Plasma silicon oxynitride film has been applied as a final passivation layer for semiconductor devices, because it has high resistance to humidity and prevents from alkali ion's penetration, and has low film stress. Structure properties of plasma silicon oxynitride film have been studied experimentally by the use of FT-IR, AES, stress gauge and ellipsometry. In this experiment,Si-N bonds increase as NS12TO/(NS12TO+NHS13T) gas ratio increases. Peaks of Si-N bond, Si-H bond and N-H bond were shifted to high wavenumber according to NS12TO/(NS12TO+NHS13T) gas ratio increase. Absorption peaks of Si-H bond were decreased by furnace anneal at 90$0^{\circ}C$. The atomic composition of film represents that oxygen atoms increase as NS12TO/(NS12TO+NHS13T) gas ratio increases, to the contrary, nitrogen atoms decrease.
To understand the complex hydrogen bonding structure, several phenolic derivatives and benzoxazine model compounds are synthesized and characterized by Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). The estimation of molar extinction coefficients for various types of hydrogen bonding species is systematically carried out by the curve-resolving of FT-IR spectra. The distribution of hydrogen bonding species in benzoxazine model dimers is quantitatively analyzed. It is revealed that benzoxazine dimers and BA-a polybenzoxazine are mainly composed of intramolecular interaction rather than intermolecular interaction.
The hydrogenation of $AlB_2$-type BaGaGe exhibits a metal to insulator (MI) transition, inducing a puckering distortion of the original hexagonal [GaGe] layers. We investigate the electronic structure changes associated with the hydrogen-induced MI transition, using extended H$\ddot{u}$ckel tight-binding band calculations. The results indicate that hydrogen incorporation in the precursor BaGaGe is characterized by an antibonding interaction of $\pi$ on GaGe with hydrogen 1s and the second-order mixing of the singly occupied antibonding $\pi^*$ orbital into it, through Ga-H bond formation. As a result, the fully occupied bonding $\pi$ band in BaGaGe changes to a weakly dispersive band with Ge pz (lone pair) character in the hydride, which becomes located just below the Fermi level. The Ga-Ge bonds within a layered polyanion are slightly weakened by hydrogen incorporation. A rationale for this is given.
When isolated phenol or a small phenol-solvent cluster is excited to the $S_1\;state\;of\;{\pi}{\pi}^*$ character, the hydrogen atom of the hydroxyl group dissociates via a ${\pi}{\sigma}^*$ state that is repulsive along the O-H bond. We computationally investigated the substitution effects of an amino group on the excited state hydrogen transfer reaction of phenol. The time-dependent density functional theory (TDDFT) with B3LYP functional was employed to calculate the potential energy profiles of the ${\pi}{\pi}^*$ and the ${\pi}{\sigma}^*$ excited states along the O-H coordinate, together with the orbital shape at each point, as the position of the substituent was varied. It was found that the amino substitution has an effect of lowering the ${\pi}{\sigma}^*$ state and enhancing the excited state hydrogen transfer reaction.
C-terminus specific immobilization often results in a increased structural stability resistant to various denaturation factors. In order to elucidate the immobilization effect on the c-terminus in molecular level, we made over 200 protein data set from Protein Data Bank(PDB), analyzed c-terminus structure of each protein, and investigated the structural relationship with the stabilizing factors such as hydrogen bond, ion pairs, cation pi, disulfide bond, solvation free energy, surface area, flexibility and so on.
MeOH-DMSO 혼합용매중에서 t-butyl halide의 가메탄올 분해반응 속도상수 및 활성화 파라미터를 전기전도도법으로 측정하였고, Taft의 분광용매화 변수인 용매의 극성-편극성(${\pi}^{\ast}$), 수소결합주기산도(${\alpha}$) 및 수소결합 받기염기도(${\beta}$)를 분광법에 의해서 5가지의 지시약을 이용하여 측정계산하였다. 분광용매화변수와 반응속도상수로부터 얻은 활성화파라미터를 써서 용매의 부피조성비에 따른 가용매분해반응의 속도상수 변화를 논의한 결과, t-butyl halide의 이온화에 용매의 ${\pi}^{\ast}$, ${\alpha}$ 및 ${\beta}$가 협동적으로 기여했고, 또한 이탈기와 혼합용매사이의 이온-쌍극자 작용과 수소결합주기-받기 작용과 같은 독특한 상호작용이 전이상태의 안정화에 미치는 가장 중요한 용매효과 인자들임을 밝혔다.
살리실알데히드-4-피페리디노티오세미카르바죤의 분잠 및 결정구조를 X-선 회절법으로 밝혔다. 이 화합물의 결정은 직각비등축정계에 속하며 공간군은 $P2_12_12_1$이다. 단위세포상수는 a = 6.52(2), b = 13.42(4), c = 14.92(4)${\AA}$으로서 4개 분자를 포함하고 있다. 원자의 좌표는 중원자법을 이용하여 결정하였고 최소자승법으로 정밀화하였다. 1019개의 구조인자에 대한 최종 R값은 0.10이다. 티오세미카르바죤 화합물에서 C=S결합은 N-NH 결합에 대해 트랜스 위치에 존재하는 경우가 많은데 살리실알데히드-4-피페리디노티오세미카르바죤에서는 시스위치에 있다. 히드록실기의 산소원자는 O-H${\cdots}$O의 분자내수소결합과 N-H${\cdots}$O의 분자간수소결합에 참여하는데 그 수소결합길이는 각각 2.56${\AA}$과 3.00${\AA}$이다. 분자간에는 N-H${\cdot}{\cdot}{\cdot}$O 수소결합에 의하여 a축에 평행한 나선축을 따라 나선형 분자띠를 이루고 있으며 이들 분자띠는 반데르왈스힘으로 결합되어 있다.
고에너지 화합물의 수소결합 현상을 연구하기 위하여 nitromethane 단량체 (monomer)와 이합체 (dimer)에 대하여 Gaussian-98 프로그램을 사용하여 restricted BLYP/6-311++G(d,p), B3LYP/6-311++G(d,p), MP2/6-311++G 계산을 수행하였다 . 이러한 이론적 연구를 통하여 nitromethane 단량체 및 이합체의 구조와 수소결합 및 진동스펙트럼을 구하였다 . 본 연구의 결과 nitromethane 상온에서 분자 간에 두 개의 수소결합을 이루며 이합체를 형성하는 것이 유리하고 , 이 이합체는 단량체보다 BLYP, B3LYP, MP2 level 계산에서 각각 약 15.2, 19.4, 32.6 kJ/mol 만큼 안정화됨을 알 수 있었다.
The nucleophilic substitution reactions of p-substituted benzyl bromide with l-substituted N,N-dimethylanilines in methanol and acetonitrile binary solvent mixture which is known to an isodielectric solvent system kinetically and the results are as follows. The positive charge is developed on the reaction center of the substrate and it means that the bond cleavage is preceded more than bond formation in the transition state on the analogy of Hammett px values. The bond form3tlon is not progressed in the case of electron donating substituent of substrate. However, the bond formation is much developed in the case of electron withdrawing substituent of substrate on the analogy of Hammett py values. The nucleophilic attacking ability is shown a highest at 80% (V/V) methanol content and the bond formation is well progressed at the same methanol composition on the result of a cross interaction coefficient, pxy. The result of transition state structure that is applicated to the potential energy surface model is in accord with the result that Is applicated to the reaction susceptibilities. The reaction Is subject to the polarity-polarizability term more than the hydrogen bond donor acidity term by application to the solvatochromic parameter eouation.
Details of the double-bond isomerization of 1-hexene over H-ZSM-5 were clarified using density functional theory. It is found that the reaction proceeds by a mechanism which involves the Br${\o}$nsted acid part of the zeolite solely. According to this mechanism, 1-hexene is first physically adsorbed on the acidic site, and then, the acidic proton transfers to one carbon atom of the double bond, while the other carbon atom of the double bond bonds with the Br${\o}$nsted host oxygen, yielding a stable alkoxy intermediate. Thereafter, the Br${\o}$nsted host oxygen abstracts a hydrogen atom from the $C_6H_{13}$ fragment and the C-O bond is broken, restoring the acidic site and yielding trans-2-hexene. The calculated activation barrier is 12.65 kcal/mol, which is in good agreement with the experimental value. These results well explain the energetic aspects during the course of double-bond isomerization and extend the understanding of the nature of the zeolite active sites.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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