The genome sequencing project has generated and will contitute to generate enormous amounts of sequence data. Since the first complete genome sequence of bacterium Haemophilus in fluenzae was published in 1995, the complete genome sequences of 2 eukaryotic and about 22 prokaryotic organisms have detemined. Given this everincreasing amounts of sequence information, new strategies are necessary to efficiently pursue the phase of the geome project- the elucidation of gene expression patterns and gene product function on a whole genome scale. In order to assign functional information to the genome sequence, DNA chip technology was developed to efficienfly identify the differential expression pattern of indepondent biogical samples. DNA chip provides a new tool for genome expreesion analysis that may revolutionize revolutionize many aspects of human kife including mew surg discovery and human disease diagnostics.
Sesaminol in sesame seed was postulated to have antitumor activity. The present study was performed to characterize the role of crude sesaminol extracted from sesame seed (Sesame Crude Sesaminol; SCS) on inhibiting the in vitro growth of human leukemia HL-60 cells. SCS inhibited the growth of human leukemia HL 60 cells in culture and macromolecular synthesis in a dose and time dependent manner. The cytostatic range of SCS concentration was found to be 60 to 100 $\mu\textrm{g}$/ml. SCS concentration greater than 200 $\mu\textrm{g}$/mlwere cytocidal to HL-60 cells. When SCS concentraction was 6 $\mu\textrm{g}$/mland 50 $\mu\textrm{g}$/ml the synthesis of HL-60 cells was inhibited by 35% for DNA, 6% for RNA and 5% for protein and 83% for DNA, 76% for RNA and 60% for protein. Of specific interest was the irreversible effect of SCS in inhibiting DNA synthesis of HL-60 cells. This was evidenced from the fact that, even after washed with PBS three times, preincubated HL-60 cells still showed the inhibited DNA synthesis.
DNA methylation at CpG sites is an essential epigenetic mark that regulates gene expression during mammalian development and diseases. Methylome refers to the entire set of methylation modifications present in the whole genome. Over the last several years, an increasing number of reports on brain DNA methylome reported the association between aberrant methylation and the abnormalities in the expression of critical genes known to have critical roles during aging and neurodegenerative diseases. Consequently, the role of methylation in understanding neurodegenerative diseases has been under focus. This review outlines the current knowledge of the human brain DNA methylomes during aging and neurodegenerative diseases. We describe the differentially methylated genes from fetal stage to old age and their biological functions. Additionally, we summarize the key aspects and methylated genes identified from brain methylome studies on neurodegenerative diseases. The brain methylome studies could provide a basis for studying the functional aspects of neurodegenerative diseases.
DNA isolation for PCR-based short tandem repeat (STR) analysis is essential to recover high yields of amplifiable DNA from low copy number (LCN) DNA samples. There are different methods developed for DNA extraction from the small bloodstain and gloves, commonly found at crime scenes. In order to obtain STR profiles from LCN DNA samples, DNA extraction protocols, namely the automated $iPrep^{TM}$$ChargeSwitch^{(R)}$ method, the automated $QIAcube^{TM}$ method, the automated $Maxwell^{(R)}$ 16 DNA $IQ^{TM}$ Resin method, and the manual $QIAamp^{(R)}$ DNA Micro Kit method, were evaluated. Extracted DNA was quantified by the $Quantifiler^{TM}$ Human DNA Quantification Kit and DNA profiled by $AmpFISTR^{(R)}$$Identifiler^{(R)}$ Kit. Results were compared based on the amount of DNA obtained and the completeness of the STR profiles produced. The automated $iPrep^{TM}$$ChargeSwitch^{(R)}$ and $QIAcube^{TM}$ methoas produced reproducible DNA of sufficient quantity and quality trom the dried blood spot. This two automated methods showed a quantity and quality comparable to those of the forensic manual standard protocols normally used in our laboratory. In our hands, the automated DNA extraction method is another obvious choice when the forensic case sample available is bloodstain. The findings of this study indicate that the manual simple modified $QIAamp^{(R)}$ DNA Micro Kit method is best method to recover high yields of amplifiable DNA from the numerous potential sources of LCN DNA samples.
Nguyen, Thi Bich Nga;De, Nguyen Van;Nguyen, Thi Kim Lan;Quang, Huynh Hong;Doan, Huong Thi Thanh;Agatsuma, Takeshi;Le, Thanh Hoa
Parasites, Hosts and Diseases
/
제56권5호
/
pp.453-461
/
2018
The aim of this study is to delineate 'admixed hybrid' and 'introgressive' Fasciola genotypes present in the Fasciola population in Vietnam. Adult liver flukes collected from ruminants in 18 Provinces were morphologically sorted out by naked eyes for small (S), medium (M) and large (L) body shapes; and human samples (n=14) from patients. Nuclear ribosomal (rDNA) ITS1 and ITS2, and mitochondrial (mtDNA) nad1 markers were used for determination of their genetic status. Total 4,725 worm samples of ruminants were tentatively classified by their size: 6% (n=284) small (S)-, 13% (n=614) medium (M)-, and 81% (n=3,827) large (L)-forms. All the representative (n=120, as 40 each group) and 14 human specimens, possessed maternal mtDNA of only F. gigantica and none of F. hepatica. Paternally, all (100%) of the L-(n=40) and 77.5% (n=31) of the M-flukes had single F. gigantica rDNA indicating 'pure' F. gigantica. A majority (90%, n=36) of the S- and 15% (n=6) of the M-worms had single F. hepatica rDNA, indicating their introgressive; the rest (10%, n=4) of the S- and 7.5% (n=3) of the M-flukes had mixture of both F. gigantica and F. hepatica rDNAs, confirming their admixed hybrid genetic status. Fourteen human samples revealed 9 (64%) of pure F. gigantica, 3 (22%) of introgressive and 2 (14%) of admixed hybrid Fasciola spp. By the present study, it was confirmed that the small worms, which are morphologically identical with F. hepatica, are admixed and/or introgressive hybrids of Fasciola spp., and able to be the pathogens of human fascioliasis.
Kim, Sun-Jung;Yu, Dae-Yeul;Lee, Ko-Woon;Cho, Yong-Yeon;Lee, Chul-Sang;Han, Yong-Mahn;Lee, Kyung-Kwang
BMB Reports
/
제28권1호
/
pp.57-61
/
1995
The expression of a recombinant human lactoferrin is reported in mouse HC11 mammary epithelial cells. Expression of human lactoferrin (hLF) was achieved by placing its cDNA under the control of the bovine ${\beta}$-casein gene. To improve the hLF expression level in a cell culture system, two artificial introns were also introduced to construct expression vectors. One intron was a hybrid-splice signal consisting of bovine ${\beta}$-casein intron 1 and rabbit ${\beta}$-globin intron II. The other intron was a DNA fragment spanning intron 8 of the bovine ${\beta}$-casein gene. The hybrid intron moderately elevated hLF expression, whereas intron 8 alone did not express any detectable amount of hLF as judged by Northem and Western blot analyses. When the two introns were used together they contributed to a synergistic elevation of hLF expression. These data indicate that artificial introns on both sides of the hLF cDNA were necessary to increase expression of cDNA.
Aim: Liquid-based cytology is the most often used method for cervical cancer screening, but it is relatively insensitive and frequently gives equivocal results. Used as a complementary procedure, the high-risk human papillomavirus (HPV) DNA test is highly sensitive but not very specific. The human telomerase RNA gene (TERC) is the most often amplified oncogene that is observed in cervical precancerous lesions. We assessed genomic amplification of TERC in liquid-based cytological specimens to explore the optimal strategy of using this for cervical cancer screening. Methods: Six hundred and seventy-one residual cytological specimens were obtained from outpatients aged 25 to 64 years. The specimens were evaluated by the Digene Hybrid Capture 2 (HC2) HPV DNA test and fluorescence in situ hybridization (FISH) with a chromosome probe to TERC (3q26). Colposcopic examination and histological evaluation were performed where indicated. Results: The TERC positive rate was higher in the CIN2+ (CIN2, CIN3 and SCC) group than in the normal and CIN 1 groups (90.0% vs. 10.4%, p < 0.01). In comparison with the HC2 HPV DNA test, the TERC amplification test had lower sensitivity but higher specificity (90.0% vs. 100.0%, 89.6% vs. 44.0%, respectively). TERC amplification test used in conjunction with the HC2 HPV DNA test showed a combination of 90.0% sensitivity and 92.2% specificity. Conclusion: The TERC amplification test can be used to diagnose cervical precancerous lesions. TERC and HPV DNA co-testing shows an optimal combination of sensitivity and specificity for cervical cancer screening.
To investigate the XIST gene expression and its effect in a Klinefelter's patient, we used Klinefelter's syndrome (XXY) patient with azoospermia and also used a normal male (XY) and a normal female (XX) as the control, We were performed cytogenetic analysis, Y chromosomal microdeletion assay (Yq), semi-quantitative RT-PCR, and the Northern blot for Klinefelter's syndrome (KS) patient, a female and a male control, We extracted total RNA from the KS patient, and from the normal cells of the female and male control subjects using the RNA prep kit (Qiagen), cDNA microarray contained 218 human X chromosome-specific genes was fabricated. Each total RNA was reverse transcribed to the first strand cDNA and was labeled with Cy-3 and Cy-5 fluorescein, The microarray was scanned by ScanArray 4000XL system. XIST transcripts were detected from the Klinefelters patient and the female by RT-PCR and Northern blot analysis, but not from the normal male, In the cDNA microarray experiment, we found 24 genes and 14 genes are highly expressed in KS more than the normal male and females, respectively. We concluded that highly expressed genes in KS may be a resulted of the abnormal X inactivation mechanism.
Multiplex PCR-based short tandem repeat (STR) analysis is considered as a good tool for monitoring bone marrow engraftment after sex-mismatched allogeneic transplantation and provides a sensitive and accurate assessment of the contribution of both donor and/or recipient cells in post-transplantation specimens. Forensic STR analysis and quantitative real time PCR are used to determine the proportion of donor versus recipient each contained within the total DNA. The STR markers were co-amplified in a single reaction by using commercial $PowerPlex^{(R)}$ 16 system and $AmpFISTR^{(R)}$$Identifiler^{(R)}$ / $Yfiler^{(R)}$ PCR amplification kits. Separation of the PCR products and fluorescence detection were performed by ABI $PRIS^{(R)}$ 3100 Genetic Analyzer with capillary electrophoresis. The $GeneMapper^{TM}$ ID software were used for size calling and analysis of STR profiles. Extracted DNA was quantified by the $Quantifiler^{TM}$ Human DNA / Y Human Male DNA Quantification Kit The intent of this study was to analyze the ratio of donor versus recipient cells in the post-transplant peripheral blood, spleen, lung and kidney specimens. Specimens were taken from the traffic accident male victim who had been engrafted from bone marrow female donor. Blood and spleen specimens displayed female donor DNA profile. Kidney specimen showed male recipient DNA profile. Interestingly, lung tissue showed mixed profiles. The findings of this study indicate that the forensic STR analysis using fluorescence labeling PCR combined with capillary electrophoresis is quick and reliable enough to assess the ratio of donor versus recipient cells and to monitor the mixed chimeric patterns.
cDNA for human cholesteryl ester transfer protein (CETP), a potent atherogenic plasma protein that redistributes the neutral lipids among lipoproteins, was expressed in recombinant vaccinia virus-infected cells (CV-1). Two insertion vectors regulated by different promoters were constructed. The vectors were introduced into human thymidine kinase-negative ($TK^-$) 1438 cells infected with wild-type vaccinia virus (WR strain). Recombinant viruses were selected with 5-bromodeoxyuridine (BUdR) and X-gal and identified with DNA dot blot analysis (vSC11-CETP and vTM1-CETP). The CETP cDNA insert in the recombinant vaccinia virus genome was identified by Southern blot analysis. Transcription of CETP cDNA in CV-1 cells infected with recombinant vaccinia virus was monitored by Northern blot analysis using the CETP cDNA as a probe. Positive signals were detected at 1.8 kb in cells infected with vSC11-CETP and at 2.3 kb in cells infected with vTM1-CETP. The recombinant vaccinia virus-infected CV-1 cells were shown to produce functional CETP when the culture medium was subjected to the CETP assay.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.