• 제목/요약/키워드: HSVd

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국내 얼룩반점 자두에서 발생한 호프왜화바이로이드(HSVd)의 유전자 변이 (Hop stunt viroid (HSVd) Sequence Variants from Dapple Fruits of Plum (Prunus salicina L.) in Korea)

  • 조인숙;정봉남;조점덕;최승국;최국선;김정수
    • 식물병연구
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    • 제17권3호
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    • pp.358-363
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    • 2011
  • 경기도와 경상북도 일대의 '대석조생' 자두 재배포장에서 착색이 불균일한 얼룩 반점 증상의 과실이 발생하였다. 이들 시료로부터 유전자 진단(RT-PCR)과 Dot-blot hybridization 검정 결과 호프왜화바이로이드(HSVd)가 검출되었고 유전자 염기서열 분석을 통해 2개의 HSVd 변이주(DP1, DP2) 를 동정하였다. GenBank에 등록된 자두 HSVd의 7개 변이주와 새로운 DP1, DP2 변이주와의 유전자 염기서열을 비교분석한 결과 94-100%의 높은 상동성을 보였다. DP1와 DP2의 유전자는 59번과 60번 염기가 각각 CG, AA로 서로 다른 변이를 보였다. 국내외 자두 과실 얼룩반점 증상에서 동정된 HSVd의 유전자는 특이적으로 59번과 60번 부위의 염기가 CG, AA, TG인 3개 군으로 크게 구분되는 것을 알 수 있었다.

Sequence variant of Hop Stunt Viroid(HSVd) detected from Plum trees cultivated in Korea and Phylogenetic Analysis

  • Lee, Sung-Joon;Hwang, Seung-Lark;Kwon, Tae-Young;Lee, Jai-Youl
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.143.1-143
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    • 2003
  • Hop stunt viroid(HSVd) is a plant pathogen which infect a number of hosts such as grapevine, Citrus and Prunus plants. Sequence variants of HSVd have been divided into three types(i. grapevine and hop, ii. citrus, iii. plum, peach, apricot and almond). Purified RNAs from plum trees were used for the synthesis of cDNA with reverse transcription and amplified by polymerase chain reaction. Cloned cDNAs were sequenced and two different consensus sequence variants were detected. A neighbor-joining analysis was carried out on the sequence variants together with 62 previously described variants of HSVd from hop, plum and other species. Sequence variants from plum trees cultivated in Korea were clustered in HSVd-plum subtype and not in HSVd-hop subtype which were two Korean isolates belongs. These relationship between sequence variants from plum and two Korean isolates in HSVd-hop type supports the other origin for hop stunt disease.

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호프 왜화바이로이드 Kh 계통 (HSVd-Kh)의 염기서열 (Nucleotide Sequence of Hop Stunt Viroid Kh Strain (HSVd-Kh))

  • 이재열;김경숙;정동수
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.612-613
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    • 1998
  • The nucleotide sequence of hop stunt viroid HHSVd) Kh strain was sequenced by the reverse transcription and polymerase chain reaction. It consists of 296 nucleotides, and differs by one nucleotide deletion of cytosine at the position of 295 from the HSVd-K strain which consists of 297 nucletoides.

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