• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제69권6호
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• pp.442-449
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• 2010

Background: Melanoma antigen genes (MAGE) are expressed in many human malignant cells and are silent in normal tissues other than in testis and in placenta. But MAGE expression in benign lung diseases, such as pulmonary tuberculosis or cases with severe inflammation, needs further evaluation to overcome false-positive findings. We evaluated detection rates of the melanoma antigen genes (MAGE) RT-nested PCR in bronchoscopic washing samples from patients with benign lung disease, as well as in patients with malignancies. Methods: Bronchial washing fluid from 122 patients was used for cytological examination and MAGE gene detection using RT-nested-PCR of common A1-6 mRNA. We compared the results from the RT-nested PCR and the pathologic or bacteriologic diagnosis. We also analyzed the expression rate and false positive rate of MAGE gene. Results: Among 122 subjects, lung cancer was diagnosed in 23 patients and benign lung disease was diagnosed in 99 patients. In patients with lung cancer, the positive rate of MAGE expression was 47.8% (11/23) and in benign lung disease group, the expression rate was 14.1% (14/99). Among benign lung disease group, the expression rate of MAGE gene (25.0%) in patients with pulmonary tuberculosis (11/44) was especially high. Conclusion: MAGE A1-6 RT-nested PCR of bronchial washing fluid can be used as a complementary method in lung cancer, but that test results in a high false positive rate in tuberculosis patients.

• 한국지능시스템학회:학술대회논문집
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• 한국지능시스템학회 2007년도 추계학술대회 학술발표 논문집
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• pp.357-361
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• 2007

비정상 트래픽 제어 프레임워크에 적용된 비정상 트래픽 제어 기술은 침입, 분산서비스거부 공격, 포트스캔 공격과 같은 비정상 행위의 트래픽을 제어하는 공격 대응 방법이다. 이 대응 방법은 비정상 행위에 대한 true-false 방식의 공격 대응 방법이 가지는 높은 오탐율(false-positive rate)을 낮출 수 있다는 장점이 있지만, 공격 지속시간에만 의존하여 비정상 트래픽을 판단하기 때문에, 공격에 대한 신속한 대응을 하지 못한다는 한계를 가지고 있다. 이에 본 논문에서는 비정상 트래픽 제어 프레임워크에 퍼지 로직을 적용하여 신속한 공격 대응이 가능한 포트스캔 공격 탐지 기법을 제안한다.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2001년도 추계학술발표대회
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• pp.815-818
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• 2001

수계 미생물의 세포 농도 정도를 DST와 spectrophotometer를 이용하여 간편하고 빠르게 측정할 수가 있었다. 기존의 MPN와 MF의 방법은 노동집약적이며 false positive나 false negative의 확률이 높고 검출 시간도 하루이상 소요되는 단점이 있었다. 그러나, 세포 성장거동과 DST의 원리를 웅용하여 간편한 검출 시스템을 정량적으로 기술함으로써 쉽고 빠르게 수계 미생물의 농도를 측정하는 방법을 제시하였다.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1994년도 춘계학술대회 and 제3회 신약개발 연구발표회
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• pp.193-193
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• 1994

발암물질의 조기검색법 개발 및 chemoprevention연구의 일환으로 발암물질과 DNA 및 단백질의 공유결합체인 발암물질-DNA 및 -단백질 adduct를 연구하였다. 발암물질(예, 밴조피렌)-단백질 adduct에 관한 연구에서는 시료(단백질)에 soluble protease를 이용하는 간편하고 손쉬운 ELISA(Enzyme Linked Immunosorbent Assay)분석법을 확립했다. 발암물질(예,벤조피렌,아플라톡신 B1) -DNA 및 -단백질 adduct를 이용한 발암성 조기검색법의 개발을 Ames test 및 염색체이상시험과 비교 연구한 결과 본 연구에서 새로이 개발한 DNA 및 Protein-adduct형성 시험법은 저농도에서 고농도에 이르기까지 뚜렷한 용량-반응 관계를 나타냈으며 Ames test 및 Chromosomal test에서 일어날 수 있는 false positive나 false negative의 결과를 나타낼 우려가 없었다. 벤조피렌-DNA adduct를 이용한 chemoprevention 연구에서는 항산화제로 알려진 비타민 E,C 및 $\beta$-carotene을 시험한 결과 용량의존적으로 벤조피렌-DNA adduct 형성을 억제하였다.

• 대한전기학회:학술대회논문집
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• 대한전기학회 2008년도 학술대회 논문집 정보 및 제어부문
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• pp.349-350
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• 2008

지능 로봇은 표현 가능한 사물, 공간을 모델링하기 위해 주변 환경을 인지하고, 자신이 수행할 수 있는 행동을 결합하여 임무를 수행하게 된다. 이를 위해 온톨로지를 사용하여 사물, 공간, 상황 및 행동을 표현하고 특정 임무 수행을 위한 자바 기반 Rule을 통해 다양한 추론 방법을 제공하는 로봇 지식 체계를 사용하였다. 사용된 로봇 지식 체계는 생성되는 인스턴스가 자료의 클래스와 속성 값이 일관성 있고 다른 자료와 모순되지 않음을 보장해 준다. 이러한 로봇 지식 체계를 효율적으로 사용하기 위해서는 완전한 온톨로지 인스턴스의 생성이 밑받침 되어야 한다. 하지만 실제 환경에서 로봇이 Vision Sensor를 통해 사물을 인식할 때 False Positive False Negative와 같은 인식 오류를 발생시키는 문제점이 있다. 이를 보완 하기 위해 본 논문에서는 물체와 물체간의 Spatial Relation, Temporal Relation과 각 물체마다의 인식률 및 속성을 고려하여 물체 인식 오류에서도 안정적으로 인스턴스 관리를 가능하게 하는 Rule 기반의 일식오류 검출 필터를 제안한다.

• Journal of Information Processing Systems
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• 제13권2호
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• pp.321-339
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• 2017

In this work, we are interested in the extraction of areas of interest from satellite images by introducing a MO-TRIBES/OC-SVM approach. The One-Class Support Vector Machine (OC-SVM) is based on the estimation of a support that includes training data. It identifies areas of interest without including other classes from the scene. We propose generating optimal training data using the Multi-Objective TRIBES (MO-TRIBES) to improve the performances of the OC-SVM. The MO-TRIBES is a parameter-free optimization technique that manages the search space in tribes composed of agents. It makes different behavioral and structural adaptations to minimize the false positive and false negative rates of the OC-SVM. We have applied our proposed approach for the extraction of earthquakes and urban areas. The experimental results and comparisons with different state-of-the-art classifiers confirm the efficiency and the robustness of the proposed approach.

• 대한전자공학회:학술대회논문집
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• 대한전자공학회 2009년도 정보 및 제어 심포지움 논문집
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• pp.267-269
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• 2009

Incomplete knowledge instances may be registered from misidentifications of sensors, such as vision sensor. In previous study, we proposed robust object instance registration method to robot centered knowledge framework to guarantee the consistency of the registered knowledge. In real environment, a persistent update is necessary due to the objects can be moved dynamically. In this paper, we propose the way to update robot knowledge continually using the registration method. Our experiment in this paper shows that sound and complete knowledge can be registered and updated by the proposed method, even under imperfect sensing data.

• 대한전자공학회:학술대회논문집
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• 대한전자공학회 2008년도 하계종합학술대회
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• pp.861-862
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• 2008

This paper presents the results of iris region localization for imprecisely taken iris images in UBIRIS ver2. UBIRIS database consisting of 500 images of 24-bit RGB typed TIFF file. They were captured by conventional digital camera in visible light environment. Experimental result showed that FP(False Positive rate) and FN(False Negative rate) were about 2.2% and 29.1%, respectively.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제12권2호
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• pp.61-65
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• 2015

Whole genome sequencing (WGS)-based noninvasive prenatal test (NIPT) is the first method applied in the clinical setting out of various NIPT techniques. Several companies, such as Sequenom, BGI, and Illumina offer WGS-based NIPT, each with different technical and bioinformatic approaches. Sequenom, BGI, and Illumina utilize z-, t-, and L-scores, as well as normalized chromosome values, respectively, for trisomy detection. Their outstanding performance has been demonstrated in clinical studies of more than 100,000 pregnancies. The sensitivity and specificity for detection of trisomies 13, 18, and 21 were above 98%, as reported by all three companies. Unlike other techniques, WGS-based NIPT can detect other trisomies as well as clinically significant segmental duplications/deletions within a chromosome, which could expand the scope of NIPT. Incorrect results could be due to low fetal fraction, fetoplacental mosaicism, confined placental mosaicism or maternal copy number variation (CNV). Among those, maternal CNV is a significant contributor of false positive results and therefore genome wide scanning plays an important role in preventing the occurrence of false positives. In this article, the bioinformatic techniques and clinical performance of three major companies are comprehensively reviewed.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제28권6호
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• pp.1557-1564
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• 2017

We take genomic sequences of high-dimensional low sample size (HDLSS) without ordering of response categories into account. When constructing an appropriate test statistics in this model, the classical multivariate analysis of variance (MANOVA) approach might not be useful owing to very large number of parameters and very small sample size. For these reasons, we present a pseudo marginal model based upon the Gini-Simpson index estimated via Bayesian approach. In view of small sample size, we consider the permutation distribution by every possible n! (equally likely) permutation of the joined sample observations across G groups of (sizes $n_1,{\ldots}n_G$). We simulate data and apply false discovery rate (FDR) and positive false discovery rate (pFDR) with associated proposed test statistics to the data. And we also analyze real SARS data and compute FDR and pFDR. FDR and pFDR procedure along with the associated test statistics for each gene control the FDR and pFDR respectively at any level ${\alpha}$ for the set of p-values by using the exact conditional permutation theory.