• Journal of Ecology and Environment
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• 제29권5호
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• pp.411-414
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• 2006

The mating systems of two groups of natural populations of Gleditsia japonica var. koraiensis in Korea were determined using allozyme analysis. The result suggests that G. japonica var. koraiensis is predominantly outcrossing. The tm values of eight populations in Korea varied from 0.667 (Mdh-1) to 0.938 (ldh-1), giving an average 0.820. Population and individual outcrossing estimates were associated with flowering tree density or degree of spatial isolation. The reason for relatively low outcrossing rates of some populations could be attributed to reduction of effective population sizes of sib for the medicine, small population size, and isolation of flowering mature trees. The heterozygote excesses were observed in some natural populations, whereas other populations exhibited varying degrees of inbreeding and heterozygotes deficit. Thus, selection against homozygotes operated in the progeny populations throughout the life cycle.

• 농업과학연구
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• 제7권1호
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• pp.12-26
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• 1980

1977년(年)에 충남대학교(忠南大學校) 농과대학(農科大學)에서 수집(蒐集)한 재래종(在來種) 옥수수 육종(育種)에 이용(利用)될 수 있는 새로운 육종재료(育種材料)를 유지(維持)하고 또 찾기 위해 충남대학(忠南大學) 포장(圃場)과 농촌진흥청(農村振興聽) 작물시험장(作物試驗場) 포장(圃場)에 파종(播種)하여 얻어진 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 편의상(便宜上) 실제(實際)로 옥수수 육종(育種)에 응용(應用)할 수 있는 응용면(應用面)과 장차 기초연구(基礎硏究)를 위해 필요(必要)하다고 생각되는 학술면(學術面) 그리고 재래종(在來種) 전반(全般)에 걸친 유전적(遺傳的) 정보(情報)로 나누어 요약(要約)하고자 한다. A. 응용면(應用面) 1. 근래(近來)에 정부(政府)에서 도입(導入) 장려하고 있는 재래종(在來種)(마치종(馬齒種))에 피해(被害)를 주는 흑조위축병(黑條萎縮病)에 내병성(耐病性)인 계통(系統)이 확인(確認)되었다. 2. 곡실(穀實)의 다수(多收)와 싸이레지용(用)으로 이용(利用)할 수 있다고 보이는 다수성(多穗性) (Prolific type) 옥수수 계통(系統)과 분지성(分枝性) 옥수수 계통(系統)이 확보(確保)되었다. 3. 여러 유형(類型)의 찰옥수수 계통(系統)이 확인(確認)되었다. (현재(現在) 작물시험장(作物試驗場)에서 연구중(硏究中)임). 4. 또 여러 유형(類型)의 폭열종(爆裂種) 옥수수가 확인(確認)되었다. 5. 웅수출현기(雄穗出現期)에 있어서도 많은 변이(變異)를 보여주어 웅수출현(雄穗出現)을 조절(調節)할 수 있는 육종재료(育種材料)가 확보(確保)되었다. 6. 고단백질(高蛋白質) 옥수수를 육종(育種)할 수 있는 육종재료(育種材料)가 확보(確保)되었다. B. 기초학술면(基礎學術面) 1. 새로운 sugary인자(因子)의 표현형(表現型)이 관찰(觀察)되었다. 2. 새로운 opaque인자(因子)의 표현형(表現型)이 관찰(觀察)되었다. 3. 새로운 웅수불임계통(雄穗不稔系統)이 관찰(觀察)되었다. 4. 다수성(多穗性) 계통(系統)이 관찰(觀察)되었다. 5. 다지성(多枝性) 계통(系統)이 관찰(觀察)되었다. 6. 내흑조위축병(耐黑條萎縮病) 계통(系統)이 관찰(觀察)되었다. 7. 폭열종(爆裂種) 계통(系統)이 관찰(觀察)되었다. 8. 웅수출현(雄穗出現)에 있어서 환경(環境)에 예민(銳敏)한 계통(系統)과 둔(鈍)한 계통(系統)이 관찰(觀察)되었다. C. 재래종(在來種)의 유전적(遺傳的) 정보(情報) 간장(稈長), 100립종(粒種)에 대(對)하여 자식열세(自殖劣勢) 잡종강세현상(雜種强勢現像)을 분석(分析)하였던 바. 1. 대부분(大部分)의 수집재래종(蒐集在來種) (강원도(江原道) 등 산간지역(山間地域) 주민(住民) 제외(除外))들이 동형접합체화(同型接合體化) 되어 있음을 알 수 있었다. 2. 간장(稈長)에 대(對)한 자식열세현상(自殖劣勢現像)은 평균(平均) 6%로서 거의 모든 계통(系統)이 자식열세현상(自殖劣勢現像)을 보였으며 아울러 잡종강세현상(雜種强勢現像)도 컸다(평균(平均) 40%). 그리고 이들 자식열세현상(自殖劣勢現像)과 잡종강세현상(雜種强勢現像)을 퍼센트로 표시(表示)할때에 계통(系統)들 간(間)에 큰 차이(差異)가 있었다. 3. 100립종(粒種)에 대(對)한 자식열세현상(自殖劣勢現像)은 평균(平均) 16%로서 간장(稈長)에 있어서와 같이 모든 계통(系統)들이 자식열세현상(自殖劣勢現像)을 보였다. 잡종강세현상(雜種强勢現像)에 있어서는 평균(平均) 43%로서 자식열세현상(自殖劣勢現像)에 비(比)하여 그 크기가 컸다. 100립종(粒種)에 대(對)한 자식계통(自殖系統)과 잡종강세현상(雜種强勢現像)에 대(對)한 계통간(系統間) 차이(差異)도 컸다.

• 한국산림과학회지
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• 제104권4호
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• pp.578-587
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• 2015

교배양식 유전모수를 확인하기 위하여 nuclear SSR (nSSR) 표지와 chloroplast SSR (cpSSR) 표지를 이용하여 2006년과 2007년에 안면도 소나무 채종원(77년 조성)에서 생산된 종자를 대상으로 타가교배율과 화분오염율, 근친교배율을 확인하였다. cpSSR 유전형에 근거한 타가교배율은 2006년에 94.9~100%(평균 98.9%)이며, 2007년에는 91.2~100%(평균 97.7%)이다. nSSR 유전자형에 근거한 타가교배율은 2006년에 90.3~100%(평균 95.9%), 2007년에 81.6~100%(평균 95.3%)의 타가교배율이 산출되었다. 두 표지를 동시에 비교하여 확인한 결과 2006년 생산종자의 평균 누적 타가교배율 100%, 2007년 생산종자의 평균 누적 타가교배율은 98.9%로 추정되었다. 근친교배율($t_m-t_s$: biparental inbreeding)은 2006년에 -0.006과 2007년에 0.007으로 추정되었다. 평균 화분오염율은 2006년에 평균 48.9%, 2007년에 평균 42.4%이며, 종자의 cpSSR 유전형을 근거로 확인한 화분친 기여율(기여화분친 수)은 2006년에 0.458(평균 16.2개), 2007년에 0.512(평균 14.8개)로 확인되었다. 결론적으로, 2006년, 2007년 안면도 소나무 채종원(77년 조성) 내 클론간 높은 타가교배율이 확인됨으로써 채종원산 종자의 유전적 품질은 자가교배로 인한 근교약세가 원인이 되는 불량형질이 발생할 가능성이 낮을 것으로 기대된다. 안면도 소나무 채종원(77년 조성) 내 교배양식 연간 분석을 통해서 확인된 결과가 향후 진전세대 채종원 조성 및 관리에 유용한 정보를 제공할 것으로 기대된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제17권10호
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• pp.1355-1359
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• 2004

Japanese Black cattle of Hyogo prefecture (Tajima strain) are famous for its ability to produce high-quality meat and have been maintained as a closed system for more than 80 years. In order to assess the usefulness of microsatellite markers in closed cattle populations, and evaluate the genetic structure of the Tajima strain, we analyzed representative dams of the Tajima strain comprised of the substrains Nakadoi and Kinosaki. Genetic variability analyses indicated low genetic diversity in the Tajima strain. In addition, a recent genetic bottleneck, which could be accounted for by the high level of inbreeding, was detected in both substrains. In phylogenetic analyses, relationship coefficients and genetic distances between individuals were calculated using pedigree and microsatellite information. Two phylogenetic trees were constructed from microsatellite and pedigree information using the UPGMA method. Both trees illustrated that most individuals were distinguished clearly on the basis of the two substrains, although in the microsatellite tree some individuals appeared in clusters of different substrains. Comparing the two phylogenetic trees revealed good consistency between the microsatellite analysis tree and the pedigree information. The correlation coefficient between genetic distances derived from microsatellite and pedigree information was 0.686 with a high significance level (p<0.001). These results indicated that microsatellite information may provide data substantially equivalent to pedigree information even in unusually inbred herds of cattle, and suggested that microsatellite markers may be useful in revealing genetic structure without accurate or complete pedigree nformation. Japanese Black cattle of Hyogo prefecture (Tajima strain) are famous for its ability to produce high-quality meat and have been maintained as a closed system for more than 80 years. In order to assess the usefulness of microsatellite markers in closed cattle populations, and evaluate the genetic structure of the Tajima strain, we analyzed representative dams of the Tajima strain comprised of the substrains Nakadoi and Kinosaki. Genetic variability analyses indicated low genetic diversity in the Tajima strain. In addition, a recent genetic bottleneck, which could be accounted for by the high level of inbreeding, was detected in both substrains. In phylogenetic analyses, relationship coefficients and genetic distances between individuals were calculated using pedigree and microsatellite information. Two phylogenetic trees were constructed from microsatellite and pedigree information using the UPGMA method. Both trees illustrated that most individuals were distinguished clearly on the basis of the two substrains, although in the microsatellite tree some individuals appeared in clusters of different substrains. Comparing the two phylogenetic trees revealed good consistency between the microsatellite analysis tree and the pedigree information. The correlation coefficient between genetic distances derived from microsatellite and pedigree information was 0.686 with a high significance level (p<0.001). These results indicated that microsatellite information may provide data substantially equivalent to pedigree information even in unusually inbred herds of cattle, and suggested that microsatellite markers may be useful in revealing genetic structure without accurate or complete pedigree information.

• 한국산림과학회지
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• 제105권4호
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• pp.414-421
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• 2016

국내 당단풍나무 집단의 유전다양성, 유전분화 및 유연관계를 알아보기 위해 AFLP 분석을 실시하였다. 14개 당단풍나무 집단에 대한 7개 AFLP 프라이머 조합을 적용한 결과 유효대립유전자 수($A_e$)가 1.4개, 다형적 유전자좌 비율(%P)이 82.2%, Shannon의 다양성 지수(I)가 0.358, 이형접합도 기대치($H_e$)가 0.231이었고, 베이즈 방법으로 추론한 이형접합도 기대치(Hj)는 0.253으로 나타났다. 당단풍나무의 유전다양성은 단풍나무속 수종들과 비교했을 때 중간수준이었고, 생활사나 생태적 특성이 유사한 수종들에 비해 낮았다. 베이즈 방법으로 추정된 평균 $F_{IS}$값은 0.712로 나타나 자가수분이나 근연관계 개체 간 교배에 의한 동형접합체 증가가 유전다양성에 영향을 준 것으로 생각된다. AMOVA로 추정한 당단풍나무의 유전분화율(${\Phi}_{ST}$)은 0.107이었고, 베이즈 방법으로 추정한 유전분화율(${\Phi}^{II}$)은 0.110이었다. 당단풍나무는 생활사나 생태적 특성이 유사한 종들에 비해 유전분화가 적게 이루어진 것으로 나타났다. 유연 관계 분석에서 울릉도 집단은 내륙의 집단들과 유전적으로 가장 상이한 집단으로 나타났다. 울릉도 집단은 유전다양성이 가장 낮은 집단으로서, 내륙의 집단 일부가 이주하면서 생긴 창시자 효과와 유전적 부동에 의해 유전다양성 감소가 이루어졌고 내륙과의 지리적 격리로 인해 유전자 교류가 감소했기 때문으로 추정된다.

• 식물분류학회지
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• 제42권4호
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• pp.253-259
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• 2012

한국특산식물이며 희귀식물인 변산바람꽃(Eranthis byunsanensis)의 보전을 위해 5개 자생지 집단을 대상으로 9개의 allozyme marker를 이용하여 유전적 다양성과 구조를 분석하였다. 변산바람꽃 집단의 대립 유전자의 수(A)는 2.4개, 다형적 유전좌위의 비율(P)은 90.0%, 이형접합자의 평균 기대치($H_E$)는 0.311을 나타내어 분포 역이 넓은 특산식물과 유사하거나 다소 높은 수준의 유전적 다양도를 유지하는 것으로 나타났다. 유전적 구조분석 결과 집단간 $F_{IS}$는 양의 값을 나타내었고 집단간 유전적 분화도는 낮은 결과(0.131)를 보였다. 집단간 높은 유전적 변이, 낮은 유전적 분화, 이형접합자의 결여양상은 이 종이 최근 고립되어 서식지의 단편화를 경험했을 가능성을 제시하며 유전적 확산을 막아 집단의 근친교배율이 증가한 것으로 판단된다. 현재 마이산과 나로도 자생지는 집단의 작은 크기와 종의 생존을 위협하는 인간활동에 의해 매우 취약한 상태이다. 따라서 유전적 변이가 다소 높고 분화가 적은 변산바람꽃 집단의 합리적 보전을 위해서는 특정한 집단에 대한 보전의 우선권을 설정하는 것 보다 전체 집단을 지속적으로 유지하고 근친교배율을 낮추기 위한 노력이 요구된다.

• 한국임상수의학회지
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• 제30권5호
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• pp.384-386
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• 2013

2년령 암컷 잉글리쉬 불독이 근친 유래의 동결정액을 이용한 인공수정을 위해 내원하였다. 배란 후 이틀 뒤 자궁 내 인공수정을 실시하였다. 정액을 해동 후 컴퓨터 기반의 정액 분석기를 사용하여 평가한 결과, 해동된 정자는 정상 모양을 가지고 있었고 운동성이 89.8%였다. 초음파와 방사선 촬영을 통하여 8마리를 임신한 것을 확인하였고, 인공 수정 후 60일 째 제왕절개를 실시하였다. 8마리의 산자가 안전하게 분만이 되었지만, 모든 산자들에서 심각한 활모양 다리, 구개열, 구순열, 확장된 두부(頭部) 등을 포함한 기형이 관찰되었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권5호
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• pp.671-676
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• 2005

A total of 50 individual catfish, the Tra (Pangasius hypophthalmus) cultivated in either floating cages (Tra-c) or in ponds (Tra-p) and the Basa (Pangasius bocourti) raised in three floating cages, were collected in two of the Mekong Delta provinces. The caudal fin of each individual fish was used for protein electrophoresis employing the SDS-PAGE method. The one fillet sides were used as a representative sample to determine the dry matter (DM), crude protein (CP), ether extract (EE) and amino acids (AAs). The catfish oil was extracted from the belly fats, and the fatty acid (FA) composition was analyzed. There were 21 bands of the Tra and the Basa. Protein bands of the two varieties were 28.6-33.3% polymorphic, while polymorphic individuals of the Tra ranged from 80.0 to 100.0%, and the Basa was 90.0% polymorphic. The phenotypic diversity (Ho) of the Tra ranged from 1.71 to 1.80, while the Basa ranged as high as 2.14%. Diversity values (H$_{EP}$) for genetic diversity markers were equal in the Tra and the Basa. The sum of the effective number of alleles (SENA) of both varieties ranged from 3.40 to 3.83 for the Basa and the Tra, respectively. The lower values of Ho and SENA, as compared with those of the fresh water prawn (Macrobrachium equidens) in the area, would suggest that the species with the low values will become extinct due to inbreeding; the gene pools of each observed population were below a suitable threshold. Many of the differences in the nutritional values of the Tra-c, the Tra-p and the Basa were measured; their nutrient values were comparable to fishmeal or fish oil. Most of the DM, CP, and EE were higher in the Tra, especially in the Tra-c. The essential AA content, especially that of lysine, was highest in the Tra-c, next highest in the Tra-p, and lowest in the Basa. Therefore, the amino acid patterns were closer to the ideal patterns in the same sequences. In contrast, the essential FAs were concentrated in the Basa fish oil. It was found that suitable selection of parents for seed production is required to avoid inbreeding. Catfish may be valuable sources of nutrition for both humans and animals, and the differences in their nutritional values by variety and/or management must be taken into account.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• 제4권
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• pp.12-17
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• 1986

고추 육종(育種)의 기초자료(基礎資料)를 얻고자 $342{\times}$김장고추, 馬山${\times}$Hungarian wax 그리고 마산(馬山)${\times}$제주(濟州) 등(等) 3조합(組合)의 친(親), $F_1$, $F_2$ 그리고 $BCF_1$ 세대(世代)에 대(對)해 적숙(赤熟)된 과실(果實)을 수집(收穫)하여 1생(生) 건과중(乾果重)을 구성(構成)하는 형질(形質)들의 잡종강세(雜種强勢), 유전성분(遺傳成分) 및 상관관계(相關關係)를 조사(調査)한 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 평균(平均) Heterosis는 거의 모든 형질(形質)에서 정(正)의 값을 나타내었고 평균(平均) Heterobeltiosis는 $342{\times}$김장고추조합(組合)을 제외(除外)하고는 거의 부(負)의 값을 나타내었다. 또한 근교약세(近交弱勢)도 정(正)의 값을 보여 $F_2$에서의 무게감소가 있는 것으로 나타났다. 형질발현(形質發現)에는 각(各) 조합(組合)의 형질(形質)에 따라 중복적(重複的) 혹(或)은 보족적(補足的)으로 상위성(上位性)이 작용(作用)하였으며 $F_2$에서 과중(果重)과 과육중(果肉重)은 광의(廣義) 및 협의(狹義)의 유전력(遺傳力)이 높았으며 기타형질(其他形質)은 전반적(全般的)으로 낮았다. 각(各) 과중구성요소간(果重構成要素間)의 형질상관(形質相關)은 생(生) 건과중(乾果重)에서 모두 정(正)의 유의(有意)한 상관(相關)을 보였다.

• Genes and Genomics
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• 제40권11호
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• pp.1249-1258
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• 2018

The Jeju horse is an indigenous Korean horse breed that is currently registered with the Food and Agriculture Organization of the United Nations. However, there is severe lack of genomic studies on Jeju horse. This study was conducted to investigate genetic characteristics of horses including Jeju horse, Thoroughbred and Jeju crossbred (Jeju${\times}$Thoroughbred) populations. We compared the genomes of three horse populations using the Equine SNP70 Beadchip array. Short-range Linkage disequilibrium was the highest in Thoroughbred, whereas $r^2$ values were lowest in Jeju horse. Expected heterozygosity was the highest in Jeju crossbred (0.351), followed by the Thoroughbred (0.337) and Jeju horse (0.311). The level of inbreeding was slightly higher in Thoroughbred (-0.009) than in Jeju crossbred (-0.035) and Jeju horse (-0.038). $F_{ST}$ value was the highest between Jeju horse and Thoroughbred (0.113), whereas Jeju crossbred and Thoroughbred showed the lowest value (0.031). The genetic relationship was further assessed by principal component analysis, suggesting that Jeju crossbred is more genetically similar to Thoroughbred than Jeju horse population. Additionally, we detected potential selection signatures, for example, in loci located on LCORL/NCAPG and PROP1 genes that are known to influence body. Genome-wide analyses of the three horse populations showed that all the breeds had somewhat a low level of inbreeding within each population. In the population structure analysis, we found that Jeju crossbred was genetically closer to Thoroughbred than Jeju horse. Furthermore, we identified several signatures of selection which might be associated with traits of interest. To our current knowledge, this study is the first genomic research, analyzing genetic relationships of Jeju horse, Thoroughbred and Jeju crossbred.