• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제4권2호
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• pp.231-236
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• 2000

Gonadotropin-releasing hormone (GnRH)과 그 수용체가 흰쥐의 난소, 정소, 자궁, 태 반 그리고 유선 등의 생식기관에서 발현됨이 알려져 있다. 더욱이, 뇌하수체 전엽에 작용하는 GnRH의 표적 산물로 알려진 luteinizing hormone (LH)이 흰쥐 생식소에서도 발현됨이 알려졌는데, 이는 생식소 내에 GnRH-LH로 이루어진 국부 회로 (local circuit)가 존재함을 시사하는 것이다 본 연구는 LH와 그 수용체 유전자가 흰쥐 유선에서도 발현되는가를 규명한 것이다. 이를 위해 reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR)과 LH 방사면역측정법 (radioimmunoassay, RIA)을 사용하였다. RT-PCR을 시행한 결과 생식 주기중인 임신하지 않은 흰쥐 유선에서 뇌하수체 유형의 LH${\beta}$ 전사체 (exon 1-3)가 증폭되었으나 정소특이적 LH${\beta}$ exon 부분은 검출되지 않았다. 뇌하수체 glycoprotein hormone에서 공통적으로 존재하는 ${\alpha}$-subunit과 LH 수용체에 대한 전사체 역시 흰쥐 유선에 존재함이 확인되었다. 또한 기존의 보고에서 수유중인 흰쥐 유선에서만 발현된다고 알려진 GnRH가 임신하지 않은 흰쥐 유선에서도 발현됨을 확인하였다. LH 방사면역측정법을 시행한 결과 흰쥐 유선조직 추출물에서 immunoreactive LH분자들이 검출되었으며, LH standard curve와 parallelism을 보이므로 흰쥐 유선의 LH가 뇌하수체 형과 동일할 가능성을 확인하였다. 본 연구는 흰쥐 유선에서 LH subunit들과 수용체 유전자가 발현됨을 최초로 보고한 것으로서, 흰쥐 유선이 LH의 생성처이면서 동시에 작용처이며 유선에서 합성된 GnRH의 조절하에 국부적인 인자로 작용할 가능성을 시사한다.

• 한국유기농업학회지
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• 제24권3호
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• pp.427-433
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• 2016

보리누른모자이크병은 토양전염성 곰팡이인 Polymyxa graminis (P. graminis)에 의해 매개된다. 본 연구에서는 BaYMV 이병토양 및 이병주 뿌리로부터 P. graminis의 PCR 검정방법을 확립하였다. P. graminis type I (P. graminis f.sp. temperata) Internal Transcribed Spacer (ITS) 영역의 염기서열 특이적인 primer를 제작하고, 이병토양 및 이병주의 뿌리와 잎으로부터 DNA를 추출하여 PCR 검정을 실시하였다. 결과 P. graminis는 이병토양 및 이병주 뿌리로부터 검출되었다. 남부지역의 대표적인 보리 재배지역 8개 지역으로부터 이병토양을 채집하여 PCR 검정에 의해 P. graminis의 분포상황을 조사하였다. 결과 조사한 지역 전체에서 P. graminis의 분포가 확인되었다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권8호
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• pp.4883-4889
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• 2013

Background: The most common incident cancer and cause of cancer-related deaths in women is breast cancer. The Myc gene is upregulated in many cancer types including breast cancer, and it is considered as a potential anti-cancer drug target. The present study was conducted to evaluate the Myc (gene and protein) expression pattern in an experimental mammary tumour model in rats. Materials and Methods: Thirty six Sprague Dawley rats were divided into: Experimental group (26 animals), which received the chemical carcinogen N-methyl nitrosourea (MNU) and a control group (10 animals), which received vehicle only. c-Myc oncoprotein and its mRNA expression pattern were evaluated using immunohistochemistry (IHC) and semi-quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), respectively, in normal rat mammary tissue and mammary tumours. The rat glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) gene was used as internal control for semi-quantitative RT-PCR. Results: Histopathological examination of mammary tissues and tumours from MNU treated animals revealed the presence of premalignant lesions, benign tumours, in situ carcinomas and invasive carcinomas. Immunohistochemical evaluation of tumour tissues showed upregulation and heterogeneous cellular localization of c-Myc oncoprotein. The expression levels of c-Myc oncoprotein were significantly elevated (75-91%) in all the tumours. Semi-quantitative RT-PCR revealed increased expression of c-Myc mRNA in mammary tumours compared to normal mammary tissues. Conclusions: Further large-scale investigation study is needed to adopt this experimental rat mammary tumour model as an in vivo model to study anti-cancer strategies directed against Myc or its downstream partners at the transcriptional or post-transcriptional level.

• The Plant Pathology Journal
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• 제32권1호
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• pp.53-57
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• 2016

Major diseases in grafted cacti have been reported and Fusarium oxysporum, Bipolaris cactivora, Phytophthora spp. and Collectotrichum spp. are known as causal pathogens. These pathogens can lead to plant death after infection. Therefore, some European countries have quarantined imported cacti that are infected with specific fungal pathogens. Consequently, we developed PCR detection methods to identify four quarantined fungal pathogens and reduce export rejection rates of Korean grafted cacti. The pathogen specific primer sets F.oF-F.oR, B.CF-B.CR, P.nF-P.nR, and P.cF-P.CR were tested for F. oxysporum, B.cactivora, P. nicotinae, and P. cactorum, respectively. The F.oF-F.oR primer set was designed from the Fusarium ITS region; the B.CF-B.CR and P.nF-P.nR primers respectively from Bipolaris and Phytophthora ITS1; and the P.cF-P.CR primer set from the Ypt1protein gene region. The quarantine fungal pathogen primer pairs were amplified to the specific number of base pairs in each of the following fungal pathogens: 210-bp (F. oxysporum), 510-bp (B. cactivora), 313-bp (P. nicotinae), and 447-bp (P. cactorum). The detection limit for the mono- and multiplex PCR primer sets was 0.1 ng of template DNA under in vitro conditions. Therefore, each primer set successfully diagnosed contamination of quarantine pathogens in export grafted cacti. Consequently, our methodology is a viable tool to screen contamination of the fungal pathogen in exported grafted cacti.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제48권1호
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• pp.26-33
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• 2021

당귀는 일반적으로 이용되는 대표적인 다년생의 약용식물이다. 최근 국제적 추세에 따라 자국의 유전자원의 발굴, 보존 등이 강화됨에 따라 인접국가와 국내 자생 당귀 계통을 판별할 수 있는 기준설정에 관한 연구의 필요성이 대두되고 있지만, 분자생물학적 판별 기술의 개발은 아직 미흡한 실정이다. 본 연구에서는 국내 토종 당귀인 참당귀와 세발당귀, 그리고 해외 유래 당귀 종의 기원을 판별하기 위해 핵의 리보솜에 존재하는 ITS 유전자단편에서 SNP를 이용한 판별 프라이머를 확보하였으며, 이를 보완하여 보다 신속하게 판별하기 위하여 ARMS-PCR 기술을 이용한 판별 마커와 그 조건을 확립하였다. 그러므로, 본 연구에서 개발된 SNP 마커는 다양한 지역 또는 국가에서 서식하는 당귀 종들의 신속한 확인을 위해 매우 유용하게 이용될 것으로 생각된다.

• 한국약용작물학회지
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• 제17권1호
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• pp.26-32
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• 2009

The region containing 18S rRNA gene, ITS 1 and part of the 5.8S rRNA gene of the Atractylodes japonica Koidz was amplified by PCR and the product cloned in a pBluescript SK II plasmid. DNA sequence of the cloned DNA was determined and submitted to the GenBank (accession number EU678363). Phylogenetic analysis of the ITS 1 DNA showed close similarity with the other plant species of the family Compositae. The extract of the plant materials of five different members of the family Compositae was analyzed by HPLC to detect atractylon. Extract of the A. japonica Koidz showed presence of significant amount of atractylon. However, noticeable amount of atractylon was not detected by the same analyses from the extracts of the other plants belonging to the family Compositae including Artemisia capillaris, Chrysantemum zawadskii, Eclipta prostrata or Taraxacum platycarpum.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제32권3호
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• pp.249-255
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• 2004

배추김치를 담근 직후 $4^{\circ}C$, $10^{\circ}C$, 그리고 $20^{\circ}C$에서 최고 50일까지 발효시키면서 매일 시료를 취하여 pH 및 적정산도의 변화를 경시적으로 관찰하였다. pH 와 산도는 발효온도에 따라서 크게 영향을 받은 것으로 나타났으며 이러한 결과는 발효 김치중의 미생물학적 성상이 발효 온도에 따라서 상당하게 달라진다는 점을 암시하였다. 각 발효 온도별로 숙성 김치의 상미범위로 알려진 적정산도 0.6～0.8%(pH 4.2)에 도달하여 유지되는 시간을 보면 $4^{\circ}C$에서는 20～30일, 1$0^{\circ}C$에서는 3～5일 그리고 $20^{\circ}C$에서는 1～2일이 소요되었다. 각 김치 시료로부터 vancomycin(300$\mu$g/m1)이 함유된 modified Lactobacilli MRS agar를 이용하여 vancomycin에 대한 내성을 나타내는 127주를 분리하였다. 이 중에서 저온에서 분리한 균주를 중심으로 13개를 선택하여 생화학적 동정(API 50 CHL kit)을 실시함으로서 분리균 중 Leuconostoc 속 균주가 차지하는 비율을 검토한 결과 Leuconostoc 속과 Lactobacillus 속은 각각 6 균주로 나타났으며, 한 균주는 생화학적 동정이 불가능하여 아직 보고되지 않은 새로운 균종으로 추정되었다. 생화학적 방법의 재현성이 문제가 되어 다시 ITS-PCR법을 사용하여 동정하였다. 그 결과 8 균주는 크기가 564 bp인 1개의 DNA 밴드를 형성하였으며, Leuconostoc mesenteroides ssp. mesenteroides/dextraniucm로 동정되었다. 또 3개의 DNA밴드를 나타낸 4개의 균주는 L. brevis로 동정 되었으나 1 균주는 ITS-PCR법으로도 동정할 수 없었다. 본 연구의 결과로 미루어 볼 때 4～$10^{\circ}C$ 발효초기에는 Leuconostoc 속이 우점 세균으로 지목되었고 발효기간이 경과 할수록 L. brevis도 김치의 균총에서 상당한 부분을 차지할 것으로 추정된다. 이에 반해서 $20^{\circ}C$에서는 Leuconostoc속 균주가 우세하게 출현할 것이라는 예상과는 달리 발효 초기부터 L. brevis와 같은 세균이 발효를 주도하는 균종으로 생각되었다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권4호
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• pp.2521-2523
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• 2013

Background: Papillary thyroid cancer or papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most common thyroid cancer. The fact that it occasionally occurs in women aged 30-40 years old suggests that genetic alterations are involved its genesis. Recently, activator mutations in BRAF gene have been relatively frequently discovered. Materials and Methods: In this study, we tested 63 DNA samples from PTC patients to identify the V600E mutation frequency in the Ahvaz population. DNA was isolated from formalin fixed paraffin-embedded (FFPE) PTC tumor tissues. Genotyping was performed by PCR-RFLP and confirmed by direct DNA sequencing of a subset of PCR products. PCR-RFLP data were reported as genotype frequencies and percentages. Results: Forty nine out of 63 patients (77.8%) had a mutated heterozygote form while 14 (22.2%) showed normal genotype but none demonstrated a mutant homozygote genotype. The frequency of V600E mutation was significantly high in PTC patients. Conclusions: These findings support involvement of V600E mutations in PTC occurrence in Iran. Assessment of correlations between BRAF V600E mutations and papillary thyroid cancer progression needs to be performed.

• 생명과학회지
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• 제8권3호
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• pp.285-293
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• 1998

이미 밝혀져 있는 mariner 전이인자의 전이효소를 암호화하는 부위에 대하여 퇴화성 primer를 사용하여 PCR 방법에 의해 누에(Bombyx mori)에서 ariner 유사 전이닌자의 잠정적인 전이효소 부위를 클로닝 하였다. BmoMAR로 망명된 이 PCR 클론으로부터 추론된 아미노산은 152개로 다섯 개의 종결코돈이 삽입되어 있었으며, Drosophila mauritiana의 active Mos 1에 37%의 아미노산 상동성을 보였다. 또한, 기존의 곤충들에서 밝혀진 mariner-like element에 대한 상동성은 DNA 수주에서는 Apis mellifera에 59% 그리고 아미노산 수준에서는 D. mauritiana 7.9 clone에 37% 상동성을 보였다. 이 결과는 mariner-like element가 B. mori에도 존재하고 있지만. 이들 전이인자의 전이효소를 암호화하는 부위에 종결코돈이 발견되는 것으로 보아서 비활성 전이인자 혹은 일존의 selenoprotein으로 추정된다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제56권2호
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• pp.113-119
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• 2018

Cryptosporidium species is an important cause of gastrointestinal infections globally. This study aimed to shed light on its role in diarrheic immunocompetent patients in Beni-Suef, Egypt and to compare three diagnostic methods. Two hundred diarrheic patients, $37{\pm}16.8year$ old, were enrolled. Stool samples were examined by light microscopy, using modified Ziehl-Neelsen stain (MZN) for Cryptosporidium spp. oocysts. Coproantigens were detected by sandwich ELISA. DNA molecular diagnosis was done by nested PCR. PCR yielded the highest detection rates (21.0%), compared to ELISA (12.5%) and MZN staining method (9.5%). The higher infection rates were in 20-40 year-old group, followed by 40-60 year-old. Association between epidemiologic factors was statistically not significant; positivity and gender, clinical manifestations, residence, source or water, or contact with animals. Cryptosporidiosis is an important enteric parasitic infection in Beni-Suef and PCR remains the gold standard for diagnosis.