• 제목/요약/키워드: KACC 91532

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De Novo Assembly and Comparative Analysis of the Enterococcus faecalis Genome (KACC 91532) from a Korean Neonate

  • Ham, Jun Sang;Kwak, Woori;Chang, Oun Ki;Han, Gi Sung;Jeong, Seok Geun;Seol, Kuk Hwan;Kim, Hyoun Wook;Kang, Geun Ho;Park, Beom Young;Lee, Hyun-Jeong;Kim, Jong Geun;Kim, Kyu-Won;Sung, Samsun;Lee, Taeheon;Cho, Seoae;Kim, Heebal
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권7호
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    • pp.966-973
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    • 2013
  • Using a newly constructed de novo assembly pipeline, finished genome level assembly had been conducted for the probiotic candidate strain E. faecalis KACC 91532 isolated from a stool samples of Korean neonates. Our gene prediction identified 3,061 genes in the assembled genome of the strain. Among these, nine genes were specific only for the E. faecalis KACC 91532, compared with all of the four known reference genomes (EF62, D32, V583, OG1RF). We identified genes related to phenotypic characters and detected E. faecalis KACC 91532-specific evolutionarily accelerated genes using dN/dS analysis. From these results, we found the potential risk of KACC 91532 as a useful probiotic strain and identified some candidate genetic variations that could affect the function of enzymes.

한국인 영유아 장내균총 정상화를 위한 프로바이오틱 유제품의 개발 (Development of Probiotic Dairy Product for the Normalization of Microbial Flora in Korean Infants)

  • 김민경;최아리;한기성;정석근;채현석;장애라;설국환;오미화;김동훈;함준상
    • 한국축산식품학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.290-295
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    • 2011
  • 유아의 장내 균총 정상화에 유용한 새로운 발효유제품을 개발하고자 본 실험을 수행하였다. 신생아 분변시료에서 2,200균주를 분리하고 348 균주의 16S rRNA를 분석한 결과, 유산균의 37.8%가 E. faecalis로 확인되었다. 가장 많은 유전자형을 나타낸 E. faecalis 중에서 MRS 액체배지에서 가장 생장이 우수한 E. faecalis KACC 91532를 선발하였다. 선발 유산균을 이용하여 전통식품인 타락죽을 발효하고 이화학적, 관능적 특성을 분석하였다. 타락죽의 발효시 E. faecalis KACC 91532는 $6.14{\pm}0.19$에서 $7.36{\pm}0.13$ Log CFU/mL로 증가하여, 섭취량과 E. faecalis가 건강기능식품기준 및 규격에 고시되어 있는 점을 고려시 건강기능식품으로 판매가 가능하며, 특히 유아의 장내 균 총 정상화에 기여할 수 있을 것으로 생각된다.