• 제목/요약/키워드: HERV

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내인성 레트로바이러스의 발현과 질병 (Expression of Endogenous Retroviruses and Disease)

  • 이재영
    • 미생물학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.237-242
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    • 2007

  • 레트로바이러스(Retrovirus; RV)의 독특한 특징 중 하나는 프로바이러스의 상태로 숙주세포의 염색체에 삽입되어 숙주세포 유전자의 일부분으로서 다른 숙주세포 유전자들과 함께 다음세대로 유전된다는 것이다. 이러한 독특한 형태의 RV를 내인성 RV (endogenous RV; ERV)라고 하는데, 여러 종류의 내 외적신호에 의해 그자신의 유전자뿐만 아니라 인근한 숙주유전자의 발현에 변화가 일어난다. 사람과 쥐에서는 각각 HERV (Human ERV)와 MuERV (Murine ERV)가 세포 속에 존재하여 이들의 발현 변화가 숙주 생물체에 주로 해롭게 작용하여 질병을 일으키게 된다. 이들 ERV는 생체분자, 세포물질들이 관여하는 기작을 통해 암과 자가면역 반응과 같은 질병을 일으키는데, 이에 수반하여 많은 병리생리적 변화를 가져온다. HERV와 관련된 질병을 앓고 있는 환자들을 위해서는 이러한 질병을 이해하고, 이를 바탕으로 치료요법을 개발하기 위해 여러 단계의 대책들이 고려되어야 한다.

  • PDF KSCI

Human Endogenous Retroviruses as Gene Expression Regulators: Insights from Animal Models into Human Diseases

  • Durnaoglu, Serpen;Lee, Sun-Kyung;Ahnn, Joohong
    • Molecules and Cells
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    • 제44권12호
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    • pp.861-878
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    • 2021

  • The human genome contains many retroviral elements called human endogenous retroviruses (HERVs), resulting from the integration of retroviruses throughout evolution. HERVs once were considered inactive junk because they are not replication-competent, primarily localized in the heterochromatin, and silenced by methylation. But HERVs are now clearly shown to actively regulate gene expression in various physiological and pathological conditions such as developmental processes, immune regulation, cancers, autoimmune diseases, and neurological disorders. Recent studies report that HERVs are activated in patients suffering from coronavirus disease 2019 (COVID-19), the current pandemic caused by SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) infection. In this review, we describe internal and external factors that influence HERV activities. We also present evidence showing the gene regulatory activity of HERV LTRs (long terminal repeats) in model organisms such as mice, rats, zebrafish, and invertebrate models of worms and flies. Finally, we discuss several molecular and cellular pathways involving various transcription factors and receptors, through which HERVs affect downstream cellular and physiological events such as epigenetic modifications, calcium influx, protein phosphorylation, and cytokine release. Understanding how HERVs participate in various physiological and pathological processes will help develop a strategy to generate effective therapeutic approaches targeting HERVs.

  • https://doi.org/10.14348/molcells.2021.5016 인용 PDF KSCI

전 유전체 단계적 가시화를 위한 새로운 컴포넌트 소프트웨어 (A New Component Software for Hierarchical Visualization for Whole Genomes)

  • 정우근;조치영;조환규
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2009년도 춘계학술발표대회
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    • pp.988-991
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    • 2009

  • 게놈 데이터의 지속적인 증가로 인해 생물정보학에서 유전체 정보를 체계적으로 저장하고 열람하는 효과적이고 효율적인 시스템을 확립하는 것은 중요한 일이다. 잘 알려진 게놈 정보의 계층적 구조처럼 우리는 게놈의 내부 구조를 연구하기 위한 우수한 툴도 필요하다. 게놈 연구에 있어서 한 가지 문제는 유전체 정보는 너무 거대해서 표준적인 정보 처리를 이용하는 간단한 툴로는 작업하기 어려운 점이다. 예를 들어 특정 게놈 데이터 크기는 100메가 바이트를 넘는다. 추가적으로 유전자, promoters, retro-elements(HERV), operons, exon-introns와 같은 많은 게놈 요소들이 있다. 전통적으로 생물학자 들은 게놈 연구를 위해 툴을 아무거나 사용하지 않고, 보통 그들의 연구에 좋은 툴을 채택하려 노력했다. 게놈 연구에서 기본적이고 주시할만한 단계는 다른 종과 유전체 요소를 비교하기 위해 위치를 인식할 수 있도록 하나의 화면에 모든 게놈 데이터를 시각화하는 것이다. 생물학자에게 툴의 개발은 많은 시간이 걸리고 시행착오를 겪기 쉬운 일이다. 이 논문에서 우리는 전체 게놈 중 어떤 게놈 요소를 시각화하는 컴포넌트 웨어의 셋을 제안한다. 그리하여 실험을 목적으로 생물학자를 만나서 우리의 셋을 이용하여 컴포넌트를 조합하여 소프트웨어를 만드는 것은 비교적 간단한 작업이다. 이 실험에서 우리는 HERV와 연동되는 게놈 요소를 보여주는 툴을 어떻게 우리의 컴포넌트 웨어를 간단히 조합하여 구축하는지를 보여주겠다.

  • https://doi.org/10.3745/PKIPS.y2009m04a.988 인용 PDF