• 제목/요약/키워드: Influenza virus A

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부산지역에서 유행한 계절인플루엔자바이러스의 유전자 특성 및 계통분석('06-'08 절기) (Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of Season Influenza Virus Isolated in Busan during the 2006-2008 Seasons)

  • 박연경;김남호;최성화;민상기;이미옥;김성준;조경순;나영란
    • 생명과학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.365-373
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    • 2010
  • 2006년 10월부터 2008 년 6월까지 총 인플루엔자 의사 환자 1,822건의 인후도찰물 및 비인후도찰물에서 277건의 인플루엔자바이러스를 분리했다. 절기별로는 2006~2007 절기의 1,154검체 중 52건(4.5%), 2007~2008절기의 668검체 중 210건(31.4%)에서 인플루엔자바이러스를 분리하였다. 인플루엔자바이러스 A/H1N1의 HA 유전자의 경우, 2008~2009 절기의 백신주인 A/Brisbane/59/2007과는 96.7%~97.7%, A/Solomon Islands/3/2006 96.5%~97.3%, A/New Caledonia/20/99와는 95.6%~96.6%의 유사성을 나타냈으며, NA 유전자의 경우, A/Brisbane/59/2007과는 97.8%~98.5%, A/Solomon Islands/3/2006과는 96.7%~97.6%, A/New Caledonia/20/99와는 96.8%~97.7%의 유사성을 보여 2008~2009절기의 백신주인 A/Brisbane/59/07과 가장 유사성이 컸다. 인플루엔자바이러스 A/H3N2의 분리주 중 1주를 제외한 모든 분리주가 HA 유전자에서 2008~2009 절기 백신주인 A/Brisbane/10/2007과는 98.4%~99.7%의 유사성을 보였고, A/Wisconsin/67/2005와는 96.5%~97.5%의 유사성을 보였으며, NA 유전자에서는 A/Brisbane/10/2007과는 98.9%~99.4%, A/Wisconsin/67/2005와는 98.0%~98.6%, A/California/7/2004와는 98.3%~98.9%의 유사성을 보였다. 인플루엔자바이러스 B의 HA 유전자의 경우는 2주를 제외하고는 2008~2009 절기의 백신주인 B/Florida/4/2006과는 96.5%~99.7%의 유사성을 보였으며, B/Malaysia/2506/2004와는 86.7%~87.7%의 유사성을 보여 B/Florida/4/2006과의 유사성이 크게 나타났다. NA 유전자의 경우는 reassortant분리주가 96.7%와 97.3%의 유사성을 나타내는 것을 제외하고는 B/Florida/4/2006에 98.9%~100%의 유사성을 나타냈으며, 분리주 유행시기의 백신주인 B/Malaysia/2506/2004와는 94.5%~96.7%의 유사성을 나타내어 2008~2009 절기의 백신주와 더 큰 유사성을 보였다. HA 유전자에서는 conserverd receptor binding site는 아미노산의 치환 없이 모든 분리주에서 잘 보존되어 있었으며, N-linked glycosylation site도 인플루엔자바이러스 A/H1 1주, A/H3 1주를 제외하고는 모두 같은 수의 N-linked glycosylation sites를 가졌으며, 인플루엔자바이러스 B의 경우는 2008~2009 절기의 백신주보다 1개가 많은 4개의 N-linked glycosylation sites를 가지고 있었다. Antigenic sites의 경우는 인플루엔자바이러스 A/H1의 Sb의 3개의 아미노산에서 백신주들과 다른 아미노산을 가지고 있으며, A/H3에서는 A, B, E 부위에서 는 아미노산의 변화가 나타났고, C, D 부위에서는 변화가 없었다. 인플루엔자바이러스 B의 4개의 분리주에서는 150 loop와 160 loop에서 B/Florida/4/2006과 비교하여 1개의 아미노산에서 치환이 나타났으며, 190 helix에서 모든 분리주가 B/Florida/4/2006과 비교하여 1개의 아미노산에서 치환이 나타났다.

제주지역 돼지에서 증식성 괴사성 폐렴의 원인체 검출 (Detection of etiological agents of proliferative and necrotizing pneumonia in pigs in Jeju)

  • 김재훈;정지열;양형석;김재훈
    • 한국동물위생학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.63-69
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    • 2022
  • Proliferative and necrotizing pneumonia (PNP) is a form of interstitial pneumonia that occurs in post-weaning pigs. In this study, we investigated the presence of swine influenza virus (SIV), porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV), porcine circovirus type 2 (PCV2) and Aujeszky's disease virus (ADV) in PNP lesions in Jeju pigs. Based on the histopathologic criteria for PNP, a total of 50 cases were selected in Jeju pigs between 2008 and 2010. Coupled with histopathological examinations, the presence of ADV and SIV by polymerase chain reaction (PCR) and reverse transcription PCR (RT-PCR) and PRRSV and PCV2 by immunohistochemical (IHC) methods were investigated. Based on the PCR and RT-PCR methods, ADV and SIV nucleic acids were not detected in all cases. According to IHC, PRRSV was detected in 38 of the 50 cases examined (76%) and PCV2 in 25 cases (50%). PRRSV or PCV2 were detected in 19 (38%) or 6 (12%) cases, respectively. Both PRRSV and PCV2 were identified in other 19 cases (38%). Antigens of PRRSV and PCV2 were commonly observed in the cytoplasm of macrophages and clusters of necrotic cells in alveolar cavities. The results of the present study demonstrate that PRRSV is predominantly associated with PNP in Jeju pigs. Co-infection with PRRSV and PCV2 may enhance the severity of PNP lesions in affected pigs.

부산지역 호흡기감염증 환자로부터 분리한 아데노바이러스와 보카바이러스의 유행양상 분석 (Epidemiological Characterization of Adenovirus and Human Bocavirus Detected Acute Respiratory Patients in Busan)

  • 황수정;김남호;박동주;구평태;이미옥;진성현
    • 생명과학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.275-282
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    • 2017
  • 부산지역 급성호흡기감염증으로 내원한 환자에서 호흡기바이러스 검사를 시행하여 아데노바이러스 및 보카바이러스의 특징적인 임상증상 및 유행양상을 알아보고자 하였다. 3,230명의 환자에서 총 1,485건(46.0%)의 호흡기바이러스가 검출되었고 이 중 아데노바이러스 257건(8.0%), 보카바이러스 68건(2.1%)을 확인하였다. 성별 발생양상은 남자가 여자보다 아데노바이러스, 보카바이러스로 인한 호흡기감염증에 취약하였으며, 모두 1~5세 연령군에서 높은 검출률을 보여 영 유아의 주요 감염요인임을 확인할 수 있었다. 주요 임상증상으로 아데노바이러스는 발열, 두통이 보카바이러스는 천명음이 통계적으로 유의하였다. 아형분석결과, 아데노바이러스는 1~6, 8형의 혈청형을 확인하였고 기존 분리주와 97% 이상의 상동성을 보였다. 연도별 유행 혈청형은 2011년 아데노바이러스 1형, 2012년 3형과 4형, 2013년에는 3형이 우점적으로 유행하였다. 아데노바이러스 3형의 경우, 대유행을 유발하는 아형으로 보인다. 보카바이러스는 모두 1형으로 나타났다.

서울의 2008-2009년 가을, 겨울철에 유행한 소아의 하기도 호흡기 바이러스 병원체의 규명 (Identification of Viral Pathogens for Lower Respiratory Tract Infection in Children at Seoul During Autumn and Winter Seasons of the Year of 2008-2009)

  • 김기환;김지홍;김경효;강춘;김기순;정향민;김동수
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제17권1호
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    • pp.49-55
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    • 2010
  • 목 적 : 서울 지역의 급성 호흡기 감염의 원인이 되는 바이러스를 분석하고 임상적 특징과 비교, 분석하였다. 방 법: 2008년 9월부터 2009년 3월까지 3개 대학병원에 입원한 5세 미만의 소아의 급성하기도감염환자에서 418개의 비인두흡입검체를 채취하여, 14종 바이러스를 multiplex PCR을 통한 진단하였다. 바이러스 양성환자의 임상정보를 병원별, 시기별로 분석하였다. 결 과: 418명이 분석되었고, 연령은 평균 16.4개월, 성별비는 1.36대 1이었다. 환자들 중 56.2%에서 바이러스 양성을 보였고, RSV (35%)가 가장 많이 검출된 바이러스였으며, 다음은 hRV (22%)였으며, HBoV, ADV, hMPV, PIV1, IFV, hCoV, PIV2, PIV3가 검출되었다. 양성검체 중 21.9%에서 동시감염이 있었다. 결 론:바이러스의 지역별, 시기별 지속적인 감시가 필요하며, 급성호흡기질환을 보이는 소아의 진료에, 유행하는 바이러스의 특징을 고려해야 할 것이다.

닭에서 저병원성 조류인플루엔자와 뉴캐슬 바이러스의 복합감염에 따른 임상적, 병리학적 연구 (Clinical and pathological studies on co-infection of lowpathogenic avian influenza virus and Newcastle disease virus in the chicken)

  • 이성민;조은상;최보현;손화영
    • 한국동물위생학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.163-169
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    • 2013
  • Both of avian influenza (AI) and Newcastle disease (ND) can cause mild to severe diease in poultry. In this study, clinical signs, macro, and micro lesions were studied. Eighteen six-week-old SPF chicks were divided into 4 groups (E1, E2, E3 and C1) and housed in different rooms of the isolation facility at CAVAC (Daejeon, Korea). The control group (C1) of 3 chicks was housed separately as uninoculated. Experimental groups (E1, E2 and E3) challenged with H9N2 and/or NDV. E1 group was challenged with 0.1 mL A/Kr/Ck/01310/01 (H9N2) $10^{5.6}$ $EID_{50}$ by intranasal, E2 group was challenged with 0.5 mL Kyojeongwon (KJW) $10^{5.0}{\sim}10^{6.0}$ $ELD_{50}$ by intramuscular, and E3 group was challenged with 0.1 mL A/Kr/Ck/01310/01 $10^{5.6}$ $EID_{50}$ by intranasal and 0.5 mL KJW $10^{5.0}{\sim}10^{6.0}$ $ELD_{50}$ by intramuscular 7 days after H9N2 challenge. In clinical signs and gross findings, E1 group showed 0% mortality, anorexia, and hemorrhage of proventriculus and thymus, E2 group showed 100% mortality within 3~5 days after challenge, anorexia, green diarrhea, hemorrhage of proventriculus, proximal esophagus and thymus, enlargement of kidney, and bronze liver, and E3 group showed 100% mortality within 24~36 hours after NDV challenge, depression, anorexia, green diarrhea, hemorrhage of proventriculus, spleen, and lung, enlargement of kidney, and reduction of thymus size and number. In histopathological examination, E1 group showed depletion and necrosis in bursa of Fabricius, thymus, and spleen, and E2 and E3 group showed severe lymphocyte depletion and necrosis with destruction of lymphoid organ structures. In conclusion, co-infection of H9N2 with ND virus causes acute disease with high mortality than single infection and the pathologic lesions were more severe.

The Adjuvant Effect of Sophy ${\beta}$-Glucan to the Antibody Response in Poultry Immunized by the Avian Influenza A H5N1 and H5N2 Vaccines

  • Le, Thanh Hoa;Le, Tran Binh;Doan, Thanh Huong Thi;Quyen, Dong Van;Le, Kim XuyenThi;Pham, Viet Cuong;Nagataki, Mitsuru;Nomura, Haruka;Ikeue, Yasunori;Watanabe, Yoshiya;Agatsuma, Takeshi
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제21권4호
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    • pp.405-411
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    • 2011
  • Avian influenza virus vaccines produced in oil-emulsified inactivated form with antigen content of at least 160 hemagglutinin units (HAU) induced immunity in birds. However, in addition to enhancing the effect of the adjuvant(s), other additional supplemented biological compounds included in inactivated vaccines could produce higher levels of antibody. We examined in chickens, Vietnamese ducks, and muscovy ducks the adjuvant effect of Sophy ${\beta}$-glucan (SBG), a ${\beta}$-1,3-1,6 glucan produced by the black yeast Aureobasidium pollulans strain AF0-202, when administered with an avian influenza H5 subtype vaccine. In Experiment 1, 40 chickens (ISA Brown hybrid), allocated to four groups of ten each, were immunized with Oil-H5N1(VN), Oil-H5N1(CN), Oil-H5N2(CN), and saline (control group), respectively. In Experiment 2, chickens (ISA Brown hybrid), muscovy ducks (French hybrid), and Vietnamese ducks (indigenous Vietnamese) were used to further assess the effect of SBG on immunogenicity of the Oil-H5N1(VN) Vietnamese vaccine. ELISA and hemagglutination inhibition (HI) assays were used to assess the antibody response. The H5 subtype vaccines initiated significantly higher immune responses in the animals dosed with SBG, with 1.0-1.5 $log_2$ higher HI titers and 10-20% ELISA seroconversion, compared with those not dosed with ${\beta}$-glucan. Notably, some of the animals dosed with SBG induced HI titers higher than 9.0 $log_2$ following boosting immunization. Taken together, our serial studies indicated that SBG is a potential effector, such as enhancing the immune response to the H5 vaccines tested.

Novel influenza A (H1N1) 2009 infection in the pediatric patients with hematologic and oncologic diseases in the Yeungnam region in Korea

  • Kang, Seok-Jeong;Lee, Jae-Min;Hah, Jeong-Ok;Shim, Ye-Jee;Lee, Kun-Soo;Shin, Hyun-Jung;Kim, Heung-Sik;Choi, Eun-Jin;Jeon, So-Eun;Lim, Young-Tak;Park, Ji-Kyeong;Park, Eun-Sil
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제54권3호
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    • pp.117-122
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    • 2011
  • Purpose: Natural history and consequences of the novel 2009 influenza A H1N1(2009 H1N1) infection in immunocompromised pediatric patients are not yet fully understood. In this study, we investigated the clinical features and outcomes of the 2009 H1N1 infection in pediatric patients with hematological and oncological diseases. Methods: We retrospectively reviewed the medical records of 528 patients who had hematological and oncological diseases and who were treated at 7 referral centers located in the Yeungnam region. Among the 528 patients, 27 with definite diagnosis of 2009 H1N1 infection were the subjects of this study. All patients were divided into the following 3 groups: patients who were receiving chemotherapy (group 1), patients who were immunosuppressed due to a nonmalignant hematological disease (group 2), and patients who were off chemotherapy and had undergone their last chemotherapy course within 2 years from the influenza A pandemic (group 3). Results: All 28 episodes of 2009 H1N1 infection were treated with the antiviral agent oseltamivir ($Tamiflu^{(R)}$), and 20 episodes were treated after hospitalization. Group 1 patients had higher frequencies of lower respiratory tract infection and longer durations of fever and hospitalization as compared to those in group 2. Ultimately, all episodes resolved completely with no complications. Conclusion: These results suggest that early antiviral therapy did not influence the morbidity or mortality of pediatric patients with hematological and oncological diseases in the Yeungnam region of Korea after the 2009 H1N1 infection. However, no definite conclusions can be drawn because of the small sample size.

DNA 교차 오염 방지 기능을 가진 돼지 인플루엔자바이러스 감별진단용 one-step multiplex RT-PCR 진단법 (One step multiplex RT-PCR preventing DNA carryover contamination for differential diagnosis of swine influenza viruses)

  • 김희정;김은미;신연경;송재영;김성희;이경기;이명헌;김영화;박준철;여상건;박최규
    • 한국동물위생학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.263-271
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    • 2014
  • In this study, we developed a cost and time saving one-step multiplex RT-PCR for the simultaneous detection and differentiation of swine influenza viruses (SIV) and 2009 pandemic influenza H1N1 virus (pH1N1). The one-step multiplex RT-PCR using four sets of primer was confirmed to be capable of detection of all SIV subtypes and differential diagnosis of major SIV subtype H1, H3 and pH1N1 on individual or mixed viral culture samples. The sensitivity of the multiplex RT-PCR was determined to be at least $2^{-6}$ $HA/25{\mu}L$ of the presented SIVs, providing sufficient efficacy for a routine SIV monitoring in diagnostic laboratories. In addition, compared with the conventional RT-PCR methods that cannot avoid the carryover DNA contamination, the developed RT-PCR applied with the uracil DNA glycosylase (UNG) system was proven to prevent a false positive reaction by carryover contamination of the pre-amplified DNA. In conclusion, the one-step RT-PCR with UNG system could be applicable to detect and differentiate of SIV from the viral cultures without worry of carryover DNA contamination in clinical laboratories.

소아 급성 바이러스성 하기도 감염의 유행 및 임상양상 (1998년 9월-2003년 5월) (Epidemiology and Clincal Analysis of Acute Viral Respiratory Tract Infections in Children(September, 1998-May, 2003))

  • 이수진;신언우;박은영;오필수;김광남;윤혜선;이규만
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제48권3호
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    • pp.266-275
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    • 2005
  • 목 적 : 바이러스는 소아 하기도 감염증의 가장 흔한 원인으로 소아에서 흔히 이환되어 모세기관지염, 폐렴, 크룹, 기관 기관지염 등의 하기도 감염을 일으키는 원인 바이러스들로서 이들의 유행 시기 및 임상 양상을 조사하여 각 질환의 특성을 알아 보고자 하였다. 방 법 : 1998년 9월부터 2003년 5월까지 한림대학교 한강성심병원과 강남성심병원 소아과에 급성 호흡기 감염증으로 입원했던 환아 10,630명 중 총 4,554례에서 비인두 흡인물을 채취하여 바이러스 배양 및 단일 클론 항체를 이용한 면역 형광 검사법으로 881례(19%)에서 호흡기바이러스가 분리되었다. 그 중 모세기관지염, 폐렴, 크룹, 기관 기관지염 등의 급성 하기도 감염증으로 진단 받은 837례의 의무기록을 후향적으로 고찰하였다. 결 과 : 1) RSV가 485례(55%)로 가장 많았고, PIV 152례(17%), FluA 114례(13%), ADV 79례(9%), FluB 51례(6%) 순이었다. 2) 발생시기는 RSV의 경우 연중 발생하였고, 주로 11-12월에 많았다. PIV 매년 4-6월에 최고치를 이루었고, FluA는 매년 11-12월부터 다음해 1월까지 발생하였으나, 2002년 1월과 11월에 가장 많았다. FluB는 매년 3-4월에 유행하였고, 그 중 2002년 4월에 최고치를 이루었다. ADV는 연중 비슷하게 발생하였다. 3) 남녀 성별 비는 3 : 2로 남아가 더 많았고, 중앙연령은 9개월이었다. 4) 임상적 진단에는 세기관지염 395례(47%), 폐렴 305례(36%), 크룹73례(9%), 기관 기관지염 64례(8%)의 순이었고, RSV의 경우 세기관지염이 280례(60%)였다. 5) 임상증상 및 징후에는 각 바이러스 모두 기침(96%), 가래(83%), 비루(65%), 발열(61%)이 많았고, ADV는 설사(23%)가 다른 바이러스에 비해 많았다. 6) 청진 소견으로 천명음이 들렸던 경우는 RSV가 55%로 많았고, 수포음은RSV(47%), ADV(43%), FluA(40%) 순이었다. 건성수포음은 FluB가 49%로 많았으며, 협착음은 PIV가 27%로 높았다. 7) 말초 혈액 백혈구 수는 전체 62%에서 정상이었고, 36%에서 증가하였다. 적혈구 침강 속도는 30%에서 증가하였고, C 반응 단백은 20%에서 양성이었다. 8) 방사선 소견은 고찰이 가능하였던 803례 중 각 바이러스 모두 정상 소견이 557례(69%)로 가장 많았고, 특징적으로 하인두 확장은 PIV에서 31례(21%)로 현저하게 많았다. 결 론 : 소아에서 급성 하기도 감염증의 중요한 원인을 차지하는 호흡기 바이러스는 각각 발생시기 및 유행 양상에서 차이를 보였으나, 임상 양상은 서로 비슷하였고, 배양검사 결과가 확인되기 이전에 정확한 원인 바이러스를 예측하고 규명하기에는 어려운 점이 있었다. 이에 질병을 예측할 수 있는 신속한 진단법들이 개발되어 항바이러스제제를 적절한 시기에 선택하고 또한 예방접종시기를 예측하는데 도움이 되어야겠다.

Prevalence of Canine Influenza Infection in Pet Dogs and Canine Parvovirus Infection in Street Dogs of Bangladesh

  • Hassan, Md. Kumrul;Nahat, Faizul Wasima;Bhattacharjee, Palash Kumar;Rahman, Md. Siddiqur;Rahman, A.K.M. Anisur;Islam, Md. Ariful;Akter, Mahmuda;Chae, Joon-Seok
    • 한국임상수의학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.165-171
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    • 2017
  • A cross-sectional study was conducted to investigate the prevalence of canine influenza (CI) infection in pet dogs and canine parvovirus (CPV) infection in street dogs of different age and sex by collecting rectal and nasal swab samples from three districts, Dhaka, Mymensingh and Sirajgonj, in Bangladesh using a RapiGEN$^{(R)}$ Canine Influenza Virus Ag Test kit and RapiGEN$^{(R)}$ Canine Parvovirus Ag Test Kit. Out of 114 rectal swabs and 115 nasal swab samples, the overall prevalence of CI and CPV was found to be 11.30% and 32.45%, respectively. The prevalence of parvovirus infection was found to be significantly higher in puppies and dogs 6 months of age (50.0%) than those > 24 months of age (p = 0.005). The prevalence was also higher in males (34.42%) than females (30.18%). The prevalence of CI was higher (30.43%) in dogs up to 6 months of age (p = 0.011) than 6-12 month (7.93%) and 12-18 month (6.66%) old dogs. Moreover, the prevalence of CI was found to be higher in males (16.10%) than females (5.66%). The prevalence of CPV infection also varied significantly in different study areas (p = 0.0029), with 12.72%, 12.5% and 7.14% of dogs found to be CI positive in Dhaka, Mymensingh and Sirajgonj, respectively. Overall, the highest prevalence of CI was found in local breeds (6.08%) followed by German shepherds and Keeshonds (1.73%), and Bloodhounds and Terriers (0.86%). Additionally, there were more positive CI found in unvaccinated dogs (14.81%) than vaccinated (2.94%) dogs. Dogs with flu-like symptoms were more positive (19.23%) for CI relative to those without flu-like symptoms (4.76%) samples. Overall, the results of this study indicate that canine vaccination should be initiated to prevent the occurrence of diseases and that regular monitoring should be continued in Bangladesh.