• 제목/요약/키워드: GII

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서울지역 급성위장관염 환자에서 검출된 노로바이러스의 유전자형 분포 (Genetic Distribution of Human Noroviruses Detected from Acute Gastroenteritis Patients in Seoul)

  • 김은정;박상훈;송미옥;김무상;김민영;천두성;정혜숙;김철중
    • 미생물학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.135-139
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    • 2008
  • 2004년부터 207년까지 서울지역에서 산발적으로 발생한 급성위장관염 환자에 대하여 RT-PCR을 이용하여 노로바이러스를 검출하였다. 검출된 노로바이러스 258건에 대하여 염기서열분석을 실시한 결과 GII.1, GII.2, GII.3, GII.4, GII.5, GII.6, GII.8, GII.10, GII.12, GII.13, GII.15, GII.16, GII.17 등 13가지 유전자형이 검출되었으며 산발적으로 발생한 급성위장관염 환자에서 가장 많이 검출된 유전자형은 GII.4(76.7%)로 나타났다. 노로바이러스 유전자형의 다양성에 대한 연구로 서울지역 노로바이러스성 질환의 예방을 위한 기초자료로 활용될 것으로 기대된다.

Prevalence of GII.4 Sydney 2012 and Recombinant GII.3P[12] Noroviruses Associated with Acute Gastroenteritis in Hospitalized Children in Thailand, 2015-2017

  • Manowong, Areerat;Chanta, Chulapong;Chan-it, Wisoot
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제50권1호
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    • pp.126-134
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    • 2022
  • Norovirus (NoV) is an important pathogen causing acute gastroenteritis worldwide. The purpose of the present study was the molecular characterization of NoV. A total of 408 stool specimens collected from hospitalized children associated with acute gastroenteritis in Chiang Rai, Thailand, 2015-2017 were investigated for the presence of NoVs by RT-PCR. NoV GII was detected in 32 samples (7.8%). Five distinct genotypes were identified, including GII.4 (13/32, 40.6%), GII.3 (11/32, 34.3%), GII.17 (4/32, 12.5%), GII.2 (2/32, 6.3%), and GII.14 (2/32, 6.3%). NoV infection occurred mostly in young children under 3 years of age (31/32, 96.9%) and showed the main peak in summer months from March to April (18/32, 56.3%). Phylogenetic analysis revealed that all 13 GII.4 strains clustered with GII.4 Sydney 2012 variant. Representative GII.3 strains were analyzed as a recombinant GII.3P[12] strain. Several amino acid differences were found in the antigenic epitopes and antibody binding sites of the VP1 capsid of the GII.3P[12]. Homology modeling of the P domain of the GII.3P[12] strain demonstrated that 10/13 amino acid differences were predicted to be located on the surface-exposed area of the capsid structure. These amino acid changes might affect the infectivity and the antigenicity of the recombinant GII.3P[12]. The prevalence of GII.4 Sydney 2012 and recombinant GII.3P[12] strains indicates the genetic diversity of circulating NoVs in Thailand, emphazing the importance of continuous surveillance to mornitor newly emerging NoV strains in the future.

부산지역 집단 식중독 발생에서 검출된 노로바이러스의 유행양상 (Prevalence of Noroviruses Detected from Outbreaks of Acute Gastroenteritis in Busan, Korea)

  • 구희수;구평태;이미옥;백형석
    • 생명과학회지
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    • 제26권8호
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    • pp.911-920
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    • 2016
  • 최근 4년 동안 부산지역에서 2인 이상 발생된 식중독 사례를 대상으로 급성 위장관염 증상을 보인 환자 472건와 조리종사자 109건을 대상으로 유전자 분석을 한 결과 총 581건 중 71건(12.2%)에서 노로바이러스를 확인하였다. 연도별 검출현황은 2012년 18.3%(30/164건), 2013년 5.6%(6/107건), 2014년 8.0%(6/75건), 2015년 12.3%(29/235)으로 2012년과 2015년이 Norovirus 식중독에 의한 유병률이 가장 높았다. 월별 발생양상은 2월에 20건(28.2%)으로 가장 많이 발생했으며, 11월 18건(25.4%), 12월 12건(16.9%) 순이었고, 5월~8월에는 노로바이러스 환자 발생이 없어, 비교적 추운 계절에 높은 검출율을 보이는 계절적인 특징을 나타내었다. 연령별 분포는 11세~20세의 검체가 269건으로 10대의 초, 중, 고등학생의 검체가 전체의 46.3%를 차지하였다. ANOVA Scheffe 검정 결과를 통해, Norovirus의 예방 및 확산 방지를 위해 10대를 위한 위생 교육 및 식중독 예방교육을 더욱 철저히 실시해야 할 시사점을 얻었다. Norovirus genotype 분석 결과, GI genogroup은 GI-1형, GI-2형, GI-3형, GI-5형, GII genogroup은 GII-1형, GII-4형, GII-5형, GII-6형, GII-17형으로 다양한 genotype이 분포되었다. 연도별 유행하는 유전형은 2012년 GII-6형(17건), 2013년 GII-6형(3건), 2014년 GII-4형(5건), 2015년 GII-6형(18건)이 가장 우세했다. 그러나 최근 국내 뿐 아니라 전 세계적으로 GII-4형이 매우 유행하고 있으나, 부산지역은 2014년을 제외하고는 GII-6형이 우세한 genotype이라는 매우 특징적 결과를 얻었다.

Global Information Infrastructure 구축을 위한 ITU-T Joint Rapporteur Group 회의 및 ISO/IEC/ITU International GII 세미나 참관기

  • 최준균
    • TTA 저널
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    • 통권43호
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    • pp.129-149
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    • 1996
  • 본 고에서는 Global Information Infrastructure (GII) 구축을 위하여 국제 표준화기구인 ITU, ISO, IEC 간에 최근 활동현황에 대하여 소개한다. 이를 위해 지난 1996년 1월 17-19일간에 열린 Global Information Infrastructure (GII)를 위하여 ITU-T 내에 Joint Rapporteur Group(JRG)회의 결과와 1월 24-26일간에 열린 ISO/IEC/ITU International GII 세미나에서 논의된 주요 결과를 정리한다. 먼저 ITU-T JRG 회의는 차기 연구회기(1997년-2000년)동안에 GII 표준화 절차와 기술적인 이슈를 ITU-T SG13을 중심으로 모든 ITU-T 스터디 그룹이 나누어서 진행해야될 업무를 정리하는 것이며 이는 1996년 10월에 개최될 WTSC에 제출할 예정이다. 다음으로 ISO/IEC/ITU International GII 세미나는 GII와 관련된 ITU, ISO, IEC 소속의 약 100여개의 표준화 그룹이 모여서 국제적으로 효과적인 작업을 하기 위한 방안을 모색하기 위하여 개최된 세미나이다. 여기는 통신망 관련하여 ITU, 상위 데이터 서비스와 관련된 ISO, 그리고 가전기기 및 단말장치와 관련된 IEC가 공통의 정보 하부구조의 건설을 위하여 더 이상 각기 표준화를 진행해서는 안 된다는 인식을 바탕으로 한 것이다.

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Detection and phylogenetic analysis of norovirus from individual septic tanks in the drainage basin of the coastal area located in the Jaran Bay of Korea

  • Ham, In Tae;Kim, Byeo Ri;Park, Yu Jeong;Jung, Yeun Joong;Park, Kunbawui;Kwon, Ji Young;Mok, Jong Soo;Yu, Hongsik
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제24권1호
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    • pp.10-18
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    • 2021
  • Norovirus (NoV) prevalence was investigated in 100 sewage samples collected from 35 individual septic tanks around the drainage basin of Jaran Bay, Korea in January, May, and July of 2017. Genotypes and diversity of NoV strains detected in sewage samples were also assessed using the conventional RT-PCR and phylogenetic analysis. NoV GI or GII were detected in 22 (22.0%) and 24 (24.0%) samples, respectively. Thirteen genotypes were identified with three dominant genotypes (GI.9, GII.5 and GII.17) and GII.17 showed relatively higher prevalence during the survey period. GII.17 strains were clustered into recombinant type variant or NoV GII.17 Kawasaki variant. NoV GII.17 strains were considered emergent epidemic variants with widespread circulation. NoV surveillance strategy should include both environmental (sewage) and clinical data to reveal minor NoV genotypes likely cause of asymptomatic or underreported infections in the local population.

집단식중독 환자에서 검출된 노로바이러스 및 아스트로바이러스의 분자역학적 연구 (Epidemiological Study of Outbreak of Gastroenteritis Associated with Norovirus and Astrovirus in Busan, Korea)

  • 구희수;조현철;백형석
    • 생명과학회지
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    • 제26권9호
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    • pp.999-1006
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    • 2016
  • 2016년 3월, 부산 D대학 인근 음식점에서 모임을 한 후, 설사, 구토를 호소하는 환자들이 발생하였다. 역학조사팀은 설사 환자 및 해당 음식점 조리종사자에 대한 분변 검체를 수집하였고 해당 음식점 주방에서 식품용수에 대한 채수도 진행하였다. 인체 검체 42건에서 노로바이러스 16건, 아스트로바이러스 8건이 검출되었으며, 노로바이러스의 경우는 GI, GII genogoup 모두 검출되었으며, GI.3, GI.4, GII.4, GII.13, GII.17, GII.21로 6가지 다양한 유전자형의 분포를 확인하였다. 아스트로바이러스의 경우 Type 5과 Type 2의 유전자형 분포양상을 확인하였다. 또한 노로바이러스와 아스트로바이러스가 복합 감염된 3 케이스도 포함되어 있었다. 노로바이러스는 전세계적으로 GII.4형이 유행하고 있고, 최근에는 GII.17형이 출현하고 급증하는 동향에 따라 본 연구에서도 GII.17형이 가장 우세하였으며, 아스트로바이러스 경우는 국내에서 우세한 유전자형인 Type 1인 것과는 차이가 있는 사례였다. 특히, 부산지역에서 아스트로바이러스가 식중독 발생의 원인이 된 경우는 이번이 첫 사례여서 본 연구를 통하여 부산지역의 식중독 발생에 새로운 발생 양상을 파악하는 매우 특징적 결과를 얻었다.

글로벌 정보기반구조(GII) 구축을 위한 표준화 기관의 활동 및 우리의 대응방안 (A Recent Trends of PSOs and Our Future Plan for the GII Standardization)

  • 김형준;이영희
    • 전자통신동향분석
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    • 제11권2호통권40호
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    • pp.99-118
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    • 1996
  • 전세계는 소위 21세기 정보사회 진입을 향한 각종의 정보 기반구조 건설을 추진중에 있으며 국제표준화 기구를 비롯한 지역별, 국가별 표준화 기관들은 상호 연동환경 보장 및 적기 표준 공급을 위한 GII(Global Information Infrastructure) 표준화 추진계획을 발표하고 있다. 본 고에서는 ITU-T를 비롯한 ETSI(European Telecommunication Standards Institute), T1 Committee, TTC(Telecommunication Technology Council), GSC(Global Standards Collaboration) 등의 GII 표준화 활동현황을 기술하고, 초고속 정보통신 기반구축을 위한 표준화의 중요성 및 우리의 대응방안을 살펴보고자 한다.

부산, 울산 및 경상남도 지역의 지하수 중 norovirus 오염실태 조사 (Groundwater Contamination of Noroviruses in Busan, Ulsan, and Gyeongsangnam-do, Korea)

  • 박병주;오혜리;강호영;장경립
    • 생명과학회지
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    • 제21권6호
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    • pp.819-828
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    • 2011
  • 본 연구에서는 2009년부터 2010년까지 부산, 경남 및 울산 지역의 145 개 지하수 시료들을 대상으로 norovirus의 오염실태를 조사하였다. 먼저 norovirus의 검출을 위한 두 세트의 primer를 제작하였으며 이를 이용하여 최적 nested reverse transcription (RT)-PCR 조건을 확립하였다. 지하수의 norovirus 오염실태 조사에 의하면, 건기(4월~6월)와 우기(7월~8월)에 각각 21개(25.9%)와 15개(23.4%)의 시료에서 norovirus가 검출되었다. 부산, 울산 및 경상남도의 시료에서 각각 15%, 7% 및 32%의 norovirus가 검출되어 지역적인 차이를 나타내었다. norovirus 양성시료에서 GI과 GII가 각각 5개와 31개가 검출되어GI에 비하여 GII가 우세함을 알 수 있었다. norovirus 분리주들의 계통분류학적 분석 결과에 의하면, GI 분리주들은 모두 GI.5 유전자형으로 분류되었으며, GII 분리주들은 GII.3과 GII.4로 양분되었다. norovirus의 검출은 pH, 온도, 산화-환원전위 및 용존산소 등의 이화학적 인자들과 일반세균, 총대장균군 및 대장균과 같은 미생물 수질지표들과 통계적인 유의성이 있는 상관관계를 나타내지 않았다. 반면에 norovirus의 검출과 저탁도(<0.50 NTU) 사이에는 밀접한 상관성이 있음이 밝혀졌다. 본 연구를 통하여 지하수 중 norovirus의 분포실태를 어느 정도 파악할 수 있었으며 수인성 질병의 예방과 국민 보건위생을 위해서는 지하수의 주기적인 norovirus 모니터링이 필요함을 제시하였다.

Aspergillus sp.가 생산하는 Glucoamylase Isozymes의 성질 (Properties of Glucoamylase Isozymes Produced by Aspergillus sp.)

  • Park, Inshik;Youngho Chung
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.320-326
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    • 1988
  • Aspergillus sp.로부터 추출한 glucoamylase를 Sephacryl S-200과 DEAE-Sephacel 이온교환 칼럼을 통과시킨 후, 2개의 Isozyme으로 분리하였다. 분리된 glucoamylase isozyme(GI, GII)의 효소학적특성을 각각 조사하였다. GI 및 GII isozyme의 활성최적 pH 및 온도는 pH4.5 및 $65^{\circ}C$였다. 분리된 효소는 pH 3-7 사이에서 안정했으며, 또한 55$^{\circ}C$ 이하에서 안정하였다. Hg$^{++}$는 효소 황성을 완전히 저해하였으나, 글리세롤은 효소의 안정성을 크게 증가시켰다. 효소반응의 활성화에너지는 GI의 경우 10,62 kcal/mole이었으며, GII의 경우에는 10.23kcal/mole이었다. GI isozyme의 기질에 대한 Km값은, 0.62% (soluble starch), 0.32% (dextrin), 1.03%(glycogen)이었으며, GII isozyme의 경우에는, 0.66%(soluble starch) 0.23%(dextrin), 그리고 0.14% (glycogen)이었다.

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Emergence of GII.4 Sydney Norovirus in South Korea During the Winter of 2012-2013

  • Kim, Hyun Soo;Hyun, Jeongwon;Kim, Han-Sung;Kim, Jae-Seok;Song, Wonkeun;Lee, Kyu Man
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권11호
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    • pp.1641-1643
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    • 2013
  • Norovirus is the major cause of acute gastroenteritis worldwide. Between November 2012 and June 2013, 1718 stool samples were requested for norovirus antigen testing in the metropolitan areas of South Korea, and 91 samples were genotyped. The norovirus antigen-positive rate peaked at 52.8% in December 2013. A novel norovirus GII.4 variant, GII.4 Sydney 2012, was the most frequently found genotype (60.4%) during this period. This study demonstrates that norovirus activity increased during the winter of 2012-2013 in South Korea and that norovirus GII.4 Sydney 2012 was the cause of the norovirus epidemic during this period.