• 제목/요약/키워드: F. thunbergii

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Plant Virome Analysis by the Deep Sequencing of Small RNAs of Fritillaria thunbergii var. chekiangensis and the Rapid Identification of Viruses

  • Chen, Lu-xi;Pan, Hang-kai;Tao, Yu-tian;Yang, Dang;Deng, Hui-min;Xu, Kai-jie;Chen, Wen-bin;Li, Jun-min
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제38권5호
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    • pp.533-540
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    • 2022
  • Thunberg fritillary (Fritillaria thunbergii), a perennial used in traditional Chinese herbal medicine, is a members of the family Liliaceae. The degeneration of germplasm is a severe problem in the production of Fritillaria thunbergii var. chekiangensis. However, no information about viral infections of F. thunbergii var. chekiangensis has been reported. In this study, we sequenced the small RNAs of F. thunbergii var. chekiangensis from leaves and bulbs, and viruses were identified using a phylogenetic analysis and BLAST search for sequence. In addition, multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to rapidly detect viruses in this variety. Our study first reported that five viruses infected F. thunbergii var. chekiangensis. Among them, fritillary virus Y (FVY), lily mottle virus (LMoV), Thunberg fritillary mosaic virus (TFMV), and hop yellow virus (HYV) had been reported in F. thunbergii, while apple stem grooving virus was first reported in the genus Fritillaria. A multiplex RT-PCR method was developed to rapidly test the four viruses FVY, LMoV, TFMV, and HYV in F. thunbergii var. chekiangensis. Our results provide a better understanding of the infection of F. thunbergii var. chekiangensis by viruses and a basic reference for the better design of suitable control measures.

백화사설초(白花蛇舌草), 산자고(山慈姑), 절패모(浙貝母)에 의한 MDA-MB-231 인체 유방암 세포에서의 항암 효과 (Anti-cancer Effects of Oldenlandia diffusa, Cremastra appendiculata and Fritillaria thunbergii on MDA-MB-231 Human Breast Cancer Cells)

  • 진명호;박선영;강유경;심원석;허희수;홍상훈;박철;최영현;박상은
    • 대한한방내과학회지
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    • 제35권2호
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    • pp.133-144
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    • 2014
  • O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii are reported to possess many pharmacological activities including anti-oxidant, anti-inflammatory, anti-hypertension, anti-diabetic and anti-cancer effects. However, their anti-cancer activities in human breast cancer have not been clearly elucidated yet. Objectives: In the present study, we compared the in vitro cytotoxic effects of single and complex treatment of O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii in human breast cancer MDA-MB-231 cells. Methods: After we treated human breast cancer MDA-MB-231 cells with O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii. we evaluated viability, growth inhibition, morphological changes, apoptotic body formation, measurement of the cell cycle and formation of DNA fragmentation of these cells. Results: We found that single treatment of O. diffusa and F. thunbergii could inhibit cell proliferation in human breast cancer MDA-MB-231 cells. However, complex treatment of O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii had weak or no effect on the cell proliferation of MDA-MB-231 cells. The first, anti-proliferative effects of O. diffusa in MDA-MB-231 cells was associated with G2/M arrest of cell cycle and apoptotic cell death. The second, anti-proliferative effect of F. thunbergii in MDA-MB-231 cells was associated with apoptotic cell death. Conclusions: Taken together, these findings suggest that O. diffusa and F. thunbergii may be a potential chemotherapeutic agent for the control of human breast cancer cells, further studies will be needed to identify the molecular mechanisms.

Pinus thunbergii×P. massoniana F1 교잡종(交雜種) 유묘(幼苗)의 특성(特性) (Characteristics of Pinus thunbergii×P. massoniana F1 Hybrid Seedlings)

  • 박문한;전계상;윤양
    • 한국산림과학회지
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    • 제69권1호
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    • pp.51-55
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    • 1985
  • Pinus thunbergii를 교배모수(交配母樹)로 하고 대만(台灣)으로부터 도입(導入)된 P. massoniana 화분(花粉)으로 인공교배(人工交配)한 교잡종(交雜種)과 그의 모수(母樹) 풍매차대(風媒次代)들에 대(對)한 충실종자생산(充實種子生産), 생장(生長), 외부형태학적(外部形態學的) 특성(特性) 및 Phenol 물질함량(物質含量)을 조사(調査)하였다. 1) 구과당(毬果當) 충실종자(充實種子) 생산량(生産量)은 교잡종(交雜種)이 평균(平均) 2.3립(粒)으로 풍매(風媒) 26립(粒)에 비(比)하여 저조(低調)하였다. 2) 유묘시(幼苗時) 묘고생장(苗高生長)은 교잡종(交雜種)이 풍매차대(風媒次代)에 비(比)해 평균(平均) 151%로 우수(優秀)하였으며 120~208%의 변이(變異)를 나타냈다. 3) 침엽(針葉)의 외부형태학적(外部形態學的) 특성(特性)은 교잡종(交雜種)이 풍매차대묘(風媒次代苗)에 비(比)하여 침엽(針葉)이 부드럽고, 연(軟)하고, 길며, 연록색(軟綠色)을 나타내고 해부형태(解剖形態)에 있어서는 수지구(樹脂溝)의 위치(位置)가 P. thunbergii 풍매차대(風媒次代)는 중위(中位)인데 비(比)하여 교잡종(交雜種)들은 중위(中位)와 외위(外位)가 동시(同時)에 나타났다. 4) Phenol 물질분석(物質分析)에 있어서는 교잡종(交雜種)과 P. thunbergii 풍매차대간(風媒次代間)에 뚜렷한 차이(差異)가 없었으나 Unknown 4와 6의 물질(物質)이 교잡종(交雜種)에만 나타난 사실(事實)은 특이(特異)하나 이것이 화분수(花粉樹)에서 유래(由來)된 것인지의 여부(與否)는 좀 더 구명(究明)되어야 할 과제(課題)이다.

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MCF-7 인체 유방암 세포에서 백화사설초(白花蛇舌草), 산자고(山慈姑), 절패모(浙貝母)의 항암 효과 (Anti-cancer Effects of Oldenlandia diffusa, Cremastra appendiculata and Fritillaria thunbergii on MCF-7 Cells)

  • 진명호;홍상훈;박철;최영현;박상은
    • 동의생리병리학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.310-316
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    • 2014
  • Oldenlandia diffusa, Cremastra appendiculata and Fritillaria thunbergii are widely distributed in the Korea, China and Japan, and has been used in traditional medicine for various diseases, such as pharyngolaryngitis, tonsillitis, goiter and stomach ulcer. However, the anti-cancer activities in human breast cancer have not been clearly elucidated yet. In this study, it was compared the in vitro cytotoxic effects of single and complex treatment of O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii. We treat human breast cancer MCF-7 cells with O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii. And we evaluated viability, growth inhibition, morphological changes, apoptotic bodies formation, measurement of the cell cycle and formation of DNA fragmentation of these cells. It was found that single treatment of O. diffusa could inhibit the cell proliferation in human breast cancer MCF-7 cells. However, complex treatment of O. diffusa, C. appendiculata and F. thunbergii is weakly or not affect the cell proliferation of MCF-7 cells. And anti-proliferative effects of O. diffusa in MCF-7 cells was associated with G1 arrest of cell cycle. These findings suggest that O. diffusa may be a potential chemotherapeutic agent for the control of human breast cancer cells and further studies will be needed to identify the molecular mechanisms.

First Report of Pitch Canker Disease on Pinus rigida in Korea

  • Lee, Jong-Kyu;Lee, Sang-Hyun;Sung-II Yang;Lee, Yin-Won
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제16권1호
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    • pp.52-54
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    • 2000
  • Pitch canker of Pinus rigida, caused by Fusarium subglutinans f. sp. pini, was first noticed in Inchon, Korea, and is now being spread into other plantations of pines. Typical symptoms re resin flows from canders on the shoots, branches, and trunks, and resin-soaking of the sap wood under the bark. Pathogenic fungi were isolated from the infected shoots, branches, and sees on Fusarium-selective medium. Mycelial growth and microscopic characteristics were examined. Pathogenicity test was carried out by inoculating four common species of pines (P. rigida, P. densiflora, P. thunbergii, and P. koraiensis) in Korea. P. rigida and P. thunbergii showed symptoms identical to those of naturally infected trees, while P. densiflora and P. koraiensis remained free symptomless.

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Comparative Analysis of the Complete Genomes of Three Ficus L. (Moraceae) Species and Its Implication

  • Kim, Tae-Hee;Jung, Joonhyung;Kim, Joo-Hwan
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2019년도 추계학술대회
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    • pp.41-41
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    • 2019
  • The genus Ficus L., containing approximately 850 species, is by far the largest genus in the Moraceae. They are mainly distributed worldwide, mainly in tropical countries. In South Korea, there are three native Ficus (including F. erecta Thunb, F. sarmentosa var. nipponica (Franch. & Sav.) Corner, and F. thunbergii Maxim.). Among them, F. erecta is effectively natural resources for the improvement of senile cognitive impairment. However, the chloroplast (cp) genome sequences and information of F. erecta have not been addressed. Therefore, in this study, we provide the complete cp genome of F. erecta and its allied species using next-generation sequencing technology. The chloroplast of Ficus species has typical structure which includes large and small single copy regions and a pair of inverted repeats (IRs). The sizes of cp genomes range from 160,276 bp to 160,603 bp. To determine the phylogenetic positions of these species, we conducted a maximum likelihood analysis using common protein-coding genes in chloroplast sequences. Also, we describe a newly developed single nucleotide polymorphism (SNP) markers using multiplex PCR to identify F. erecta based on amplification-refractory mutation system (ARMS) technique. We analyzed matK, atpB of the chloroplast genes and ITS from F. erecta and three related taxa, F. carica, F. sarmentosa var. nipponica and F. thunbergii. It provides useful information for molecular identification between F. erecta and related Korean native species.

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한국산 갈조식물 지충이의 지리적 형태변이 (Geographical Variations of Sargassum thunbergii Morphology in Korea)

  • 김상일;오윤식;원남일;박상률
    • 환경생물
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    • 제32권4호
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    • pp.353-362
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    • 2014
  • 이번 연구는 한국산 지충이 [Sargassum thunbergii (Mertens ex Roth) Kuntze]의 지리적 형태변이를 확인하고, 형태변이에 따른 품종의 구분에 대하여 분류학적 재검토를 시도하였다. 동해, 서해와 남해안에 분포하는 지충이 개체군의 지리적 형태변이를 조사하기 위해서 개체가 가장 성숙한 시기인 봄철에 채집하였다. 지충이의 관찰대상 형질은 부착기, 줄기의 길이와 직경, 체장, 중심가지의 직경, 마디간격, 측지의 길이와 직경, 잎의 길이와 폭 및 두께, 기낭의 길이와 직경, 기낭 자루와 기낭 돌기의 길이, 생식기탁의 길이와 직경, 질감이었다. 서해안의 지충이는 엽체가 짧고 가늘며, 마디간격이 넓어서 성긴 느낌이고 질감이 부드러워 다른 두 해역의 지충이와는 다른 형태적 특징을 보였다. 동해안의 지충이는 체장이 서해안의 것과 비슷하지만 중심가지와 측지가 굵어서 질감이 거칠고, 측지가 없거나 매우 짧은 것도 있으며, 잎과 기낭이 다른 해역에 비해 컸다. 남해안의 지충이는 체장과 측지가 가장 길고 잎과 기낭이 짧은 것이 특징이었다. 동해안 북부에서 채집된 개체들은 f. latifolium과 형질이 유사하였다. 그러나 다른 해역에서는 네 품종의 원기재와 정확히 일치하지 않아 품종을 구분하는 식별형질은 한국산 지충이의 형태 변이에 적용할 수 없었다. 따라서 생육지에 따라 나타나는 지충이의 다양한 형태변이는 종 이하의 분류군으로 나누는 것보다는 생육지 환경조건에 따른 변이체로 보는 것이 타당할 것으로 사료된다.

금강소나무 - 유전적으로 별개의 품종으로 인정될 수 있는가? - 동위효소분석 결과에 의한 고찰 - (Pinus densiflora for. erecta - Can It Be Treated Genetically as a Distinct Group? - Reconsideration Based on Allozyme Data -)

  • 김진수;이석우;황재우;권기원
    • 한국산림과학회지
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    • 제82권2호
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    • pp.166-175
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    • 1993
  • 별개의 품종으로 인정되고 있는 강원 경북지역의 금강소나무(Pinus densiflora for. erecta) 8개 집단, 소나무 17개 집단 및 곰솔 13개 집단을 대상으로 공통으로 조사된 16개 동위효소 23개 유전자좌에서의 유전변이를 상호간에 비교 분석하였다. 소나무와 금강소나무 집단에서의 대립유전자 종류와 빈도분포가 매우 유사하고 곰솔에만 출현하는 표식인자가 금강소나무 집단에서 전혀 발견되지 않은 사실로부터 금강소나무가 곰솔의 영향을 받은 이입잡종이라는 근거를 찾을 수 없었다. 계층구조에 의한 Wright의 F 분석 및 Nei의 유전적 거리, 유전자좌별 거리계수 빈도분포를 이용한 여러가지 유전분석 (유집분석, 요인분석, 수지구분석)의 결과로 부터 강원 경북지역의 소나무 집단이 다른 지역의 소나무 집단들과 구분될 수 있는 뚜렷한 유전적 차이가 없음을 확인하였다.

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제주도 해송에서 분리한 푸사리움가지마름병균에 대한 교잡종 (리기다소나무×리기테다소나무) 소나무와 해송 묘목의 감수성 변이 (Susceptibility of a hybrid (Pinus rigida×P. x rigitaeda) and P. thunbergii Seedlings to Fusarium circinatum Isolated from P. thunbergii in Jeju Island)

  • 윤준혁;우관수;신한나;이승규
    • 한국육종학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.420-428
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    • 2009
  • 제주도에서 푸사리움가지마름병의 자연감염목으로 추정되는 해송에서 분리된 균을 분자생물학적 기법을 이용하여 기존의 푸사리움가지마름병균과 비교하고, 분리된 균을 리기다소나무${\times}$리기테다소나무 2, 4년생과 해송 2, 3, 6년생 묘목에 인공 접종하여 수종 및 수령별 감수성을 파악하고자 본 실험을 수행하였다. Site 1(FT)에서는 총 샘플 14 개체 중 13 개체에서 푸사리움균이 분리되었으며, Site 2(FS)에서는 9 개체 중 7 개체가 분리되었다. 분리된 균을 ITS region의 증폭을 통해 염기서열을 비교해 본 결과 FS와 FT 균주는 동일한 염기서열을 얻었고, 기존의 푸사리움가지마름병균인 FE 1-1과도 차이를 나타내지 않았다. 반면 잿빛곰팡이와는 차이를 나타내었다. 교잡종인 리기다소나무${\times}$리기테다소나무의 경우, 2년생의 고사율이 93.3%로 다른 수령에 비해 가장 감수성이 높게 나타났고, 해송은 3년생의 고사율이 66.7%로 가장 높은 감수성을 나타내었다. 근원직경과 lesion 길이는 리기다소나무${\times}$리기테다소나무($R^2=0.66$)와 해송($R^2=0.60$)에서 모두 정의 상관관계를 나타내었다. Lesion 길이도 리기다소나무${\times}$리기테다소나무 (p < 0.0001)와 해송(p < 0.0001)에서 모두 묘령에 따라 차이를 나타내어 Lesion 길이가 감수성 정도의 유용한 지표임이 확인되었다.

Assessment of Pathogenic Variation against Pitch Canker Pathogen, Fusarium circinatum in Pinus thunbergii and Responses of Natural Selection Pinus × rigitaeda to Branch Inoculation in a Seed Orchard

  • Woo, Kwan-Soo;Yoon, Jun-Hyuck;Han, Sang-Urk;Kim, Chang-Soo
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제26권4호
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    • pp.299-305
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    • 2010
  • A half-sib family of two 4-year-old seedlings of Pinus $\times$ rigitaeda was inoculated with each of 20 Pinus thunbergii isolates of Fusarium circinatum (syn. Fusarium subglutinans f. sp. pini) from two pitch canker damaged sites in Jeju Island, South Korea. Initial symptoms of needle damages were visible on most of the seedlings at 18 days after inoculation. The 20 tested isolates were not significantly different in virulence, based on lesion lengths at the site of inoculation (P = 0.217). The most virulent isolate FT-7 showed the longest lesion length. Some seedlings began to die 46 days after inoculation. All seedlings were dead by 68 days after inoculation except two seedlings inoculated with each of isolates FS-2 and FS-13, respectively. Using the FT-7, 38-year-old 11 P. $\times$ rigitaeda trees, which were survived from a seed orchard severely damaged by pitch canker, were inoculated on branches in the seed orchard in Jeju Island to assess differences in susceptibility to pitch canker. The 11 trees differed significantly (P < 0.001) in susceptibility to F. circinatum based on average lesion lengths measured 56 days after inoculation. It is possible that induced resistance contributed to their capacity to limit lesion development. The susceptibility of natural selection P. $\times$ rigitaeda trees are more likely affected by interaction with F. circinatum rather than environmental conditions.