• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권24호
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• pp.10893-10898
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• 2015

Several molecular markers have been proposed as predictors of outcome in patients with glioblastomas. We investigated the prognostic significance of $O^6$-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) promoter methylation and TP53 mutation status dependent on isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1) mutation in glioblastoma patients. A cohort of 78 patients with histologically confirmed glioblastomas treated with radiation therapy and chemotherapy were reviewed retrospectively. We evaluated the prognostic value of MGMT promoter methylation and TP53 mutation status with regard to progression-free survival (PFS) and overall survival (OS). It was revealed that mutations in IDH1, promoter methylation of MGMT, TP53 mutation, age, Karnofsky performance status (KFS), and extension of resection were independent prognostic factors. In patients with an IDH1 mutation, those with an MGMT methylation were associated with longer PFS (p=0.016) and OS (p=0.013). Nevertheless, the presence of TP53 mutation could stratify the PFS and OS of patients with IDH1 wild type (p=0.003 and 0.029 respectively, log-rank). The MGMT promoter methylation and TP53 mutation were associated with a favorable outcome of patients with and without mutant IDH1, respectively. The results indicate that glioblastomas with MGMT methylation or TP53 mutations have improved survival that may be influenced by IDH1 mutation status.

• BMB Reports
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• 제48권5호
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• pp.266-270
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• 2015

Over the last decade, comprehensive genome-wide sequencing studies have enabled us to find out unexpected genetic alterations of metabolism in cancer. An example is the identification of arginine missense mutations of isocitrate dehydrogenases-1 and -2 (IDH1/2) in glioma, acute myeloid leukemia (AML), chondrosarcomas, and cholangiocarcinoma. These alterations are closely associated with the production of a new stereospecific metabolite, (R)-2-hydroxyglutarate (R-2HG). A large number of follow-up studies have been performed to address the molecular mechanisms of IDH1/2 mutations underlying how these events contribute to malignant transformation. In the meanwhile, the development of selective mutant IDH1/2 chemical inhibitors is being actively pursued in the scientific community and pharmaceutical industry. The present review article briefly discusses the important findings that highlight the molecular mechanisms of IDH1/2 mutations in cancer and provides a current status for development of selective mutant IDH1/2 chemical inhibitors. [BMB Reports 2015; 48(5): 266-270]

• Journal of Korean Neurosurgical Society
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• 제64권1호
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• pp.100-109
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• 2021

Objective : Diffuse astrocytic tumour (DAT) is a diffuse infiltrative astrocytoma tumour accompanied by molecular parameters such as the presence or absence of isocitrate dehydrogenase (IDH) gene mutations. Ki-67 is a marker for DAT proliferation, while programmed death ligand 1 (PD-L1) indicates an immune evasion mechanism. This study aimed to analyze the correlation among mutant IDH1 R132H, Ki-67, and PD-L1 immunoexpression in the DAT. Methods : A cross-sectional study was carried out on 30 paraffin blocks of DAT cases. Paraffin block samples consist of grade II (n=14), grade III (n=8), and grade IV (n=8). In this study, the immunohistochemistry-staining of mutant IDH1 R132H, Ki-67, and PD-L1 were carried out to determine the frequency of DAT with IDH1 mutations. Results : Our study shown the frequency of IDH1 mutations in grade II 50.0% (7/14), grade III 37.5% (3/8), and grade IV 12.5% (1/8). Our study also showed a difference in Ki-67 and PD-L1 expression between each the degree of DAT histopathology (p=0.0001 and p=0.002, respectively). There was an association between both mutant IDH1 R132H, and Ki-67 with PD-L1 expression in DAT (p=0.0087 and p=0.0049, respectively). Conclusion : DAT with the mutant IDH1 is frequently observed in grade II and small number of grade III. The expression of wild type IDH1, Ki-67, and PD-L1 were found to be higher in high grade DAT (grade III and grade IV). There is a correlation between each of mutant IDH1 status and Ki-67 with PD-L1 expression in DAT.

• BMB Reports
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• 제43권5호
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• pp.369-374
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• 2010

The PC12 is the widely used cell line to study neuronal differentiation. We had extensively investigated the details of protein expression in differentiated PC12 cells by proteomic analysis. The cells were incubated at the presence of nerve growth factor. We had analyzed the expression changes in the differentiating PC12 cells by 2-dimensional electrophoresis and the identification of the proteins using MALDI-TOF MS. By comparing expression pattern in the time course, we identified the candidate genes which are associated with neuronal differentiation. Among these genes, we performed real-time PCR analysis to validate $Idh3{\alpha}$ expression by the time course. To identify the function of $Idh3{\alpha}$ in neuronal differentiation stage, the transfection of $Idh3{\alpha}$ to PC12 cells was performed. As a result, we proved that up-regulation of $Idh3{\alpha}$ causes reduction in neural differentiation of PC12 cells. Based on these data, we suggest that $Idh3{\alpha}$ plays a role to the neuronal differentiation.

• 생명과학회지
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• 제26권4호
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• pp.414-418
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• 2016

본 연구에서는 제주흑돼지와 랜드레이스 품종 사이에서 생산된 F₂ 교배 집단의 경제형질과 isocitrate dehydrogenase 3, beta subunit (IDH3B) 유전자의 유전적 다형성의 상관관계를 시험하였다. IDH3B 유전자의 프로모터 지역에서 304-bp 삽입/결실 돌연변이를 기준으로 전체 1,105 F₂들에 유전자형 분석에 이용하였다. 기초축군과 F₁, F₂에서 세 가지 유전자형(AA, AB, BB)이 모두 발견되었다. 통계적 상관 분석결과에서 도체중(CW), 세 지점(4-5번 흉추 사이, 11-12번 흉추 사이, 13번 흉추-1번 요추 사이)에서 측정한 등지방두께와 도체장(CL)의 수준은 유전자형애 따른 유의적인 차이를 나타내었지만(p<0.05), 육색(MC), 등심단면적(EMA)과 근내지방도(MARB)은 유의적인 차이를 나타내지 않았다(p>0.05). IDH3B 동형접합자 BB를 보유한 F₂ 돼지들은 도체중이 더 무겁고(80.790±0.725 kg), 도체장은 더 짧은(101.875±0.336 cm) 양상을 보였다(p<0.05). 또한, IDH3B 유전자형 BB인 개체들은 IDH3B AA나 AB 유전자형에 비해 4-5번 흉추 사이, 11-12번 흉추 사이에서 측정된 등지방두께도 더 두꺼운 수준을 나타내었다(p<0.05). 이상의 결과들은 IDH3B의 유전적 다양성이 제주흑돼지와 랜드레이스와 관련된 교배육종 체계의 산육능력 향상을 위한 유전적 분자 표지인자로 활용될 수 있음을 나타내었다.

• BMB Reports
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• 제32권4호
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• pp.385-392
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• 1999

The $NAD^+$-specific activity of a dual coenzyme-specific isocitrate dehydrogenase (IDH; EC 1.1.1.41) from the primitive fungus Pythium ultimum was investigated to elucidate the regulatory factors that may influence the intracellular distribution of carbon and the availability of intermediates, e.g. citrate, for fatty acid synthesis. Inhibition of $NAD^+$-IDH activity by diphospho- and triphosphonucleotides (ATP, ADP, and GTP) reflected the sensitivity of this enzyme to cellular energy charge even though monophosphonucleotides (AMP and GMP) had little effect on activity. NADPH, but not NADH, substantially inhibited $NAD^+$-IDH activity, showing noncompetitive inhibition with isocitrate. Oxalacetate and ${\alpha}$-ketoglutarate showed competitive inhibition with isocitrate, while citrate and cis-aconitate showed mixed-noncompetitive inhibition with isocitrate. Inhibition by these substances ranged from 29 to 46% at 10 mM. The inhibitory effect of oxalacetate was increased synergistically by glyoxylate, which alone caused 31% uncompetitive inhibition at 10 mM, and a mixture of the two substances at 1 mM each showed 98% inhibition of $NAD^+$-IDH activity. The regulation of $NAD^+$-IDH in Pythium ultimum seems to be a complex process involving mitochondrial metabolites. The addition of glyoxylate (3 mM) and oxalacetate (3 mM) to the culture medium resulted in the production of 49% more lipid by P. ultimum.

• 생명과학회지
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• 제27권3호
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• pp.295-300
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• 2017

제주재래흑돼지와 듀록의 교배 $F_2$ 집단에서 경제형질과 isocitrate dehydrogenase 3, beta subunit (IDH3B) 유전자의 유전자형의 연관을 시험하였다. IDH3B 유전자형은 promoter 영역에서 304-bp 삽입/결실 절편의 유무를 기준으로 기초축군과 $F_1$, $F_2$에서 판독하였다. 세 가지 유전자형(AA, AB, BB)이 $F_1$과 $F_2$에서는 모두 발견되었으나, JBP에서는 AA 유전자형이, Duroc에서는 BB 유전자형이 발견되지 않았다. 연관 분석결과에서 도체중(CW), 등지방두께(BFT)와 등심단면적(EMA)의 수준이 유전자형에 따라 유의적인 차이를 보였으나(p<0.05), 각기 다른 성장시기별로 측정된 체중들과 일당증체량을 포함한 성장형질, 유두수를 포함한 번식형질, 등심 내 조지방함량(CFAT)의 수준은 유의적인 차이가 없었다(p>0.05). IDH3B AA 동형접합자인 $F_2$ 돼지들은 다른유전자형을 보유한 개체들에 비해 도체중이 더 무겁고($72.92{\pm}11.133kg$), 등지방두께는 더 두껍고($25.75{\pm}6.06mm$), 등심단면적은 더 넓은 수준($23.82{\pm}4.825cm^2$)을 보였다(p<0.05). 이상은 비육돈 생산 후기에 근내지방의 축적과 상관없이, 등심단면적, 등지방두께, 도체중의 증가가 IDH3B 유전자형과 연관된 생물학적 작용에 의한 결과라 하겠다. 돼지 IDH3B의 304-bp 삽입 대립 유전자는 제주재래흑돼지와 Duroc-관련 분자육종체계에서 돈육 생산성 향상을 위한 분자도움선발의 유전적 마커로 이용될 것으로 기대된다.

• 한국자원식물학회지
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• 제2권2호
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• pp.312-318
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• 1989

가을무우의 궁중 무우 6품종 및 연마무우 4품종에 관하여 Acp, NDH 및 IDH의 다형적변이를 조사하였다. 1. Acp에서는 7개의 Band가 (PH 7.0~8.0),NH에서는 2개의 Band가 (PH7.5~8.0) IDH에서는 3개의 Band가 (PH 5.0~6.0) 검출되었다. 2.Acp-1, -2, -3, -5 및 -6의 band, NDH-2의 Band 및 IDH-2의 Band 가 전품조에서 고정적인 Band로 검축되었다. 3.궁중군에서는 NDH-1, Acp-4 의 Band가 전혀 검출되지 않았다. 4. 다형적인 변이가 보여진 Acp-4 및 -7, NDH-1, IDH-1 및 -3의 5가지의 Band에서 품종판별로 Marker로 활용할 수 있음이 밝혀졌다.

• 한국수산과학회지
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• 제27권1호
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• pp.83-88
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• 1994

연어, 산천어, 무지개송어 등 우리나라의 연어과 어류에 있어서 종의 식별 및 3배체 어류의 판정에 동위효소를 genetic marker로 활용할 수 있는지의 가능성을 타진하고자 LDH, MDH, IDH, a-GPDH, ME, 6-PGD, PGI 및 PGM 등 8개 동위효소에 대하여 골격근 조직을 중심으로 분석을 실시하였다. 이중 골격근 조직의 MDH-B와 IDH loci에서 종간에 뚜렷한 차이를 나타내었으며 특히 MDH-B loci의 b 유전자의 출현빈도는 연어나 산천어에서는 거의 나타나지 않았으나 무지개송어에서는 매우 높게 나타났다. 또한 IDH도 무지개송어와 산천어간의 genetic marker로 유용할 것으로 보인다. 한편, PGI는 3배체 어류 생산시 친어를 상호 대립유전자(allele)의 동형접합(homozygote)인 개체를 사용할 경우 이의 효율적인 판정을 위한 새로운 marker로 활용할 수 있는 가능성을 가지고 있는 것으로 나타났으며 다른 loci에서는 별다른 차이를 발견할 수가 없었다.

• 한국산림과학회지
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• 제78권2호
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• pp.242-247
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• 1989

경북지방(慶北地方)에 자생(自生)하는 소나무 및 곰솔을 중심(中心)으로 동위효소(同位酵素)에 의한 유전적(遺傳的) 변이(變異)를 조사(調査)하기 위하여 종자(種子)의 megagametophyte 조직(組織)으로 IDH, ME 및 PGI의 유전양상(遺傳樣相)을 조사(調査)하였다. IDH는 하나의 유전자좌(遺傳子座)에 소나무는 2개(個)의 대립유전자(對立遺傳子)가 출현(出現)하였고 곰솔은 하나의 대립유전자(對立遺傳子)인 $A_1$만 나타나서 차이(差異)가 없었다. ME는 하나의 유전자좌(遺傳子座)에 소나무와 곰솔 모두 4개(個)의 대립유전자(對立遺傳子)가 출현(出現)하였다. PGI는 2개(個)의 유전자좌중(遺傳子座中) A-locus는 하나의 대립유전자(對立遺傳子)만이 나타나서 변이(變異)가 없었고 B-locus는 소나무에서는 5개(個)의 대립유전자(對立遺傳子)가 나타나서 곰솔에서는 $B_1$, $B_2$ 2개(個)의 대립유전자(對立遺傳子)만이 출현(出現)하고 있었다. 특히 PGI에서는 band가 multiple band로 나타나며 하나의 대립유전자(對立遺傳子)는 4-5개(個)의 band로 구성되어 있었다. 이상(以上)의 IDH, ME 및 PGI의 대립유전자(對立遺傳子) 분리비(分離比)를 ${\chi}^2$-검정(檢定)한 결과(結果) 신뢰도(信賴度)가 0.5-0.95로서 거의 1 : 1로 분리(分離)되고 있었다.