• The Plant Pathology Journal
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• 제18권1호
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• pp.30-35
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• 2002

The hyphal growth and biocontrol efficacy of Trichodemo harzianum in soil may depend on its interactions with biotic components of the soil environment. The effect of soil microbial biomass on growth and biocontrol efficacy of T. hanianum isolate ThzIDl-M3 (green fluorescent protein transformant) was investigated using artificially prepared different levels of soil microbial biomass (153,328, or 517ug biomass carbon per g of dry soil; BC). The hyphal growth of T. harzanum was significantly inhibited in the soil with 328 or 517 $\mu$g BC compared with 153 ug BC. When ThzIDl-M3 was added to the soils as an alginate pellet formulation, the recoverable population of ThzIDl-M3 varied, but the highest population occurred in 517ug BC. Addition of alginate pellets of ThzIDl-M3 to the soils (10 per 50 g) resulted in increased indigenous microbial populations (total fungi, bacterial fluorescent Pseudomonas app., and actinomycetes). Furthermore, colonizing ability of ThzIDl-M3 on sclerotia of Sclerotinia sclerotiorum was significantly reduced in the soil with high revel of BC. These results suggest that increased soil microbial biomass contributes to increased interactions between introduced T. harzianum and soil microorganisms, consequently reducing the biocontrol efficacy of 1T. harzianum.

• The Plant Pathology Journal
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• 제28권1호
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• pp.1-9
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• 2012

In this study, 200 isolates of fluorescent pseudomonads were isolated from different fields of East and West Azarbaijan and Ardebil provinces of Iran. These bacterial isolates were screened on the basis of a dual culture assay, the presence of known antibiotic genes, and their ability to successfully colonize roots and to promote plant growth. Twelve isolates exhibited 30% or more inhibition of mycelia growth of $P.$ $drechsleri$. Genes encoding production of the antibiotics 2,4-diacetylphloroglucinol, phenazine-1-carboxylic acid, and pyoluteorin were detected in some strains but none of the strains possessed the coding gene for production of antibiotic pyrrolnitrin. In an $in$ $vitro$ test for root colonization, the population density on roots of plants treated with most of the above strains was more than 6 $\log_{10}$ CFU $g^{-1}$ roots, with a maximum of 7.99 $\log_{10}$ CFU $g^{-1}$ roots for strain 58A. Most of the strains promoted significant plant growth in comparison to non-treated controls. In green house studies, the percentage of healthy plants in pots treated with strains 58A and 8B was 90.8% and 88.7%, respectively. The difference between these treatments and treatment with the fungicide metalaxyl was not significant.

• 한국토양비료학회지
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• 제23권2호
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• pp.152-159
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• 1990

밀의 근권(根圈)에서 병원성(病原性) 사상균(絲狀菌)에 대해 길항성(拮抗性)이 높은 균주(菌株)를 분리(分離), 동정(同定)하여 연작장해(連作障害)의 피해경감과 생물방제(生物防除)의 기초자료(基礎資料)를 삼고자 그 균이 생성(生成)하는 siderophore에 의한 사상균(絲狀菌)의 생육(生育) 저해력(沮害力)을 조사한 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 밀의 근권(根圈)에서 형광성(螢光性) 세균(細菌)을 선별하여 R. solani, F. oxysperum, F. solani에 대한 생육저해(生育沮害)가 큰 (10mm이상) 균주(菌株)를 P. fluerescens Biovar I(Ps-1, Ps-2, Ps-5)과 Biovar II(Ps-3)로 동정(同定)되었다. 2. 선발균주(選拔菌株)가 생성(生成)하는 색소(色素)는 green-yellow 로 410nm에서 최대의 흡광도(吸光度)를 나타내었다. 3. Siderophore는 $Fe^{+3}$의 첨가시 생성량(生成量)은 현저히 감소하였으나 $Fe^{+2}$의 첨가시에는 생성량(生成量)의 감소는 보이지 않았다. 4. 선발균주(選拔菌株)중 Ps-5가 생성(生成)한 색소(色素)는 R. solani의 생육(生育)에 영향을 미치지 않았으며 $FeSO_4$의 처리시 생육(生育)이 증가되었다. 그러나 균주(菌株) Ps-1, Ps-2, Ps-3가 생성(生成)한 색소(色素)는 R. solani, F. oxysperum, F. solani에 대한 생육저해(生育沮害)는 컷으며 $Fe^{+2}$의 첨가시 저해력(沮害力)은 현저히 감소되었다. 5. 암소재배법(暗所栽培法)을 이용한 오이의 연작지토양(連作地土壤)에 오이를 파종하여 접종효과(接種效果)를 본 결과(結果) Ps-2>Ps-1>Ps-5>Ps-3의 순(順)으로 접종효과(接種效果)가 있었으며 Ps-1과 Ps-2는 captan 50ppm의 처리구 보다도 효과(效果)가 더 좋았다.

• 한국토양비료학회지
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• 제31권3호
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• pp.291-300
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• 1998

본 시험은 염류의 종류와 처리함량에 따른 작물근권 생태계의 미생물상 변동과 근권정착성을 구명하고자 하였다. 토양처리 염류($KNO_3$, $K_2HPO_4$, KCl, $K_2SO_4$)의 염농도(EC)와 포자형성세균, 그람음성세균수는 부의 상관관계를 보였으며, $K_2HPO_4$, $K_2SO_4$보다 KCl, $KNO_3$ 처리구에서 균수가 급격히 감소하였다. 균형염 처리토양의 미생물 밀도는 탄소원 첨가의 경우 그람음성세균은 EC $0.5dS\;m^{-1}$, 포자형성균은 EC $2.1dS\;m^{-1}$, 사상균 및 Fusarium sp.은 EC $8.0dS\;m^{-1}$에서 최대의 균수를 보였다. 균형염 처리토양의 Bacteria/Fungi 율은 염농도가 높아질수록 현저히 감소하며 토양처리 10일 경과후 757~1571, 30일 경과 후 89~215로 현저하게 낮아졌다. 오이, 토마토 근권 미생물의 뿌리정착밀도는 토양의 염농도가 높아질수록 형광성 Pseudomonas sp.은 현저하게 감소하였으나 병원성 Fusarium sp.은 증가하였다.

• 한국균학회지
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• 제25권1호통권80호
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• pp.10-19
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• 1997

무우품종(Raphanus sativus L.) Saxa Nova에 시들음병을 일으키는 Fusarium oxysporum f. sp. raphani (FOR)에 대해 저항성을 증가시켜 방제효과를 얻기 위하여 식물성장을 증진시키는 것으로 알려진 Pseudomonas florescens WCS374 (WCS 374), P. putida RE10 (RE10) 및 Pseudomonas sp. EN41S (EN415)을 병원균처리 토양에 단독 또는 혼합처리하여 4주간 폿트배양한 후 무우에 나타나는 외부 및 내부병징을 조사하여 처리세균에 의한 병억제 효과를 측정하였다. 내부 및 외부병징으로 대조구는 각각 46.5% 및 21.1%를 나타내었고, RE10처리는 내외병징이 각각 12.2%와 7.8%로 발병이 억제됨을 알 수 있었다. 그러나 발병억제력이 높다고 알려진 WCS374는 내외 병징이 각각 45.6%와 27.8%로 나타났다. 한편 RE10균주를 WCS374 또는 EN415 균주와 혼합하여 처리할 경우 내외 병징이 10.0-22.1% 정도이었고 EN415와 혼합처리하면 7.8-20.2%의 병징을 나타낸다. FOR의 뿌리점유율은 뿌리에서 $2.4-5.1{\times}10^3/g$였고 토양내 분포수는 $0.7-1.3{\times}10^3/g$이었다. 대조구는 뿌리에서 $3.8{\times}10^3/g$였으며 RE10의 처리는 $2.9{\times}10^3/g$로 분포수가 적었고, 3종 세균의 혼합처리는 $5.1{\times}10^3/g$으로 많이 관찰되었으나, 처리간에 통계적 차이는 없었다. 토양에서 관찰된 FOR은 부리부분 보다 그 분포 수가 적었다. 처리된 3가지 세균은 뿌리에서 $2.3-4.0{\times}10^7/g$ 범위이고, 토양에서는 $0.9-1.8{\times}10^7/g$으로 뿌리에서 관찰된 수 보다 적게 분포하였다. 뿌리부분에서 대조구나 RE10의 처리토양은 형광성 Pseudomonas spp.의 분포수가 적고 처리간에는 통계적 차이를 나타냈으나, 토양조사에서 이세균은 큰 차이를 나타내지 않았다. 뿌리에 처리된 세균과 FOR의 분포수는 토양에 처리된 것과 대조하였을 때 많았으며, 이 실험 에 사용된 RE10과 EN415은 Fusarium시들음병에 대한 기주의 저항성을 유도하는 것으로 생각된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권5호
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• pp.891-899
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• 2016

The recently isolated aniline-degrading bacterium Pseudomonas migulae AN-1 was tagged with green fluorescent protein (GFP) to investigate its bioaugmentation potential against aniline-contaminated groundwater through microcosm experiments. The survival and cellular response of GFP-tagged AN-1 introduced in a lab-scale aquifer corresponded directly with aniline consumption. During the process, the GFP-tagged AN-1 biomass increased from 7.52 × 10⁵ cells/ml to 128 × 10⁵ cells/ml and the degradation rate of aniline was 6.04 mg/l/h. GFP-tagged AN-1 was moderately hydrophobic (41.74%-47.69%) when treated with 20-100 mg/l aniline and exhibited relatively strong hydrophobicity (55.25%-65.78%) when the concentration of aniline was ≥100 mg/l. The membrane permeability of AN-1 increased followed by a rise in aniline below 100 mg/l and was invariable with aniline above 100 mg/l. Pyrosequencing analysis showed that the relative abundance of Proteobacteria (accounted for 99.22% in the non-bioaugmentation samples) changed to 89.23% after bioaugmentation with GFP-tagged AN-1. Actinobacteria increased from 0.29% to 2.01%, whereas the abundance of Firmicutes barely changed. These combined findings demonstrate the feasibility of removing aniline in aquifers by introducing the strain AN-1 and provide valuable information on the changes in the diversity of dominant populations during bioaugmentation.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제19권12호
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• pp.1688-1694
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• 2009

A novel strain of fluorescent pseudomonad (PB-St2) was isolated from surface-sterilized stems of sugarcane grown in Pakistan. The bacterium was identified as Pseudomonas aurantiaca on the basis of 16S rRNA gene sequence analysis and results from physiological and biochemical characteristics carried out with API50 CH and QTS 24 bacterial identification kits. Assays using substrate-specific media for enzymes revealed lipase and protease activities but cellulase, chitinase, or pectinase were not detected. The bacterium was unable to solubilize phosphate or produce indole acetic acid. However, it did produce HCN, siderophores, and homoserine lactones. In dual culture assays on agar, the bacterium showed antifungal activity against an important pathogen of sugarcane in Pakistan, namely Colletotrichum falcatum, as well as for pathogenic isolates of Fusarium oxysporium and F. lateritium but not against F. solani. The antifungal metabolites were identified using thin-layer chromatography, UV spectra, and MALDI-TOFF spectra and shown to be phenazine-1-carboxylic acid (PCA), 2-hydroxyphenazine (2-OH-PHZ), and N-hexanoyl homoserine lactone (HHL) (assessed using only TLC data). The capacity of this bacterium to produce HCN and 2-OH-PHZ, as well as to inhibit the growth of C. falcatum, has not been previously reported.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제26권3호
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• pp.238-243
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• 1998

느타리버섯의 세균성갈반병균인 P. tolaasii(PT)를 신속 간편하게 검출할 수 있는 효소면역측정법 (ELISA)을 개발하였다. 특이항체를 생산하기 위하여 PT($5{\times}10^7$ cfu)를 Freund's adjuvant와 함께 토끼에 수차례 면역하였으며, 가장 높은 역가를 나타낸 항혈청을 이용하여 비경합 ELISA 및 경합 ELISA를 각각 확립하였다. 표준곡선으로부터 PT의 그 검출한계는 각각 $2{\times}10^2$cfu/ml 및 $3{\times}10^2$cfu/ml가량으로 나타났다. 교차반응은 비경합 ELISA의 경우 P. agarici, P. reactans 및 비병원성 Pseudomonas속 균주와 1/$10^3$이하의 매우 미약한 반응을 보였으나 P. solanacearum, Erwinia chrysanthemi, Streptococcus mutans, Xanthomonas citri 및 곰팡이인 Fusarium oxysporum등 다른 균주와의 반응성이 거의 없었으며, 경합 ELISA의 경우 PT이외에는 같은 속 균주에 대하여도 반응성이 거의 없었다. ELISA를 이용하여 버섯으로부터 분리된 18균주에 대하여 PT의 여부를 조사하였을 때 병원성과 white line 반응성을 동시에 나타내었던 11균주에 대하여만 명확한 양성으로 나타나, 본 연구에서 확립한 ELISA는 간편하고 정확한 PT검출법 임이 확인되었다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제48권3호
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• pp.296-300
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• 2005

Among the root colonizing and plant growth promoting bacteria isolated from the bacterial wilt suppressive soil, five strains were detected to produce siderophores by CAS agar assay. The most effective isolate, TS3-7 strain induced significant suppression of bacterial wilt disease in tomato and pepper plants. Seed treatment followed by soil drench application with this strain resulted in over 80% reduction of bacterial wilt disease compared with the control. Significant disease suppression by TS3-7 strain was related to the production of siderophore. Besides iron competition, induction of resistance of the host plant with siderophore was suggested to be another mode of action that suppress bacterial wilt, based on the lack of direct antibiosis against pathogen in vitro. According to Bergey's Manual of Systemic Bacteriology and 16S rDNA sequence data, TS3-7 stain was identified as Pseudomonas sp. TS3-7.

• 식물병연구
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• 제22권3호
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• pp.158-167
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• 2016

육묘장과 재배포장의 애호박에서 새롭게 발생한 병원균의 특성을 분석하여 동정하였다. 병징은 잎에 수침상의 병반과 강한 노란색의 둘레무리를 가진 점무늬, 꽃에서 갈색 병반, 열매에 노란색의 점무늬였다. 잎의 점무늬로부터 분리된 세균은 박과작물 8개의 식물체, 흑종호박, 애호박, 쥬키니호박, 풋호박, 참박, 참외, 멜론, 오이에 병원성이 있었지만 수박과 밤호박에서는 병을 일으키지 못했다. 분리세균은 다발모를 가진 막대형으로 그람음성이며 King's B 배지에서 형광성이었으며, LOPAT 1a 그룹에 속했다. 그들의 Biolog 기질이용성은 Biolog database의 P. syringae pv. syringae 이용성과 유사하였다. 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용한 계통수와 4개의 항존유전자(gapA, gltA, gyrB, rpoD)의 염기서열과 PAMDB에 있는 P. syringae균주들의 염기서열을 이용한 MLST는 애호박 분리균주들이 P. syringae pv. syringae 균주들과 동일한 그룹(clade)으로 그룹화되었고, MLST 계통수에서 애호박 분리균주들의 그룹(clade)은 genomospecies 1에 속하였다. 표현형적, 유전적 특성은 애호박 분리균이 P. syringae pv. syringae임을 제시하였다.