• 한국어병학회지
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• 제26권3호
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• pp.255-263
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• 2013

선천성 면역반응은 감염성 질병에 대한 저항력이 부족한 초기 발달단계의 자치어에게 중요하다. 특히 lectin은 선천성 면역반응에 많은 기여를 하고 있으며 종류 또한 다양하다. Lectin의 종류 중 하나인 galectin은 어류 점액 내에 존재하며 선천적으로 외부 병원체로부터 숙주를 보호하는 기능을 지니고 있다. 하지만 어류 galectin과 초기발생단계 시기와 관련된 연구들은 부족한 실정이다. 본 연구는 넙치에서 발현되는 galecin-1을 통하여 자치어의 초기발생단계별 그리고 성어의 조직별 발현을 조사하였다. 초기발생단계별 galectin 발현을 조사한 결과, 부화 전 수정란의 낭배기부터 galectin-1 유전자의 발현이 시작되었으며, 부화 후 25일까지 서서히 증가하였다. 부화 후 30~35일에 galectin-1 유전자의 발현량이 급격하게 증가하였고, 그 이후의 galecin-1 유전자의 발현량은 서서히 감소하였다. 성어 (5개월령, 29개월령)의 조직별 galectin 발현을 조사한 결과, 근육, 장, 지느러미, 위, 눈 조직 순서로 높게 발현하였고, 이외의 조직에서는 발현이 나타나지 않았다. 초기발생단계에서 galectin-1의 발현이 증가되는 것은 낭배기부터 넙치의 근육, 지느러미 그리고 눈 조직이 형성되고 galectin의 분비가 시작되어 기능을 나타내기 때문인 것으로 추측된다. 부화 후 30일부터 galectin의 발현량이 많이 증가하는 것은 장과 위 조직이 활성화됨에 따라 점액의 분비량이 증가하여 galectin의 발현량 또한 증가하는 것으로 판단된다. 이로써 넙치 초기발생단계 시기의 galectin-1 유전자의 발현패턴과 galectin이 점액 내에 다량 포함되어 있는 것을 확인하였으며, galectin의 발현은 선천적 면역반응으로 넙치의 초기발생단계 시기와 성어기에 중요할 것으로 판단된다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제51권1호
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• pp.1-6
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• 2008

Estrogens, a group of steroid compounds functioning as the primary female sex hormone, play an important role in the development and progression of breast cancer. In this study, using a novel annealing control primer-based GeneFishing PCR technology, five differentially expressed genes (DEGs), expressed using 10nM mitogenic estrogens, $17{\beta}$-estradiol (E2) and $16{\alpha}$-hydroxyestrone ($16{\alpha}$-OHE1), were selected from the estrogen receptor (ER)-positive MCF-7 human breast cancer cells. The DEGs, MRPL42, TUBA1B, SSBP1, KNCT2, and RUVBL1, were identified by comparison with the known genes via direct sequencing and sequence homology search in BLAST. Quantitative real-time PCR data showed that two DEGs, tubulin ${\alpha}1b$ and kinetochore associated 2, were greater than 2-fold upregulated by E2 or $16{\alpha}$-OHE1. Both genes could be new biomarkers for the treatment and prognosis of cancers, and further study may provide insights into the molecular mechanisms underlying development and progression of breast cancer.

• Reproductive and Developmental Biology
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• 제33권1호
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• pp.41-48
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• 2009

Placenta is the main nutrition source for the fetus during pregnancy. Thus, it has a pivotal function in the pregnant process. Many functions of the placenta have been elucidated. An abnormal placenta is associated with a high rate of pregnancy failure in somatic cloned bovine. Differentially expressed genes (DEGs) were examined in a comparison between normal and cloned bovine placenta using annealing control primer (ACP)-based GeneFishing PCR. Using 120 ACPs, nearly 80 genes were identified and the fragments of 42 DEGs were sequenced. 38 of these genes were known genes and four were unknown. To determine the DEGs result, six target clones expressing on one-side of a normal and a clone placenta were selected. Through an analysis of the target genes using the real-time PCR, the expressing pattern was found to be somewhat different from the DEGs. Additionally, several genes appeared with the same expression pattern. Taken together, this suggests that the target genes would be essential for research into what influences the placental formative mechanisms during fetal development.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권10호
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• pp.1635-1644
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• 2018

Asterias amurensis (starfish) is a marine organism that is harmful to the fishing industry, but is also a potential source of functional materials. The present study was conducted to analyze the profiles of fatty acids extracted from A. amurensis tissues and their anti-inflammatory effects on RAW264.7 macrophage cells. In different tissues, the component ratios of saturated fatty acids, monounsaturated fatty acids, and polyunsaturated fatty acids differed; particularly, polyunsaturated fatty acids such as dihomo-gamma-linolenic acid (20:3n-6) and eicosapentaenoic acid (20:5n-3) were considerably different. In lipopolysaccharide-stimulated RAW264.7 cells, fatty acids from A. amurensis skin, gonads, and digestive glands exhibited anti-inflammatory activities by reducing nitric oxide production and inducing nitric oxide synthase gene expression. Asterias amurensis fatty acids effectively suppressed the expression of inflammatory cytokines such as tumor necrosis $factor-{\alpha}$, interleukin-$1{\beta}$, and interleukin-6 in lipopolysaccharide-stimulated cells. Cyclooxygenase-2 and prostaglandin $E_2$, which are critical inflammation biomarkers, were also significantly suppressed. Furthermore, A. amurensis fatty acids reduced the phosphorylation of nuclear $factor-{\kappa}B$ p-65, p38, extracellular signal-related kinase 1/2, and c-Jun N-terminal kinase, indicating that these fatty acids ameliorated inflammation through the nuclear $factor-{\kappa}B$ and mitogen-activated protein kinase pathways. These results provide insight into the anti-inflammatory mechanism of A. amurensis fatty acids on immune cells and suggest that the species is a potential source of anti-inflammatory molecules.

• 한국발생생물학회:학술대회논문집
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• 한국발생생물학회 2003년도 제3회 국제심포지움 및 학술대회
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• pp.82-82
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• 2003

Offspring have been produced from somatic cells in a number of species. This biotechnology introduced a new phenomenon in reprogramming and differentiation of somatic cell, namely totipotency. However, birth of oversized calves and perinatal abnormalities such as increased gestation length, lack of spontaneous parturition, higher incidence of dystocia, and reduced perinatal viability of offspring are frequently observed in pregnancies of cloned bovine fetuses. Disturbance of feto-placenta has been proposed as likely causes for abnomal growth. However. Little is known the mechanism responsible for the perinatal problems. Therefore, we focused on gestation length in somatic cell nuclear recipient cows. To solve this issues, placental tissues of control and cloned bovine were obtained by a cesarean section (C-section) before 5 days of paturition. Total RNA from control and cloned bovine placenta was extractd by TRIzol reagent. GeneFishing DEG kits (Seegene) were used to identify differentially expression genes. Total RNA (3 ug) were synthesized by M-MLV reverse transcriptase (200 u/ul) with 10 uM dT-annealing control primer (ACP1) at 42C for 90 min. Then, first-strand cDNA (50 ng) was amplified using the 5 uM arbitary ACP (1-20) and 10 uM dT-ACP2 primers. Some specific expression genes were amplified, Now, we are cloning and sequencing. These finding strongly can be support to solve the problems for parturition delay in nuclear transfer cows, suggest that placenta specific proteins are key indicators for the aberration of gestation and placental function in cows.

• Journal of Korean Neurosurgical Society
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• 제48권1호
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• pp.20-30
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• 2010

Objective : We determined whether the expression of GRIM-19 is correlated with pathologic types and malignant grades in gliomas, and determined the function of GRIM-19 in human gliomas. Methods : Tumor tissues were isolated and frozen at $-80^{\circ}C$ just after surgery. The tissues consisted of normal brain tissue (4), astrocytomas (2), anaplastic astrocytomas (2), oligodendrogliomas (13), anaplastic oligodendrogliomas (11), and glioblastomas (16). To profile tumor-related genes, we applied RNA differential display using a $Genefishing^{TM}$ DEG kit, and validated the tumor-related genes by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). A human glioblastoma cell line (U343MG-A) was used for the GRIM-19 functional studies. The morphologic and cytoskeletal changes were examined via light and confocal microscopy. The migratory and invasive abilities were investigated by the simple scratch technique and Matrigel assay. The antiproliferative activity was determined by thiazolyl blue Tetrazolium bromide (MTT) assay and FACS analysis. Results : Based on RT-PCR analysis, the expression of GRIM-19 was higher in astrocytic tumors than oligodendroglial tumors. The expression of GRIM-19 was higher in high-grade tumors than low-grade tumors or normal brain tissue; glioblastomas showed the highest expression. After transfection of GRIM-19 into U343MG-A, the morphology of the sense-transfection cells became larger and more spindly. The antisensetransfection cells became smaller and rounder compared with wild type U343MG-A. The MTT assay showed that the sense-transfection cells were more sensitive to the combination of interferon-$\beta$ and retinoic acid than U343MG-A cells or antisense-transfection cells; the antiproliferative activity was related to apoptosis. Conclusion : GRIM-19 may be one of the gene profiles which regulate cell death via apoptosis in human gliomas.

• 대한구순구개열학회지
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• 제10권1호
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• pp.1-16
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• 2007

이차구개는 발생과정에서 구개선반의 형성과 성장, 거상과 융합의 과정을 통해 형성된다. 이와 같은 이차구개의 형성과정은 미세한 분자유전학적 신호전달기전에 의해 조절되는 것으로 알려져 있어서, 신호전달과정에 관여하는 유전인자의 발현이상이 되면 정상적인 이차구개가 형성되지 못하고 구개파열이라는 선천성 기형이 발생된다. 구개파열의 유발인자들에 대한 많은 연구에도 불구하고 현재까지 정상적인 이차구개의 형성을 조절하는 분자유전학적 기전에 대해서는 명확히 알려져 있지 않다. 따라서 본 연구에서는 이차구개의 형태분화를 조절하는 분자유전학적 기전을 알아보고자, 이차구개 형성의 내적 조절인자 중 핵심유전자로 알려져 있는 Osr2가 결손된 생쥐의 이차구개 형성과정에서 정상생쥐에 비해 발현의 변동이 나타나는 유전자를 확인하였다. 유전자 발현의 변동은 발생 14.5일(E14.5)의 구개선반으로부터 추출한 total RNA를 이용하여 ACP-based GeneFishing PCR을 시행하여 확인하였고, 각각의 변동된 유전자를 동정하여 정상생쥐의 이차구개 형성과정에서의 발현양상을 in situ hybridization을 시행하여 확인하였다. 총 120쌍의 primer를 이용한 검색을 통해서 정상생쥐의 구개선반에 비해 mutant에서 발현이 변동된 유전자는 7개가 검출되었고, 이들은 모두 정상생쥐에 비해 mutant에서 발현이 증가되는 것으로 확인되었다. 검출된 유전자는 vimentin(Vim), ${\beta}$-tropomyosin 2(Tpm2), thioredoxin-like 5(Txnl5), procollagen type II alpha 1(Col2a1), Insulin-like growth factor binding protein 7(IGFbp7), Sui 1 homologs(Sui 1), Defender against cell death1(Dad1)이었다. 검출된 유전자를 동정하여 정상생쥐의 구개 형성과정에서의 발현양상을 알아본 결과, Col2a1 을 제외한 유전자들은 모두 E13.5의 구개선반에서 특이적으로 발현되고 있었으나 구개선반이 융합된 E15.5에서는 Vim, Txnl5 그리고 Dad1 만이 봉합선을 따라 발현이 지속되고 있었다. 이상의 결과로 보아 검출된 유전자들은 구개선반의 형태분화과정에서 발현되어 이차구개의 형성과정에 관여할 것으로 여겨진다. 또한 이들은 이차구개 형성의 내적조절인자인 Osr2의 downstream target 으로 구개선반의 성장과 융합과정에 직접적으로 관여하는 유전물질일 것으로 추정된다.

• 한국수산과학회지
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• 제29권3호
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• pp.320-331
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• 1996

본 연구는 1994년 6월부터 1995년 5월까지 우리 나라 해역에 분포하는 오징어, Todarodes pacificus에 대해 유전자 조성을 관찰하고 군간 비교로 계군을 분석한 것이다. 각기 채집 장소가 다른 9개 지역 집단에 있어서 17개 효소를 사용하여 전기영동법으로 유전적 변이와 분화를 분석하였다. 명확하게 유전자형이 추정된 9개 효소에 대해, 11개의 유전자좌를 표지로 하여, 각기 채집 장소가 다른 9개 지역 집단의 대립유전자빈도와 유전도 변이성의 범위를 조사하였다. 그 결과, 1유전자좌당 평균 대립유전자수는 $1.64\~2.18$개 이었다. 집단의 변이량을 나타내는 다형율 $(P+P^{\ast})$은 $0.273\~0.546$이었다. 평균 이형접합체율 $(H_e)$은 $0.038\~0.085$이었다. 그리고 Nei의 유전적 거리는 $0.00019\~0.000814$로 넓음을 알 수 있었다. 각기 채집 장소가 다른 9개 지역집단간의 유전적 유연관계를 알아 본 결과, 세 집단으로 구분되었다. 이상의 결과를 종합하여 보면, 하계군, 추계군 및 동계군에는 각각의 계군으로 구명되었고, 하계군과 추계군에는 해류나 지리적인 해양환경에 의해 독립된 하나의 지역개체군이 존재하고 있음을 알 수 있었다.