• 제목/요약/키워드: Gel Image

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Comet 분석을 통한 방사선처리 고추세포의 핵 DNA 손상평가 (Assessment of Nucleus-DNA Damage in Red Pepper Cells Treated with γ-Radiation through Comet Assay)

  • 안정희;백명화;김재성;정정학;권순태
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제31권3호
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    • pp.225-230
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    • 2004
  • 방사선에 노출된 고추유묘의 잎으로부터 세포핵을 분리하여 단세포전기영동방법인 comet 분석을 통하여 핵 DNA의 손상정도를 조사하였다. Comet 분석에서 꼬리부분의 길이 (T)와 머리부분의 길이 (H)를 측정하여 T/H 비율을 조사하였다. 무처리세포는 T/H 비율이 1.28이었으나 50 및 100 Gy의 방사선을 처리한 세포는 각각 3.54 및 3.39로 방사선처리에 의해 상당량의 핵 DNA가 손상을 입은 것으로 나타났다. Comet의 head-DNA량은 무처리가 76.8%였으나 50 및 100 Gy를 처리한 세포는 각각 55.9% 및 59.5%를 보였다. 고선량의 방사선을 처리하기 전에 미리 20 Gy 이하의 저선량 방사선을 종자에 전처리하였을 경우 종자의 발아 및 생장에 대한 영향은 없었지만, 후속 고선량에 대한 핵 DNA의 손상은 경감되는 경향을 보였다.

Identification of Proteins Responsible for the Development of Adriamycin Resistance in Human Gastric Cancer Cells Using Comparative Proteomics Analysis

  • Yang, Yi-Xuan;Hu, Huai-Dong;Zhang, Da-Zhi;Ren, Hong
    • BMB Reports
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    • 제40권6호
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    • pp.853-860
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    • 2007
  • Resistance to anticancer drugs is a major obstacle in the effective treatment of tumors. To understand the mechanisms responsible for multidrug resistance (MDR), a proteomic approach was used to identify proteins that were expressed in different levels by the adriamycinresistant human gastric cancer cell line, SGC7901/ADR, and its parental cell line, SGC7901. Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) and image analysis was used to determine which protein spots were expressed in different levels by the two cell lines. These spots were then partially identified using ESI-Q-TOF mass spectrometry, and the differential expressional levels of the partially identified proteins were then determined by western blot analysis and real-time RT-PCR. Additionally, the association of Nucleophosmin (NPM1), a protein that was highly expressed by SGC7901/ADR, with MDR was analyzed using siRNA. As a result of this study, well-resolved, reproducible 2-DE patterns of SGC7901/ADR and SGC7901 were established, and 16 proteins that may playa role in the development of thermo resistance were identified. Additionally, suppression of NPMl expression was found to enhance adriamycin chemosensitivity in SGC7901/ADR. These results provide a fundamental basis for the elucidation of the molecular mechanism of MDR, which may assist in the treatment of gastric cancer.

Protein Expression of Mouse Uterus in Post-Implantation

  • Kim, Hong-Rye;Han, Rong-Xun;Kim, Myung-Youn;Diao, Yunfei;Park, Chang-Sik;Jin, Dong-Il
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제33권4호
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    • pp.237-242
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    • 2009
  • Pregnancy is a unique event in which a fetus develops in the uterus despite being genetically and immunologically different from the mother, and the underlying mechanisms remain poorly understood. To analyze the differential gene expression profiles in nonpregnant and 7 days post coitus (dpc) pregnant uterus of mice, we performed a global proteomic study by 2-D gel electrophoresis (2-DE) and MALDI-TOF-MS. The uterine proteins were separated using 2-DE, Approximately 1,000 spots were detected on staining with Coomassie brilliant blue. An image analysis using Melanie III (Swiss Institute for Bioinformatics) was performed to detect variations in protein spots between pregnant and nonpregnant uterus. Twenty-one spots were identified as differentially expressed proteins, of which 10 were up-regulated proteins such as alpha-fetoprotein, chloride intracellular channel 1, transgelin, heat-shock protein beta-1, and carbonic anhydrase II, while 11 were down-regulated proteins such as X-box binding protein, glutathione S-transferase omega 1, olfactory receptor Olfr204, and metalloproteinase-disintegrin domain containing protein TECADAM. Most of the identified proteins appeared to be related with catabolism, cell growth, metabolism, regulation, cell protection, protein repair, or protection. Our results uncovered key proteins of mouse uterus involved in pregnancy.

만성 신경병성 통증이 유발된 쥐의 뇌척수액에서 단백체학을 이용한 Calcitonin Gene-related Peptides의 정량분석 (A Proteomic Approach for Quantitative Analysis of Calcitonin Gene-related Peptides in the Cerebrospinal Fluid Obtained from a Rat Model of Chronic Neuropathic Pain)

  • 김동희;홍성호
    • The Korean Journal of Pain
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    • 제21권2호
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    • pp.112-118
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    • 2008
  • Background: This study was conducted to quantitatively analyze proteins associated with the calcitonin gene-related peptide (CGRP) in cerebrospinal fluid (CSF) that was obtained from a rat model of chronic neuropathic pain following administration of intrathecal $CGRP_{8-37}$. Methods: Male Sprague-Dawley rats (100-150 g, 5-6 wks) were divided into two groups, sham controls and neuropathic pain models. At the time of operation for neuropathic pain model, an intrathecal catheter was threaded through the intrathecal space. At 1 or 2 wks after the operation (maximum pain state), a test dose of 1, 5, 10, or 50 nM of $CGRP_{8-37}$ was injected into the intrathecal catheter and the CSF was then aspirated. Conventional proteomics to evaluate the CSF were then performed using high resolution 2-D, gel electrophoresis followed by computational image analysis and protein identification by mass spectrometry. Results: Treatment with $CGRP_{8-37}$ effectively alleviated mechanical allodynia in a dose dependent manner. The most effective response was obtained when a dose of 50 nM was administered, but significant differences were obtained following administration of only 5 nM $CGRP_{8-37}$. Furthermore, the results of the proteomic analysis were consistent with the experimental results. Specially we detected 30 differentially expressed spots in 7 images when 2-D gel electrophoresis was conducted. The intensity of 6 of these spots (spot number: 20 and 26-30) was found decrease the $CGRP_{8-37}$ dose increased; therefore, these spots were evaluated by mass spectrometry. This analysis identified 2 different proteins, CGRP (spot numbers: 26-30) and neurotensin-related peptide (spot number: 20). Conclusions: The results of this study suggest that CGRP plays a role in chronic central neuropathic pain and is a major target of chronic neuropathic pain management.

데이터 큐브를 이용한 폐암 2-DE 젤 이미지에서의 예외 탐사 (Discovery-Driven Exploration Method in Lung Cancer 2-DE Gel Images Using the Data Cube)

  • 심정은;이원석
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제15D권5호
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    • pp.681-690
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    • 2008
  • 단백질체학에서 특정 조건 하에서 단백질의 기능 이상 및 구조 변형 유무를 규명하고 질병 과정을 추적하는 것은 중요한 연구이다. 일반적으로 단백질의 발현량 변화 분석에는 통계적 방법이 많이 사용되고 있으며 단백질 상용 이미지 분석 소프트웨어에서 제공하는 그래픽을 이용한 방법들도 있으나, 이 방법들은 많은 조직 내에 존재하는 수많은 단백질을 수동으로 비교해야 하는 어려움이 있다. 본 논문에서는 데이터베이스와 데이터마이닝 기법을 이용하여 OLAP 데이터 큐브와 Discovery-driven 탐색의 응용 방법을 제안한다. 데이터 큐브의 특성을 이용함에 의해서, 질병에 의해 발현량이 변하는 단백질 뿐 아니라 임상적 특성과 단백질의 영향 관계를 분석하는 것이 가능하다. 데이터 큐브에서 단백질의 발현량 변화 분석에 적합한 데이터 큐브의 척도와Discovery-driven 탐색을 위한 예외 지표를 제안하고, 특히 In-exception을 계산하는데 있어서의 계산량 감소 방안을 제시한다. 실험을 통해 폐암 2-DE 데이터에서 데이터 큐브와 Discovery-driven 방법이 유용함을 보인다.

미세입자를 첨가한 케로신 젤 추진제의 멀티 홀 핀틀 인젝터에서의 분무 이미지 (Spray Image of Gelled Kerosene with Nanoparticles at Multi-hole Pintle Injector)

  • 황주현;최명환;구자예
    • 한국추진공학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.73-79
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    • 2021
  • 미세입자 첨가에 따른 젤 추진제의 물성 분석과 분무의 특성을 분석하고자 실험적 연구를 수행하였다. 멀티 홀의 직경을 0.4 mm로 하여 높은 전단 속도를 유도하였고, 점증제 Thixatrol ST 5 wt%와 100 nm의 SUS304를 사용해 케로신 젤 추진제를 제작했다. 축방향의 공급압력을 0.7 MPa로 고정시킨 후 반경방향의 공급압력을 0.7 MPa부터 2.1 MPa까지 조절하여 분무 실험을 진행하였다. 미세입자 첨가로 인해 압력진동과 최대 0.19의 작은 TMR(Total Momentum Ratio), 그리고 분무 각도가 70도 이상으로 급격하게 커지는 현상이 발생하였다.

라멜라-바이오 나노하이브리드: 3 Dimension-liposome을 이용한 카테킨(EGCG)에 안정화에 대한 연구 (Lamellar-bio nano-hybrid; The Study for Stability of Catechin (Green Tea: EGCG) Using 3-Dimensional Liposome)

  • Hong Geun, Ji;Jung Sik, Choi;Hee Suk, Kwon;Sung Rack, Cho;Byoung Kee, Jo
    • 대한화장품학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.201-205
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    • 2004
  • 최근 고기능성 화장품이 출시되면서 기능성 원료가 빛, 열, 산소에 매우 불안정하여 다양한 방법으로 안정성을 높이려고 연구되어 지고 있다. 특히, 카테킨은 주름 개선에 탁월한 원료이지만 빛, 열, 산소에 매우 불안정하다. 본 연구에서는 카테킨을 3Dimension화 하여 안정성 및 피부 침투를 높였다. 1 dimension으로 sol-gel method로 실리카를 다공성으로 만들어서 다공성 부문에 카테킨을 흡착시킨다. 2 dimension으로 다공성 실리카에 흡착디어진 카테킨을 non-phospholipid 베지클을 이용하여 solid lipid nanoparticle(SLN)을 만든다. 마지막으로 3dimension은 SLN되어진 카테킨을 skin lipid matrix를 이용하여 lameller phase self organization시킨다. 3 Dimension-카테킨은 일반적인 리포좀에 비해 빛과 열에 대한 color 안정성을 chromameter로 측정한 결과 5-10배 더 안정하였으며, HPLC 분석 결과 카테킨의 생존율이 3-5배 더 개선되었다. 또한 penetration effect를 측정한 결과 일반 리포좀보다 더 깊게 침투되었다. Wrinkle reduction effect를 한달 후에 측정한 결과 일반 리포좀보다 주름이 현저하게 감소되었다. 이러한 여러 가지 실험을 위해서 Laser light scattering system, cryo-SEM, chroma meter, HPLC, image analyzer, microfludizer 등을 사용하였다.

자기 공명영상 시스템의 수소원자 공명 주파수법을 이용한 생체 내 열 전달 관찰 (In-Vivo Heat Transfer Measurement using Proton Resonance Frequency Method of Magnetic Resonance Imaging)

  • 조지연;조종운;이현용;신운재;은충기;문치웅
    • 전자공학회논문지SC
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    • 제40권3호
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    • pp.172-180
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    • 2003
  • 본 연구에서는 자기공명영상(MRI)에서 수소 원자핵의 공명주파수(PRF) 방법을 기반으로 인체 종아리 근육 외부의 열원에 의해 근육 내부로 열원이 전달되는 과정을 비침습적으로 관찰하는 방법을 제시한다. 열전달과정을 온도 변화로 측정하였는데 온도 영상의 안정성 및 보정 실험은 phantom을 이용하였고 온도의 변화는 phantom과 인체 모두에서 측정하였다. Phantom 실험은 agarose gel을 중탕하여 약 50℃까지 가열시킨 후 1시간의 냉각과정 동안 매 3분마다 데이터를 획득하였다. 인체 실험에서는 지원자의 종아리(the calf)에 hot pack을 이용하여 열을 전달하였다. Hot pack을 발열시키기 전에 기준 데이터를 1번 획득하고, 발열시킨 후부터 매 2분마다 30분 동안 데이터를 획득하였다. 획득된 영상 데이터는 위상차 영상으로 재구성된 다음 각 ROI에서의 평균 위상차를 관측하였다. 온도를 34.2∼50.2℃의 범위에서 변화시켰을 때 phantom의 위상차는 온도 변화에 대해 선형적으로 변하였다. 이 범위에서 측정된 온도의 해상도는 0.0457 radian/℃(0.0038 ppm/℃)였다. 인체 실험에서는 각 영상에서 hot pack과 가까운 위치의 평균 위상차가 hot pack과 먼 위치의 평균 위상차보다 작은 값을 나타냈다 이를 통해 같은 영상 단면에서도 열원(heat source)과의 거리에 따라서 온도 변화가 다르게 나타나는 것을 관찰할 수 있었다. 본 연구를 통해 PRF방법을 이용하여 MRI에서도 비침습적으로 인체 내부의 열전달과정을 관측하였고 이로서 온열치료 시 MRI가 임상적 이용 가능성이 있음을 확인하였다.

DMH에 의한 비정상적인 혈관 내피세포의 증식에서 Protein Kinase C 동종효소 Alpha 단백발현의 특성 (Characterization of the Expression of PKCα(Isoform) in DMH-induced Vascular Endothelial Proliferation)

  • 남수봉;배용찬;박숙영;최수종
    • Archives of Plastic Surgery
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    • 제34권6호
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    • pp.679-684
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    • 2007
  • Purpose: DMH(1,2-dimethylhydrazine) has been known to induce vascular neoplasm such as malignant endothelioma in animal experiment, through induction of abnormal proliferation of HUVECs. In our previous studies, 11 types of PKC isoenzymes were determined by RT-PCR and the expression of $PKC{\alpha}$, and ${\mu}$ was more prominent than other PKC isoenzymes in the DMH-treated group. However, this result was not based on objective assessment. In this study, we further evaluated the role of $PKC{\alpha}$ on the DMH-induced abnormal proliferation of HUVECs by two different methods to identify its presence with high relevance in objective view. $PKC{\mu}$ will be investigated in further study. Methods: The study was conducted with the cultured HUVECs group(control) and the $0.75{\times}10^{-9}M$ DMH-treated group. After processing protein extraction in 0 and 24 hour, extracted protein was treated of quantitative test through BCA protein assay. In the western blot analysis, electrophoresis was performed in the order of gel preparation, sample preparation, and gel running. Electrotransfer to nitrocellulose membrane and reaction with antibody were done. Detection of $PKC{\alpha}$ was achieved through "Gel Image Analysis System". In the fluorescence immunocytochemical analysis, the grading of radiance of the intracellular $PKC{\alpha}$ particles was detected with confocal microscope after treating with primary and fluorescent secondary antibody in 0 and 24 hours. Results: The Western blot analysis showed increased $PKC{\alpha}$ expression from the specimen obtained in 24 hour of the DMH treatment group when compared to those in control group. Under confocal fluorescence microscope, the emitting radiance in the DMH treated group was brighter at 24 hours as well. Conclusion: We believe that $PKC{\alpha}$ plays a role in DMH-induced abnormal proliferation of the vascular endothelium, which may provide insights in understanding the vascular neoplasm.

치간 삭제 후 불소 또는 수산화인회석 도포 시 재광화 및 탈회억제에 관한 연구 (Effect of remineralization and inhibition to demineralization after fluoride gel or hydroxyapatite paste application on stripped enamel)

  • 홍현실;김호영;성지영;조진형;김상철
    • 대한치과교정학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.212-226
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    • 2010
  • 치간 삭제 후 재광화 및 치아우식 예방법을 찾기 위한 노력의 일환으로 1.23% 인산화불소 젤 또는 5%, 10% 수산화인회석함유 페이스트를 치간 삭제된 법랑질 표면에 도포하였고, 그 후 젖산탈회용액으로 처리하였다. 법랑질 표면의 재광화 및 탈회 후 결정구조 변화를 주사전자현미경으로 관찰하고 칼슘, 인, 불소 함량 등의 변화를 energy dispersive X-ray spectroscopy로 분석해서 비교하였다. 치간 삭제 후 5%, 10% 수산화인회석함유 페이스트를 도포한 군에서 칼슘과 인 함량이 증가하였고, 1.23% 인산화불소 젤 도포 군에서는 불소 함량이 증가하였다. 또한 모든 재광화 제제에서 법랑질 표면이 매끄럽고 부드러워졌으며 결정구조가 작고 치밀해짐을 관찰할 수 있었다. 10% 수산화인회석함유 페이스트로 재광화한 군은 탈회 후에도 칼슘과 인 함량이 증가된 채로 유지되었고, 5% 수산화인회석함유 페이스트로 재광화한 군은 탈회 후 인 함량이 증가된 채로 유지되었다. 치간 삭제 후 탈회 처리 시 대조군의 법랑질은 파괴양상이 심해 거친 굴곡으로 이루어진 불규칙한 표면 상태를 나타내었으나 불소 및 수산화인회석으로 재광화한 군에서는 법랑질의 파괴양상이 적어 작은 결정입자들과 미세공극이 유지되었다.