• Archives of Pharmacal Research
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• 제5권2호
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• pp.79-86
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• 1982

Sulfisoxazole, $C-{11}H_{13}N_{3}S$, crystallized in the orthohombic system, space group Pbca, with a = 14.492(1), b = 11.563(1), c = 14.900(2) $\AA$ and Z = 8. Intensities for 1867(1360 observed) unique reflections were measured on a four-circle diffractometer wirh CuKa radiation ($\lambda$ = 1.5418$\AA$). The structure was solved by heavy atom methods and refined by full-matrix least-squares procedures to a final R of 0.094. The benzene ring plane makes an angle of $68^{\circ}C$ with the plane of the isoxazole ring, which is plannar. The conformational angle formed by the torsional angle C(4)-S-N(2)-C(7) is $54^{\circ}C$. There are two intermolecular hydrogen bonds in the structure. One of them is of the type N-H...H with the length 2.915$\AA$. Thus two dimensional networks of hydrogen bonds form infinite moelcular sheets parallel to the (001) plane. Adjacent sheets are bound together by van der Waals forces.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제22권1호
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• pp.63-67
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• 2001

The photophysical properties and the singlet oxygen generation efficiency of tetrathiarubyrin have been investigated to elucidate the possibility of its use as a photodynamic therapy (PDT) photosensitizer by steady-state and time-resolved spectroscopic methods. The observed photophysical properties were affected by various molecular aspects, such as extended ${\pi}conjugation$, structural distortion, and internal heavy atom. The steady-state electronic absorption spectrum was red-shifted due to the extended $\pi-conjugation$, and the spin orbital coupling was enhanced by the structural distortion and the internal heavy atom effect. As a result of the enhanced spin orbital coupling, the triplet quantum yield increased to 0.90 $\pm$ 0.10 and the triplet state lifetime was shortened to 7.0 $\pm$ 1.2 ${\mu}s$. Since the triplet state decays at a relatively faster rate, the efficiency of the oxygen quenching of the triplet state decreases. The singlet oxygen quantum yield was estimated to be 0.52 $\pm$ 0.02, which is somewhat lower than expected. On the other hand, the efficiency of singlet oxygen generation during the oxygen quenching of triplet state, $f{\Delta}^T$, is near unity. Such high efficiency of singlet oxygen generation can be explained by the following two possible factors: The hydrogen bonding of ethanol which impedes the deactivation pathway of the charge transfer complex with oxygen to the ground state, the less probability of the aggregation formation.

• 한국결정학회지
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• 제12권1호
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• pp.37-54
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• 2001

1960년대까지는 단결정 구조를 해석할 때 주로 Patterson 방법으로 중원자(heavy atom)를 찾고 이 중원자에 의한 위상에 기초하여 구조를 해석해 왔다. 회절점의 위상을 수학적으로 결정하는 직접법(direct method)은 1948년 Harker와 Kasper에 의해서 최초의 논문이 발표된 이후, 50∼60년 대에 이론적 기초가 구축되었으며, 70년대부터 컴퓨터 프로그램화되어 실용되기 시작하였다. 본 해설문에서는 직접법에 사용되는 정규화된 구조 인자(normalized structure factor)와 unitary 구조 인자의 정의를 소개한 후, 직접법의 기본식인 Sayre 방정식으로부터 유도되는 반전적 혹은 대칭중심적(centric)인 경우에서 성립하는 부호 관계(sign relationship) 및 ∑₂-관계(∑₂-relation)와 비반전적(acentric)경우에서 성립하는 탄젠트 공식(tangent formula)의 유도 과정을 설명하였고, 부호 관계와 탄젠트 공식이 필요로 하는 처음 몇 개의 회절점의 위상을 정하는 과정도 보였다.

• 대한화학회지
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• 제22권2호
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• pp.55-61
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• 1978

N-아세틸피롤리돈과그 양성자 형태에 대하여 EHT 및 CNDO/2 분자궤도함수법으로 연구하였다. 계산결과는 분자내의 무거운 원자들의 골격이 평면구조인 경우가 가장 안전하며, 평면형태에서는 트란스-트란스형이 시스-트란스형보다 더 안정함을 나타내고, 양성자화는 고리에 붙어있는 카르보닐 산소에서 더 용이하게 일어남을 나타내고 있다. 이 결과를 콘주게이션, 정전기적 및 입체효과로서 설명하였다.

• 대한화학회지
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• 제20권1호
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• pp.3-14
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• 1976

살리실알데히드-4-피페리디노티오세미카르바죤의 분잠 및 결정구조를 X-선 회절법으로 밝혔다. 이 화합물의 결정은 직각비등축정계에 속하며 공간군은 $P2_12_12_1$이다. 단위세포상수는 a = 6.52(2), b = 13.42(4), c = 14.92(4)${\AA}$으로서 4개 분자를 포함하고 있다. 원자의 좌표는 중원자법을 이용하여 결정하였고 최소자승법으로 정밀화하였다. 1019개의 구조인자에 대한 최종 R값은 0.10이다. 티오세미카르바죤 화합물에서 C=S결합은 N-NH 결합에 대해 트랜스 위치에 존재하는 경우가 많은데 살리실알데히드-4-피페리디노티오세미카르바죤에서는 시스위치에 있다. 히드록실기의 산소원자는 O-H${\cdots}$O의 분자내수소결합과 N-H${\cdots}$O의 분자간수소결합에 참여하는데 그 수소결합길이는 각각 2.56${\AA}$과 3.00${\AA}$이다. 분자간에는 N-H${\cdot}{\cdot}{\cdot}$O 수소결합에 의하여 a축에 평행한 나선축을 따라 나선형 분자띠를 이루고 있으며 이들 분자띠는 반데르왈스힘으로 결합되어 있다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제14권6호
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• pp.713-717
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• 1993

The crystal structure of the potassium salt of penicillin V has been studied by the X-ray crystallographic methods. Crystal data are as follows; potassium 3,3-dimethyl-7-oxo-6-phenoxyacetoamido-4-thia-1- azabicyclo[3.2.0]-heptane-2${\alpha}$-carboxylate, $K^+{\cdot}C_{16}H_{18}N_2O_5S^-$, $M_r$= 388.5, triclinic, Pl, a= 9.371 (1), b= 12.497 (2), c= 15.313 (2) ${\AA},\;{\alpha}= 93.74\;(2),\;{\beta}=99.32\;(1),\;{\gamma}=90.17\;(1)^{\circ},\;V=1765.7\;(2)\;{\AA}^3$, Z=4, $D_m=1.461\;gcm^{-1},\;{\lambda}(Cu\;K{\alpha})=1.5418\;{\AA},\;{\mu}=40.1\;cm^{-1}$, F(000)=808, T=296 K. The structure was solved by the heavy atom and difference Fourier methods with intensity data measured on an automated four-circle diffractometer. The structure was refined by the full-matrix least-squares method to a final R= 0.081 for 3563 observed $[I_0{\geq}2{\sigam}(I_0)]$ reflections. The four independent molecules assume different overall conformations with systematically different orientations of the phenyl groups although the penam moieties have the same closed conformations. There are intramolecular hydrogen bonds between the exocyclic amide nitrogen and phenoxy oxygen atoms. The penam moiety is conformationally very restricted although the carboxyl and exocyclic amide groups apparently have certain rotational degrees of freedom but the phenyl group is flexible about the ether bond despite the presence of the intramolecular N-H${\cdots}$O hydrogen bond. There are complicated pseudo symmetric relationships in the crystal lattice. The penam moieties are related by pseudo 20.5 screw axes and the phenyl groups by pseudo centers of symmetry. The potassium ions, related by both pseudo symmetries, form an infinite zigzag planar chain parallel to the b axis. Each potassium ion is coordinated to seven oxygen atoms in a severely distorted pentagonal bipyramid configuration, forming the infinite hydrophilic channels which in turn form the molecular stacks. Between these stacks, there are only lipophilic interactions involving the phenyl groups.

• 대한화학회지
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• 제20권1호
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• pp.19-34
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• 1976

Sodium sulfisoxazole hexahydrate, $C_{11}H_{12}N_3O_3SNa{\cdot}6H_2O$의 결정 및 분자구조를 X-선 회절법으로 해명하였다. 이 화합물의 결정은 공간군 $P2_1/c$에 속하는 단사형으로 a = 15.68(3), b = 7.70(2), c = $17.94(4){\AA}$, ${\beta}$ = $118(2)^{\circ}$ and Z = 4이다. Weissenberg 사진 촬영으로 얻은 회절반점의 총수는 1717개이며 중원자법을 적용하여 구조해명을 한 후 최소 자승법으로 정밀화하였으며 최종 R값은 0.14이다. Benzene ring과 isoxazole ring은 평면구조를 가지며 서로 $60^{\circ}$의 각을 이루고 있다. 나트륨 원자는 다섯개의 물의 산소 원자들과 N(1)으로 만들어진 찌그러진 팔면체로 배위되어 있다. 분자들은 결정내에서 14개의 서로 다른 종류의 수소결합으로 결합되어 있다. 여섯종류의 $O-H{\cdots}O-H$, 세종류의 $O-H{\cdots}O,$ 두종류의 $O-H{\cdots}N$및 각각 한종류의 $N-H{\cdots}O,$ $O-H{\cdots}N$, $N-H{\cdots}O-H$ 수소결합들이며 그 길이는 2.71에서 $3.04{\AA}$까지이다.

• 대한화학회지
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• 제21권5호
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• pp.307-319
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• 1977

Thiourea derivative인 $N-({\alpha}-dimethyl\;{\beta}-hydroxy)ethyl\;N'-cyclohexyl\;thiourea,\;C_{ll}H_{22}N_2OS)$의 결정 및 분자구조를 X-선 회절법으로 해명하였다. 이 화합물의 결정은 공간군 $P_{bca}$에 속하는 orthorhombic 형으로 a = 10.33(3), b = 11.82(3), c = 22.57(4)${\AA}$ 이고 Z = 8이다. Weissenberg 사진촬영으로 얻은 회절반점의 총수는 1414개이며 중원자법을 이용하여 구조해명을 한 후 최소자승법으로 정밀화하였으며 최종 R값은 0.13이다. Cyclohexane ring은 normal chair conformation을, thiourea 부분은 평면을 이루고 있다. 일차 알코올의 hydroxyl group은 N(2)원자와 분자내 수소결합을 이뤄서 전체분자를 안정화시키고 있다. 분자들은 결정내에서 수소결합과 van der Waals힘으로 서로 결합되어 있다. 분자내 수소결합 N(2)-H${\cdot}{\cdot}{\cdot}$O는 강한 수소결합으로 N${\cdot}{\cdot}{\cdot}$O 길이는 2.71${\AA}$이고, 분자간 수소결합 O${\cdot}{\cdot}{\cdot}$H${\cdot}{\cdot}{\cdot}$S의 O${\cdot}{\cdot}{\cdot}$S 길이는 3.02${\AA}$으로 b축에 나란하다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제14권4호
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• pp.439-444
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• 1993

The aerobic oxidation of the Fe(II) complex of 1,4,8,11-tetraazacyclotetradecane, [Fe(cyclam)$(CH_3CN)_2](ClO_4)_2$, in MeCN in the presence of a few drops of $HClO_4$ leads to low spin Fe(III) species [Fe(cyclam)$(CH_3CN)_2](ClO_4)_3$. The Fe(III) cyclam complex is further oxidized in the air in the presence of a trace of water to produce the deep green binuclear bismacrocyclic Fe(II) complex $[Fe_2(C_{20}H_{36}N_8)(CH_3CN)_4](ClO_4)_4{\cdot}2CH_3CN$. The Fe(II) ions of the complex are six-coordinated and the bismacrocyclic ligand is extensively unsaturated. $[Fe_2(C_{20}H_{36}N_8)(CH_3CN)_4](ClO_4)_4{\cdot}2CH_3CN$ crystallizes in the monoclinic space group $P2_1/n$ with a= 13.099 (1) ${\AA}$, b= 10.930 (1) ${\AA}$, c= 17.859 (1) ${\AA}$, ${\beta}$= 95.315 $(7)^{\circ}$, and Z= 2. The structure was solved by heavy atom methods and refined anisotropically to R values of R= 0.0633 and $R_w$= 0.0702 for 1819 observed reflections with F > $4{\sigma}$ (F) measured with Mo K${\alpha}$ radiation on a CAD-4 diffractometer. The two macrocyclic units are coupled through the bridgehead carbons of ${\beta}$-diimitie moieties by a double bond. The double bonds in each macrocycle unit are localized. The average bond distances of $Fe(II)-N_{imine}$, $Fe(II)-N_{amine}$, and $Fe(II)-N_{MeCN}$ are 1.890 (5), 2.001 (5), and 1.925 (6) ${\AA}$, respectively. The complex is diamagnetic, containing two low spin Fe(II) ions in the molecule. The complex shows extremely intense charge transfer band in the near infrared at 868 nm with ${\varepsilon}$= 25,000 $M^{-1}cm^{-1}$. The complex shows a one-electron oxidation wave at +0.83 volts and two one-electron reduction waves at -0.43 and-0.72 volts vs. Ag/AgCl reference electrode. The complex reacts with carbon monoxide in $MeNO_2$ to form carbonyl adducts, whose $v_{CO}$ value (2010 $cm^{-1}$) indicates the ${\pi}$-accepting property of the present bismacrocyclic ligand.