Objectives: This study investigated the effects of a hydrofluoric acid (HA; solution of hydrogen fluoride [HF] in water)-based smart etching (SE) solution at an elevated temperature on yttria-stabilized tetragonal zirconia polycrystal (Y-TZP) ceramics in terms of bond strength and morphological changes. Materials and Methods: Eighty sintered Y-TZP specimens were prepared for shear bond strength (SBS) testing. The bonding surface of the Y-TZP specimens was treated with 37% phosphoric acid etching at 20℃-25℃, 4% HA etching at 20℃-25℃, or HA-based SE at 70℃-80℃. In all groups, zirconia primers were applied to the bonding surface of Y-TZP. For each group, 2 types of resin cement (with or without methacryloyloxydecyl dihydrogen phosphate [MDP]) were used. SBS testing was performed. Topographic changes of the etched Y-TZP surface were analyzed using scanning electron microscopy and atomic force microscopy. The results were analyzed and compared using 2-way analysis of variance. Results: Regardless of the type of resin cement, the highest bond strength was measured in the SE group, with significant differences compared to the other groups (p < 0.05). In all groups, MDP-containing resin cement yielded significantly higher bond strength values than MDP-free resin cement (p < 0.05). It was also shown that the Y-TZP surface was etched by the SE solution, causing a large change in the surface topography. Conclusions: Bond strength significantly improved when a heated HA-based SE solution was applied to the Y-TZP surface, and the etched Y-TZP surface was more irregular and had higher surface roughness.
Tooth bleaching has been prevailing recently for its ability to recover the color and shape of natural teeth without reduction of tooth material. However, it has been reported that bleaching procedure adversely affects the adhesive bond strength of composite resin to tooth. At the same time the bond strength was reported to be regained by application of some chemical agents. The purpose of this in vitro study was to investigate the effect of the removal of residual peroxide on the composite- enamel adhesion and also evaluated fracture mode between resin and enamel after bleaching. Sixty extracted human anterior and premolars teeth were divided into 5 groups and bleached by combined technique using of office bleaching with 35 % hydrogen peroxide and matrix bleaching with 10% carbamide peroxide for 4 weeks. After bleaching, the labial surfaces of each tooth were treated with catalase, 70% ethyl alcohol, distilled water and filled with composite resin. Shear bond strength was tested and the fractured surfaces were also examined with SEM. Analysis revealed significantly higher bond strength values. (p<0.05) for catalase-treated specimens, but water-treated specimens showed reduction of bond strength, alcohol- treated specimens had medium value between the two groups(p<0.05). The fracture mode was shown that the catalase group and the alcohol group had cohesive failure but the water sprayed group had adhesive failure. It was concluded that the peroxide residues in tooth after bleaching seems to be removed by gradual diffusion and the free radical oxygen from peroxide prevents polymerization by combining catalyst in the resin monomer. Therefore it may be possible to eliminate the adverse effect on the adhesion of composite resin to enamel after bleaching by using water displacement solution or dentin bonding agent including it for effective removal of residual peroxide.
13.56 MHz rf플라즈마를 이용하여 증착된 DLC(diamond-like carbon) 박막의 광학적 특성에 대해 조사하였다. $CH_4$가스를 원료가스로 하여 PECVD법에 의해 DLC 박막을 형성하였으며 이때 RF power, working pressure, 보조가스의 종류 및 양에 따른 투과도(transmittance)와 optical band gap의 변화를 관찰하였다. RF power가 증가하고 working pressure가 높을수록 optical band gap이 감소하는 결과를 얻을 수 있었고. FT-IR분석을 이용하여 탄소-수소 결합 양을 관찰함으로써 DLC 박막의 결합구조 변화를 증명할 수 있었다. 그리고 수소와 질소를 첨가한 경우 증착시 탄소-수소 결합을 끊는 역할을 하여 optical band gap이 감소하는 결과를 얻을 수 있었다.
We studied the interaction of 3,3',3'',3'''-ethylenetetrakis-4-hydroxycoumarin (EHC) with bovine serum albumin (BSA) in acetate buffer and phosphate buffer with different pH values by UV-vis absorption spectrometry and fluorescence spectrometry respectively. It was found that the pH values of the buffer solutions had an effect on the interaction process. In acetate buffer of pH 4.70, the carbonyl groups in EHC bound to the amino groups in BSA by means of hydrogen bond and van der Waals force, which made the extent of peptide chain in BSA changed. By contrast, in phosphate buffer of pH 7.40, hydrophobic force played a major role in the interaction between EHC and BSA, while the hydrogen bond and van der Waals force were also involved in the interaction. The results of spectrometry indicated that BSA could enhance the fluorescence intensity of EHC by forming a 1:1 EHC-BSA fluorescent complex through static mechanism at pH 4.70 and 7.40 respectively. Furthermore, EHC bound on site 1 in BSA.
Empirical force-field method를 단결정 회절방법으로 구조가 연구된 여덟개의 1,6-anhydropyranose 분자구조$^{13{\sim}21}$에 적용하였다. 이론적 계산에서도 분자들간의 pyranose고리 conformation의 $^1C_4$와 $E_0$ 사이간의 차이는 실험치와 비슷하게 얻어졌다. Five-membered anhydro 고리의 분자들간의 작은 conformation 차이는 잘 예측되지 않았다. C-C결합 길이의 계산치는 실험치와 0.012${\AA}$내에서, C-O결합 길이는 0.027${\AA}$내에서, non-hydrogen atom의 결합각은 1.9$^{\circ}$이내에서 일치되고 있다
1-염화 및 2-염화나프탈렌술포닐의 가용매 분해반응을 아세톤-물혼합용매속에서 전기전도도법으로 실시하여 여러가지 용매 파라미터 및 활성화파라미터와 관련지워 용매효과와 반응 메카니즘을 논의하였다. 반응은 $S_N2$ 메카니즘으로 진행되나 물함량이 크면 bond-breaking이 약간 증가한다. 또한 바닥상태 안정화효과와 천이상태에서의 peri-hydrogen효과 때문에 2-나프탈렌 화합물의 반응속도가 1-나프탈렌 화합물의 반응속도보다 빨랐으며 이 효과는 에탄올-물 혼합용매속에서와 비슷하였다.
Bao, Guang-Kai;Zhou, Lu;Wang, Tai-Jin;He, Lu-Fen;Liu, Tao
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제35권7호
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pp.2097-2108
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2014
Chemical feature based quantitative pharmacophore models were generated using the HypoGen module implemented in DS2.5. The best hypothesis, Hypo1, which was characterized by the highest correlation coefficient (0.96), the highest cost difference (61.60) and the lowest RMSD (0.74), consisted of one hydrogen bond acceptor, one hydrogen bond donor, one hydrophobic and one ring aromatic. The reliability of Hypo1 was validated on the basis of cost analysis, test set, Fischer's randomization method and GH test method. The validated Hypo1 was used as a 3D search query to identify novel inhibitors. The screened molecules were further refined by employing ADMET, docking studies and visual inspection. Three compounds with novel scaffolds were selected as the most promising candidates for the designing of Mcl-1 antagonists. Finally, a 10 ns molecular dynamics simulation was carried out on the complex of receptor and the retrieved ligand to demonstrate that the binding mode was stable during the MD simulation.
Receptor-oriented pharmacophore-based in silico screening is a powerful tool for rapidly screening large number of compounds for interactions with a given protein. Inhibition of the enzyme catechol-Omethyltransferase (COMT) offers a novel possibility for treating Parkinson's disease. Bisubstrate inhibitors of COMT containing the adenine of S-adenosylmethionine (SAM) and a catechol moiety are a new class of potent and selective inhibitor. In the present study, we used receptor-oriented pharmacophore-based in silico screening to examine the interactions between the active site of human COMT and bisubstrate inhibitors. We generated 20 pharmacophore maps, of which 4 maps reproduced the docking model of hCOMT and a bisubstrate inhibitor. Only one of these four, pharmacophore map I, effectively described the common features of a series of bisubstrate inhibitors. Pharmacophore map I consisted of one hydrogen bond acceptor (to Mg2+), three hydrogen bond donors (to Glu199, Glu90, and Gln120), and one hydrophobic feature (an active site region surrounded by several aromatic and hydrophobic residues). This map represented the most essential pharmacophore for explaining interactions between hCOMT and a bisubstrate inhibitor. These results revealed a pharmacophore that should help in the development of new drugs for treating Parkinson's disease.
During the fermentative production of 1,3-propanediol under high substrate concentrations, accumulation of intracellular 3-hydroxypropionaldehyde will cause premature cessation of cell growth and glycerol consumption. Discovery of oxidoreductases that can convert 3-hydroxypropionaldehyde to 1,3-propanediol using NADPH as cofactor could serve as a solution to this problem. In this paper, the yqhD gene from Klebsiella pneumoniae DSM2026, which was found encoding an aldehyde reductase (KpAR), was cloned and characterized. KpAR showed broad substrate specificity under physiological direction, whereas no catalytic activity was detected in the oxidation direction, and both NADPH and NADH can be utilized as cofactors. The cofactor binding mechanism was then investigated employing homology modeling and molecular dynamics simulations. Hydrogen-bond analysis showed that the hydrogen-bond interactions between KpAR and NADPH are much stronger than that for NADH. Free-energy decomposition dedicated that residues Gly37 to Val41 contribute most to the cofactor preference through polar interactions. In conclusion, this work provides a novel aldehyde reductase that has potential applications in the development of novel genetically engineered strains in the 1,3-propanediol industry, and gives a better understanding of the mechanisms involved in cofactor binding.
FLOWERING LOCUS T (FT) and TERMINAL FLOWER 1 (TFL1) in Arabidopsis are homologous proteins that perform opposite functions: FT is an activator of flowering, and TFL1 is a repressor. It was shown before that change of a single amino acid (His88) of TFL1 to the corresponding amino acid (Tyr) of FT is enough to convert the floral repressor to an activator. However, structural basis of the functional conversion has not been understood. In our molecular dynamics simulations on modified TFL1 proteins, a hydrogen bond present in native TFL1 between the His88 residue and a residue (Asp144) in a neighboring external loop became broken by change of His88 to Tyr. This breakage induced conformational change of the external loop whose structure was previously reported to be another key functional determinant. These findings reveal that the two important factors determining the functional specificities of the floral regulators, the key amino acid (His88) and the external loop, are correlated, and the key amino acid determines the functional specificity indirectly by affecting the conformation of the external loop.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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