줄기세포를 임상에 적용하기 위해서는 체외에서 증식 과정이 필수적이다. 그러나 배아줄기세포와는 달리 성체줄기세포는 체외에서 증식할 경우 일정시간이 지나면 줄기세포의 특성을 잃기 때문에 임상사용에 있어 제한점을 가지고 있다. 이러한 문제점을 극복하기 위해 줄기세포의 특성을 잃지 않게 세포를 보존하는 방법이 필요하며, 본 연구에서는 탯줄 유래 줄기세포를 동결 보존한 후 해동시켜 줄기세포의 특성을 분석하였다. 사람의 탯줄 유래 세포를 분리하여 체외에서 배양한 후 2번째 또는 3번째 계대의 세포를 25% FBS와 10% DMSO가 첨가된 냉동배양액에 넣어 $-196^{\circ}C$에서 동결보존한 후, 6개월 뒤에 해동시켜 세포의 성장 속도와 유전자 및 단백질 발현을 살펴보았다. 냉동 보존한 후 세포를 해동시킨 결과 74%의 생존율을 보였으며, 이 세포를 체외에서 배양하였을 경우, 냉동보존하기 전의 세포와 유사하게 방추사 모양의 섬유 아세포의 형태를 나타냈다. 또한, 성장 속도 역시 냉동보존하기 전의 세포와 똑같이 10번째 계대까지 배양되었으며, 42번 분열 능력을 나타냈다. RT-PCR 결과, 냉동 전후 세포 모두에서 Oct-4, nanog, SCF, NCAM, nestin, GATA4, BMP4, HLA-1 유전자는 모두 발현하였으며, Brachyury와 HLA-DR은 발현하지 않았다. 면역세포 화학 염색 결과, 배아줄기세포 단백질로 알려진 SSEA-3, -4, Oct-4 그리고 중간엽줄기세포 단백질인 Thy-1은 모두 발현하였으며, vimentin, fibronectin, HLA-1, HCAM, ICAM 모두 발현하였다. 그러나 SSEA-4과 Thy-1, vimentin, fibronectin, HLA-1는 냉동보존한 후 배양된 탯줄질의 발현은 냉동보존하기 전후의 탯줄 유래 세포에서 큰 차이가 없었다. 냉동 보존된 탯줄 유래 세포는 세포의 분열능력과 유전자 및 단백질의 발현이 냉동 보존 전 세포와 유사한 것으로 나타났다. 이러한 결과는 냉동보존법이 임상적으로 세포 치료 시 적절한 세포의 수나 시간을 맞추는데 효과적인 방법이 될 수 있을 것으로 기대된다.
현대 사회에서는 새로운 기술이나 가설을 증명하기 위해 시뮬레이션을 사용한다. 특히, 군사 훈련을 진행하거나 전쟁상황을 예측하기 위하여 국방 Modeling & Simulation(M&S)을 사용한다. 국방 M&S는 실제 환경에서 진행하는 Live Simulation, 가상환경에서 진행하는 Virtual Simulation, 그리고 워 게임과 같은 Constructive Simulation으로 이루어지며 각각을 L체계, V체계, C체계라고 한다. L체계는 실제 환경을 전제하기 때문에 현실성이 높지만 예산 효율성이 떨어진다. 이와 반대로 V와 C체계는 현실성이 떨어지지만 예산 효율성을 높인다. 이러한 각 체계의 장단점을 바탕으로 세 가지 체계를 모두 연동한 L-V-C 통합 환경을 구축한다면 시뮬레이션의 질을 향상시킬 수 있다. 본 논문에서는 L-V-C 통합 환경을 구축하기 위해 이기종 시뮬레이션 미들웨어 간 연동하는 방안을 제시하고 서로 다른 미들웨어간의 연동 테스트 결과를 보인다.
Muhammad Ma'ruf;Justitia Cahyani Fadli;Muhammad Reza Mahendra;Lalu Muhammad Irham;Nanik Sulistyani;Wirawan Adikusuma;Rockie Chong;Abdi Wira Septama
Genomics & Informatics
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제21권2호
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pp.26.1-26.9
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2023
Stevens-Johnson syndrome (SJS) produces a severe hypersensitivity reaction caused by Herpes simplex virus or mycoplasma infection, vaccination, systemic disease, or other agents. Several studies have investigated the genetic susceptibility involved in SJS. To provide further genetic insights into the pathogenesis of SJS, this study prioritized high-impact, SJS-associated pathogenic variants through integrating bioinformatic and population genetic data. First, we identified SJS-associated single nucleotide polymorphisms from the genome-wide association studies catalog, followed by genome annotation with HaploReg and variant validation with Ensembl. Subsequently, expression quantitative trait locus (eQTL) from GTEx identified human genetic variants with differential gene expression across human tissues. Our results indicate that two variants, namely rs2074494 and rs5010528, which are encoded by the HLA-C (human leukocyte antigen C) gene, were found to be differentially expressed in skin. The allele frequencies for rs2074494 and rs5010528 also appear to significantly differ across continents. We highlight the utility of these population-specific HLA-C genetic variants for genetic association studies, and aid in early prognosis and disease treatment of SJS.
Background: A large number of diseases occur in association with specific HLA-B or-C alleles. Recently a new gene, termed maj or histocompatibility complex class I chain-related gene A (MICA), has been identified in close proximity to HLA-B. The function of this gene is still unknown. However, it is structurally similar to HLA class I genes. MICA gene is polymorphic and is potentially associated with several diseases. Methods: To evaluate the association of MICA gene in Korean patients with human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) infections, Polymerase chain reaction-Sequence specific primer (PCR-SSP) was done for MICA alleles in the extracellular exons, and a microsatellite analysis for GCT repeat polymorphisms in the TM exon was also completed. Results: In 199 Korean healthy controls, 7 alleles were observed and the frequencies for each allele were MICA008 (44.7%), MICA0 10 (34.2%), MICA002 (31.7%), MICA004 (23.6%), MICA0 12 (2 1.6%), MICA009 (19.6%), and MICA007 (6.5%). When 65 HIV seropositive patients were analyzed, MICA007 allele frequency was significantly higher than in controls (15.4% vs 6.5 %, RR=2.6, p<0.04). In contrast, the frequencies of other MICA alleles and microsatellite alleles in the transmembrane region of MICA gene were not significantly different between HIV seropositive patients and controls. The tight linkage between MICA alleles in the extracellular exons and GCT repeat polymorphisms in the TM exon was observed as follows; MICA002/A9, MICA004/A6, MICA007/A4, MICA008/A5.1, MICA0 10/A5, and MICA0 12/A4 in both groups. No significant difference between patients and controls was observed in the haplotype frequencies of MICA alleles in the extracellular exons and GCT repeat polymorphisms in the TM exon. Conclusion: The data suggest that immune functions related with MICA gene may affect a HIV infections.
인체의 바이러스 감염 방어기전에서 T 림프구는 중요한 역할을 한다. 하지만, 만성 C형 간염 바이러스의 일차적 복제장소인 간염 환자의 간에서 분리된 HCV 특이 T 림프구는 심각한 기능결핍을 보인다. 이러한 T 림프구 기능결핍의 이유로는 PD-1, CTLA-4 등 면역억제 물질의 발현, 또는 간에서 특이적으로 유도되는 면역내성(immune tolerance)이 있으나, 간세포(hepatocytes)와 HCV 특이 T 림프구의 상호작용에 대해서는 명확하게 확립되어 있지 않다. 따라서 본 연구에서는 HLA(human leukocyte antigen) A2+ 간암세포주(human hepatoma cell line; huh7.5)가 항원제시(antigen presentation)를 통해 효과적으로 HCV 특이 T 림프구를 활성화시키며 간암세포주(huh7.5) 표면의 PD-L (program death ligand) 1 발현은 T림프구의 활성을 감소시켜 면역조절의 가능성이 있음을 시사하였다. 또한, HCV 특이 tetramer 반응은 T 림프구의 과도한 활성으로 자기사멸(apoptosis)의 경로에 있음을 caspase 3 활성으로 확인하였고, 역시 PD-L1의 발현이 T 림프구를 자기사멸(apoptosis)로부터 구제하여 caspase 3 활성이 감소하는 것을 확인하였다. 이는 PD-L1과 간성(liver) T 림프구 표면의 PD-1 결합이 T 림프구의 자기사멸을 막고, 또한 그 기능을 회복시켜 만성 C형 간염 치료에 응용될 수 있음을 시사한다.
최근 과학기술의 발전에 따라 국방 M&S에서의 무기체계 기술 및 분석을 위한 요구사항이 매우 다양화되고 복잡해졌으며, 무기체계에 요구되는 성능 또한 엄격해지고 있다. 따라서 미래의 무기체계는 와치-독 시스템, 지휘 통제 시스템, C4I 시스템과 같이 서로 다른 시스템들과의 연동기술이 필수적이다. 그러나 급속도로 발전하고 있는 M&S 기술과 비교하였을 때, 새로운 무기체계 획득 시 소요되는 시간, 비용 및 위험성은 감소되지 않고 있다. 이러한 애로사항을 극복하고자 국방 M&S 기술이 그 대안으로 떠오르고 있다. 본 논문에서는 수중대잠전 교전모델의 무기체계 효과도를 검증하기 위한 도구로써, 합성환경기반의 가상시험 프레임워크를 설계하고자 한다. 이를 위해, 오픈 소스 소프트웨어 중 하나인 Delta3D 시뮬레이션 엔진을 이용하여 가상시험 테스트베드를 구축하였으며, 다른 시뮬레이터들과의 상호연동성을 위해 HLA/RTI을 만족하는 페더레이션을 설계하였다. 본 연구의 중요성은 한국전장에 적합한 효율적인 시뮬레이션 도구를 개발하고, 보다 현실적인 시뮬레이션을 위한 전투객체의 운동방정식 및 환경 객체의 페더레이션을 설계하는데 있다.
Nontypeable H. influenzae (NTHi), a Gram-negative obligate human pathogen, causes pneumonia, chronic bronchitis, and otitis media, and the respiratory epithelium is the first line of defense that copes with the pathogen. In an effort to identify transcriptional responses of human respiratory epithelial cells to infection with NTHi, we examined its differential gene expression using high density cDNA microarrays. BEAS-2B human bronchial epithelial cells were exposed to NTHi for 3 hand 24 h, and the alteration of mRNA expression was analyzed using microarrays consisting of 8,170 human cDNA clones. The results indicated that approximately 2.6% of the genes present on the microarrays increased in expression over 2-fold and 3.8% of the genes decreased during the 24-h infection period. Upregulated genes included cytokines (granulocyte-macrophage colony stimulating factor 2, granulocyte chemotactic protein 2, IL-6, IL-10, IL-8), transcription factors (Kruppel-like factor 7, CCAAT/enhancer binding protein $\beta$, E2F-1, NF-$\kappa$B, cell surface molecules (CD74, ICAM-1, ICAM-2, HLA class I), as well as those involved in signal transduction and cellular transport. Selected genes were further confirmed by reverse-transcription-PCR. These data expand our knowledge of host cellular responses during NTHi infection and should provide a molecular basis for the study of host-NTHi interaction.
목적 : 1987년 7월부터 1992년 12월까지 가톨릭의과대학 부속 성모병원 치료방사선과에서 만성골수성백혈병으로 진단되어 동종골수이식을 위한 전신방사선치료를 받은 환자 22명을 대상으로 생존율 및 재발율에 영향을 미치는 요소들을 알아보기 위하여 후향분석을 시행하였다. 대상 및 방법 : 22명중 14명은 만성기였으며 8명은 이행기 혹은 급전기였고 진단 후 골수이식까지의 기간은 4-36개월 (중간값, 8개월)이었으며, 모든 환자들은 HLA 완전일치의 동종골수이식을 위한 전처치로 화학요법과 전신방사선조사가 시행되었다. 전신방사선조사는 6예에서는 1200cGy/6 fractions/3days, 16예에서는 1320cGy/8fractions/4days로 시행되었다. 화학요법은 8명에서는 cyclophosphamide(CTX), 5명에서는 CTX과 Daunorubicin, 그리고 9명에서는 CTX과 Adriamycin이 병용되었다. 또한 골수이식전 비장이 절제된 경우는 14예였고 6예에서는 비장에 방사선조사 (250-800 cGy/2-8fractions)가 시행되었으며 2예에서는 비장 방사선조사후 비장절제술이 시행되었다. 이식편대숙주병을 예방하기 위해 4명에서는 cyclosporine A가 단독투여되었고 18명에서는 methotrexate가 추가 투여되었다. 결과 : 전체환자의 4년 생존율은 $58.8\%$였고 22명중 8명이 재발되었으며 4년 무병생존율은 $41.2\%$였다. 생존율 및 재발율, 이식편대숙주병에 있어서 환자의 성별, 연령, 진단에서 골수이식까지의 기간, 골수이식 당시의 병기, 비장상태, 골수공여자와의 성별 혹은 혈액형 일치여부, 골수 공여자의 연령, 전처치 항암제의 종류, 방사선치료방법, 이식편대숙주병의 억제를 위한 화학요법의 방법 등이 어떤 영향을 미치는지 분석한 결과 골수이식당시의 병기만이 생존율에 유의한 차이를 보였다. 또한 이식편대숙주병과 재발율 사이에도 유의한 연관성을 보이지 않았다. 결론적으로 동종골수이식을 위한 전처치 및 면역억제방법에 따라 생존율 및 재발율이 크게 다르지 않았으며 HLA 일치 혈연자중 골수공여자가 있는 만성기의 만성골수성 백혈병 관자에서 동종골수이식을 위한 전처치로서 화학요법과 함께 전신방사선 분할조사는 중요한 역할을 담당함을 알 수 있었으나 보다 많은 환자를 대상으로 한 전향적 연구가 필요할 것으로 사료된다.
Cytomegalovirus (CMV), a beta-herpesvirus with worldwide distribution, exhibits host persistence, a distinguishing characteristic of all herpesviruses. This persistence is dependent upon restricted gene expression in infected cells as well as the ability of productively infected cells to escape from normal cell-mediated anti-viral immunosurveillance. Type I (IFN-α/β) and type II (IFN-γ) interferons are major components of the innate defense system against viral infection. They are potent inducers of MHC class I and II antigens and of antigen processing proteins. Additionally, IFNS mediate direct antiviral effects through induction effector molecules that block viral infection and replications such as 2′, 5-oligoadenylate synthetase (2, 5-OAS). IFNS function through activation of well-defined signal transduction pathways that involve phosphorylation of constituent proteins and ultimate formation of active transcription factors. Recent studies have shown that a number of diverse viruses, including CMV, EBV, HPV mumps and Ebola, are capable of inhibiting IFN-mediated signal transduction through a variety of mechanisms. As an example, CMV infection inhibits the ability of infected cells Is transcribe HLA class I and II antigens as well as the antiviral effector molecules 2, 5-OAS and MxA I. EMSA studies have shown that IFN-α and IFN-γ are unable to induce complete signal transduction in the presence of CMV infection, phenomena that are associated with specific decreases in JAKl and p48. Viral inhibition of IFN signal transduction represents a new mechanistic paradigm for increased viral survival, a paradigm predicting widespread consequences in the case of signal transduction factors common to multiple cytokine pathways.
해군 무기체계 전투실험은 미래 새로운 무기체계의 소요를 창출하고 운용개념을 정립하며, 작전운용성능을 실험하고 검증할 뿐 아니라 나아가 교리발전 및 훈련에 이르기까지 폭넓게 실험을 수행하고 있다. 한국 해군은 전투실험을 효과적으로 지원할 수 있는 도구는 물론 전용의 실험 시설을 통해서 효율적, 효과적인 모의기반획득 지원환경을 구축하기 위해 노력하고 있다. 본 논문에서는 해군 전투실험의 훈련 및 전술발전 지원을 위한 C2 가상모의 연동 시뮬레이터를 개발하고 연동을 위한 아키텍처를 설계하였다. 대함전/대공전 시뮬레이션은 교전급 모델인 SADM을 이용하고 대잠전 시뮬레이션은 공학급 모델인 교전분석 시뮬레이터를 재사용하여 운용자 참여가 가능한 전투실험을 수행하였다. 전투실험을 통해 나온 결과를 분석, 훈련 전술에 반영하고 운용자 참여를 통해서 훈련 현실감을 높였다. C2 가상모의 연동 아키텍처는 전투실험 교전에 대한 연동 및 C2 훈련이 가능한 구성의 아키텍처로 설계되었다. 또한 서로 다른 운용개념의 시스템을 통합하고 연동하기 위한 아키텍처이다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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