• 한국환경생태학회지
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• 제29권4호
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• pp.599-604
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• 2015

본 연구에서는 서울시 도시 숲에 속해 있는 불암산, 대모산, 봉화산 3개 산을 대상으로 군집분석을 하였다. 불암산 군집분석 결과 소나무(Pinus densiflora)-신갈나무(Quercus mongolica), 서어나무(Carpinus laxiflora)-리기다소나무(Pinus rigida), 굴참나무(Quercus variabilis)-팥배나무(Sorbus alnifolia)로 나왔으며 대모산의 군집은 리기다소나무-일본잎깔나무(Larix leptolepis), 현사시나무(Populus tomentiglandulosa)-물박달나무(Betula davurica Pall)로 구분되었다. 봉화산의 군집분석 결과 소나무-팥배나무와 상수리나무(Quercus acutissima)-벚나무(Prunus serrulata)로 구분되었다. 불암산, 대모산, 봉화산의 지역별 유사도에서는 불암산과 대모산의 유사도 지수가 0.634로 높게 나와 비슷한 식생들이 분포하고 있으며 다른 지역보다 대모산 지역의 우점도가 0.166으로 다수의 종이 우점한다. 또한 종다양도 분석결과 대모산이 가장 안정된 상태를 이루고 있으며 종다양도, 최대종다양도, 균재도는 불암산, 봉화산, 대모산 지역으로 갈수록 높아지고 우점도는 불암산, 봉화산, 대모산 지역으로 갈수록 낮아진다.

• 한국과학교육학회지
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• 제36권3호
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• pp.509-517
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• 2016

학생들의 진화에 대한 대안개념(목적론, 용불용설 등)이 과학사에서 나타나는 설명의 발전 형태와 유사하다는 연구는 있었다. 하지만 과학사적으로 설명의 발달과정을 반영하여 부분점수를 주는 평가방식은 활용되지 않았다. 이 연구의 목적은 창조론에서 자연선택까지 과학사적 발달과정을 반영하여 부분점수를 주는 방법을 제안하고 이 방법이 타당한지에 대한 양적인 증거를 수집하는 것이다. 이 연구는 과학사에 근거하여 진화개념검사도구의 학생응답을 순위선다형점수로 변환하고 부분채점모형의 라쉬모델분석을 포함한 통계적 방법으로 새로운 평가방식이 타당한지 확인하였다. 또한 개념발달이 인간, 동물, 문항의 상황에 따라 다른지 확인하였다. Ha(2007)가 개발한 검사도구를 활용하여 1711명의 초, 중, 고등학생과 비전공, 전공생물 교사를 대상으로 생성한 자료를 통하여 분석하였다. 창조론, 목적, 의도, 용불용설, 자연선택에 0점에서 4점씩 부분점수로 제시한 평가방법은 Cronbach alpha를 통한 내적일관성 신뢰도, 라쉬분석의 MNSQ값 등 통한 문항적합도를 확인한 결과 타당한 것으로 확인되었다. 초등학생과 중학생들의 개념수준은 의도에서 용불용설 단계에, 고등학생부터 용불용설 이후의 단계로 개념발달이 이루어지고 있었다. 진화설명의 발달 과정은 인간, 동물, 식물에 따라 차이가 나타남을 확인할 수 있었다. 이 연구는 과학사와 학생들의 개념발달이 유사하다는 기존의 주장에 새로운 양적증거를 추가하고, 진화개념 평가를 위한 새로운 분석방법을 제안한다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제35권11호
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• pp.3181-3187
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• 2014

A series of 3,4-dihydroquinazoline derivatives with anti-cancer activities against human colon cancer HT-29 cell were subjected to three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) studies using the comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) approaches. The most potent compound, BK10001 was used to align the molecules. As a result, the best prediction was obtained with CoMSIA combined electrostatic, hydrophobic, and hydrogen-bond acceptor fields ($q^2=0.648$, $r^2=0.882$). This model was validated by an external test set of six compounds giving satisfactory predictive $r^2$ values of 0.879. This model would guide the design of potent 3,4-dihydroquinazoline derivatives as anti-cancer agent for the treatment of human colon cancer.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권4호
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• pp.453-457
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• 2005

The genetic variations in three major river populations viz. the Halda, the Jamuna and the Padma of the Indian major carp, Catla catla were analyzed by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers. Four decamer primers were used for amplifying DNA of 10 individuals from each population. The proportion of polymorphic loci and the gene diversity estimates were 59.4 and 0.20 for the Halda, 37.5 and 0.14 for the Jamuna and 46.9 and 0.16 for the Padma populations respectively indicating the existence of a relatively high level of genetic variation in the Halda river population. The inter-population similarity indices, gene flow and genetic distance values indicated that the Jamuna-Padma population pair of catla was genetically closer than the Halda-Jamuna and the Halda-Padma population pairs in compliance with the geographical distances among them. The coefficient of gene differentiation ($G_{ST}$=0.13) reflects some degree of genetic differentiation among three populations of catla studied. The data suggest that the RAPD technique could be used to discriminate different river populations of catla.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제32권2호
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• pp.645-650
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• 2011

The 3D-QSAR study of 2-arylbenzoxazoles as novel cholesteryl ester transfer protein inhibitors was performed by comparative molecular field analysis (CoMFA), CoMFA region focusing (CoMFA-RF) for optimizing the region for the final PLS analysis, and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) methods to determine the factors required for the activity of these compounds. The best orientation was searched by all-orientation search strategy using AOS, to minimize the effect of the initial orientation of the structures. The predictive ability of CoMFARF and CoMSIA were determined using a test set of twelve compounds giving predictive correlation coefficients of 0.886, and 0.754 respectively indicating good predictive power. Further, the robustness and sensitivity to chance correlation of the models were verified by bootstrapping and progressive scrambling analyses respectively. Based upon the information derived from CoMFA(RF) and CoMSIA, identified some key features that may be used to design new inhibitors for cholesteryl ester transfer protein.

• 대한기계학회논문집A
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• 제35권7호
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• pp.729-736
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• 2011

TOPSIS(Technique for Order Preference by Similarity to Ideal Solution)는 상충되는 다수의 속성이 존재하는 상황에서 의사결정이 요구되는 다속성 의사결정법(Multi Attribute Decision Making) 중 하나이다. 이는 선택된 대체안이 최선의 이상적 대체안으로부터 가장 가까운 거리에 위치해야 하고, 동시에 부정적으로 이상적인 대체안으로부터는 가장 멀리 위치해야 한다는 논리에 입각한 의사결정 기법이다. TOPSIS 는 최소화와 최대화가 공존하는 다목적함수 형상 최적설계에 적용이 가능하다. 본 연구에서는 TOPSIS 와 베지어 곡선(Rational Bezier Curve)을 적용하여 CRT(Cathode Ray Tubes) 후면유리의 다중목적 형상최적설계를 수행하였다. 무게와 1 차 주응력의 두 가지 다중목적 함수를 최적화하기 위하여, 다중목적 함수의 성능지표를 TOPSIS 의 상대적 근접도로 정의하고 이를 반응표면모델로 구성하여 다중목적 형상최적설계가 가능한 방법론을 제안하였다. 이를 통해 하나의 최적해가 아닌 최적해의 군이 선정되어, 무게와 주응력 최적해의 모순관계를 확인하면서 다양한 설계요구 스펙을 만족시켜줄 수 있는 방안을 설계자가 스스로 선택하도록 하였다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제15권6호
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• pp.423-429
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• 2011

B13 analogues are being considered as therapeutic agents for cancer cells, since B13 is a ceramide analogue and inhibits ceramidase to promote apoptosis in cancer cells. B13 sulfonamides are assumed to have biological activity similar to B13, since they are made by bioisosterically substituting the carboxyl moiety of B13 with sulfone group. Twenty B13 sulfonamides were evaluated for their in vitro cytotoxicities against human colon cancer HT-29 and lung cancer A549 cell lines using MTT assays. Replacement of the amide group with a sulfonamide group increased cytotoxicity in both cancer cell lines. The sulfonamides with long alkyl chains exhibited activities two to three times more potent than that of B13 and compound (15) had the most potent activity with $IC_{50}$ values of 27 and $28.7{\mu}M$ for HT-29 and A549, respectively. The comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) were used to carry out QSAR molecular modeling of these compounds. The predictive CoMSIA models for HT-29 and A549 gave cross-validated q2 values of 0.703 and 0.830, respectively. From graphical analysis of these models, we suppose that the stereochemistry of 1,3-propandiol is not important for activity and that introduction of a sulfonamide group and long alkyl chains into B13 can increase cytotoxicity.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제14권6호
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• pp.441-447
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• 2010

B13, a ceramide analogue, is a ceramidase inhibitor and induces apoptosis to give potent anticancer activity. A series of thiourea B13 analogues was evaluated for their in vitro cytotoxic activities against human renal cancer Caki-2 and leukemic cancer HL-60 in the MTT assay. Some compounds (12, 15, and 16) showed stronger cytotoxicity than B13 and C6-ceramide against both tumor cell lines, and compound (12) gave the most potent activity with $IC_{50}$ values of 36 and $9\;{\mu}M$, respectively. Molecular modeling of thiourea B13 analogues was carried out by comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA). We obtained highly reliable and predictive CoMSIA models with cross-validated $q^2$ values of 0.707 and 0.753 and CoMSIA contour maps to show the structural requirements for potent activity. These data suggest that the amide group of B13 could be replaced by thiourea, that the stereochemistry of 1,3-propandiol may not be essential for activity and that long alkyl chains increase cytotoxicity.

• 감성과학
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• 제7권2호
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• pp.133-140
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• 2004

최근 대량으로 쏟아지는 감성공학 연구 결과와 논문들을 가치 있는 자료로 만들기 위해서는 감성 데이터가 산업 전반에 활용될 수 있도록 지표로 정리해야 한다. 본 논문에서는 "웹기반 감성 데이터 베이스 구축 및 보급에 관한 연구" 과제를 통해 작성된 감성 데이터 지표에 입각해서 앞으로 대량으로 출현할 감성공학 데이터의 지속적인 지표화를 위한 과정의 자동화를 제안한다. 문서 데이터의 지표화 작업이 자동요약과 유사하다는 점에 착안하여 자동지표화 시스템을 위한 기술들의 기초가 되는 정보유형 및 주요어 추출, 특성표현을 통한 정보문 추출에 대해 감성공학 코퍼스 분석을 통해 연구하고자 한다. 이는 감성공학 분야에서의 지식관리 시스템이나 자동요약 시스템에 활용될 수 있다. 활용될 수 있다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권6호
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• pp.1823-1828
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• 2013

Tetraoxanes (1,2,4,5-tetraoxanes) have been reported to exhibit potent antimalarial activity. In the present study, the three dimensional-quantitative structure activity relationship (3D-QSAR) studies were performed on a series of tetraoxanes derivatives using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) techniques. The best predictive CoMFA model with atom fit alignment resulted in cross-validated coefficient ($q^2$) value of 0.719, non-cross-validated coefficient ($r^2$) value of 0.855 with standard error of estimate (SEE) 0.335. Similarly, the best predictive CoMSIA model was derived with $q^2$ of 0.739, $r^2$ of 0.847 and SEE of 0.344. The generated models were externally validated using test sets. The final QSAR models as well as the information gathered from 3D contour maps should be useful for the design of novel tetraoxanes having improved antimalarial activity.