• 제목/요약/키워드: Frankia EuIK1 strain

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보리수나무 뿌리혹으로부터 Frankia EuIK1 공생균주의 분리 (Isolation of Symbiotic Frankia EuIK1 Strain from Root Nodule of Elaeagnus umbellata)

  • 김성천
    • Journal of Plant Biology
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    • 제36권2호
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    • pp.177-182
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    • 1993
  • The root nodules of Elaeagnus umbellata were coralloid-shape due to repeated dichotomous branching of nodule meristem. The filamentous endophyte with vesicle cluster ranging from 30 ${\mu}{\textrm}{m}$ to 60 ${\mu}{\textrm}{m}$ in diameter was present only in the cortical cells. The isolated endophytes in vitro culture showed typical Frankia morphology, consisting of highly branched hyphae ranging from 0.8 ${\mu}{\textrm}{m}$ to 1.0 ${\mu}{\textrm}{m}$ in diameter, terminal and intrahyphal sporangia varing in shape and size up to 60 ${\mu}{\textrm}{m}$ in length and laminated vesicles. Its infectivity and effectivity were confirmed by induction of nitrogen-fixing root nodules on the inoculated seedlings of two Elaeagnus species. Consequently, the isolate was confirmed as a true symbiont of Elaeagnus umbellata root nodule and named Frankia EuIK1.

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보리수나무 뿌리혹 공생균주인 Frankia EuIK1의 nifH, D클로닝 (Molecular Cloning of nifH, D from Frankia EuIK1 Strain, A Symbiont of Elaeagnus umbellata Root Nodules)

  • 김호방;김준호;송순달;안정선
    • 미생물학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.258-263
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    • 1994
  • 보리수나무(Elaeagnus umbellata) 뿌리혹엣 분리한 공생균주인 Frankia 균주 EuIK1 게놈에 대해 K. pneumoniae의 nifH,D를 탐침으로 Southern hybridization을 수행한 결과, 3.2 Kb와 5.5 Kb BamHI 절편과 15 Kb PstI 절편이 강한 혼성화 반응을 보여 이들 절편에 nifH,D 유전자가 존재함을 확인하였다. 동일 탐침을 사용한 colony hybridization을 통해 pWE15 cosmid vector 에 작성되 게놈 library로부터 하나의 nif-클론 (pEuNIF)을 선별하였다. 이 클론을 BamHI으로 절단한 후 동일한 탐침으로 혼성화 반응을 수행한 결과, 3.2 Kb와 5.5 Kb가 강한 혼성화 반응을 보였으며, 이 결과는 게놈 혼성화 반응 결과와 일치하였다. 그러나 Frankia FaC1의 nifH 만을 탐침으로 이용한 결과 3.2Kb BamHI 절편만이 혼성화 반응을 나타내었다. 또한 3.2 Kb의 3‘ 말단과 5.5 Kb의 5’ 말단의 염기서열로부터 추론한 아미노산 서열을 ArI3의 nifD와 비교한 결과 182번부터 240번까지, 241번부터 282번까지의 아미노산 서열과 각각 매우 높은 유사성을 보였다. 이러한 결과로부터 3.2Kb 절편에는 nifH와 일부의 nifD 서열이 존재하고, 이 절편에 연속된 5.5Kb 절편에는 나머지 nifD서열이 존재함을 알 수 있었다.

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