• Journal of Genetic Medicine
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• 제15권1호
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• pp.17-19
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• 2018

Alkaptonuria (AKU, OMIM: 203500) is a rare autosomal recessive disorder of tyrosine metabolism due to a defect of enzyme activity, homogentisate 1,2-dioxygenase (HGD). The patients with AKU initially presented with dark urine discoloration, and ochronosis and arthritis develop after third decades of life. With advances of Internet resources, web-based health seekers for rare disease are increasing. Here, we report the case of an 18-year-old boy with AKU who visited our center due to dark black urine based on self-diagnosis via web searching of this rare condition. Compound heterozygous mutations in HGD gene, IVS5+3A>C and IVS12+6T>C were identified and both of mutations were detected in his parents. Our case illustrates the utility of publicly available Internet resources for diagnosis of rare disease.

• 생명과학회지
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• 제24권11호
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• pp.1168-1173
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• 2014

HGD (homogentisate1,2-dioxygenase)유전자는 소의 1번 염색체에 존재하며, tyrosine과 phenylalanine의 이화 작용을 돕는 효소 중 하나로 알려져 있다. 또한 소에서 도체중과 등심단면적에 영향을 주는 유전자로 보고된 바 있다. 본 연구는 한우 집단을 대상으로 HGD유전자내 변이지역을 탐색하고, 경제형질과의 연관성을 분석하기 위하여 실시하였다. 총 14개의 Exon지역을 바탕으로 변이지역을 탐색한 결과, 10개의 SNPs를 확인하였고, 이 중 genotype의 Frequency (MAF>0.1)를 고려하여 6개의 SNPs (G34256T, G34257C, T34284C, T42333G, T42348C, T42468C)를 발굴하여 경제형질과의 연관성을 분석하였다. 그 결과 G34256T에서 근내지방도와 유의적인 연관성이 확인되었고, G34257C에서 등심단면적과 근내지방도에서 유의적인 연관성이 확인되었다. 따라서 본 연구 결과에서 확인된 HGD 유전자의 SNP유전자형은 한우선발 및 개량을 위한 분자육종의 기초 자료로 이용할 수 있을 것으로 사료된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권14호
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• pp.5875-5881
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• 2015

Cholangiocarcinoma (CCA) is a rare but highly fatal cancer for which the molecular mechanisms and diagnostic markers are obscure. We therefore investigated the kinetic expression of isocitrate dehydrogenase-1 (IDH1), isocitrate dehydrogenase-2 (IDH2) and homogentisate 1,2-dioxygenase (HGD) during the tumorigenesis of O. viverrini infection-associated CCA in an animal model, and confirmed down-regulation of expression in human cases of opisthorchiasis-associated CCA through real time PCR. Kinetic expression of HGD, IDH1 and IDH2 in the animal model of O. viverrini infection-induced CCA was correlated with human CCA cases. In the animal model, expression of HGD was decreased at all time points (p<0.01) and expression of both IDH1 and IDH2 was decreased in the CCA group. In human cases, expression of HGD, IDH1 and IDH2 was decreased more than 2 fold in 55 cases (70.5%), 25 cases (32.1%) and 24 cases (30.8%) respectively. The present study suggests that reduction of HGD, IDH1 and IDH2 may be involve in cholangiocarcinoma genesis and may be useful for molecular diagnosis.

• 분석과학
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• 제28권5호
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• pp.323-330
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• 2015

알캅톤뇨증은 극히 드문 희귀 유전성 대사이상질환으로, 호모겐티세이트 디옥시게나제의 부족이나 결손으로 인한 질환이며 호모겐티식산 (HGA)의 축적을 특징으로 한다. 임상적으로는 호모겐티식산 혈증, 관절염 및 퇴자병 (ochronosis) 등을 보인다. 본 연구는 고가이고 시간이 많이 걸리는 고체상 추출단계 없이 신속하게 우수한 감도로 혈장 중 HGA의 정량분석을 위해 개발되었다. 통합 혈장 중 100 µL를 취하여 에틸아세테이트로 액체-액체 추출(LLE)한 후, 트리메틸 실릴 유도체 (TMS) 화한 후 GC-MS로 정량하였다. 카르복실기 및 히드록실 관능기의 TMS 유도체화의 형성은 80 ℃에서 5 분 동안 BSTFA (10% TMCS 포함)로 반응시켜 수행 하였다. GC-MS 의 선택 이온 모니터링을 위한 HGA의 선택 이온은 m/z=384, m/z= 341, m/z=25로 설정 하였다. 통합 혈장에 여러 농도로 표준품을 첨가하여 검토한 검량선은 1-100 ng/µL 범위에서 직선성은 R²=0.9991로 양호하게 나타났다. 통합 혈장에 HGA를 2, 20과 80 ng/µL 농도를 첨가하여 회수율, 정확도와 정밀도를 측정하였을 때, 일간내 회수율은 99-125% 였고, 일간외 회수율은 95-115% 였고, 정확도는 1-15% 이내로 양호하였다. LOD와 LOQ는 각각 0.4 ng/µL, 4 ng/µL로 관찰되었다. 한국인 정상 혈장으로부터 HGA를 분석하였을 때, 적용된 모든 시료에서 HGA는 검출되지 않았다. 결론적으로 본 연구에서 개발된 분석 방법을 이용하면 알캅톤뇨증 환자를 신속하게 진단할 수 있으며 그 치료과정에서의 HGA 모니터링에 유용하게 응용할 수 있음을 시사한다.