• 제목/요약/키워드: GALT gene

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새로운 GALT 유전자의 돌연변이에 의한 갈락토스혈증 (A Case of Galactosemia with Novel Mutation in the GALT Gene)

  • 김신아;신영림;홍용희
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.126-130
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    • 2013
  • Galactosemia is a metabolic disorder inherited by the recessive autosome, and appears by the deficiency of one enzyme out of GALT (Galactose-1-Phosphate Uridyltransferase), GALK (galactokinase), and GALE (epimerase) enzymes, among which the GALT deficiency disease is denominated as classical galactosemia and known to have symptoms such as severe nausea, jaundice, hepatomegaly, sucking difficulty and so on. We report the case of a 16-day-old female baby with the new p.A101D mutation together with p.N413d in the GALT gene analysis found in the neonatal screening test and diagnosed to have galactosemia by the GALT deficiency through the enzyme analysis. For the prognosis prediction, the treatment, the genetic counseling and the prenatal diagnosis of the patients, more detailed genetic diagnosis is required by performing GALT gene analysis, and it is deemed to be necessary to analyze the correlation between the phenotype and the genotype of the domestic galactosemia patients.

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GALT 유전자의 복합 이형 돌연변이에 의한 전형적 갈락토오스혈증 1례 (A Case of Classical Galactosemia caused by Compound Heterozygous Mutations of the GALT Gene)

  • 전종근;조민성;고정민;김구환;유한욱
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제5권2호
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    • pp.131-135
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    • 2008
  • 전형적 갈락토오스혈증(classical galactosemia)은 상염색체 열성으로 유전되는 galactose-1-phosphate uridyltransferase(GALT) 효소의 결핍에 의한 갈락토오스 대사 장애 질환이며 galactose-1-phosphate가 축적되어 간, 뇌, 신경에 심각한 영향을 끼친다. 본 증례는 GALT 효소 결핍 신생아에서, 출생 후 락토오스가 함유된 일반 수유를 시작하면서 심한 황달, 구토, 심한 출혈경향 및 간 부전 등이 발생하였다. 신생아 선별검사에서 갈락토오스의 증가로 재검을 의뢰하였고, 그 사이에 일반수유로 인해 임상증상이 악화 되어 생후 11일째 본원으로 전원되었다. 효소분석검사와 유전자검사로 확진 전에 임상적으로 갈락토오스혈증이 의심이 되어 소이 분유로 수유를 시작하였고, 이후 심한 황달과 출혈경향의 호전, 간기능 호전, 체중 증가와 전신상태가 회복되어 11일간의 입원 이후 퇴원하였다. 갈락토오스혈증의 임상 증상에 대한 올바른 이해를 통해 조기 진단하여 식이요법 등의 치료로 사망률을 줄이고, 유전자검사로 갈락토오스혈증을 확진하여 유전상담 및 산전진단에 유용하게 이용할 수 있는데, 본 증례에서는 효소분석 결과 GALT 효소 결핍증과 유전자검사에서 아직까지 보고된 적이 없는 GALT 유전자의 이형 돌연변이를 경험 하였기에 이를 보고하는 바이다.

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Duarte Variant/Classical Galactosemia (D/G) Heterozygote으로 진단된 일란성 쌍둥이 1례 (A Twin diagnosed with Duarte Variant/Classical (D/G) Galactosemia)

  • 구교연;이철호;양정윤;이진성
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.58-63
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    • 2012
  • 고전적 갈락토오스혈증(classical galactosemia; OMIM #230400)은 상염색체 열성 유전의 갈락토오스 대사장애로, 9번 염색체에 위치하는 GALT 유전자(OMIM *606999)로부터 전사되는 galactose-1-phosphate uridylyltransferase (GALT; E.C.2.7.7.12)의 심각한 결손으로 인해 유발되는 질환이다. GALT의 결함은 galactose-1-phosphate의 체내 축적을 일으켜, 신생아 시기부터 구토, 수유 곤란, 황달, 복수, 경련 발작, 기면 상태 등의 증상을 유발하고, 장기적으로는 백내장, 성장지연, 지능저하를 초래한다. 반면 Duarte형 갈락토오스혈증은 적혈구에서의 GALT 효소 활성도가 감소되어 있어 혈중 galactose와 galactose-1-phosphate의 농도가 증가하지만 임상적으로는 거의 증상을 보이지 않는 아형이다. 최근 신생아 선별검사의 발달과 함께, 무증상의 양성 판정 환아들이 늘고 있으며, 이들 환아들이 Duarte형 갈락토오스혈증일 가능성이 제기되고 있다. 이에 저자들은 국내에서 그 동안 드물게 보고되었던 N314D와 -119_-116delGT CA/E363K이형접합체의 Duarte형 갈락토오스혈증 일란성 쌍둥이 1례를 보고하고자 한다.

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갈락토스혈증의 신생아 선별검사 후 진단 알고리즘 (A Diagnostic Algorithm of Newborn Screening for Galactosemia)

  • 손영배
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제15권3호
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    • pp.101-109
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    • 2015
  • 신생아 선별검사의 확장으로, 조기에 진단되어 치료하지 않으면 치명적인 경과를 보이는 고전적 갈락토스 혈증 환자를 조기 발견하여 치료할 수 있게 되었다. 신생아 선별검사에서는 원인에 관계없이 갈락토스 대사 산물이 증가한 경우를 양성으로 판정한다. 그러나 신생아 선별검사에서 양성 판정을 받은 경우 실제 GALT 효소의 완전 결핍에 의한 고전적 갈락토스혈증 뿐만 아니라, 다른 원인에 의해 갈락토스가 증가하는 경우도 많으므로 정확한 감별진단을 위한 진단 과정이 필수적이다. 특히 우리나라를 포함한 아시아에서는 서양과 달리 고전적 갈락토스혈증의 발생률이 낮으며, 유전형이 전혀 다른 것으로 보고되고 있어, 신생아 선별검사에서 갈락토스혈증이 있는 경우 정확한 원인을 감별하는 진단 과정이 서양의 것과 차별화 될 필요가 있다. 그러나 아직 우리나라에서는 선천성 대사이상질환 신생아 선별검사에서 갈락토스혈증 양성 판정을 받은 경우 이후 확진을 위한 진단 및 치료 지침이 확립되어 있지 않은 실정이다. 이에 본 종설에서는 국내 현실을 고려하여 신생아 선별검사 양성 판정을 받은 이후 확진을 위한 적절한 진단 및 치료를 위한 지침을 제시하고자 하였다. 갈락토스혈증은 위양성의 경우, 추적검사 결과를 기다리는 적어도 2-3주 동안 모유 수유를 중단해야 한다는 점을 고려해야 한다. 최근 국내에서 다양한 선천성 질환에서 유전자 검사가 매우 활발하게 이용되고 있으므로, 갈락토스혈증의 선별검사나 생화학적 검사결과가 모호하여 추적 검사를 필요로 하는 경우, 유전자 검사를 조기에 시행하면 Duarte 변이형 갈락토스혈증과 같이 철저한 식이 제한을 필요로 하지 않는 형태의 갈락 토스혈증을 감별하는데 도움이 될 것으로 생각된다.

Analysis of H3K4me3-ChIP-Seq and RNA-Seq data to understand the putative role of miRNAs and their target genes in breast cancer cell lines

  • Kotipalli, Aneesh;Banerjee, Ruma;Kasibhatla, Sunitha Manjari;Joshi, Rajendra
    • Genomics & Informatics
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    • 제19권2호
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    • pp.17.1-17.13
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    • 2021
  • Breast cancer is one of the leading causes of cancer in women all over the world and accounts for ~25% of newly observed cancers in women. Epigenetic modifications influence differential expression of genes through non-coding RNA and play a crucial role in cancer regulation. In the present study, epigenetic regulation of gene expression by in-silico analysis of histone modifications using chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-Seq) has been carried out. Histone modification data of H3K4me3 from one normal-like and four breast cancer cell lines were used to predict miRNA expression at the promoter level. Predicted miRNA promoters (based on ChIP-Seq) were used as a probe to identify gene targets. Five triple-negative breast cancer (TNBC)-specific miRNAs (miR153-1, miR4767, miR4487, miR6720, and miR-LET7I) were identified and corresponding 13 gene targets were predicted. Eight miRNA promoter peaks were predicted to be differentially expressed in at least three breast cancer cell lines (miR4512, miR6791, miR330, miR3180-3, miR6080, miR5787, miR6733, and miR3613). A total of 44 gene targets were identified based on the 3'-untranslated regions of downregulated mRNA genes that contain putative binding targets to these eight miRNAs. These include 17 and 15 genes in luminal-A type and TNBC respectively, that have been reported to be associated with breast cancer regulation. Of the remaining 12 genes, seven (A4GALT, C2ORF74, HRCT1, ZC4H2, ZNF512, ZNF655, and ZNF608) show similar relative expression profiles in large patient samples and other breast cancer cell lines thereby giving insight into predicted role of H3K4me3 mediated gene regulation via the miRNA-mRNA axis.

SLC35B2 Expression is Associated with a Poor Prognosis of Invasive Ductal Breast Carcinoma

  • Chim-ong, Anongruk;Thawornkuno, Charin;Chavalitshewinkoon-Petmitr, Porntip;Punyarit, Phaibul;Petmitr, Songsak
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권15호
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    • pp.6065-6070
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    • 2014
  • Background: Breast cancer is the most common malignancy in women worldwide, including Thailand, and is a major cause of mortality and morbidity, despite advances in diagnosis and treatment. Novel gene expression in breast cancer is a focus in searches for prognostic biomarkers and new therapeutic targets. Materials and Methods: The mRNA expression of novel B4GALT4, SLC35B2, and WDHD1 genes in breast cancer were examined in invasive ductal breast carcinoma (IDC) patients using quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction (QRT-PCR). Results: Among these genes, increased expression of SLC35B2 mRNA was significantly associated with TNM stage III + IV of IDC (p<0.001). Hence, up-regulation of SLC35B2 may serve as a prognostic biomarker for poor prognosis, and is also a potential therapeutic target in breast cancer.

Gut-residing Microbes Alter the Host Susceptibility to Autoantibody-mediated Arthritis

  • Lee, Hyerim;Jin, Bo-Eun;Jang, Eunkyeong;Lee, A Reum;Han, Dong Soo;Kim, Ho-Youn;Youn, Jeehee
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제14권1호
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    • pp.38-44
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    • 2014
  • K/BxN serum can transfer arthritis to normal mice owing to the abundant autoantibodies it contains, which trigger innate inflammatory cascades in joints. Little is known about whether gut-residing microbes affect host susceptibility to autoantibody-mediated arthritis. To address this, we fed C57BL/6 mice with water containing a mixture of antibiotics (ampicillin, vancomycin, neomycin, and metronidazol) for 2 weeks and then injected them with K/BxN serum. Antibiotic treatment significantly reduced the amount of bacterial genomic DNA isolated from fecal samples, in particular a gene encoding 16S ribosomal RNA derived from segmented filamentous bacteria. Arthritic signs, as indicated by the arthritic index and ankle thickness, were significantly attenuated in antibiotic-treated mice compared with untreated controls. Peyer's patches and mesenteric lymph nodes from antibiotic-treated mice contained fewer IL-17-expressing cells than those from untreated mice. Antibiotic treatment reduced serum C3 deposition in vitro via the alternative complement pathway. IL-$17^{-/-}$ congenic C57BL/6 mice were less susceptible to K/BxN serum-transferred arthritis than their wild-type littermates, but were still responsive to treatment with antibiotics. These results suggest that gut-residing microbes, including segmented filamentous bacteria, induce IL-17 production in GALT and complement activation via the alternative complement pathway, which cause the host to be more susceptible to autoantibody-mediated arthritis.