• 제목/요약/키워드: Gamma-coding

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Isolation and Characterization of a New ${\gamma}$-Polyglutamic Acid Producer, Bacillus mesentericus MJM1, from Korean Domestic Chungkukjang Bean Paste

  • ZHAO , XIN-QING;PARK, KWAN-HYONG;JIN, YING-YU;LEE, IN HYUNG;YANG, YOUNG-YELL;JOO-WON SUH,
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권1호
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    • pp.59-65
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    • 2005
  • Poly-${\gamma}$-glutamic acid (PGA) is an unusual anionic polypeptide and has great potential as an environmentally and industrially significant biodegradable material. A new ${\gamma}$-PGA producer, Bacillus mesentericus MJM1, with high production capacity was isolated from Korean domestic Chungkuckjang bean paste. It produced ${\gamma}$-PGA at the level of 10 g/l in suitable media. The viscosities of 5% initially extracted mucin and purified ${\gamma}$-PGA solutions were 660 cps and 600 cps, respectively. The produced ${\gamma}$-PGA polymer consisted of 2,000 glutamic acid residues with even proportion of L and D types with molecular mass of about 200- 300 kDa. Bacillus mesentericus MJM1 displayed ${\gamma}$-glutamyltranspeptidase (${\gamma}$-GTP) activity that is known to play a key role in ${\gamma}$-PGA biosynthesis. The ${\gamma}$-GTP coding region was located on the plasmid of 5.8 kb. The plasmid, named pMMH1, is a rolling-circle replication (RCR) plasmid and additionally contained a replication origin and type I signal peptidase (sipP) coding region.

Analytical Approximation Algorithm for the Inverse of the Power of the Incomplete Gamma Function Based on Extreme Value Theory

  • Wu, Shanshan;Hu, Guobing;Yang, Li;Gu, Bin
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제15권12호
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    • pp.4567-4583
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    • 2021
  • This study proposes an analytical approximation algorithm based on extreme value theory (EVT) for the inverse of the power of the incomplete Gamma function. First, the Gumbel function is used to approximate the power of the incomplete Gamma function, and the corresponding inverse problem is transformed into the inversion of an exponential function. Then, using the tail equivalence theorem, the normalized coefficient of the general Weibull distribution function is employed to replace the normalized coefficient of the random variable following a Gamma distribution, and the approximate closed form solution is obtained. The effects of equation parameters on the algorithm performance are evaluated through simulation analysis under various conditions, and the performance of this algorithm is compared to those of the Newton iterative algorithm and other existing approximate analytical algorithms. The proposed algorithm exhibits good approximation performance under appropriate parameter settings. Finally, the performance of this method is evaluated by calculating the thresholds of space-time block coding and space-frequency block coding pattern recognition in multiple-input and multiple-output orthogonal frequency division multiplexing. The analytical approximation method can be applied to other related situations involving the maximum statistics of independent and identically distributed random variables following Gamma distributions.

수정된 감마 코딩 기반 의료 검진 데이터 압축 (Compression of Medical Examination Data Based on Modified Gamma-Coding)

  • 구동윤;박재욱;이용규
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제19권2호
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    • pp.133-142
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    • 2014
  • 의료 정보 시스템의 발달로 인해 환자들의 진료 시간이 짧아지고 그에 따라 진료 받는 환자들의 수가 증가하여 진료 데이터 양이 급속도로 증가하고 있으며, 증가하는 환자들의 데이터를 효율적으로 저장, 관리하기 위해 다양한 압축 방법에 대한 연구가 진행 중이다. 그러나 기존 방법들은 측정값을 원시 데이터로 압축하여 저장하기 때문에 압축률이 떨어지는 단점이 있다. 이러한 문제를 해결하기 위해 본 논문에서는 비트 단위로 압축 가능한 감마 코딩 기법을 이용하여 측정값과 정상범위 값과의 편차를 부호화하여 압축하는 방법을 제안한다. 또한 측정값과 편차가 가장 작은 과거 데이터를 기준치로 삼아 그 편차를 부호화하여 압축하는 방법을 제안한다. 제안하는 방법은 매우 간단하며 편차를 압축하기 때문에 기존 방법보다 압축률이 높은 장점이 있다. 성능평가를 통하여 제안한 방법이 기존 압축방법보다 우수하다는 것을 검증한다.

결핵환자에서 IFN-${\gamma}$ 수용체의 기능적 및 유전적 이상에 관한 연구 (The Functional and Genetic Defects of IFN-${\gamma}$ Receptor in the Patients with Tuberculosis)

  • 박계영;황유진;임영희;안창혁;박정웅;정성환
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제52권5호
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    • pp.497-505
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    • 2002
  • 연구배경 : 결핵의 방어면역에서 IFN-${\gamma}$는 매우 중요한 역할을 한다. IFN-${\gamma}$ 수용체의 완전결손이 있는 환자는 Mycobacterium 감염에 감수성이 높아서 매우 치명 적이다. 매우 드문 일부 Mycobacterium 감염에서 IFN-${\gamma}$ 수용체의 완전결손 외에 여러 종류의 부분결손들과 STAT1의 돌연변이들이 알려져 있다. 특히, IFN-${\gamma}$ 수용체의 부분결손이 있는 환자들의 경우 병리학적 소견파 임상적 경과가 일반적 결핵과 유사한 소견을 보이는 것으로 알려져 있다. 방 법 : 임상적 결핵환자에서 IFN-${\gamma}$ 수용체의 기능을 평가하여 대조군과 비교하였다. IFN-${\gamma}$ 수용체의 이상이 있을 가능성이 가장 높은 파종성 결핵환자의 DNA에서 앞서 발표된 증례들에서 확인된 IFN-${\gamma}$ 수용제와 STAT1의 유전적 이상을 확인하였다. 결 과 : 말초혈액 단핵구를 recombinant IFN-${\gamma}$ (100, 1000IU/ml)로 자극하였을 때 대조군과 환자군에 모두 HLA-DR과 CD64의 발현이 증가하였으나, 두 군간의 차이는 없었다. 대조군과 환자군에서 모두 LPS자극하였을 때 TNF-${\alpha}$의 생산이 증가하였으며 IFN-${\gamma}$로 전처치 후에 다시 LPS로 자극하였을 때 TNF-${\alpha}$의 생산은 더욱 더 증가하였다. 그러나, 두 군간의 통계적으로 유의한 차이는 없었다. 파종성 결핵 환자에서 기존에 알려진 IFNgR1과 STAT1의 돌연 변이를 확인하였을 때 특이한 이상소견을 발견할 수 없었다. 결 론 : 임상적 결핵에서 IFN-${\gamma}$ 수용체의 기능적 및 유전적 이상을 확인할 수 없었다. 기존의 연구에서 BCG와 NTM 감염과 관련 있는 것으로 알려진 IFN-${\gamma}$수용체의 이상 만으로는 임상적 결핵의 개체감수성을 설명할 수 없었다.

원근문제와 나카가미 페이딩을 고려한 하이브리드 DS/FH-CDMA 방식의 성능 분석 (Performance Analysis of Hybrid DS/FH-CDMA over Nakagami Fading Channels with Near-Far Problem)

  • 임태길;강희조
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제10권7호
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    • pp.1118-1130
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    • 1999
  • 본 논문에서는 무선 채널 환경에서 원큰문제와 다중경로 페이딩에 의한 부호분할 다원접속(DS/FH CDMA) 시스템의 성능을 분석하였다. 고려되는 부호분할 다원접속 시스댐은 시스템의 성능을 향상시키기 위하여 최대비 합성 다이버시티 수신법과 BCH(Bose-Chau dhuri-Hocquenghem) 부호화 기법을 사용하였다. 유도한 오율식을 이용하여 부호분할 다원접속 시스댐의 성능을 구하여, PN 코드 길이(N). 호핑수(q) 다중 사용자의 수(J(). 다이 버시티 가지의 수(M). 부호화 율($\gamma$) 그리고 비트에너지 대 잡음전력비($E_b/N_o$)등을 함수로 하여 그래프로 나타내 고 분석하였다. 분석결과에 의하면 원근문제와 다중경로 페이딩의 영향을 억압하기 위해서는 DS 방식보다도 DS/FH 방식이 효율적임을 알 수 있었다. 그리고, MRC 다이버시티 기법이나 BCH 부호화 기법을 채용함으로써 큰 폭의 성능 개선을 얻을 수 있었다. 결과적으로 제안된 시스템의 구조는 원근문제와 페이딩이 존재하는 채덜에 서 음성 통신시스템으로서 적절하다고 예상된다.

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들깨 ${\gamma}-tocopherol$ methyltransferase cDNA 유전자의 분리 및 특성 (Molecular Cloning and Characterization of ${\gamma}-tocopherol$ Methyltransferase cDNA from Perilla frutescens)

  • 황선갑;김동헌;이재열;김용환;황영수;김경환
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제45권4호
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    • pp.203-206
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    • 2002
  • ${\gamma}-Tocopherol$ methyltransferase(TMT)는 토코페롤 생합성 대사의 마지막 단계인 감마 토코페롤을 알파 토코페롤로 변환하는데 관여하는 효소이다. 들깨의 미성숙 종자 cDNA유전자 은행에서 TMT로 추정되는 유전자를 분리하였으며 이 유전자는 1369개의 염기와 367개의 아미노산으로 구성되었으며 분자량은 약 42kDa의 추정된다. 이 cDNA는 Genbank와 상동성 분석결과 애기장대의 TMT유전자와 아미노산 수준에서 60% 정도의 상동성을 가지고 있으며 methyltransferase domain과 S-adenosyl methionine binding domain을 가지고 있으므로 TMT 유전자로 추정했다. 이 유전자의 특성을 알기 위하여 완전한 크기를 가지는 TMT유전자를 대장균에서 발현하고 invitro에서 효소의 활성을 측정하였다.

Effect of Korean Mistletoe Lectin on Gene Expression Profile in Human T Lymphocytes: A Microarray Study

  • Lyu, Su-Yun;Park, Won-Bong
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제18권4호
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    • pp.411-419
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    • 2010
  • Korean mistletoe has a variety of biological effects, such as immunoadjuvant activities. This study investigates the effects of Korean mistletoe lectin (Viscum album L. var. coloratum agglutinin, VCA) on human T lymphocytes to determine whether VCA acts as an immunomodulator. Purified human T-lymphocytes were cultured with VCA and RNA from each point was analyzed using Affymetrix human genome chips containing 22,500 probe sets which represents more than 18,000 transcripts derived from 14,500 human genes. As a result, there was a striking upregulation of genes coding for chemokines. Seventeen genes out of 50 coding for proteins with chemokine activity were upregulated including CXCL9 and IL-8 which are related to the treatment of cancer. In addition, 28 cytokine genes were upregulated including IL-1, IL-6, IL-8, IFN-$\gamma$, and TNF-$\alpha$. Taken together, the data suggest that Korean mistletoe lectin, in parallel with European mistletoe, has an ability to modulate human T cell function.

DPCM 음성 부호화기의 부정합현상에 관한 연구 (On the Mismatch Phenomena in DPCM Coding of Speech)

  • 유득수;조동호;은종관
    • 대한전자공학회논문지
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    • 제23권5호
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    • pp.597-604
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    • 1986
  • This paper describes various mismatch phenomena in differential pulse code modulation (DPCM) coding, such as the mismatch effects of probability density functin(pdf), signal variance, and correlation. At a high transmission rate(i.e., above 32 kbits/s), the performance of DPCM can be improved by matching the pdf shape between the input signal and the quantizer. However, the same gain cannot be obtained at a lower transmission rate. Also, it is shown that the gamma quantizer is realtively robust to the variation of pdf shaper and signal variance. Moreover, as the transmission rate increases, the performance of DPCM for the input signal with large variance is worse than that of DPCM for the signal with small variance due to the increase of overload noise. According to our simuladiton results, the mismatch effects of pdf shape and variance appear to yield more degradatin than that of correlation in a DPCM system.

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임의 접근을 지원하는 간단한 정수 배열 코드 시스템 (A Simple Integer Sequence Code System Supporting Random Access)

  • 이준희;스리니바사 라오 사티
    • 정보과학회 컴퓨팅의 실제 논문지
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    • 제23권10호
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    • pp.594-598
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    • 2017
  • 정수 형태의 배열로 이루어진 데이터가 주식 시장과 같은 원본으로부터 셀 수 없을 정도로 매일 생성되고 있다. 정수 배열을 저장하는 데에 감마 코드, 델타 코드, 피보나치 코드 등을 포함한 범용 코드가 일반적으로 사용된다. 이 배열을 적은 공간을 차지하게 하면서 빠른 시간에 특정 원소에 접근하는 연산을 수행할 수 있게 하려는 시도가 진행되었다. 본 논문에서는 간결한 자료구조의 특성을 활용하여 부호화된 정수 배열에서의 임의 접근을 가능하도록 한 코드 시스템을 제시한다. 이는 코드 시스템에 사용되는 구획 문자 비트열을 압축하면서 질의 수행 시간을 상수 시간에 지원하는 자료구조를 통해 구현되었다. 실험 결과를 통해 범용 코드 시스템보다 더 적은 공간과 시간을 사용해 정수 배열을 표현할 수 있다는 것을 보인다.

스프레이형 국화와 화색변이체로부터 Leucoanthocyanidin dioxygenase (LDOX) 유전자의 분리 (Isolation of a Leucoanthocyanidin Dioxygenase (LDOX) Gene from a Spray-type Chrysanthemum (Dendranthema × grandiflorum) and Its Colored Mutants)

  • 정성진;이긍주;이혜정;김진백;김동섭;강시용
    • 원예과학기술지
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    • 제28권5호
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    • pp.818-827
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    • 2010
  • 스프레이 국화 'Argus'의 꽃잎으로부터 $DgLDOX$의 전장 cDNA와 genomic DNA를 분리하였고, 감마선 변이원으로부터 유래된 3가지 화색변이체 사이의 다양한 유전자 특성들을 밝혀냈다. cDNA 영역은 1068bp이고 356 amino acid로 변환되었다. Genomic DNA의 크기는 'Argus'에서 1346bp이었고, 3가지 화색 변이체에서는 1363부터 1374의 크기를 나타내었다. $DgLDOX$ 유전자는 두 개의 엑손 사이에 하나의 인트론을 갖고 있는 구조이고, 그 크기는 'Argus'에서 112bp 이지만 3가지 화색 변이체에서는 128 혹은 137bp였다. 이것은 감마선 조사에 의해 인트론 부분에 유전자가 삽입됐다는 것을 나타낸다. DNA 분석 결과 국화의 게놈 내에서는 하나의 $LDOX$ 유전자를 갖는 것이 확인되었다. $DgLDOX$ 유전자의 발현 정도를 분석한 결과, 연분홍의 'Argus'와 두 개의 보라색 변이체(AM1 and AM3) 에서 높게 발현되었으나 흰색 변이체(AM2)에서는 매우 약하게 발현되었다. 이러한 결과들은 $DgLDOX$ 유전자의 인트론에 삽입된 유전자 조각 혹은 엑손 부위의 일부 아미노산의 변화에 의해서 변이체의 화색이 변할 수 있다는 것을 보여주고 있다.