Islam, Mohammad Saiful;Islam, Mohammad Jahidul;Ahmed, Sheikh Ali;Chun, Su-Kyoung;Chong, Song-Ho;Kim, Jong-In
한국가구학회지
/
제18권4호
/
pp.317-323
/
2007
Almost all the people, particularly the rural people are directly dependent on the continued productivity of natural resources, like water, soils, forests and fisheries. But the overuse by the extremely high population pressures has degraded the natural resources into severe widespread deforestation. The degradation of natural resources, particularly the plant resources has been a great concern for socio-economic and sustainable development of the country. The Forests in Bangladesh have been depleted and degraded in volume, area, and quantity, thus requiring urgent forest protection by identifying the causes of forest loss. There are so many causes of deforestation and loss of genetic resources such as; the timber industry, which, legal or not, are cutting too many trees; indigenous forest dwellers, having their own types of problems; migrants, who, because of problems in their places of origin, have decided to move to the forests and the government through its Forest Department which is not able or willing to implement suitable policies to regulate the cutting trees and to prevent illegal cutting. Because it is a time consuming task to mitigate the first and second sets of factors, we recommend involving forest dwellers in forestry practices as much as possible and taking necessary steps to alleviate the third and fourth sets and thereby reduce the rate of forest depletion. Accordingly, a number of strategies that should be adopted to halt the loss of remaining forest cover are discussed.
In contrast to high genetic diversity of mitochondrial DNA (mtDNA), equine Y chromosome shows extremely low variability, implying limited patrilines in the domesticated horse. In this study, we applied direct sequencing and restriction fragment length polymorphism (RFLP) methods to investigate the polymorphisms of 33 Y chromosome specific loci in 304 Chinese indigenous horses from 13 breeds. Consequently, two Y-single nucleotide polymorphisms (SNPs) (Y-45701/997 and Y-50869) and one Y-indel (Y-45288) were identified. Of those, the Y-50869 (T>A) revealed the highest variation frequency (24.67%), whereas it was only 3.29% and 1.97% in Y-45288 (T/-) and Y-45701/997 (G>T) locus, respectively. These three mutations accounted for 27.96% of the total samples and identified five Y-SNP haplotypes, demonstrating genetic diversity of Y chromosome in Chinese horses. In addition, all the five YSNP haplotypes were shared by different breeds. Among 13 horse breeds analyzed, Balikun horse displayed the highest nucleotide diversity (${\pi}=5.6{\times}10^{-4}$) and haplotype diversity (h = 0.527), while Ningqiang horse showed the lowest nucleotide diversity (${\pi}=0.00000$) and haplotype diversity (h = 0.000). The results also revealed that Chinese horses had a different polymorphic pattern of Y chromosome from European and American horses. In conclusion, Chinese horses revealed genetic diversity of Y chromosome, however more efforts should be made to better understand the domestication and paternal origin of Chinese indigenous horses.
The Fukushima Daiichi Nuclear Power Plant accident in March 2011 caused severe radioactive contamination in the surrounding environment. Since the accident, much attention has been paid to the biological and genetic consequences of organism inhabiting the contaminated area. The effect of radiation exposure on genetic mutation rates is little known, especially for low doses and in situ conditions. Evaluating DNA mutation by low levels of radiation dose is difficult due to the rare mutation event and lack of sequence information before the accident. In this study, correlations with air dose levels and somatic DNA mutation rates were evaluated using Next Generation Sequencer for the clonal plant, Phyllostachys edulis. This bamboo is known to spread an identical clone throughout Japan, and it has the advantage that we can compare genetic mutation rate among identical clone growing different air dose levels. We collected 94 samples of P. edulis from 14 sites with air dose rates from $0.04{\sim}7.80{\mu}Gy/h$. Their clonal identity was confirmed by analysis using 24 microsatellite markers, and then, sequences among samples were compared by MIG sequence. The sequence data were obtained from 2,718 loci. About ~200,000 bp sequence (80 bp X 2,718 loci) were obtained for each sample, and this corresponds to about 0.01% of the genome sequence of P. edulis. In these sequences, 442 loci showed polymorphism patterns including recent origin mutation, old mutation, and sequence errors. The number of mutations per sample ranged from 0 to 13, and did not correlate with air dose levels. This result indicated that DNA mutations have not accumulated in P. edulis living in the air doses levels less than $10{\mu}Gy/h$. Our study also suggests that mutation rates can be assessed by selecting an appropriate experimental approach and analyzing with next generation sequencer.
Objectives : Genetic analysis and taste pattern were performed to identify species between Glycyrrhiza uralensis and G. glabra which are officially listed in Korean Pharmacopoeia IX as origin of Gamcho(g$\={a}$nc$\v{a}$o, licorice root, Glycyrrhizae Radix et Rhizoma). Methods : Genetic analysis showed that identification between two species was done by comparing base sequence of ITS(intergenic transcribed spacer) and trnH-psbA regions from eleven Gamchoes sold in market. There was different taste pattern using by taste sensor in Glycyrrhiza uralensis and G. glabra. Results : Genetic analysis showed that six Gamchoes from China were identified as Glycyrrhiza uralensis and five Gamchoes from Uzbekistan were G. glabra. From the results of taste pattern, sourness and astringency of Glycyrrhiza uralensis from China were significantly higher than G. glabra from Uzbekistan, and aftertaste of astringency, aftertaste of umami, and saltiness of Glycyrrhiza uralensis were signicantly low as compared to G. glabra. There is no significant difference between two species in terms of bitterness, aftertaste of bitterness, and umami. Conclusions : Taken together, Glycyrrhiza uralensis from China and G. glabra from Uzbekistan were identified by taste sensor, and this technic could be applied to establishment of taste pattern marker for identification of different species located in various regions.
PURPOSES : The Toll Collection System (TCS) operated by the Korea Expressway Corporation provides accurate traffic counts between tollgates within the expressway network under the closed-type toll collection system. However, although origin-destination (OD) matrices for a travel demand model can be constructed using these traffic counts, these matrices cannot be directly applied because it is technically difficult to determine appropriate passenger car equivalent (PCE) values for the vehicle types used in TCS. Therefore, this study was initiated to systematically determine the appropriate PCE values of TCS vehicle types for the travel demand model. METHODS : To search for the appropriate PCE values of TCS vehicle types, a traffic demand model based on TCS-based OD matrices and the expressway network was developed. Using the traffic demand model and a genetic algorithm, the appropriate PCE values were optimized through an approach that minimizes errors between actual link counts and estimated link volumes. RESULTS : As a result of the optimization, the optimal PCE values of TCS vehicle types 1 and 5 were determined to be 1 and 3.7, respectively. Those of TCS vehicle types 2 through 4 are found in the manual for the preliminary feasibility study. CONCLUSIONS : Based on the given vehicle delay functions and network properties (i.e., speeds and capacities), the travel demand model with the optimized PCE values produced a MAPE value of 37.7%, RMSE value of 17124.14, and correlation coefficient of 0.9506. Conclusively, the optimized PCE values were revealed to produce estimates of expressway link volumes sufficiently close to actual link counts.
종간 유연관계와 다배체종의 기원을 규명하기 위해 한국산 꿩의비름속 식물 6종 20집단에 대해 형태형질과 동위효소 자료를 이용하여 유전적, 형태적 연구를 수행하였다. 형태 형질 분석결과에 의하면 삼배체인 새끼꿩의비름은 세잎꿩의비름과 매우 가까운 유연관계를 보여 주고 있고, 동위효소 분석에서도 높은 빈도로 나타나는 대립유전자에서도 두 종이 매우 유사한 양상을 보여 주었다. $PGI-1^b$의 경우 두 종에서만 독특하게 고정되어 있어 세잎꿩의비름이 새끼꿩의비름의 이배체 조상일 가능성을 시사하였다. 하지만 $ALD-1^c$ 대립인자의 경우, 새끼꿩의비름에서만 독특하게 나타나며, 꿩의비름과 큰꿩의비름에서 공통으로 나타나는 대립인자들이 새끼꿩의비름에서는 나타나지 않아 위 두 종이 새끼꿩의비름의 또 다른 사배체 조상일 가능은 희박하다고 하겠다. 우리나라 특산종인 섬꿩의비름은 형태적으로나 유전적으로 꿩의비름과 매우 유사한 양상을 보여주고 있어 꿩의비름으로부터 직접 또는 공통의 조상으로부터 나왔을 가능성이 크다. 또한, 둥근잎꿩의비름은 꿩의비름, 섬꿩의비름과 가까운 유연관계를 보여주고 있다.
Asekova, Sovetgul;Kulkarni, Krishnanand P.;Oh, Ki Won;Lee, Myung-Hee;Oh, Eunyoung;Kim, Jung-In;Yeo, Un-Sang;Pae, Suk-Bok;Ha, Tae Joung;Kim, Sung Up
Plant Breeding and Biotechnology
/
제6권4호
/
pp.321-336
/
2018
Sesame (Sesamum indicum L.) is an important oilseed crop grown in tropical and subtropical areas. The objective of this study was to investigate the genetic relationships among 129 sesame landraces and cultivars using simple sequence repeat (SSR) markers. Out of 70 SSRs, 23 were found to be informative and produced 157 alleles. The number of alleles per locus ranged from 3 - 14, whereas polymorphic information content ranged from 0.33 - 0.86. A distance-based phylogenetic analysis revealed two major and six minor clusters. The population structure analysis using a Bayesian model-based program in STRUCTURE 2.3.4 divided 129 sesame accessions into three major populations (K = 3). Based on pairwise comparison estimates, Pop1 was observed to be genetically close to Pop2 with $F_{ST}$ value of 0.15, while Pop2 and Pop3 were genetically closest with $F_{ST}$ value of 0.08. Analysis of molecular variance revealed a high percentage of variability among individuals within populations (85.84%) than among the populations (14.16%). Similarly, a high variance was observed among the individuals within the country of origins (90.45%) than between the countries of origins. The grouping of genotypes in clusters was not related to their geographic origin indicating considerable gene flow among sesame genotypes across the selected geographic regions. The SSR markers used in the present study were able to distinguish closely linked sesame genotypes, thereby showing their usefulness in assessing the potentially important source of genetic variation. These markers can be used for future sesame varietal classification, conservation, and other breeding purposes.
Adzuki beans have gained popularity in recent years due to their health benefits. Breeding of Adzuki beans is less favorable than with other legumes due to low genetic diversity. This study aimed to evaluate the genetic diversity of 252 adzuki bean germplasms from China, Japan, and Korea using 18 agro-morphological parameters and comparing their performance to three prominent Korean cultivars: Geomguseul, Arari, and Chungjupat. Leaf shape, pod color, and seed coat color were among the qualitative traits that showed wide variations. The quantitative variables also showed wide variations among adzuki bean germplasms. Although there was no significant difference (p < 0.05), the average rate of germination declined in the order of Korean (91.44%) > Chinese (91.31%) > Japanese (87.47%) adzuki beans. Chinese adzuki beans needed fewer days to flower (DF, 58.22 days) and days to mature (DM, 107.13 days), which varied significantly compared to the Korean and Japanese adzuki beans (p < 0.05). The average number of pods per plant (PPP) and one-hundred seeds weight (HSW) were higher in Japanese adzuki beans compared to the Korean and Chinese adzuki beans although the variation of each was not significant. Almost 29.76% of the accessions had early-blooming flowers, 3.97% were premature, 21.43% produced more PPP, and 3.97% yielded more SPP compared to control cultivars. Results of hierarchical cluster and principal component analyses revealed three clusters with significant variation in all quantitative variables except for RG (p < 0.05). The key factors in multivariate analyses were DF, DM, and HSW. Our study investigated the genetic diversity of adzuki bean accessions and identified ten early maturing and ten high PPP-yielding accessions. Our findings would help farmers and breeders to select the top-performing accessions that can provide them with various options.
High-quality and high-phytonutrient watermelon fruits have strong market opportunities besides their health related benefits. Hence, investigating quality and nutritional related traits of watermelon genetic resources could provide important baseline data in breeding for increased lycopene content thereby increasing the marketability of watermelon. To this end, we have examined some fruit morphological traits and lycopene content of 105 genetic resources. The morphological characters were recorded on the field and inside laboratory and lycopene was measured using spectrophotometric and HPLC methods. Watermelon fruits have shown a diverse morphological characters. Red and pink fleshed fruits dominated in the entire collections. Fruits with higher thickness of rind were found to exhibit less soluble solid content (SSC). Korean origin fruits were characterized by intermediate SSC while USA, RUS, TJK, TKM, TWN, and URY originated fruits had the highest SSC. The lycopene content varied between 41.37 and 182.82 ㎍/g, 2.81 and 163.72 ㎍/g, and 3.54 and 255.47 ㎍/g using HPLC, UV-Vis, and microplate reader instrumnets, respectively. Red- and pink-fleshed fruits had the highest levels of lycopene content compared to the yellow- and orange-fleshed. Lycopene content had a significant positive correlation with SSC, however, no correlations were detected between lycopene and other quantitative fruit morphological characters.
Jeon, Hyeong-Kyu;Park, Hansol;Lee, Dongmin;Choe, Seongjun;Kang, Yeseul;Bia, Mohammed Mebarek;Lee, Sang-Hwa;Sohn, Woon-Mok;Hong, Sung-Jong;Chai, Jong-Yil;Eom, Keeseon S.
Parasites, Hosts and Diseases
/
제56권3호
/
pp.275-280
/
2018
In the present study, we identified a Spirometra species of Myanmar origin (plerocercoid) by molecular analysis using mitochondrial cox1 and nad1 genes, as well as by morphological observations of an adult tapeworm. Spargana specimens were collected from a paddy-field in Taik Kyi Township Tarkwa Village, Yangon, Myanmar in December 2017. A total of 5 spargana were obtained from 20 frogs Hoplobatrachus rugulosus; syn: Rana rugulosa (Wiegmann, 1834) or R. tigrina (Steindachner, 1867). The plerocercoids were used for experimental infection of a dog. After 4 weeks of infection, an adult tapeworm was recovered from the intestine of the dog. Morphologically, the distinct features of Spirometra sp. (Myanmar origin) relative to S. erinaceieuropaei and S. decipiens include a uterine morphology comprising posterior uterine coils that larger than the terminal uterine ball and coiling of the uteri diagonally (swirling) rather than spirally. The cox1 sequences (1,566 bp) of the Myanmar-origin Spirometra species showed 97.9% similarity to a reference sequence of S. decipiens (GenBank no. KJ599679) and 90.5% similarity to a reference sequence of S. erinaceieuropaei (GenBank no. KJ599680). Phylogenetic tree topologies were identical and presented high confidence level of values for the 3 major branches of the 3 Spirometra species in cox1 and nad1 genes. These results indicated that Myanmar-origin Spirometra species coincided with those of S. ranarum and may be considered as a valid species.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.