• 제목/요약/키워드: Expression analysis

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Effects of Differential Distribution of Microvessel Density, Possibly Regulated by miR-374a, on Breast Cancer Prognosis

  • Li, Jian-Yi;Zhang, Yang;Zhang, Wen-Hai;Jia, Shi;Kang, Ye;Tian, Rui
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권3호
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    • pp.1715-1720
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    • 2013
  • Background: The discovery that microRNAs (miRNAs) regulate proliferation, invasion and metastasis provides a principal molecular basis of tumor heterogeneity. Microvessel distribution is an important characteristic of solid tumors, with significant hypoxia occurring in the center of tumors with low blood flow. The distribution of miR-374a in breast tumors was examined as a factor likely to be important in breast cancer progression. Methods: Breast tissue samples from 40 patients with breast cancer were classified into two groups: a highly invasive and metastatic group (HIMG) and a low-invasive and metastatic Group (LIMG). Samples were collected from the center and edge of each tumor. In each group, six specimens were examined by microRNA array, and the remaining 14 specimens were used for real-time RT-qPCR, Western blot and immunohistochemical analyses. Correlation analysis was performed for the miRNAs and target proteins. Follow-up was carried out during 28 months to 68 months after surgery, and survival data were analyzed. Results: In the LIMG, the relative content of miR-374a was lower in the center of the tumor than at its edge; in the HIMG, it was lower at the edge of the tumor, and miR-374a levels were lower in breast cancer tissues than in normal tissues. There was no difference between VEGF-A and VCAM-1 mRNA levels at the edge and center of the tumor; however, we observed a significant difference between VEGF-A and VCAM-1 protein expression levels in these two regions. There was a negative correlation between miR-374a and target protein levels. The microvessel density (MVD) was lower in the center of the tumor than at its edge in HIMG, but the LIMG vessels were uniformly distributed. There was a significant positive correlation between MVD and the number of lymph node metastases (Pearson correlation, r=0.912, P<0.01). The median follow-up time was 48.5 months. LIMG had higher rate of disease-free survival (100%, P=0.013) and longer median survival time (66 months) than HIMG, which had a lower rate of 75% and shorter median survival time (54 months). Conclusions: Our data demonstrated miR-374a to be differentially distributed in breast cancer; VEGF-A and VCAM-1 mRNA had coincident distribution, and the distribution of teh respective proteins was uneven and opposite to that for the miR-374a. These data might explain the differences in the distribution of MVD in breast cancer and variation in breast cancer prognosis.

Plasma Vascular Endothelial Growth Factors A and C in Patients undergoing Prostatic Biopsy and TURP for Suspected Prostatic Neoplasia

  • Singh, A.N.;Gautam, Kirti A.;Dalela, D.;Sankhwar, S.N.;Natu, S.M.;Sankhwar, P.L.;Srivastava, A.N.
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권3호
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    • pp.2053-2058
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    • 2013
  • Background: Formation of new blood vessels is necessary for the development and spread of neoplasms more than 1 mm3 in volume, angiogenesis being responsible for formation of new from pre-existing blood vessels. Vascular endothelial growth factor (VEGF) is pivotal and the best studied angiogenic factor in all human cancers. Therefore we designed this study to investigate the role of VEGF-A and VEGF-C in prostate cancer in comparison with BPH controls in a north Indian population. Methods: In this case-control study a total of 100 subjects were included on the basis of confirmed histopathological reports, out of which 50 were prostate cancer patients and the other 50 were BPH patients with PSA levels >2 ng/ml and abnormal digital rectal examination (DRE) findings during September 2009 to August 2011 from the Department of Urology, KGMU, Lucknow, India. Plasma levels of VEGF were determined using quantitative immunoassay (ELISA-enzyme linked immunosorbent assay). Statistical analysis was carried out using SPSS 15.0 version. Results: The mean age of prostate cancer ($67.6{\pm}5.72$) patients was significantly higher (p=0.005) than BPH ($63.6{\pm}7.92$) patients. Expression of VEGF-A was not significantly higher in disease stage C1 than D1 or D2 and A or B (p=0.13) while the level of VEGF-A was significantly higher (p=0.04) in prostate cancer as compared to BPH subjects (PCa=13.0 pg/ml, BPH=6.8 pg/ml). Levels of VEGF-C were similar in both groups (PCa=832.6 pg/ml, BPH=823.7 pg/ml). In ROC curve, the area under curve (AUC) was 0.70 (95%CI: 0.60-0.80) and the cut-off value for which a higher proportion of patients was correctly classified (20%) was 26.0 pg/mL. Conclusion: Although VEGF-A is increased in cancer prostate patients a statistically significant correlation could not be established in this study. VEGF-C was not found to be a useful biomarker.

Screening for the 3' UTR Polymorphism of the PXR Gene in South Indian Breast Cancer Patients and its Potential role in Pharmacogenomics

  • Revathidevi, Sundaramoorthy;Sudesh, Ravi;Vaishnavi, Varadharajan;Kaliyanasundaram, Muthukrishnan;MaryHelen, Kilyara George;Sukanya, Ganesan;Munirajan, Arasambattu Kannan
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제17권8호
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    • pp.3971-3977
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    • 2016
  • Background: Breast cancer, the commonest cancer among women in the world, ranks top in India with an incidence rate of 1,45,000 new cases and mortality rate of 70,000 women every year. Chemotherapy outcome for breast cancer is hampered due to poor response and irreversible dose-dependent cardiotoxicity which is determined by genetic variations in drug metabolizing enzymes and transporters. Pregnane X receptor (PXR), a member of the nuclear receptor superfamily, induces expression of drug metabolizing enzymes (DMEs) and transporters leading to regulation of xenobiotic metabolism. Materials and Methods: A genomic region spanning PXR 3' UTR was amplified and sequenced using genomic DNA isolated from 96 South Indian breast cancer patients. Genetic variants observed in our study subjects were queried in miRSNP to establish SNPs that alter miRNA binding sites in PXR 3' UTR. In addition, enrichment analysis was carried out to understand the network of miRNAs and PXR in drug metabolism using DIANA miRpath and miRwalk pathway prediction tools. Results: In this study, we identified SNPs rs3732359, rs3732360, rs1054190, rs1054191 and rs6438550 in the PXR 3; UTR region. The SNPs rs3732360, rs1054190 and rs1054191 were located in the binding site of miR-500a-3p, miR-532-3p and miR-374a-3p resulting in the altered PXR level due to the deregulation of post-transcriptional control and this leads to poor treatment response and toxicity. Conclusions: Genetic variants identified in PXR 3' UTR and their effects on PXR levels through post-transcriptional regulation provide a genetic basis for interindividual variability in treatment response and toxicity associated with chemotherapy.

A Study on Fashion Design Applied from Color-Field Abstract of Matk Rothko: Focusing on Needle-Punching Felt Technique

  • Park, Kyung-Mi;Lee, Mi-Ryang
    • The International Journal of Costume Culture
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    • 제13권2호
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    • pp.141-153
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    • 2010
  • Fashion needs to be understood as practicality and creative behavior and various movements of paintings act as inspirations of original design for fashion designers. This study seeks to find sources of fashion designs in the works of Mark Rothko who is in the center of color-field abstract. Color-field of Rothko provides infinite inspirations as colors are identically treated as shapes and lighting and textures are all included on top of it. In this study, the purpose is to create color focused artistic fashion design by exploring the possibility of expression with the colors of Rothko as the main motive. The study method is as follows. First, the concept and significance of color-field abstract are researched through documented data. Works of Rothko is divided into three periods according to their characteristics. The background of the formation of color-field abstract of Rothko is understood by analyzing the trends of the works in each period. Second, twenty representative works from 1949 to 1969 are selected and analyzed in formative components of color, shape and textures in order to more accurately understand shape of colors, brilliance, simplicity that appear in the mature color-field abstract of Rothko. Third, preexisting methods of color-field of paintings developed into motives of clothing are studied focusing on the collections from 1997 to 2006. Examples of applications of color-field images in modern fashion designs are analyzed. Fourth, motives are selected based on general characteristics of color-field abstract of Rothko and the results of the formative analysis. Clothing is produced that expresses the colors of the paintings of Rothko more effectively. As the results of the study, restrained shapes and textures and various forms of color combinations shown in color-field abstract of Rothko provided deep inspirations on material composition and color planning for fashion design focused on colors. Additionally, needle-punching technique using wool for the production technique enabled relief texture expressions of materials by colors and effective applications of soft and warm atmosphere of color-field abstract of Rothko on clothing. Especially, the ideology of color-field abstract of Rothko of shaping of colors could be expressed and the direction of the development of motives could be presented at the same time by specifically applying color combination method using horizontal division of atypical color-field from the formative characteristics of color-field abstract of Rothko.

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공적 인물의 통신비밀보호와 공적 관심사에 대한 언론보도의 자유: '안기부 X파일' 사건에 대한 서울고법 2006노1725판결을 중심으로 (Constitutional Protection for the Secrecy of Wire Communication and Freedom of News Reporting on Public Affairs)

  • 이승선
    • 한국언론정보학보
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    • 제38권
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    • pp.211-244
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    • 2007
  • 현재 한국법원의 언론소송에서는 보도내용이 공적인물 공적존재 공직자 공적관심사와 관련이 있을 때 진실하지 않더라도 면책범위를 확대하고 있고, 나아가 악의적이거나 현저히 상당성을 잃은 공격이 아닌 한 위법성을 조각하고 있다. 그러나 보도목적과 보도내용의 공공성에도 불구하고 취재행위의 위법성은 엄격하게 법적 책임을 묻는다. 이 연구는 이러한 언론소송법 환경에서 불법도청에 직간접적으로 관여하지 않고 획득한 도청테이프에 담긴 내용이 공적인물의 공적인 관심사와 긴밀히 관련될 때, 그 내용을 보도한 행위의 위법성이 조각될 수 있는지를 검토하였다. 구체적으로 MBC 이상호 기자의 통신비밀보호법 위반행위가 사회상규에 반하지 아니하여 위법성이 조각된다는 원심과 달리, 사회상규에 반하여 위법성이 조각되지 않는다고 유죄 판단한 항소심 판결의 내용을 분석 평가하였다. 연구 결과 통신비밀의 침해를 방지함으로써 보호되는 법익과 공적관심사에 대한 언론보도의 자유를 보장함으로써 달성되는 법익을 조정함에 있어서 사회상규에 반하지 아니하여야 한다는 위법성 조각의 요건을 엄정하고 제한적으로 적용하는 것은 타당하고, 이러한 기준에 의거 이 사건보도의 목적정당성, 수단방법의 상당성, 법익균형성, 긴급성과 보충성 등의 요건을 검토할 때, 이 사건의 보도는 사회상규에 반하지 아니함으로 그 위법성을 조각시키는 것이 바람직하다고 판단하였다. 대통령제를 채택하고 있는 우리 헌법구조를 고려할 때 불법적인 방법으로 대통령선거, 나아가 국정을 농단하려고 도모하는 것이야말로 시와 때를 넘어서 국민들에게 알려져야 할 우리 사회의 가장 중대한 공익적 필요가 있는 사안이라고 할 것이기 때문이다. 그러나 통비법을 개정하여 위법성조각규정을 신설하자는 주장에 대하여 필자는 현대 사회에서 통신비밀보호의 중요성을 감안, 반대했다.

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언론사로부터 전재 받은 뉴스기사의 댓글에 대한 포털의 작위의무 -서울중앙지법 2005가합64571 판결에 대한 비판적 고찰- (Portal's Liability for User Reply to News Article, Provided by the News Media -A Critical Analysis on 2005 GaHap64571 of Seoul Central District Court-)

  • 김경호
    • 한국언론정보학보
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    • 제42권
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    • pp.140-167
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    • 2008
  • 이 연구는 포털 편집판에 게시된 언론사로부터 전재 받은 뉴스기사에 딸린 댓글의 명예훼손행위를 포털의 작위의무에 따라 판단한 서울중앙지방법원의 법리를 비판적으로 분석하고 있다. 편집판에 게시하는 언론기사의 진위를 포털이 확인하도록 요구하고, 그 기사에 대한 명예훼손적 댓글을 삭제하도록 발행자 수준의 작위의무를 강제하는 것은 결국 사적 검열로 이어져 정보의 유통과 표현의 자유를 제한할 수 있다. 이는 사적 존재인 포털을 검열의 주체로 재판부가 인정하는 것과 다를 바 없으며, 위헌적 요소를 포함하고 있다. 포털이 직접 관리하는 영역과 커뮤니티 관리자에게 위임된 카페와 게시판 등을 구분해서 작위의무를 판단할 필요가 있다. 단순 전달자 수준을 넘어서는 작위의무를 부과하기 위해서는 포털이 언론사로부터 제공받은 기사를 임의로 변경하거나, 내용 변경을 통해 명예훼손을 유도한 경우로 한정해야 한다. 더불어 포털이 언론사로부터 전재 받은 기사의 위법성을 알 수 있었고, 이를 삭제하지 않았다는 사실만으로는 공동정범이 성립될 수 없다. 결론적으로 전재 받은 기사를 적극적으로 변경하여 명백하게 명예훼손에 이르는 경우에 한해서 포털에 책임을 묻는 것이 '사적 검열의 강제'로부터 자유로울 수 있을 것이며, 온라인상에서의 표현의 자유가 보호될 수 있을 것이다.

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루푸스 환자의 면역글로불린 λ 경쇄 레파토리 분석 (Analysis of Immunoglobulin λ Light Chain Repertoire in Systemic Lupus Erythematosus)

  • 장지은;이지수
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제3권3호
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    • pp.227-234
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    • 2003
  • Background: Immunoglobulin (Ig) light chain repertoire has been implicated as a critical determinant in regulation of autoreactive B cells and production of pathogenic anti-DNA antibodies in systemic lupus erythematosus (SLE). We analyzed the impact of Ig ${\lambda}$ chain repertoire on development of autoimmunity in patients with SLE. Methods: We obtained genomic DNA from individual peripheral CD19+ B cells of 3 untreated active SLE patients, and amplified $V{\lambda}$ rearrangements from each single cell by polymerase chain reaction. Results: A total number of 208 $V{\lambda}J{\lambda}$ rearrangements were analyzed. Analyzed sequences included 158 productive rearrangements and 50 nonproductive rearrangements. The differences in $V{\lambda}$ gene usage in the productive and nonproductive repertoire of SLE patients were found compared to the non-autoimmune individuals. $V{\lambda}$ gene, 9A was significantly overrepresented in nonproducative repertoire of SLE patients (P=0.016). In the productive repertoire, $V{\lambda}$ genes, 3L and 1E were found more often in the SLE patients (P=0.001, P=0.043). When the productive and the nonproductive repertoires were compared, 9A was found significantly less in the productive repertoire in the SLE patients (P=0.000). There were no significant differences in the $J{\lambda}$ gene usage between SLE patients and non-autoimmune individuals, but $J{\lambda}2/3$ gene was the most frequently used in SLE, whereas $J{\lambda}7$ gene was the most frequently used in the normal subjects. In the productive SLE $V{\lambda}$ repertoire, 9.4% of the total sequences employed identical CDR3. It was particularly striking to find 7 identical versions of the 1G-$J{\lambda}2/3$ $V{\lambda}J{\lambda}$ rearrangements from one patient and 3 of the same sequence from another patient. Notably, identical $V{\lambda}$ junctions in the SLE patients utilized significantly more homologous joining compared to $V{\lambda}$ junctions of the normal adults (P=0.044). Conclusion: These data demonstrate regulation of ${\lambda}$ light chain expression in the SLE patients by selection of unique $V{\lambda}$ genes. Also, biased selection and clonal expansion of particular $V{\lambda}$ rearrangements are apparent in the SLE ${\lambda}$ repertoire.

협동 중계 시스템을 이용한 분산 Alamouti 시공간 블록 부호 (Distributed Alamouti Space Time Block Coding Based On Cooperative Relay System)

  • 송외;조계문;이문호
    • 대한전자공학회논문지TC
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    • 제46권9호
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    • pp.16-23
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    • 2009
  • 본 논문에서는 하나의 기지국, 세 개의 중계국, 하나의 수신국으로 이루어진 중계 기반 협동 시스템을 이용하는 새로운 분산 Alamouti 시공간 블록 부호화 기법을 제안하였다. 세 개의 중계국 중에서 선택한 두 개의 중계국과 통신이 이루어지도록 기지국은 두 개의 빔(beam)으로 구성된 array를 사용하는 개별적인 두 개의 안테나로 이루어졌다고 가정하였다. 첫 번째 시간 슬롯(slot) 동안, 기지국의 한 안테나로부터 전송된 개별적인 두 개의 신호가 하나의 중계국에 의하여 선택되고, 더해지고, 증폭되고, 수신국으로 보내진다. 이 전송 기법은 중계국과 수신국 사이의 채널에서 생성될 수 있는 새로운 분산 Alamouti 시공간 블록 부호를 나타낸다. 심벌의 등가 행렬 표현을 이용하여 처노프(Chernoff) 상계(upper bound) 쌍 오류 확률(PEP)의 관점에서 제안된 시공간 블록 부호의 성능을 분석하였다 또한, 수신 신호 성능 관점에서 기지국의 두 개의 안테나 사이의 전력 배분에 따라 결정되는 계수 $\alpha$의 효과를 평가하였다. 컴퓨터 모의실험을 통하여 $\alpha$의 값이 $\frac{2}{3}$일 때에만 세 개의 중계국에서의 수신 신호가 같은 분산을 갖는다는 것을 확인할 수 있었다. 결과적으로 수신국에서 더 나은 성능을 얻을 수 있었다. 이 분석 결과를 통하여 제안된 기법을 이용할 경우 기존의 기법에 비하여 중계국에서의 다이버시티 이득, PEP, 복잡성 관점에서 뛰어난 성능을 얻을 수 있다는 것을 확인할 수 있었다.

Polycan-Calcium Gluconate 복합제에 의한 염증인자의 감소 효과 (The Effect of Polycan-Calcium Gluconate Complex on Inflammatory Mediators from Periodontitis Patients)

  • 김지혜;김기림;진혜정;임상욱;송근배;최연희
    • 치위생과학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.223-229
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    • 2014
  • 본 연구에서는 체내 염증지표 변화를 모니터링 함으로써 새로운 천연추출물인 polycan 및 calcium gluconate 복합제제의 치주질환 개선 효과를 평가하고자 하였으며, 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 치은열구액 내 $IL-1{\beta}$는 대조군과 시험군 모두 시간에 따른 유의한 차이는 없었으나(p>0.05), 4주째 시험군이 대조군보다 낮았다(p<0.05). 2. 치은열구액 내 MMP-8과 $TNF-{\alpha}$는 4주째 시험군에서 초기에 비해 감소하였으며, 시험군이 대조군보다 낮았다. 3. 혈액 내 MMP-8은 4주째 시험군에서 유의하게 감소하였고(p<0.05), 대조군에 비해 통계적으로 유의하게 낮았다(p<0.05). 그러나 혈액 내 CRP는 유의한 변화가 관찰되지 않았다(p>0.05). 이상의 결과들을 종합해 보았을 때, polycan을 함유한 calcium gluconate 복합제 복용이 전신적인 염증성 생체지표에 영향을 미쳐 치은열구액 내의 염증매개물질들을 감소시킴으로써 치은건강에 긍정적인 효과를 나타내는 것으로 사료된다.

Megalocytivirus 감염 해산 어류에서 나타나는 임상증상의 정량적 변화 분석 (Quantitative analysis of the clinical signs in marine fish induced by Megalocytivirus infection)

  • 진지웅;조혜진;김광일;정준범;박경현;정현도
    • 한국어병학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.53-64
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    • 2011
  • Megalocytivirus 감염 시 나타나는 임상적 증상의 정량적인 분석을 위하여, 돌돔에서 분리된 megalocytivirus IVS-1을 돌돔성어와 치어에 인위 감염시켰다. 그 결과 spleen index가 각각 $4.49{\pm}1.13$$4.85{\pm}1.06$로 나타 났으며, 이것은 정상배에 비해 3배 이상 증가한 값이었다. 폐사율은 돌돔성어와 치어에서 모두 100% 폐사한 반면 참돔치어는 30일이 지나도 60%의 폐사만 나타나 돌돔폐사율에 비해 낮은 폐사율을 나타냈다. 또한 IVS-1을 감염시킨 빈사상태의 참돔치어는 spleen index가 동일 크기의 돌돔치어 보다 낮은 $1.47{\pm}0.87$을 보였다. Real-time PCR을 이용하여 감염의 진행에 따른 바이러스 농도를 측정한 결과, 돌돔 치어와 성어의 감염 조직 내 바이러스 최고 농도는 각각 $2.03{\times}10^7$ copies/mg과 $2.40{\times}10^7$ copies/mg으로 비슷하였으나 돌돔성어에서 먼저 최고치에 도달하였다. 더구나 비장의 비정형비대세포의 수 역시 돌돔치어의 경우 지속적으로 증가한 반면 돌돔성어의 경우 최고치에 도달 후 오히려 감소히는 경향을 보였다. 본 연구에서는 megalocytivirus 감염 시 조직의 형태적 변화와 조직 내의 바이러스 농도와 같은 임상적인 증상을 정량적인 분석을 통해 나타내었고 이러한 정량적인 수치와 megalocytivirus 감염의 진행 정도와의 상관관계에 대해 조사하였다.