• 한국응용곤충학회지
• /
• 제32권1호
• /
• pp.68-75
• /
• 1993

우리나라에 발생하고 있는 벼멸구 생태형의 형태적 차이를 구명하고자 생태형 1, 2, 3의 단시형 암컷과 숫컷의 다리부분의 형태를 관찰하였다. 앞다리, 가운데 다리 그리고 뒷다리의 제3부절의 형태를 51개 부위에서 조사한 다음 통계학적 분석을 위하여 정준 판별 분석법을 도입하였다. 각 생태형간의 Mahalanobis distance는 숫컷의 경우 생태형 2와 3 사이에서 가장 짧았고, 암컷은 생태형 1과 2 사이에서 가장 길었다. Scatter plot diagram상에서 각 생태 형간 분리현상이 뚜렷하여 중심점이 각각 다르게 나타났고 각 생태형에 속하는 개체는 중심점 부근에 고르게 분포하였다. 각 생태형간의 Group membership 조사에서 암수 모두 각 생태형은 각각 동일한 생텨형을 분류되었다.

• 한국산림과학회지
• /
• 제99권2호
• /
• pp.235-243
• /
• 2010

Picea jezoensis with several infraspecific taxa is indigenous to Eastern Asia and the Far East of Russia. Although these taxa are very common, the taxonomic confusion surrounding this complex is reflected in ambiguity of the various taxonomic treatments currently used. Patterns of intraspecific variations of cone morphology and recognition of taxa within the P. jezoensis complex were investigated from 175 individuals. Morphological variation of cone characters was determined by the univariate analysis to be insignificant in separating most previously recognized infraspecific taxa in Korea, China, Russia, and Japan. Our statistical analysis showed that cones from northern populations were larger and wider than those from southern populations. Individuals from South Korea were predominantly smaller even than those from Honshu of Japan which were previously recognized as var. hondoensis. All measured characters appeared to show some clinal variation with changes in latitude, and a distinctive trend was evident. Consequently var. hondoensis, var. koreana, and var. microsperma cannot retain their infraspecific state within the P. jezoensis complex.

• Animal cells and systems
• /
• 제16권6호
• /
• pp.488-497
• /
• 2012

A DNA barcode based on 648 bp of cytochrome c oxidase I (COI) gene aims to build species-specific libraries for animal groups. However, it is hard to recover full-length (648 bp) barcode gene from environmental fecal samples due to DNA degradation. In this study, we designed a new primer set (K_Bird), which amplifies a 226 bp fragment targeted an inner position of full-length COI barcode based on 102 species of Korean birds to improve amplification success, and we attempted to identify bird species from 39 avian fecal samples collected during 4 months from Jinan, South Korea. Simultaneously, we conducted a dietary analysis using a universal DNA mini-barcode (Uni_Minibar) from same fecal samples. In silico analysis on newly designed mini-barcode represented that genetic distances were 0.5% in species and 9.1% in genera. Intraspecific variations of 149 species out of 174 species (86%) between Korea and North America were within the threshold (5.3% threshold in this study). From environmental fecal samples collected in Jinan, we identified seven avian species, which have high similarity (99-100%) with registered COI sequences in GenBank. Eight kinds of prey species, such as moth, spider, fly, and dragonfly, were identified in dietary analysis. We suppose that our strategy applying mini-barcode for environmental fecal samples, might be a useful and convenient tool for species identification and dietary analysis for birds.

• 농업생명과학연구
• /
• 제45권6호
• /
• pp.1-7
• /
• 2011

This work was performed to confirm the molecular discrimination through the nrITS1 sequences among 3 taxa of Scirpus L. sensu lato (s.l.) species. S. planiculmis represented only 2 base sequence variations with S. maritimus in spite that they showed different morphological features. The nucleotide sequences of the ITS1 region from S. planiculmis were shown to have 99.1% homology with S. maritimus and 60.4% homology with S. triqueter. Although the morphology of S. planiculmis is similar with S. triqueter, molecular basis of the size and sequences on ITS1 region were shown to have distinctive differences. For divergency investigation on same sites and metapopulation, sequencing was conducted on ITS1 region with partial 5.8S and 18S regions. All plants of each species collected at the same site had identical band size pattern and sequences. Intraspecific molecular divergency was not identified in spite that these species live in different wetland sites. The ITS1 sequences described here provided a powerful genetic tool for phylogenetic studies which was difficult by morphological identification as high rate of morphological plasticity.

• Animal cells and systems
• /
• 제4권4호
• /
• pp.319-324
• /
• 2000

Species boundaries among the Alcyonacean soft coral, the genus Dendronephthya, are often obscured by inter- and intraspecific morphological variations. In the present study, we attempted to infer the genetic relationships of eight dendronephthians based on their molecular characters, the internal transcribed spacer (ITS) regions of ribosomal DNA, and then compared this result together with the random amplified polymorphic DNA (RAPD) data from our previous investigation. Dendronephthya. putteri and D. suensoni formed a divaricate form - VI grade specific clade, whereas D. castanea, D. gigantea, D. aurea and D. spinifera, formed a umbellate and glomerate form - IV and III grade specific clade. Therefore, we confirmed that the main characters the growth form and the anthocodial grade and formula, are important in identification of the species in dendronephthians despite some problems. Also, the relationships of the growth form are clarified as the glomerate form is much closer to the umbellate form than to the divaricate form based on two sets of independent molecular data. However, we cannot determine the molecular markers which limit the species boundaries among this genus with ITS sequences.

• 생명과학회지
• /
• 제12권6호
• /
• pp.821-834
• /
• 2002

알렉산드륨 적조생물의 리보소옴 알엔에이 유전자의 ITS1, 2 및 5.8S부위를 대상으로 종간 혹은 종내의 유전적 다양도를 조사하기 위하여 지리적으로 격리된 33 스트레인 유전자의 염기서열를 비교했다. 진해만에서 분리된 AT-2, AT-6, AT-10, AT-A, AT-B 5클론은 일본종 OFX151-A과 동일한 유전자임을 발견했다. ITS부위에서 가장 짧은 종은 A. margalefi로 481 bp이며 가장 긴 종은 A. affine으로 528 bp로 나타났다. ITS1과 ITS2 염기서열에 대한 상호관계는 역으로 나타낸 반면에, G＋C 함량에 대한 상호관계는 플러스로 나타났다. 유전적 변이율은 0.3% (1 bp)에서 53% (305 bp)였다. A. tamarense과 가장 적게 유전적 변이율을 보인 종은 A. fundyense(1.2-2.3% ＝ 6-12 bp)인 반면에, A. catenella와는 큰 변이율 (19.8% ＝ 102 bp)을 보였고, A. catenella와 A. fundyense은 19.7% 상이하였다. 알렉산드륨 적조생물의 bootstrap은 약하게 지지되는 데도 불구하고, A. catenella 분리종은 독립적인 그룹으로 형성하여 상호간에는 강력한 bootstrap 값은 PAUP과 NJ 분석에서 보였다. A. cohorticula와 A. frateculus 적조생물은 항상 sub-group 내에서 높은 bootstrap을 가졌다. 결론적으로 ITS부위의 염기서열 분석은 알렉산드륨 적조생물의 집단내 혹은 집단간의 계통분류을 밝히는데 유용한 것으로 보였다.

• 한국양식학회지
• /
• 제19권4호
• /
• pp.281-287
• /
• 2006

우리나라 주요 담수어종인 미꾸라지(Misgurnus mizolepis)를 어류 염색체 조작 모델로 개발하기 위한 연구의 일환으로 동일 종내 웅성발생성 이배체 유도 조건을 개발하고 유도된 웅성발생성 이배체의 생존능력을 평가하였다. 자외선(UV; $10,800\;ergs/mm^2$)을 이용하여 난자의 유전물질을 불활성화시키고 인공수정 28분 후(제1난할 중기)에 온도처리(고온 자극 $40.5\;^{\circ}C$ 120초 후 저온 자극 $1\;^{\circ}C$ 45분)를 통해 제1난할을 억제하였다. 본 온도처리를 통해 생존력 있는 웅성발생성 이배체들이 유도되었고(평균 부화율, 26.9%), 부화 후 1주일째를 기준으로 평균 웅성발생성 이배체 수율은 최초 처리난의 7%내외로 나타났다. 그러나 웅성발생성 이배체 유도 효율은 cytoplasmic donor의 질에 크게 영향을 받음이 관찰되어 사용한 암컷 친어별로 큰 편차가 관찰되었다. Flow cytometry 분석에 의해 생존력 있는 웅성발생성 개체들의 이배체 복원이 확인되었으며 아울러 형질전환 표지를 이용하여 동형접합성 개체 유도의 가능성이 확인되었다. 웅성발생성 이배체들은 일반대조군 이배체에 비해 낮은 생존능력을 보였으며 특히 부화 후 1개월까지 유의적으로 낮은 생존율을 나타내었다. 그러나 후기 생존능력은 일반 이배체군과 유사하였다.

• 환경생물
• /
• 제32권4호
• /
• pp.353-362
• /
• 2014

이번 연구는 한국산 지충이 [Sargassum thunbergii (Mertens ex Roth) Kuntze]의 지리적 형태변이를 확인하고, 형태변이에 따른 품종의 구분에 대하여 분류학적 재검토를 시도하였다. 동해, 서해와 남해안에 분포하는 지충이 개체군의 지리적 형태변이를 조사하기 위해서 개체가 가장 성숙한 시기인 봄철에 채집하였다. 지충이의 관찰대상 형질은 부착기, 줄기의 길이와 직경, 체장, 중심가지의 직경, 마디간격, 측지의 길이와 직경, 잎의 길이와 폭 및 두께, 기낭의 길이와 직경, 기낭 자루와 기낭 돌기의 길이, 생식기탁의 길이와 직경, 질감이었다. 서해안의 지충이는 엽체가 짧고 가늘며, 마디간격이 넓어서 성긴 느낌이고 질감이 부드러워 다른 두 해역의 지충이와는 다른 형태적 특징을 보였다. 동해안의 지충이는 체장이 서해안의 것과 비슷하지만 중심가지와 측지가 굵어서 질감이 거칠고, 측지가 없거나 매우 짧은 것도 있으며, 잎과 기낭이 다른 해역에 비해 컸다. 남해안의 지충이는 체장과 측지가 가장 길고 잎과 기낭이 짧은 것이 특징이었다. 동해안 북부에서 채집된 개체들은 f. latifolium과 형질이 유사하였다. 그러나 다른 해역에서는 네 품종의 원기재와 정확히 일치하지 않아 품종을 구분하는 식별형질은 한국산 지충이의 형태 변이에 적용할 수 없었다. 따라서 생육지에 따라 나타나는 지충이의 다양한 형태변이는 종 이하의 분류군으로 나누는 것보다는 생육지 환경조건에 따른 변이체로 보는 것이 타당할 것으로 사료된다.

• 한국작물학회:학술대회논문집
• /
• 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
• /
• pp.306-306
• /
• 2017

Screening for drought and salinity tolerance was undertaken for selected Philippine upland rice landraces during germinative and seedling stages to identify varieties which can potentially be grown in marginally dry and saline soils. While increasing PEG and NaCl concentrations caused obvious signs of injury to all rice genotypes, considerable varietal differences were noted in the nature of responses providing evidence that these genotypes possess broad intraspecific genetic variations for drought and salt tolerance. Inconsistent responses of these varieties during both growth stages highlight complexities involved in stress responses and underscore the futility of utilizing a single stage in the rice plant's life cycle for physiological screening. Notwithstanding these perplexing responses, G_Katiil and Ml-Pilit Tapul were observed to thrive relatively well despite increased salt and drought stress during early growth stages and may therefore possess genes needed in crop improvement efforts for drought and salinity tolerance. While these results do not reflect the entire spectrum of adaptive expression to drought and salinity stress during the life cycle of the upland rice plant, they nonetheless provide an easy, reliable and reproducible method for preliminary identification of drought and salt tolerant rice varieties.

• 한국잡초학회지
• /
• 제18권1호
• /
• pp.76-83
• /
• 1998

피속 잡초 수집종 33종을 대상으로 RAPD marker를 이용하여 피 수집종 간의 유전적변이를 알아보고, 수집종들을 판별할 수 있는 DNA marker를 선발하기 위하여 본 실험을 수행한 결과를 요약하면 다음과 같다. Operon사에서 제작된 74개의 10-mer RAPD primer 가운데에서 명확한 다형성을 보이는 6개 primer를 선발하였다. 이들 primer로 PCR에서 증폭된 밴드는 31개이었으며 이 가운데 다형성을 나타내는 band는 26개(83.9%)로 나타났다. 피 수집종 간의 유연 관계를 분석한 결과 공시된 피 수집종은 크게 3그룹으로 분류할 수 있었다.