• 식물병연구
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• 제24권2호
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• pp.162-169
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• 2018

The GacS/GacA system in the root colonizer Pseudomonas chlororaphis O6 is a key regulatory system of many traits relevant to the plant probiotic nature of this bacterium. The work in this paper elucidates proteins using proteomics approach in P. chlororaphis O6 under the control of the cytoplasmic regulatory protein, GacA. A gacA mutant of P. chlororaphis O6 showed loss in production of phenazines, acyl homoserine lactones, hydrogen cyanide, and protease, changes that were associated with reduced in vitro antifungal activity against plant fungal pathogens. Production of iron-chelating siderophore was significantly enhanced in the gacA mutant, also paralleling changes in a gacS mutant. However, proteomic analysis revealed proteins (13 downregulated and 7 upregulated proteins in the mutant compared to parental strain) under GacA control that were not apparent by a proteomic study of a gacS mutant. The putative identity of the downregulated proteins suggested that a gacA mutant would have altered transport potentials. Notable would be a predicted loss of type-VI secretion and PEP-dependent transport. Study of mutants of these GacA-regulated proteins will indicate further the features required for probiotic potential in this rhizobacterium.

• 생명과학회지
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• 제25권2호
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• pp.136-150
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• 2015

Pseudomonas syringae pv. tabaci 11528은 담배를 숙주로 하여 wildfire disease를 일으키는 식물 병원성 세균이다. P. syringae pv. tabaci psyR deletion mutant를 이용하여 swarming motility, tabtoxin 생산능, siderophore 생산능, AHL 생산능 등의 phenotypic test를 수행하였다. psyR deletion mutant는 wild-type 균주보다 swarming motility가 증가하였고, tabtoxin 생산 또한 증가하였다. 하지만 siderophore와 AHL 생산능은 감소하였고 virulence 또한 지연되었다. 이러한 결과로 PsyR이 QS regulator로 작용한다는 사실과 더불어 병원성 유전자의 조절에도 관여한다는 것을 확인하였다. PsyR이 각각의 병원성 유전자의 발현을 조절하는 regulator들에게 미치는 영향을 전사단계에서 확인하기 위해 fur, gacA, psyI, prhI, prhA, hrpR, hrpA 유전자들을 정량적 real-time PCR (qRT-PCR) 방법으로 확인하였다. 또한 PsyR에 의한 병원성 유전자 조절이 DNA상에 직접적으로 결합하여 일어나는 것인지 아니면 다른 경로를 통해 간접적으로 일어나는 것인지를 확인할 필요가 있어 정제한 PsyR 단백질과 병원성 관련 유전자들의 upstream region 서열을 이용하여 electrophoretic mobility shift assay (EMSA)를 수행한 결과 본 연구에서 선정한 병원성 관련 유전자들이 PsyR에 의해 직접적으로 조절되지는 않는다는 사실을 밝혔다.