 연구로 Pseudomonas aeruginosa KLP-2가 생산하는 항균성 물질을 동정하고, 생리화학적 특성을 확인하였다. 본 항균성 물질을 전제하여 FAB-MS로 확인한 결과 pyocyanine으로 동정되었으며, 진청색의 needles 성상을 나타내었고 chloroform, methanol, ethyl acetate와 같은 용매에 높은 용해도를 나타내었다. Pyocyanine의 UV spectrum은 methanol에서 최대 흡광치(318 nm)를 보였고, FAB-MS로 확인한 결과 m/z 211에서 protonated molecular ion(M+H)$^{+}$ 이 관찰되었으며, 분자식은 $C_{13}$H$_{10}$ N$_{2}$O로 확인되었다. Pyocyanine 은 Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Micrococcus luteus, Rodococcus equi, Staphylococcus aureus, Streptococcus faecalis, E. coli. Kegionella peneumophila, Shigella flexneri, Shigela boydii, Shigella sonnei, NAG Vibro cholerae, Vibrio parahaemolyticus, Vibro vulnificus, Yersinia enterocolitica 및 Saccharomyces cerevisiae 등의 다양한 세균에 대하여 항균활성을 보여 비교적 넓은 항균범위를 나타내었으며, 특히 Legionella pneumophila에 대하여 0.5$\mu$g의 pyocyanine을 함유한 disk가 48mm의 억제환을 타나내어 가장 높은 항균활성을 보였다.

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한글 두 글자 단어와 비단어의 어휘판단에 글자 빈도, 글자 유형, 받침이 미치는 영향: KLP 자료의 분석 (The Effect of Syllable Frequency, Syllable Type and Final Consonant on Hangeul Word and Pseudo-word Lexical Decision: An Analysis of the Korean Lexicon Project Database)

  • 신명석;박창호
    • 인지과학
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    • 제34권4호
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    • pp.277-297
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    • 2023
  • 본 연구는 한국어 심성어휘 데이터베이스(KLP-DB)의 분석을 통해 글자 빈도, 글자의 모음 유형, 받침 유무 등 글자 수준 정보가 두 글자로 된 단어와 비단어의 어휘판단에 어떤 영향을 주는지를 알아보고자 하였다. 반응시간과 오반응률에 대한 위계적 회귀분석을 실시한 결과 단어의 어휘판단에는 단어빈도가 중대한 영향을 미치지만, 첫째 글자의 빈도, 첫째 글자와 둘째 글자의 모음 유형과 받침 유무와 같은 글자 속성이 영향을 미쳤고, 두 글자의 모음 유형의 조합 및 둘째 글자의 빈도와 받침 유무의 조합도 영향을 주었다. 비단어의 어휘판단에는 첫째 글자와 둘째 글자의 빈도, 첫째 글자의 모음 유형, 첫째 글자와 둘째 글자의 받침 유무와 같은 글자 속성이 영향을 미쳤고, 두 글자의 사용빈도의 조합, 모음 유형의 조합, 및 첫째 글자의 빈도와 받침의 조합도 영향을 주었다. 단어빈도는 단어의 어휘판단에서 강력한 영향을 미쳤으며, 글자속성은 단어보다 비단어의 판단에서 더 일관적인 영향을 미쳤다. 본 연구의 결과는 어휘판단과제에서 단어와 비단어 목록의 구성 및 반응시간의 해석에 글자 속성의 문제를 충분히 고려해야 함을 가리킨다. 글자 속성의 효과에 대한 이해는 단어 재인 과정의 이해에도 기여할 것이다.

Mobile Client Webservice Architecture for Personal Navigation Service

  • Hong, Sang-Gi;Kim, Kyong-Ho;Park, Jong-Hyun
    • 대한원격탐사학회:학술대회논문집
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    • 대한원격탐사학회 2003년도 Proceedings of ACRS 2003 ISRS
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    • pp.691-693
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    • 2003
  • The development of an open LBS platform makes it easy to use of the location information between telecommunication companies which have different platforms and to develop various LBS solutions using position information. This paper proposes a mobile webservice solution providing public transportation services to the mobile subscribers.

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Complete Sequence of a Gene Encoding KAR3-Related Kinesin-like Protein in Candida albicans

  • Kim Min-Kyoung;Lee Young Mi;Kim Wankee;Choi Wonja
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권5호
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    • pp.406-410
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    • 2005
  • In contrast to Saccharomyces cerevisiae, little is known about the kinesin-like protein (KLP) in Candida albicans. The motor domain of kinesin, or KLP, contains a subregion, which is well conserved from yeast to humans. A similarity search, with the murine ubiquitous kinesin heavy chain region as a query, revealed 6 contigs that contain putative KLPs in the genome of C. albicans. Of these, the length of an open reading (ORF) of 375 amino acids, temporarily designated CaKAR3, was noticeably short compared with the closely related S. cerevisiae KAR3 (ScKAR3) of 729 amino acids. This finding prompted us to isolate a ${\lambda}$ genomic clone containing the complete CaKAR3 ORF, and here the complete sequence of CaKAR3 is reported. CaKAR3 is a C-terminus motor protein, of 687 amino acids, encoded by a non-disrupting gene. When compared with ScKAR3, the amino terminal region of 112 amino acids was unique, with the middle part of the 306 amino acids exhibiting $25\%$ identity and $44\%$ similarity, while the remaining C-terminal motor domain exhibited $64\%$ identity and $78\%$ similarity, and have been submitted to GeneBank under the accession number AY182242.

Bi-directional LSTM-CNN-CRF를 이용한 한국어 개체명 인식 시스템 (Korean Entity Recognition System using Bi-directional LSTM-CNN-CRF)

  • 이동엽;임희석
    • 한국정보과학회 언어공학연구회:학술대회논문집(한글 및 한국어 정보처리)
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    • 한국정보과학회언어공학연구회 2017년도 제29회 한글 및 한국어 정보처리 학술대회
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    • pp.327-329
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    • 2017
  • 개체명 인식(Named Entity Recognition) 시스템은 문서에서 인명(PS), 지명(LC), 단체명(OG)과 같은 개체명을 가지는 단어나 어구를 해당 개체명으로 인식하는 시스템이다. 개체명 인식 시스템을 개발하기 위해 딥러닝 기반의 워드 임베딩(word embedding) 자질과 문장의 형태적 특징 및 기구축 사전(lexicon) 기반의 자질 구성 방법을 제안하고, bi-directional LSTM, CNN, CRF과 같은 모델을 이용하여 구성된 자질을 학습하는 방법을 제안한다. 실험 데이터는 2017 국어 정보시스템 경진대회에서 제공한 2016klpNER 데이터를 이용하였다. 실험은 전체 4258 문장 중 학습 데이터 3406 문장, 검증 데이터 426 문장, 테스트 데이터 426 문장으로 데이터를 나누어 실험을 진행하였다. 실험 결과 본 연구에서 제안하는 모델은 BIO 태깅 방식의 개체 청크 단위 성능 평가 결과 98.9%의 테스트 정확도(test accuracy)와 89.4%의 f1-score를 나타냈다.

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Bi-directional LSTM-CNN-CRF를 이용한 한국어 개체명 인식 시스템 (Korean Entity Recognition System using Bi-directional LSTM-CNN-CRF)

  • 이동엽;임희석
    • 한국어정보학회:학술대회논문집
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    • 한국어정보학회 2017년도 제29회 한글및한국어정보처리학술대회
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    • pp.327-329
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    • 2017
  • 개체명 인식(Named Entity Recognition) 시스템은 문서에서 인명(PS), 지명(LC), 단체명(OG)과 같은 개체명을 가지는 단어나 어구를 해당 개체명으로 인식하는 시스템이다. 개체명 인식 시스템을 개발하기 위해 딥러닝 기반의 워드 임베딩(word embedding) 자질과 문장의 형태적 특징 및 기구축 사전(lexicon) 기반의 자질 구성 방법을 제안하고, bi-directional LSTM, CNN, CRF과 같은 모델을 이용하여 구성된 자질을 학습하는 방법을 제안한다. 실험 데이터는 2017 국어 정보시스템 경진대회에서 제공한 2016klpNER 데이터를 이용하였다. 실험은 전체 4258 문장 중 학습 데이터 3406 문장, 검증 데이터 426 문장, 테스트 데이터 426 문장으로 데이터를 나누어 실험을 진행하였다. 실험 결과 본 연구에서 제안하는 모델은 BIO 태깅 방식의 개체 청크 단위 성능 평가 결과 98.9%의 테스트 정확도(test accuracy)와 89.4%의 f1-score를 나타냈다.

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