• 제목/요약/키워드: InDel

검색결과 649건 처리시간 0.03초

DNA 형태 적응을 거쳐 P2sir-관련 도움파지 비효율성을 극복하는 박테리오파지 P4 sid+ 유도체 정성 연구 (Characterization of the bacteriophage P4 sid+ derivative overcoming P2sir-associated helper inefficiency through DNA conformational adaptation)

  • 김경진
    • 미생물학회지
    • /
    • 제52권1호
    • /
    • pp.120-124
    • /
    • 2016
  • P2-크기 머리에 packaging 될 특정 DAN 크기(28-29 kb long)와 박테리오파지 P4 유전자 sid의 변이가 "P2 sir-관련 도움파지 비효율성"을 극복할 수 있는 요소로 압축되었다. 유전자 sid의 변이 여부가 필수적인지를 확인하기 위해, 정상적인 sid 유전자를 가지며 $P2_{sir3}$-크기의 큰 머리에 packaging 될 DNA 크기가 28.5 kb되는 P4 delRI::kmr을 사용하여 실험하였다. P4 delRI::kmr이 P2 sir3 용원소에 대해 낮은 EOP를 보이므로, 이를 증가시키기 위해 P2 sir3 용원소를 숙주세포로 하여 파지 stock을 제조하였다. 이 과정에서 P4 delRI::kmr이 P2 sir3 용원소에 대해 적응하는 것을 관찰하고, CsCl 부양 균등밀도 편차실험과 분리된 DNA의 전기영동을 통해 그것이 packaging 될 머리 크기에 따른 DNA 형태 변화에 의한 적응이라는 것을 알아냈다. P2 sir3 용원소에 적응된 P4 delRI::kmr과 적응되지 않은 P4 delRI::kmr stock의 burst size 결정 실험은, sid 유전자 변이에 상관없이 packaging 될 DNA 크기에 의해 "P2 sir-관련 도움파지 비효율성"이 극복된다는 것을 보여주었다.

Screening of 185DelAG, 1014DelGT and 3889DelAG BRCA1 Mutations in Breast Cancer Patients from North-East India

  • Hansa, Jagadish;Kannan, Ravi;Ghosh, Sankar Kumar
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제13권11호
    • /
    • pp.5871-5874
    • /
    • 2012
  • Around 1.35 million people of worldwide suffer from breast cancer each year, whereas in India, 1 in every 17 women develops the disease. Mutations of the Breast Cancer 1 (BRCA1) gene account for the majority of breast/ovarian cancer families. The purpose of study was to provide a prevalence of BRCA1 germline mutations in the North-East Indian population. In relation to the personal and family history with the breast cancer, we found mutations in 6.25% and 12.5% respectively. Three mutations, 185DelAG, 1014DelGT and 3889DelAG, were observed in our North-East Indian patients in exons 2 and 11, resulting in truncation of the BRCA1 protein by forming stop codons individually at amino acid positions 39, 303 and 1265. Our results point to a necessity for an extensive mutation screening study of high risk breast cancer cases in our North-East Indian population, which will provide better decisive medical and surgical preventive options.

구문론으로서의 수학: 괴델의 비판과 카르납의 과학적 철학 (Mathematics as Syntax: Gödel's Critique and Carnap's Scientific Philosophy)

  • 이정민
    • 논리연구
    • /
    • 제21권1호
    • /
    • pp.97-133
    • /
    • 2018
  • 괴델은 '수학은 언어의 구문론인가?'라는 미출간 논문에서 그가 '구문론적 해석'이라고 부르는 카르납의 관점을 비판한다. 박일호, 전영삼, 어워디와 캐러스, 리켓츠, 테넌트 등은 괴델의 논변을 여러 가지 방식으로 재구성하고, 카르납의 가능한 대응을 검토해 왔다. 이 논문은 수학의 성격에 대한 괴델과 카르납의 논쟁을 재현한 뒤 대부분의 기존 논의를 비판하고 다음과 같은 새로운 기여를 하려 한다. 먼저 여러 학자가 카르납의 견해로 지적한 '언어 상대성'이 과장되었다고 주장한다. 오히려 괴델 비판의 핵심은 수학의 적용 문제이며 '기대가능성'에 기초한 논변이다. 따라서 카르납이 수학의 적용, 특히 과학에의 적용을 어떻게 보았는지를 논의하여 괴델에 응답한다. 그 과정에서 기존 논의가 간과한 카르납의 '대응 원리'가 핵심적인 역할을 한다고 주장한다. 마지막으로 괴델 불완전성 정리의 진정한 함축인 수학의 소진불가능성은 카르납과 괴델 자신이 정확히 동의하는 부분이라고 주장한다.

전술환경에서 QoS 보장을 위한 클래스 기반 FQ-Codel 알고리즘 적용 연구 (Application Study of FQ-CoDel Algorithm based on QoS-guaranteed Class in Tactical Network)

  • 박주만
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
    • /
    • 제19권3호
    • /
    • pp.53-58
    • /
    • 2019
  • 본 논문은 전술 통신망에서 QoS 향상을 위한 클래스 기반의 FQ-CoDel(Flow queue-Control Delay) 알고리즘을 제안한다. 전술 통신망에서 다양한 응용체계 서비스를 제공하게 되면서 병목현상으로 인한 트래픽 손실 및 지연 문제가 대두되었고 따라서 효과적인 트래픽 처리 방안 연구에 대한 필요성이 제기되었다. 제안방안은 클래스 기반의 FQ-CoDel 알고리즘을 이용한 동적인 버퍼 관리 및 스케줄링 기술로써 서비스 특성 및 중요도에 따라 해당 큐에 패킷을 분류하고 주기적으로 각 패킷의 대기시간을 체크하여 기준 대기 시간을 초과하는 경우 해당 패킷을 폐기하여 큐에 저장된 트래픽 양을 일정 수준으로 조절한다.

ON THE ORBIFOLD EULER CHARACTERISTIC OF LOG DEL PEZZO SURFACES OF RANK ONE

  • Hwang, DongSeon
    • 대한수학회지
    • /
    • 제51권4호
    • /
    • pp.867-879
    • /
    • 2014
  • It is known that the orbifold Euler characteristic $e_{orb}(S)$ of a log del Pezzo surface S of rank one satisfies the inequality $0{\leq}e_{orb}(S){\leq}3$. In this note, we show that the orbifold Euler characteristic of S is strictly positive, i.e., 0 < $e_{orb}(S)$. Moreover, we also show, by construction, the existence of log del Pezzo surfaces of rank one with arbitrarily small orbifold Euler characteristic.

MINIMAL DEL PEZZO SURFACES OF DEGREE 2 OVER FINITE FIELDS

  • Trepalin, Andrey
    • 대한수학회보
    • /
    • 제54권5호
    • /
    • pp.1779-1801
    • /
    • 2017
  • Let X be a minimal del Pezzo surface of degree 2 over a finite field ${\mathbb{F}}_q$. The image ${\Gamma}$ of the Galois group Gal(${\bar{\mathbb{F}}}_q/{\mathbb{F}}_q$) in the group Aut($Pic({\bar{X}})$) is a cyclic subgroup of the Weyl group W($E_7$). There are 60 conjugacy classes of cyclic subgroups in W($E_7$) and 18 of them correspond to minimal del Pezzo surfaces. In this paper we study which possibilities of these subgroups for minimal del Pezzo surfaces of degree 2 can be achieved for given q.

Human Papillomavirus Genotypes among Females in Mexico: a Study from the Mexican Institute for Social Security

  • Salcedo, Mauricio;Pina-Sanchez, Patricia;Vallejo-Ruiz, Veronica;Monroy-Garcia, Alberto;Aguilar-Lemarroy, Adriana;Cortes-Gutierrez, Elva I.;Santos-Lopez, Gerardo;Montoya-Fuentes, Hector;Grijalva, Renan;Madrid-Marina, Vicente;Apresa-Garcia, Teresa;Hernandez, Dulce M.;Jave-Suarez, Luis F.;Romero, Pablo;Poot, Albros;Salgado, Eduardo;Ramos-Gonzalez, Patricia;Gonzalez-Hernandez, Rigoberto;Canton, Juan C.;Jimenez-Aranda, Lucio;Parra-Melquiadez, Miriam;Paniagua, Lucero;Mendoza, Monica;Arreola, Hugo;Villegas, Vanesa;Torres-Poveda, Kirvis;Bahena-Roman, Margarita;Gonzalez-Yebra, Beatriz;Taniguchi, Keiko;Rodea, Carlos;Mantilla-Morales, Alejandra;Mora-Garcia, Maria L.;Velazquez-Velazquez, Cindy K.;Cordova-Uscanga, Candelaria;Peralta, Raul;Lopez-Romero, Ricardo;Marrero, Daniel;Bandala, Cindy;Reyes-Leyva, Julio;Furuya, Maria E.;Almeida, Eduardo;Galvan, Maria E.;Grijalva, Israel
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제15권23호
    • /
    • pp.10061-10066
    • /
    • 2015
  • Background: The aetiological relationship between human papillomavirus (HPV) infection and cervical cancer (CC) is widely accepted. Our goal was to determine the prevalence of HPV types in Mexican women attending at the Mexican Institute for Social Security from different areas of Mexico. Materials and Methods: DNAs from 2,956 cervical samples were subjected to HPV genotyping: 1,020 samples with normal cytology, 931 with low-grade squamous intraepithelial lesions (LGSIL), 481 with high grade HGSIL and 524 CC. Results: Overall HPV prevalence was 67.1%. A total of 40 HPV types were found; HPV16 was detected in 39.4% of the HPV-positive samples followed by HPV18 at 7.5%, HPV31 at 7.1%, HPV59 at 4.9%, and HPV58 at 3.2%. HPV16 presented the highest prevalence both in women with altered or normal cytology and HPV 18 presented a minor prevalence as reported worldwide. The prevalence ratio (PR) was calculated for the HPV types. The analysis of PR showed that HPV16 presents the highest association with CC, HPV 31, -33, -45, -52 and -58 also demonstrating a high association. Conclusions: The most prevalent HPV types in cervical cancer samples were -16, -18, -31, but it is important to note that we obtained a minor prevalence of HPV18 as reported worldwide, and that HPV58 and -52 also were genotypes with an important prevalence in CC samples. Determination of HPV genotypes is very important in order to evaluate the impact of vaccine introduction and future cervical cancer prevention strategies.

Increased Expression of P2RY2, CD248 and EphB1 in Gastric Cancers from Chilean Patients

  • Aquea, Gisela;Bresky, Gustavo;Lancellotti, Domingo;Madariaga, Juan Andres;Zaffiri, Vittorio;Urzua, Ulises;Haberle, Sergio;Bernal, Giuliano
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제15권5호
    • /
    • pp.1931-1936
    • /
    • 2014
  • Background: Gastric cancer (GC) ranks as one of the major causes of mortality due to cancer worldwide. In Chile, it is currently the leading cause of cancer death. Identification of novel molecular markers that may help to improve disease diagnosis at early stages is imperative. Materials and Methods: Using whole-genome DNA microarrays we determined differential mRNA levels in fresh human GC samples compared to adjacent healthy mucosa from the same patients. Genes significantly overexpressed in GC were validated by RT-PCR in a group of 14 GC cases. Results: The genes CD248, NSD1, RAB17, ABCG8, Ephb1 and P2RY2 were detected as the top overexpressed in GC biopsies. P2RY2, Ephb1 and CD248 showed the best sensitivity for GC detection with values of 92.9%, 85.7% and 64.3% (p<0.05), respectively. Specificity was 85.7%, 71.4% and 71.4% (p<0.05), for each respectively.

The Water-Soluble Chitosan Derivative, N-Methylene Phosphonic Chitosan, Is an Effective Fungicide against the Phytopathogen Fusarium eumartii

  • Mesas, Florencia Anabel;Terrile, Maria Cecilia;Silveyra, Maria Ximena;Zuniga, Adriana;Rodriguez, Maria Susana;Casalongue, Claudia Anahi;Mendieta, Julieta Renee
    • The Plant Pathology Journal
    • /
    • 제37권6호
    • /
    • pp.533-542
    • /
    • 2021
  • Chitosan has been considered an environmental-friendly polymer. However, its use in agriculture has not been extended yet due to its relatively low solubility in water. N-Methylene phosphonic chitosan (NMPC) is a water-soluble derivative prepared by adding a phosphonic group to chitosan. This study demonstrates that NMPC has a fungicidal effect on the phytopathogenic fungus Fusarium solani f. sp. eumartii (F. eumartii) judged by the inhibition of F. eumartti mycelial growth and spore germination. NMPC affected fungal membrane permeability, reactive oxygen species production, and cell death. Also, this chitosan-derivative exerted antifungal effects against two other phytopathogens, Botrytis cinerea, and Phytophthora infestans. NMPC did not affect tomato cell viability at the same doses applied to these phytopathogens to exert fungicide action. In addition to water solubility, the selective biological cytotoxicity of NMPC adds value in its application as an antimicrobial agent in agriculture.

한국 여성 노인에서 α -Adducin, Angiotensinogen, ACE 유전자다형성 및 나트륨 섭취수준에 따른 혈압의 비교 (Blood Pressure in Relation to α-Adducin, Angiotensinogen, ACE Gene Polymorphisms and Sodium Intake in Korean Female Elderly Subjects)

  • 채선주;정자용
    • 한국식품영양과학회지
    • /
    • 제35권10호
    • /
    • pp.1371-1377
    • /
    • 2006
  • 본 연구에서는 60대 이상 한국 여성 노인을 대상으로 하여 체내 나트륨 대사에 밀접하게 관여하는 ADD1 Gly460Trp, AGT Met235Thr, ACE Ins/Del 유전자형의 분포를 살피고 각각의 유전자 다형성 혹은 유전자형의 조합과 수축기 및 이완기 혈압과의 관계, 그리고 식이 나트륨 섭취 수준이 유전자-혈압과의 관계에 미치는 영향에 대해 파악하고자 수행 되었으며 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 본 연구에서 분석된 유전자형들의 분포는 1) ADD1 유전자-Gly/Gly:Gly/Trp:Trp/Trp=16.5:49.5:34.0, 2) AGT 유전자-Met/Met:Met/Thr:Thr/Thr=4.6:31.2:64.2, 3) ACE 유전자-Ins/Ins:Ins/Del:Del/Del=34:49.5:16.5이었다. AAD1 Gly460Trp, AGT Met235Thr, ACE Ins/Del 각각의 유전자형은 본 연구대상자들의 수축기 및 이완기 혈압을 유의하게 변화시키지 않았으나, ACE Del/Del형과 ADD1 Trp/Trp형을 동시에 보유하고 있는 경우 다른 유전자형을 가진 대상자들에 비해 수축기 혈압이 유의적으로 높았으며(p=0.01), ACE Del/Del형과 AGT Met allele을 동시 에 보유하고 있는 경우 다른 그룹들에 비해 높은 이완기 혈압을 가지고 있는 것으로 나타났다(p<0.001).식이 나트륨 섭취량의 상대적인 수준에 따라 전체 대상자를 두 그룹으로 나누었을 때, 나트륨 섭취량이 낮은 그룹에서만 ADD1 Gly460Trp유전자형에 따른 평균 수축기 혈압의 차이가 관찰되었고(p=0.03), 나트륨 섭취량이 높은 그룹에서는 ADD1유전자형별 평균 수축기 및 이완기 혈압에 유의적인 차이가 없었다. 이상의 결과는 한국 여성 노인에 있어 혈압의 증가에 ADD1, AGT 및 ACE유전자 다형성이 복합적으로 관여함을 제시한다. 또한, 이들 유전자 다형성에 대한 혈압의 표현형이 식이 나트륨 섭취 수준에 따라 변화함을 규명하였다. 이러한 결과로 볼 때, 앞으로 유전자-질병간의 연관성을 밝히기 위한 연구들에서 단일 유전자보다는 다양한 유전자들에 대한 분석이 복합적으로 이루어져야 하며, 식이 요인 등 주요 환경 요인에 대한 분석이 반드시 함께 수행되어야 할 것으로 생각된다.