In this study, we investigated how the force-field, which is the most important factor to define atomic motion in molecular dynamics (MD), affects the motion of the polymer and gas molecules. The repeat units and the polymer structure were well simulated in all five force-fields, and the distribution of the polymer linear chain in the final polymer 3D model did not show any significant difference. However, the movement of actual gas molecules showed a very different tendency, which was also observed in COMPASS and pcff using the same functional form. Therefore, even if the same structure is used, it can be seen that the motion of the gas molecule moves under the influence of the force-field continuously over time, so that the effect is much larger than that of macromolecules such as a polymer linear chain. Accordingly, in case of using different force-fields, it is necessary to be very careful in comparison of those results.
Park Chang-Keun;Lee Sun-Hyung;Chung Hun-Young;Yang Jae-Ho
The Journal of Korean Academy of Prosthodontics
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v.32
no.4
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pp.484-514
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1994
Cantilever bridge is widely used by mny clinicians, but its worst mechanical character, so called Class I lever system, makes dentists hesitate to restore the missing tooth with it. Therefore it is important to study stress of the cantilever bridge. In this study, two models of cantilever bridges that restores the missing mandibular second molar with two abutment teeth were constructed. One model was a type of cantilever bridge supported by a normal alveolar bone, the other one was supported by an alveolar bone resorbed to its 1/3 of root length. Maximum bite force(550N) and funtional maximum bite force(300N) were vertically applied to the distal end of the pontic, distal 1/3, and distal half of the pontic. And each force was also applied to centric occlusal contacts as a distributed force. Total 16 loading cases were compared and analyzed with 3-dimensional finite element method. The results were as follows: 1. The stress was concentrated on the joint of the pontic and the retainer, grooves, and distal cervical margin of the posterior retainer. 2. In case of maximum bite force(550N) at the end of the pontic, the risk of fracture at the joint of the pontic and the retainer was high. 3. In case of distributed force in centric occlusion and functional maximum bite force(300N), the stresses were less than the yield strength of the type VI gold for any loading cases. 4. In case of alveolar bone resorption, the occlusal force to the cantilever pontic caused more stress on the root apex and less stress on the alveolar crest region of the distal surface of the posterior abutment. 5. In case of alveolar bone resorption, the displacement was larger than that of normal alveolar bone in all loading cases.
The effects of taping on the use of such measures for prevention have already been comprehensively described in the literature. However, few studies have analyzed ground reaction forces and postural stability with functional ankle instability subject during dynamic activities with ankle taping The purpose of this study was to identify the effects of ankle taping on ground reaction force and postural stability during jump landing. Fourteen players who has ankle instability were participated in this study. we used vicon and force platform. The application of taping who has ankle instability decreased DF and inversion angular velocity and peak vertical ground reaction force during landing. It also improved A-P cop, M-L cop in stability. The findings of this study support the use of taping as part of injury prevention for subject with functional ankle instability in clinical setting.
Kim, Hyung-Tae;Park, Joo-Cheol;Lee, Chang-Seop;Park, Heon-Dong
Journal of the korean academy of Pediatric Dentistry
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v.30
no.2
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pp.308-319
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2003
Mechanical forces are known to have an effect on bone formation, maintenance and remodeling, and there is evidence that the development of the mandibular condyle in the rat or mouse is influenced by altered functional force. However, studies are lacking in molecular-biologic mechanism such as the identification of differentiation factor induced from functional force. Here a mouse model was used to investigate the functional stress-responsive gene or factors which is related to the altered force by comparing the expression genes of functional state and hypo-functional state of the mouse mandible. ICR mice were provisioned with either a soft, mushy diet (soft-diet group) or hard rat pellets (hard-diet group) beginning at weaning for the alteration of functional force and subsequently sacrificed at 89 days of age. Incisor of mice in group 1 were trimmed twice a week to reduce occlusal forces. After killing the animals, mandibular bone including condyle were collected for RNA extraction, subtractive hybridization, northern blot analysis and mRNA in-situ hybridization. The results as follows; 1. A total of 39 clones were sequenced, and 11 individual sequence types were subsequently identified by subtractive hybridization, as 28 clones were represented twice in the analyzed sets. 2. Consequently four candidate clones, FS-s (functional stress-specific)2, -5, -18, and -22 were identified and characterized by homolgy search and northern analysis. Four of these clones, FS-s2, -5, -18, and -22, were shown to be expressed differentially in the hard-diet group. 3. Histologic sections showed that osteoblastic activity along the bone trabeculae and active bone remodeling were significantly lower in soft than in hard diet animals. A soft diet seems to enable a longer period of endochondral ossification in the mandibular condyle. 4. Although the mRNAs of FS-s2, -5, -18, and -22 were expressed rarely by cells of the soft-diet group, highest expression was detected in the cells of the hard-diet group. Together with the above results, it is suggested that FS-s2, -5, -18, and -22 could act as an important factors controlling the tissue changes in response to functional stress. The exact functional significance of these findings remains to be established.
Purpose: Leg length discrepancy causes the posture deformation, gait asymmetry, and lower back pain. The purpose of this study is to investigate the correlation among functional leg length discrepancy (FLLD), muscle activity, muscle contraction onset time and vertical ground reaction force (vGRF) during simple lifting task. Methods: Thirty-nine subjects participated in this study. FLLD was measured from the umbilicus to medial malleolus of left and right leg using a tape. The subjects performed to lift a 10 kg box from the floor to chest. The muscle activity and muscle contraction onset time of rectus abdominis, erector spinae and rectus femoris was measured using EMG system and vGRF was measured by two force plate. Pearson correlation was used to fine out the correlation among FDDL, muscle activity, muscle contraction onset time and vGRF during simple lifting task. Results: Correlation between FLLD and difference of muscle activity of short-long side was very high (r>0.9) during simple lifting task. Correlation between FLLD and difference of muscle contraction onset time of short-long side was very high (r>0.9) during simple lifting task. And correlation between FLLD and difference of vGRF of short-long side was high (r>0.7) during simple lifting task. Conclusion: This study suggests that there is high correlation between FLLD and muscle activity, muscle contraction onset time, and ground reaction force during simple lifting task. Therefore, FLLD could negatively affect the postural balance.
A musculotendon model is investigated to show muscle fatigue under the repeated functional electrical stimulation (FES). The normalized Hill-type model can predict the decline in muscle force. It consists of nonlinear activation and contraction dynamics including physiological concepts of muscle fatigue. A muscle fatigue as a function of the intracellular acidification, pHi is inserted into contraction dynamics to estimate the force decline. The computer simulation shows that muscle force declines in stimulation time and the change in the estimate of the optimal fiber length has an effect only on muscle time constant not on the steady-state tetanic force.
Jaeyeon, Kim;Yiseul, Choi;Yool Bin, Song;Wonse, Park;Seong Taek, Kim
Journal of Dental Rehabilitation and Applied Science
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v.38
no.4
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pp.204-212
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2022
Purpose: The aim of this study was to compare changes of bite force, occlusal contact area, and dynamic functional occlusion analysis after occlusal stabilization splint therapy during sleep for one month in a patient with bruxism. Materials and Methods: From October 2021 to July 2022, sleep bruxism of 30 patients who visited the Department of Oral Medicine at Yonsei University College of Dentistry Hospital were recruited. The participants were divided into two groups: using an occlusal stabilization splint during sleep (treatment; n = 15) and not using an occlusal stabilization splint (control; n = 15). Before using the occlusal stabilization splint and one month after, bite force, occlusal contact area and dynamic functional occlusion analysis (ratio of left/right bite forces, average bite forces, maximum bite forces, and maximum contact areas during lateral and anterior and posterior mandibular movements) were performed. Results: There was no difference in bite force and occlusal contact area between the treatment group using the occlusal stabilization splint and the control group not using the occlusal stabilization splint during sleep for one month. However, there were significant differences in the average bite force and maximum bite force in the lateral and anterior and posterior mandibular movements and the maximum contact areas in the anterior and posterior mandibular movements. Conclusion: The occlusal stabilization splint is helpful for sleep bruxism patients who lateral and anterior and posterior mandibular movements. In addition, further studies are needed a double-blind study with a large population.
Thrombin binding aptamter (TBA-15) is a 15-mer guanine-rich oligonucleotide. This DNA apamer specifically binds to the thrombin protein involved in blood coagulation. Using extensive umbrella sampling molecular dynamics simulation method at all atom level, we investigated the potential of mean force (PMF) upon pulling the DNA aptamer from the binding mode of aptamer/thrombin complex. From this calculation, the free energy cost for a full dissociation of this aptamer/protein complex is 17 kcal/mol, indicating a substantial binding affinity of TBA-15. Interestingly, this PMF reveals noticeable plateau regions along the pulling coordinate. Possible structural changes of this complex in the plateau were investigated in details.
1FSD is a 28-residue designed protein with a ${\beta}{\beta}{\alpha}$ motif. Since this protein displays most essential features of protein structures in such a small size, this model protein can be an outstanding system for evaluating the balance in the propensity of the secondary structures and the quality of all-atom protein force fields. Particularly, this protein would be difficult to fold to its correct native structure without establishing proper balances between the secondary structure elements in all-atom energy functions. In this work, a series of the recently optimized five amber protein force fields [$ff03^*$, $f99sb^*$-ildn, ff99sb-${\phi}^{\prime}$-ildn, ff99sb-nmr1-ildn, ff99sb-${\Phi}{\Psi}$(G24, CS)-ildn] were investigated for the simulations of 1FSD using a conventional molecular dynamics (MD) and a biased-exchange meta-dynamics (BEMD) methods. Among those tested force fields, we found that ff99sb-nmr1-ildn and ff99sb-${\Phi}{\Psi}$(G24, CS)-ildn are promising in that both force fields can locate the native state of 1FSD with a high accuracy (backbone rmsd ${\leq}1.7{\AA}$) in the global free energy minimum basin with a reasonable energetics conforming to a previous circular dichroism (CD) experiment. Furthermore, both force fields led to a common set of two distinct folding pathways with a heterogeneous nature of the transition state to the folding. We anticipate that these force fields are reasonably well balanced, thereby transferable to many other protein folds.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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