• Natural Product Sciences
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• 제25권3호
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• pp.238-243
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• 2019

In this study, the marker compounds of Curcumae Rhizoma (CR) were simultaneously quantified by high-performance liquid chromatography equipped with a photodiode array detector and the anti-inflammatory effects of CR extract and marker compounds in human benign prostatic hyperplasia epithelial-1 (BPH-1) cell lines were investigated. The marker components (4S,5S)-(+)-germacrone-4,5-epoxide, furanodienone, and germacrone, were separated on Gemini $C_{18}$ columns ($250mm{\times}4.6mm$, $5{\mu}m$) at $40^{\circ}C$ by using a gradient of two mobile phases eluting at 1.0 mL/min. Prostaglandin $E_2$ ($PGE_2$) levels in Human BPH-1 cells were determined with an ELISA kit. The coefficients of determination in a calibration curve of each analyte were all 0.9997. The limits of detection and quantification of the three compounds were $0.10-0.32{\mu}g/mL$ and $0.30-0.98{\mu}g/mL$, respectively. The content of three compounds, (4S,5S)-(+)-germacrone-4,5-epoxide, furanodienone, and germacrone, in the CR sample were found to be 5.79 - 5.92 mg/g, 4.72 - 4.86 mg/g, and 1.06 - 1.09 mg/g, respectively. Regarding pharmacological activity against benign prostatic hyperplasia, CR and its components significantly suppressed $PGE_2$ levels of BPH-1 cells. The established analysis method will help to improve quality assessment of CR samples and related products. In addition, CR and its components exhibit antiinflammatory activity in BPH-1 cells, suggesting the inhibitory efficacy of these compounds against the pathogenesis of BPH.

• Journal of Crop Science and Biotechnology
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• 제11권2호
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• pp.101-106
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• 2008

To identify inheritance of clubroot disease resistance genes in Chinese cabbage, seedling tests of $BC_1P_1,\;BC_1P_2$, and $F_2$ populations derived from $F_1$ hybrid(var. CR Saerona) using single spore isolate(race 4 identified with William's differential host) from Plasmodiophora brassciae were conducted. Resistance(R) and susceptible(S) plants segregated to 1:0 in backcross to the resistant parent. The $F_2$ population segregated in a 3(R):1(S) ratio. This result implied that the resistance of clubroot disease is controlled by a single dominant gene to the race 4 of P. brassicae in CR Saerona. To develop DNA markers linked to clubroot resistance genes, 185 plants of CR Saerona among $F_2$ populations were used. A total of 300 arbitrary decamer was applied to $F_2$ population using BSARAPD(Bulked segregant analysis-Randomly amplified polymorphic DNA). One RAPD marker linked to clubroot resistance gene in CR Saerona($OPJ_{1100}$) was identified. This marker was 3.1 cM in distance from resistance gene in $F_2$ population. This marker may be useful for a marker-assisted selection(MAS) and gene pyramiding of the clubroot disease resistant gene in Chinese cabbage breeding programs.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권3호
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• pp.328-333
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• 2007

Carboxypeptidase E (CPE) plays an important role in the regulation of the body fat content. Therefore, it has been suggested as candidate gene for traits related to meat quality in beef cattle. This study was conducted to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the CPE gene and to investigate association of SNP marker with carcass and meat quality traits in Korean cattle. Three SNPs were identified in the intron 4 (A309G SNP and C445T SNP) and exon 5 (C601T SNP) of the CPE gene by sequence analyses of CPE cDNA and genomic DNA samples. The sequences have been deposited in GenBank database with accession numbers AY970664 and AY970663. Genotyping of the gene-specific SNP marker was carried out using the PCR-RFLP with restriction enzymes DdeI for C445T SNP and NlaIII for C601T SNP. The frequencies of C and T alleles were 0.43 and 0.57 for C445T SNP and 0.42 and 0.58 for C601T SNP, respectively. Statistical analysis indicated that the C445T SNP showed a significant effect (p<0.05) on marbling score (MS) and breeding value of backfat thickness (BF-EBV), respectively. Animals with the CT genotype showed higher marbling score and backfat thickness than those with the TT genotype. This marker also showed a significant dominance effect for the MS and BF-EBV (p<0.05). However, no significant associations were observed between C601T SNP genotypes and all traits examined. The results suggest that the CPE gene may be used as a marker for carcass traits in Korean cattle.

• 한국균학회지
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• 제25권3호통권82호
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• pp.191-201
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• 1997

유전자의 삽입에 의해 발생하는 C. parasitica의 돌연변이체중 mycovirus에 감염된 것과 같이 색소와 포자를 적게 형성하는 균주(HSM1)를 선발하였다. 선발된 균주는 형태학적 병징외에도 laccase효소의 역가와 같은 생화학적 그리고 표지 유전자들을 통해 분자 생물학적인 특징도 virus에 감염된 균주와 동일한 특징을 나타냈다. HSM1에서 돌연변이가 일어날 부위를 cloning하여 조사한 결과, 유전자 삽입 부위는 C. parasitica의 두 유전자(Cpg2와Cpg3)의 사이(intergenic space)이며 유전자의 삽입 결과, HSM1에서 Cpg2의 발현이 오히려 증가됨이 관찰되었고, 나아가 이와 같은 현상은 mycovirus 감염 균주(UEP1)에서도 일어나고 있음을 확인하였다.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제3권1호
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• pp.1-5
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• 1998

One cervical cancer cell line, C9, carrying human papillomavirus type 18 (HPV18) genes that is one of the major etiologic concoviruses for cervical cancer was characterized. This cell line was further characterized for its capacity related to the epithelial cell proliferation, stratification and differentiation in reconstituted artificial epithelial tissue. The in vitro construction of three dimensional artificial cervical opithelial tissue has been engineered using C9 epithelial cancer cells, human foreskin fibroblasts and a matrix made of type I collagen by organotypic culture of epithelial cells. The morphology of paraffin embedded artificial tissue was examined by histochemical staining. The artificial epithelial tissues were well developed having multilayer. However, the tissue morphology was similar to the cervical tissus having displasia induced by HPV infection. The characteristics of the artificial tissues were examined by determinining the expression of specific marker proteins. In the C9 derived artificial tissues, the expression of EGF receptor, as epithelial proliferation marker proteins for stratum basale was observed up to the stratum spinosum. Another epithelial proliferation marker for stratum spinosum, cytokerations 5/6/18, were observed well over the stratum spinosum. For the differentiation markers, the expression of involucrin and filaggrin were observed while the terminal differentiation marker, cytokeratins 10/13 was not detected at all. Therefore the reconstituted artificial epithelial tissues expressed the same types of differentiation marker proteins that are expressed in normal human cervical epithelial tissues but lacked the final differentiation capacity representing characteristics of C9 cell line as a cancer tissue devived cell line. Expression of HPV18 E6 oncoprotein was also observed in this artifical cervical opithelial tissue though the intensity of the staining was weak. Thus this artificial epithelial tissue could be used as a useful model system to examine the relationship between HPV-induced cervical oncogenesis and epithelial cell differentiation.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제21권2호
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• pp.409-415
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• 2017

본 논문은 watershed를 이용한 차도 분할 알고리즘을 제안하고 있다. 제안된 알고리즘은 차량과 차선 정보를 이용해 차도 마커와 배경 마커를 자동 생성하는 automatic marked watershed를 이용한 영역 분할 알고리즘이고 이는 지나치게 많은 영역이나 마커를 위한 수작업 같은 watershed 기반 영역 분할의 문제점들을 해결할 수 있다. 차도 마커는 차선은 포함되나 차량은 배제되는 순수한 차도 영역을 위한 속성을 포함하고 배경 마커는 차량과 배경을 포함하는 나머지 영역을 위한 속성을 포함하고 있다. 실제 도로 영상에 적용된 영역 분할 결과들은 제안된 알고리즘은 다양한 환경에서 적절한 마커들을 생성할 수 있고, 주행 차로와 양옆 차로를 포함한 필수 차도 영역을 적절하게 분할할 수 있는 것을 보여주고, 성능 면에 있어서는 제안된 알고리즘은 수작업으로 생성된 마커를 사용한 기존 알고리즘과 대등함을 보여준다.

• 대한방사선치료학회지
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• 제22권1호
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• pp.25-32
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• 2010

목 적: 종양의 움직임을 고려하여 치료할 수 있는 RPM (Real time Position Management, Varian, USA) system을 사용하여 호흡을 고려한 방사선치료 시행 시, 제조사에서 제공하는 적외선 반사체는 일정각도 이상 couch가 회전할 경우 호흡신호 획득이 불가능하다. 이런 단점을 개선하고자 본 저자는 어느 각도에서나 호흡신호를 얻을 수 있는 3차원 적외선 반사체(3D infrared reflective marker)를 자체 개발하여 Kw-반사체라 명하고 그 유용성을 평가 하고자 한다. 대상 및 방법: 호흡신호의 안정성을 측정하기 위해 호흡운동을 재현 할 수 있는 3차원 구동팬텀(3D moving phantom) 위에 3가지 조건(A: couch 0도, 제조사의 반사체 B: couch 0도, Kw-반사체 C: couch 90도, Kw-반사체)의 적외선 반사체를 올려놓고 각각 3분 동안 호흡신호를 획득 하였다. 획득한 호흡신호는 호흡분석 프로그램(Labview ver 7.0)을 통해 최고값(peak value), 최저값(valley value), 표준편차(standard deviation), 변동값(variation value), 진폭값(amplitude value)을 획득하였다. 타겟의 회전 오차와 타겟의 이동범위를 알아보기 위해 3차원 구동팬텀 위에 B.B팬텀을 올려놓고 온-보드 영상장치(OBI)로 couch 0도와 90도 이미지를 획득한 후 B.B팬텀 중심에 위치한 ball bearing의 X, Y, Z값(mm)을 획득하였다. 결 과: 호흡신호를 분석한 결과 최고점에서 표준편차가 A: 0.002 B: 0.002 C: 0.003이고 진폭에 대한 호흡의 안정성은 A: 0.15% B: 0.14% C: 0.13%로 Kw반사체는 안정적으로 호흡신호를 얻을 수 있었다. couch 90도 회전 시 타겟인 ball bearing의 평균 회전오차는 X: -1.25 mm Y: -0.45 mm Z: +0.1 mm로 모든 방향에서 평균 1.3 mm 이내이고 타겟의 이동범위 차이도 평균 0.3 mm 이내였다. 결 론: couch가 회전하는 비동일면(Non-coplanar) 치료 시 Kw-반사체로 호흡신호를 얻은 결과 Kw-반사체는 안정적인 호흡신호를 획득할 수 있었고 제조사의 적외선반사체를 대체하기에 충분했다. 타겟의 회전오차와 이동범위 차이가 거의 없어 couch 회전 시 반사체 움직임의 변위가 호흡신호의 scale 및 진폭을 변화시킨 원인임을 알 수 있었다. 향후 couch angle값에 따른 진폭 높이의 변환 값을 연구해 적용한다면 비동일면에 대한 위상기반 gating 치료도 가능 할 것으로 사료된다.

• 한국버섯학회지
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• 제7권4호
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• pp.150-155
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• 2009

최근들어 수입량이 급증되고 있는 차가버섯의 분류체계를 확립하고, 이들 종 및 계통간의 유연관계 확립과 품종 구분을 위해 계통학적 정보를 지닌 ITS 영역의 염기서열, PCR-RFLP 및 STS 프라이머를 사용하여 종 특이적인 마커를 개발하였다. 시베리아 캄차카 반도에서 수집된 74008 균주의 염기서열을 이용하여 Inonotus spp.의 유연관계를 분석한 결과 2개의 그룹으로 나뉘어 졌고, I. obliquus DSM 856P균주와 약 98%의 가장 높은 유사성을 나타내어 차가버섯임이 확인되었다. 또한 ITS 증폭산물을 제한효소로 처리하여 밴드 패턴을 비교하였을 때 종 및 계통에 따라 밴드가 다르게 나타났으며, STS primer를 이용하여 증폭산물을 비교하였을 때 종간에는 밴드패턴이 다르나 계통내에서는 동일한 밴드패턴을 보였다. 따라서 차가버섯의 품종 구분을 위해서는 STS 마커와 PCR-RFLP를 동시에 사용함으로서 품종 구분이 좀 더 명확하리라 사료된다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제52권3호
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• pp.181-187
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• 2020

분변 칼프로텍틴(fecal calprotectin, FC)은 염증성 장질환의(inflammatory bowl disease, IBD)의 감별진단을 위한 표지자(marker)로 이용되고 있다. 또한 FC는 세균에 의한 분해가 어려워 실온에서도 1주일 정도 안정적으로 유지되며 대변 내에 균일하게 분포한다는 장점으로 치료효과의 판정과 재발을 에측하는 표지자로 활발히 연구되고 있다. 본 연구는 30~80대까지의 제주 거주 건강한 성인 남녀를 대상으로 하였다. 전체 건강대상군(N=45)의 FC 농도 범위는 0~545.9 ㎍/g로 아주 넓게 분포하였다. 건강한 성인들의 FC농도는 연령에 따라 유의한 차이를 보임을 알 수 있었으며 3개의 연령군 중에서 평균연령이 80.6세인 70세 이상의 연령군의 FC농도는 평균연령이 44세인 50세 미만의 연령군의 FC농도인 15.88 ㎍/g에 비해 약 10배 이상의 농도인 160.3 ㎍/g을 보였고 평균연령이 59.6세의 경우에도 50세 미만 연령층에 비해 2배 이상 농도인 35.46 ㎍/g 보여 연령과 FC 농도 간에는 유의한 상관관계를 보였다. 결론적으로 FC검사가 비침습적이며 비용 효과적이고 객관적인 IBD검사의 marker로 이용되기 위해서는 연령에 따른 정교한 cut-off 값이 필요하며 본 연구 결과가 IBD의 감별진단을 위한 기초자료를 제공할 수 있을 것으로 생각된다.

• Reproductive and Developmental Biology
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• 제35권4호
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• pp.399-405
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• 2011

The number of abandoned dogs is increasing with the worsening of the economy and the rising of feed value. It was becoming a serious social problem because of the disease transmission and destruction of natural ecosystems by abandoned dogs been wild animal. In order to solve these problems, companion dogs necessary to secure its own genetic information and to establish the systematic tracking system. Using multiplex-PCR method with 27 microsatellite marker (MS marker) divided 3 set, various alleles occurring to 6 dog breed (Labrador Retriever, German Shepherd, English Springer Spaniel, Belgian Malinois, Jindo Dog, PoongSan Dog) make use of markers to determine allele frequency and heterozygosity. MS marker FH2834 and FH2790 have only two allele and most were found in 13 alleles at FH3381 and FH3399. Average heterozygosity of MS marker is 0.534 and especially, heterozygosity represented the highest value of 0.765 at FH3381. So, it was recognized appropriate allele frequency for individual identification and paternity diagnosis in companion dogs. Using multiplex-PCR method with MS marker, various alleles occurring to dog breed make use of markers to deter mine individual identification and paternity diagnosis, traits associated biomarkers and breed-specific marker for faster, more accurate and ways to reduce the analysis cost. Based on this result, a scientific basis was established to the existing pedigree data by applying genetics additionally. Animal registration system is expected to be conducted nationwide in future. The method expects to very useful this system.