• 제목/요약/키워드: ITS-G5

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진딧물의 전 ribosomal RNA 염기배열 (Nucleotide Sequences of an Aphid ribosomal RNA Unit)

  • 권태영;안승락;송철;박종균;김영섭;황재삼;권오유
    • 생명과학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.32-39
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    • 1998
  • 진딧물이 하나의 ribosomal RNA 유전자(rDNA)단위는 총 길이가 13,061bp이며 총 G/C비율은 59%이다. 그것을 구성하고 있는 각 영역의 길이와 G/C비율은 다음과 같다. 5’ETS는 G/C비율이 69%이고 843bp이다 . 18S rRNA 는 2,469bp이며 G/C비율은 59%이다. ITS I길이는 229bp이며 70%의 G/C비율이다. 5.8S rRNA는 160bp이며 63%의 G/C비율이다. ITS II는 325bp이며 70%dml G/C비율이다. 28S rRNA는 4, 147bp이고 60%의 G/C비율이다. IGS는 4,888bp로 55%의 G/C비율이다.

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Molecular Identification of Gyrodinium impudicum and Gymnodinium sanguineum by Comparing the Sequences of the Internal Transcribed Spacers 1, 2 and 5.8S Ribosomal DNA

  • Kim Gi Young;Ha Myoung-Gyu;Cho Eun Seob;Lee Tae-Ho;Lee Sang Jun;Lee Jae-Dong
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제2권1호
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    • pp.66-77
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    • 1999
  • The sequences coding for the 5.8S rDNA and the internal transcribed spacers (ITS1 and ITS 2) from the isolates of nine isolates of Gyrodinium impudicum and two isolates of Gymnodinium sanguineum species were amplified, sequenced and compared with the previously known Alexandrium species and Gymnodinium catenatum. The genetic distance analyses based on the sequence alignment indicated that Gymnodinium catenatum and Gyrodinium impudicum species were some related, Alexandrium species was distant. G. catenatum and G. sanguineum were quite separate, but these two species belonged to the same genus. G. impudicum and G. catenatum forming the closet cluster showed some variation in the alignment of ITS regions. The length of ITS1 varied more than that of ITS2 and the length of ITS1 and ITS2 was different for each G. impudicum, Gymnodinium and Alexandrium species. Also, the length of ITS1 was shorter than that of ITS2. However, on the sequences of G. sanguineum, the length of ITS1 was longer about 23 nucleotides than that of ITS2. The phylogenetic analysis and rDNA similarity of G. impudicum and G. catenatum $(59\%)$ is higher than the that of G. catenatum and G. sanguineum $(55\%)$. It was thought that the phylogenetic analysis and the genetic distance revealed that G. impudicum and G. catenatum were clearly different species and G. impudicum may belong to the genus of Gymnodinium.

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Phylogenetic Relationship among Several Korean Coastal Red Tide Dinoflagellates Based on their rDNA Internal Transcribed Spacer Sequences

  • Cho, Eun-Seob;Kim, Gi-Yong;Park, Hyung-Sik;Nam, Byung-Hyouk;Lee, Jae-Dong
    • Journal of Life Science
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    • 제11권2호
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    • pp.74-80
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    • 2001
  • The nucleotide sequences of the internal transcribed spacer regions (ITS1 and ITS2) of ribosomal DNA (rDNA), and the 5.85 rRNA gene, have been determined for 13 strains of dinoflagellates in order to analyze the phylo-genetic relationship. The DNA sequences contained considerable variation in the ITS regions, but little in the 5.85 rDNA. In addition, the ITS1 was more variable than the ITS2 in all species examined. The nucleotide length of this region varied from 519 bp to 596 bp depending on the taxa. The investigated taxa were divided into three large groups based on the ITS length, i. e., a group with short ITS region (A. fraterculus and Alexandrium sp.), a with ITS region group (P. micans, P. minimum and P. triestinum) and a with ITS region group (G. impudicum, C. polykrikoides, G. sanguineum, G. catenatum and H. triquetra). The relationship between nucleotide length of ITS1 and that of ITS2 was negative, whereas G+C content and nucleotide length showed positive correlation. In phylogenetic analyses producing NJ trees, the topology was similar cluster and clearly divided the taxa into three groups based on 5.8S rDNA that were similar to those based on morphological characteristics. In particular, G. impudicum was more closely related to G. catenatum than to C. polykrikoides using phylogenetic analysis. From this study, we chew that the length of ITS region contributes to discriminate Korean harmful algal species and ITS analysis is a useful method for resolving the systematic relationships of dinoflagellates.

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ITS II 영역의 DNA 염기서열 분석에 의한 불로초(Ganoderma)속의 계통분류학적 고찰 (Phylogenetic Study of Ganoderma spp. Based on the DNA Sequences in ITS II Region)

  • 박동석;고승주;류진창;성재모
    • 한국균학회지
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    • 제27권1호통권88호
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    • pp.39-43
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    • 1999
  • 불로초의 계통 분류학적 조사를 위해 불로초속 중 8종(Ganoderma lucidum, G. tsugae, G. pfeifferi, G. resinaceum, G. australe-applanatum, G. oregonense, G. neo-japonicum, G. applanatum) 12균주와 out-group 균주로는 Inonotus xeranticus의 rDNA ITS II를 PCR로 증폭하여 염기서열을 비교 조사하였다. 불로초 속 중 ITS II 영역의 길이는 $247{\sim}257\;bp$로 분포하였고 종간 상동성은$70{\sim}100%$ 로 조사되었다. 계통도를 분석한 결과는 5개의 군(cluster)을 형성하였고 G. tsugae는 각각의 G. lucidum과 하나의 clade를 이루어 두 종은 서로 매우 밀접하게 진화된 것으로 사료되었다. 본 조사에서는 국내에서 재배되고 있는 불로초(G. lucidum)는 그 발생지 및 국외 ITS염기서얼 자료와 비교 및 분석할 때 G. tsugae로 하는 것이 타당할 것으로 사료되었다.

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도열병균(Magnaporthe grisea)의 Ribosomal DNA의 ITS II 부위 핵산 염기서열을 이용한 균주간 근연관계 비교 (Comparison of Relationships in Infraspecies of Magnaporthe grisea Using DNA Sequence of Internal Transcribed Spacer II Region in Ribosomal DNA)

  • 배신철;이신우;이인구;예완해;류진창
    • 한국식물병리학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.91-98
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    • 1996
  • 벼도열병균 14개 균주와 벼 이외 화본과 식물 도열병균 12개 균주를 대상으로 rDNA의 ITS II 부위를 증폭하여 그들의 핵산 구조 차이를 분석함으로 도열병균 균주간 분류를 시도하였다. 5.8S rDNA의 3`-말단 부위와 28S rDNA의 5`-말단 부위의 sequence 중 5`-CCCGGGAATTCGCATCGATCGATCGAATGAAGA-ACGCAGC-3`와 5`-CCCGGGATCCTCCGCTTATT-GATATGC-3`를 이용하여 PCR 증폭을 하였을 때 벼도열병균 14개 균주는 동일한 길이의 단일 밴드를 형성하였으며 벼 이외 화본과 식물 도열병균에서는 레드톱 식물로부터 분리한 도열병균만이 나머지 균주보다 38bp가 더 큰 길이를 가진 밴드를 형성하였다. PCR로 증폭된 DNA를 HaeIII와 MspI 제한효소로 절단하였을 때 벼도열병균 레이스간에는 제한효소 절단에 의한 전기영동 밴드 형태 차이를 관찰할 수 없었으나, 벼 이외 화본과 식물 도열병균 12개 균주는 3군으로 구분할 수 있었다. 벼도열병균 90=054와 강아지풀에서 분리한 도열병균 G90-5, 기장에서 분리한 G88-4, 바랭이에서 분리한 G88-5 그리고 레드톱에서 분리한 RT 균주의 ITS II 부위의 DNA 염기서열 비교 분석에 의하면 G88-4와는 다른 HaeIII와 MspI 제한효소 위치를 가지고 있었기에 제한효소 절단에 의한 전기영동 형태가 상이하였다. 또한 RT균주는 HaeIII와 MspI위치가 존재하지 않았다.

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냉동 자연 송이버섯의 피클 조리법 표준화를 위한 연구 (A Study on the Characteristics of Pine-tree Mushroom(Tricholoma matsutake Sing.) Pickle for the Standard Recipe)

  • 박미란
    • 한국조리학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.55-66
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    • 2008
  • This study investigated the rheological and sensory characteristics of pickle with frozen pine mushroom. P3(Developed pickle seasoning) was the best by preference among three kinds of pine mushroom pickle seasoning. For flavor and functionality, pine mushroom pickle was processed by using three kinds of method(P3-1: P3+cinnamon 10 g, P3-2: P3+licorice 10 g and P3-3: P3+licorice 5 g+cinnamon 5 g). As a result, the product from P3-3(P3+licorice 5 g+cinnamon 5 g) was the best preferred pine mushroom pickle. The pH value of P3-3 was 2.15, 42.9 degrees Brix, and its color value was L(54.65), a(-1.61), b(17.87). Its texture level was higher than that of other products, but it would be lowered on storage. Until the 28th day of storage, microorganisms in pine mushroom pickle seasoning were detected less than 30 CFU/mL.

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굴 세척액을 이용한 인스턴트 분말 수프의 제조 및 특성 (Preparation of Instant Powdered Soup Using Oyster Wash Water and Its Characteristics)

  • 김진수;허민수
    • 한국식품과학회지
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    • 제33권5호
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    • pp.534-539
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    • 2001
  • 굴통조림 가공부산물인 세척수를 효율적으로 이용하기 위하여 굴세척액을 이용한 인스턴트 분말수프의 제조를 시도하였다. 대조구인 굴 열수추출물 분말 수프는 열수추출물 분말에 식염, 분말크림, 유대체 분말, 밀가루, 대두분말, 전분, 글루코스, 양파가루의 일정량씩을 각각 혼합하여 제조하였다. 굴세척액 분말수프는 열수추출물 분말 대신에 세척액 분말을 첨가하고, 기타 첨가물의 경우 굴 열수추출물 분말 수프와 같은 비율로 첨가하여 제조하였다. 굴통조림 가공부산물 유래 분말 수프인 세척수 분말 수프는 탄수화물이 71.1%로 거의 대부분을 차지하였고, 다음으로 조단백질(10.8%), 조회분(8.1%) 및 조지방(3.5%)의 순이었으며, 대조구인 열수추출물 분말 수프와 차이가 없었다. 굴세척액 분말 수프는 휘발성염기질소, 생균수, 대장균군 및 수분활성이 각각 29.4 mg/100g, $4.6{\times}10^4\;CFU/g$, <18 MPN/100 g 및 0.246으로 위생적으로 안전한 인스턴트 식품이었다. 굴통조림 가공부산물 유래 분말수프의 주요 지방산은 16 : 0(31.5%), 18 : 0(10.4%) 및 18 : 1n-9(27.4%) 등이었고, 단백질의 화학가는 59.4%이었으며, 주요 무기질은 철이었다. 관능평가 결과 대조구인 열수추출물 분말 수프에 대하여 세척수 분말 수프의 경우 점도, 색조, 향 및 맛과 같은 모든 항목에서 차이가 없었다. 이상의 이화학적 및 관능적 검사 결과로 미루어 보아 굴통조림 가공부산물인 세척수는 분말화하여 배합농도를 적절히 조절하면 우수한 인스턴트 분말 수프의 소재로 이용 가능하다는 결론을 얻었다.

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시판 식육제품 중 N-Nitrosamine의 생성 제1보. 시판햄 및 소시지 중 N-Nitrosamine의 검출 (The formation of N-Nitrosamine in commercial Cured products 1. Occurrence of N-Nitrosamine in commercial Ham and Sausage)

  • 박계란;이수정;신정혜;김정균;성낙주
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.400-405
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    • 1998
  • 본 실험은 우리나라에서 생산되고 있는 시판 햄 26종과 소시지 30종을 구입하여 NA 함량을 GC-TEA로 분석하였고, 동시에 NA 생성에 영향을 미칠 것으로 판단되는 질산염 및 아질산염도 분석하였다. 시판햄의 질산염 및 아질산염 질소는 각각 1.2~16.6 mg/kg 및 0.6~2.3 mg/kg의 범위였으며, 소시지는 각각 0.1~21.1 mg/kg 및 0.1~7.8 mg/kg으로 아질산염 질소가 질산염질소에 비해 낮게 정량되었다. 대부분의 시판햄 및 소시지에서 NDMA가 검출되었으며, 햄의 경우 단일햄 및 혼합햄이 각각 $<0.5~61.5\;\mu\textrm{g}/kg\;및\;<0.5~12.5\;\mu\textrm{g}/kg$이었고, 단일소시지 및 혼합소시지가 각각 $0.5~36.8\;\mu\textrm{g}/kg\;및\;<0.5~61.5\;\mu\textrm{g}/kg$이었다. 햄보다 소시지에서 질산염 및 아질산염 함량이 높게 정량되었고 NDMA 함량은 혼합소시지에서 가장 높게 검출되었다.

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Resource Management in 5G Mobile Networks: Survey and Challenges

  • Chien, Wei-Che;Huang, Shih-Yun;Lai, Chin-Feng;Chao, Han-Chieh
    • Journal of Information Processing Systems
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    • 제16권4호
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    • pp.896-914
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    • 2020
  • With the rapid growth of network traffic, a large number of connected devices, and higher application services, the traditional network is facing several challenges. In addition to improving the current network architecture and hardware specifications, effective resource management means the development trend of 5G. Although many existing potential technologies have been proposed to solve the some of 5G challenges, such as multiple-input multiple-output (MIMO), software-defined networking (SDN), network functions virtualization (NFV), edge computing, millimeter-wave, etc., research studies in 5G continue to enrich its function and move toward B5G mobile networks. In this paper, focusing on the resource allocation issues of 5G core networks and radio access networks, we address the latest technological developments and discuss the current challenges for resource management in 5G.

Influence of Thyroxine on the Economic Parameters of the Bivoltine Silkworm, Bombyx Mori L.

  • Hugar, I.I.;Kaliwal, B.B.
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.130-137
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    • 1996
  • Thyroxine을 5, 10, 15$\mu$g/ml의 수준으로 이화성 누에 NB18 품종의 유충에 도말처리한 결과 유충, 견사선, 고치, 고치층 등의 무게가 증가되고 유충경과 일수는 단축되는 등, 누에의 실용형질이 개선됨을 확인하였다. 이러한 결과는 전반적으로 10-15$\mu$g/ml의 thyroxine 처리구에서 얻어졌고 5$\mu$g/ml처리구는 대조구와 유의차를 보이지 않았다. 화아율과 부화율은 thyroxine처리의 영향을 받지 않았고 유충경과일수는 단축되었다.

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