• 제목/요약/키워드: Gyrodinium impudicum

검색결과 18건 처리시간 0.021초

RAPD-PCR 방법을 이용한 Cochlodinium polykrikoides Gyrodinium impudicum, Gymnodinium catenatum의 분자생물학적 진단 (Molecular Discrimination of Dinoflagellates Cochlodinium Polykrikoides Margalef, Gyrodinium Impudicum Fraga et Bravo and Gymnodinium Catenatum Graham using RAPD-PCR Method)

  • Cho, Eun-Seob
    • 생명과학회지
    • /
    • 제13권5호
    • /
    • pp.651-657
    • /
    • 2003
  • 형태적으로 매우 유사한 적조생물 C. polykrikoides, G. impudicum, G. catenatum을 RAPD 방법을 이용하여 유전적 유연관계를 조사했다. 12개의 primer 중 4종류만 선택되었고 증폭된 밴드수는 59개이며 그 크기는 0.2에서 3.0 kb까지였다. C. polykrikoides, G. impudicum, G. catenatum의 다형화된 밴드수는 16개, 8개, 16개로 각각 나타났다. 반면에, 17개의 밴드만 동일하였다. C. polykrikoides, G. impudicum, G. catenatum의 종 특이적인 밴드수는 26개, 34개, 26개로 각각 보였다. C. polykrikoides와 G. impudicum/G. catenatum의 유전적 유사성은 0.83이며, G. impudicum과 G. catenatum은 0.78로 나타났다. 이러한 결과로 볼 때 형태적으로는 유사하게 보이지만, RAPD 분석에 의하면 C. polykrikoides, G. impudicum, G. catenatum은 현저하게 상이한 적조생물이다. 앞으로 RAPD 기법을 이용하면 이러한 와편모조류의 유전적 변이를 탐색하는데 유용할 것으로 보인다.

Molecular Identification of Gyrodinium impudicum and Gymnodinium sanguineum by Comparing the Sequences of the Internal Transcribed Spacers 1, 2 and 5.8S Ribosomal DNA

  • Kim Gi Young;Ha Myoung-Gyu;Cho Eun Seob;Lee Tae-Ho;Lee Sang Jun;Lee Jae-Dong
    • Fisheries and Aquatic Sciences
    • /
    • 제2권1호
    • /
    • pp.66-77
    • /
    • 1999
  • The sequences coding for the 5.8S rDNA and the internal transcribed spacers (ITS1 and ITS 2) from the isolates of nine isolates of Gyrodinium impudicum and two isolates of Gymnodinium sanguineum species were amplified, sequenced and compared with the previously known Alexandrium species and Gymnodinium catenatum. The genetic distance analyses based on the sequence alignment indicated that Gymnodinium catenatum and Gyrodinium impudicum species were some related, Alexandrium species was distant. G. catenatum and G. sanguineum were quite separate, but these two species belonged to the same genus. G. impudicum and G. catenatum forming the closet cluster showed some variation in the alignment of ITS regions. The length of ITS1 varied more than that of ITS2 and the length of ITS1 and ITS2 was different for each G. impudicum, Gymnodinium and Alexandrium species. Also, the length of ITS1 was shorter than that of ITS2. However, on the sequences of G. sanguineum, the length of ITS1 was longer about 23 nucleotides than that of ITS2. The phylogenetic analysis and rDNA similarity of G. impudicum and G. catenatum $(59\%)$ is higher than the that of G. catenatum and G. sanguineum $(55\%)$. It was thought that the phylogenetic analysis and the genetic distance revealed that G. impudicum and G. catenatum were clearly different species and G. impudicum may belong to the genus of Gymnodinium.

  • PDF

Axenic Culture of Gyrodinium impudicum Strain KG03, a Marine Red-tide Microalga that Produces Exopolysaccharide

  • Yim Joung Han;Lee Hong Kum
    • Journal of Microbiology
    • /
    • 제42권4호
    • /
    • pp.305-314
    • /
    • 2004
  • An exopolysaccharide-producing microalgal dinoflagellate was isolated from a red-tide bloom and des­ignated strain KG03. A bacteria-free culture of strain KG03 was achieved using a modified wash with phototaxis and antibiotic treatment. Combined treatment with neomycin and cephalosporin was the most effective for eliminating the bacteria associated with the microalgae. Strain KG03 was identified as Gyrodinium impudicum by analyzing the ITS regions of the 5.8S rDNA, 18S rDNA, morphological phenotype and fatty acid composition. The exopolysaccharide production and cell growth in a 300-ml photobioreactor were increased 2.7- and 2.4-fold, respectively, compared with that in a flask culture at the first isolation step.

Characteristics of chain-forming cells in Gyrodinium impudicum using fluorescent ConA

  • Park, Eun-Ju;Kim, Gwang-Hoon;Cho, Yong-Chul;Cho, Eun-Seob
    • Journal of the korean society of oceanography
    • /
    • 제34권4호
    • /
    • pp.214-219
    • /
    • 1999
  • Cells of the dinoflagellate Gyrodinium impudicum form characteristic chains, which are associated with sugar accumulated on the cell surface. To resolve the relationship between chain-formation and cell surface sugar accumulation, confocal microscopy was used to observe sugar accumulation points in the vegetative cells and long chain-forming cells of G. impudicum cells treated with fluorescent-tagged ConA. In the stationary and exponential phases, both vegetative cells and chain-forming cells were similar to each other in fluorescent intensity. There was no evidence that chain-forming cells had a specific location for sugar accumulation on the cell surface. Most of the cells formed 2-cell chains one day after inoculation, but longer chains consisting of 4-8 cells increased markedly in 4day and 8 day cultures. Gyrodinium impudicum chains usually consist of more than four cells, and chains of 8 or even 16 cells can be observed in mature cultures. Temperature played an importantrole in chain-formation of the cells, threshold temperature for the development of long chain-formation was 19 $^{\circ}$C.

  • PDF

Antiviral Effects of Sulfated Exopolysaccharide from the Marine Microalge Gyrodinium impudicum strain KG03

  • 임정한;김성진;박규진;안세훈;이현상;이홍금
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XII)
    • /
    • pp.615-620
    • /
    • 2003
  • Gyrodinium impudicum strain KG03의 세포외 다당류인 p-KG03은 황함유 다당류로 항바이러스 검색 결과, 조사대상 바이러스 중 특히 뇌심근 경색바이러스 (encephalomyocarditis virus; EMCV)에 항바이러스 활성을 가지는 것으로 조사되었다.

  • PDF

Cochlodinium polykrikoides와 Gyrodinium impudicum 형태특성과 24S rRNA 유전자 염기서열 비교 (Comparison of the Morphological Characteristics and the 24S rRNA Sequences of Cochlodinium polykrikoides and Gyrodinium impudicum)

  • 박종규;박영식
    • 한국해양학회지:바다
    • /
    • 제4권4호
    • /
    • pp.363-370
    • /
    • 1999
  • 1997년 8월 27일 전남 고흥군 외나로도 연안에 그 해 최초로 Cochlodinium polykrikoides에 의한 적조경보 발령시, 동 해역에는 형태상으로 유사하지만 크기가 다른 연쇄상의 무각 와편모조류가 공존하고 있었다. 이들의 24S rRNA 유전자 엽기서열을 분석한 경과, 염기서열의 상동성은 74.9%에 불과하여 두 총은 상이한 종인 것으로 드러났다. 또한 각 종을 분리, 배양하여 형태상의 특성을 비교 관찰한 결과, 20~35 ${\mu}m$ 내외의 큰 종은 국내에 잘 알려진 Cochlodinium polykrikoides이었으며, 12~25 ${\mu}m$ 내외의 작은 종은 아직까지 국내에 보고된 적이 없었던 Gymdinium impudicum인 것으로 밝혀졌다. 각 종의 24S rRNA 유전자 염기서열은 아직 밝혀진 적이 없어 Gcnbank에 보고하였다. 조사 당시 적조는 최고 개체수 30,000 cells $ml^{-1}$의 G. impudicum 적조였다. 본 연구에서는 광학현미경과 해부현미경으로 관찰할 수 있는 두 종의 형태상의 특성과 행동양식을 기술하였으며, Lugol용액으로 고정하여 원형이 변형된 후의 특정도 비교하여 고정시료를 통해서도 종을 구별할 수 있도록 하였다.

  • PDF

남해안 연안에서 적조생물, Cochlodinium polykikoides, Gyrodinium impudicum, Gymnodinium catenatum의 출현상황과 온도, 염분, 조도 및 영양염류에 따른 성장특성 (Abundance of Harmful Algae, Cochlodinium polykrikoides, Gyrodinium impudicum and Gymnodinium catenatum in the Coastal Area of South Sea of Korea and Their Effects of Temperature, Salinity, Irradiance and Nutrient on the Growth in Culture)

  • 이창규;김형철;이삼근;정창수;김학균;임월애
    • 한국수산과학회지
    • /
    • 제34권5호
    • /
    • pp.536-544
    • /
    • 2001
  • 적조생물 Cochlodinium polykrikoides, Gyrodinium impudicum, Gymnodinium catenatum은 독성을 지니거나, 적조를 일으킴으로써 수산피해 및 보건위생상의 문제를 야기시키는 종이다. 이 종들의 적조발생 환경과 기작을 이해하기 위해서는 종별 생태생리 (eco-physiology) 특성 등을 파악할 필요가 있다. 본 실험에서는 한국 남해안 연안에서 이들 3종의 출현상황과 성장특성을 파악하기 위해 이 해역에서 분리한 종을 대상으로 온도, 염분, 조도 및 영양염류에 따른 성장도를 조사하였다. 1999년도 남해안 남해도, 나로도, 완도 연안에서 이들 3종의 최초출현시기는 수온이 $22.8\sim26.5^{\circ}C$인 7월 중순에서 8월 중순으로써 서로 비슷한 시기에 동반 출현하였다. 유영세포의 소멸시기는 G. catenatum의 경우 8월 중, 하순이었고, C. polykrikoides와 G. impudicum은 수온이 $23^{\circ}C$ 이하로 하강하는 9월 하순이었다. 출현기간 중의 최대밀도는 C. polykrikoides의 경우 $40\times10^6$cells/L 이상으로써 고밀도 증식을 하였으나, G. impudicum과 C. catenatum은 각각 3,460ce11s/L 및 440ce11s/L로써 매우 낮은 밀도로 존재하였다. 배양실험에서 C. polykrikoides, G. impudicum, G. catenatum는 $22\sim28^{\circ}C$에서 양호한 성장을 보였고, 최적수온은 $25^{\circ}C$ 내외로 판단되었는데, 이러한 결과는 적조발생시의 수온과 대체로 일치하였다. 염분에 따른 성장률은 3종 모두 $30\sim35\%$에서 양호한 성장률을 보였다. 3종 중 G. impudicum은 비교적 광염성의 특징을 보였고, G. cstenatum은 $35\%$ 이상의 고염분에서 특히, 저조한 성장률을 보였다. 조도에 따른 성장은 C. polykrikoides와 G. impudicum의 경우 특히 7,5001ux 이상의 고조도에서 성장률이 현저히 높은 것으로 나타났다. 이러한 결과는 C. polykrikoides의 경우 조도가 높은 하계에 표층에서 강한 집적현상을 보이면서도 광저해현상을 밟지 않고 양호한 증식을 할 수 있는 특성과 관련이 있을 것으로 추정되었다. C. polykrikoides와 G. impudicum의 질산 및 암모니아 질소 농도에 따른 성장은 $40{\mu}M$까지는 농도가 높을수록 성장률도 증가하였으나 그 이상에서는 큰 차이를 보이지 않아, 두 종의 질소 임계농도는 $13.5\~40{\mu}M$로 판단되었다. 또한, 인산인은 $4.05{\mu}M$ 까지는 농도가 높을수록 성장률도 증가하였으나 그 이상에서는 큰 성장차를 보이지 않아, 두 종 모두 인산인의 임계농도는 $1.35\sim4.05{\mu}M$로 판단되었다. 한편, C. polyklikoides는 DIN과 DIP 농도가 각각 $1.2{\mu}M$$0.3{\mu}M$ 이하로 낮았던 나로도와 남해도 외측해역에서도 적조를 형성하였다. 이와 같이 낮은 영양염류 하에서 왕성하게 증식할 수 있었던 이유는 이 종의 경우 일간 수직이동을 통해 야간에 저층에서 풍부한 영양염류를 흡수할 수 있었기 때문으로 해석되었다.

  • PDF

Rheological Properties of Exopolysaccharide p-KG03 Produced by Marine Microalgae Gyrodinium impudicum strain KG03

  • 임정한;김성진;박규진;안세훈;이현상;이홍금
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XII)
    • /
    • pp.611-614
    • /
    • 2003
  • p-KG03의 고유점도는 65.22 및 50.75 $d{\ell}/g$ 이며, 사슬강도성은 0.170이였고, 특성화 농도는 0.114 g/l이었다. p-KG03은 non-Newtonic fluid로 Power-Low Model에 의한 pseudoplastic한 물성을 갖으며, 유체성으로 p-KG03 1%의 constancy index (K)는 2,172 cp, flow behavior index (n)는 0.52이었다. 특히 pH, 염 및 열에 안정하며 기존 다당류와의 혼합이용 가능성이 있을 것으로 생각된다.

  • PDF

Application of Image Analysis System for Red Tide Organisms

  • Cho Eun Seob;Kang Yoon Mi;Kim Gwang Hoon
    • Fisheries and Aquatic Sciences
    • /
    • 제2권2호
    • /
    • pp.172-175
    • /
    • 1999
  • Relative DNA contents in some harmful algae were measured using DAPI staining and image analysis system. This method was useful to identify some morphologically similar species and isolates from harmful algal blooms (HABs). In exponential phase, Prorocentrum micans had higher relative DNA content (RD) of $1.83\pm0.52$ than any other isolates, followed by Cochlodinium polykrikoides $(1.10\pm0.46)$ Alexandrium tamarense $(0.93\pm0.32)$ Gyrodinium impudicum $(0.56\pm0.17)$, Scrippsiella trochoidea $(0.41\pm0.26)$ and P. minimum$(0.05\pm0.01)$. When they were fixed with Lugol's solution, it was difficult to d,iscern C. polykrikoides from G. impudicum under the light microscope, but the DNA contents were quite different in two species. C. polykrikoides contained about twice as much RD as G. impudicum under the same culture conditions and exponential phase. DAPI­stained DNA feature in C. polykrikodes showed concentrated in the peripheral part of the cell, but in G. impudicum showed a compact structure in the central part. Although A. tamarense and S. trochoidea were morphologically similar under the light microscope, nuclear DNA content of A. tamarense was twice as much as that of S. trochoidea.

  • PDF