• 한국미생물·생명공학회지
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• 제51권3호
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• pp.306-308
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• 2023

This research presents the whole-genome sequence of Enterobacter asburiae strain IK3, which was isolated from the rhizosphere soil of soybean (Glycine max). The genome of the strain is composed of a single chromosome with 4 plasmids, total size of 5,084,040 bp, and the GC content is 55.5%.

• 한국전기화학회:학술대회논문집
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• 한국전기화학회 2005년도 수소연료전지공동심포지움 2005논문집
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• pp.177-186
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• 2005

미래의 친환경 에너지인 수소에너지 생산을 위해서 생물학적인 수소생산방법에 관한 관심이 증폭되고 있다. 생물학적인 수소생산 방법에는 여러 가지가 있으나 그중 유기물을 혐기발효하여 수소를 생산하는 방법에 관한 연구가 수행되었다. 본 연구에서 혐기성 미생물인 Enterobacter asburiae SNU-1이 쓰레기 매립지 토양에서 분리되어 수소생산 조건의 최적화 실험을 수행하였다. 본 실험에 이용된 미생물의 경우는 기존에 연구 된 적이 없는 새로운 종으로써 다른 미생물과는 다른 특징을 나타내며 수소생산 능력도 뛰어난 것을 알 수 있었다. 미생물을 이용한 수소생산에 영향을 미치는 인자로는 pH, initial glucose concentration 등이 있으며 각각의 조건에서 수소생산량을 비교하였다. 실험 결과 strain SNU-1의 최적 pH는 7이었으며 최적 initial glucose concentration은 25 g/1이다 이와 같은 최적 조건에서 strain SNU-1은 6.87 mmol/l/hr의 productivity를 나타내었다. 또한 다른 미생물과 달리 미생물이 더 이상 자라지 않는 정지기에서 더 많은 수소생산량을 나타내는 특이한 거동을 보이는 것이 관찰되었다.

• 환경생물
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• 제38권4호
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• pp.724-732
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• 2020

본 연구에서는 기 선발한 Enterobacter asburiae ObRS-5 균주를 1×10⁸ cfu mL^-1 농도로 고추에 관주 처리했을 때 Phytophthora capsici에 의한 고추역병을 74.6% 방제하는 효과가 있었다. E. asburiae ObRS-5 균주에 의한 고추역병 방제 메커니즘을 확인하기 위해 고추의 PR1, PR4 및 PR10 유전자를 특이적으로 증폭하는 프라이머를 이용하여 quantitative PCR을 수행하였다. 그 결과 E. asburiae ObRS-5 균주를 처리한 고추에서 대조구와 비교하여 상기 세 가지 유전자의 발현이 모두 높은 수준을 유지하였다. 또한 E. asburiae ObRS-5 균주는 고추의 생육을 억제하지 않으면서 ISR 반응을 유도하는 것으로 나타났다. 이러한 결과를 통하여 P. capsici이 침입할 때 E. asburiae ObRS-5 균주가 매개하는 ISR 메커니즘을 통해 Phytophthora 역병의 제어가 가능한 것으로 사료된다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제36권3호
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• pp.244-254
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• 2020

Gom-chwi (Ligularia fischeri) is severely infected with Phytophthora drechsleri, the causal organism of Phytophthora root rot, an economically important crop disease that needs management throughout the cultivation period. In the present study, Phytophthora root rot was controlled by using bacterial isolates from rhizosphere soils collected from various plants and screened for antagonistic activity against P. drechsleri. A total of 172 bacterial strains were isolated, of which, 49 strains showed antagonistic activities by dual culture assay. In the seedling assay, six out of the 49 strains showed a predominant effect on suppressing P. drechsleri. Among the six strains, the ObRS-5 strain showed remarkable against P. drechsleri when treated with seed dipping or soil drenching. The ObRS-5 strain was identified as Enterobacter asburiae based on 16S ribosomal RNA gene sequences analysis. The bacterial cells of E. asburiae ObRS-5 significantly suppressed sporangium formation and zoospore germination in P. drechsleri by 87.4% and 66.7%, respectively. In addition, culture filtrate of E. asburiae ObRS-5 also significantly inhibited sporangium formation and zoospore germination by 97.0% and 67.6%, respectively. Soil drenched bacterial cells, filtrate, and culture solution of E. asburiae ObRS-5 effectively suppressed Phytophthora root rot by 63.2%, 57.9%, and 81.1%, respectively. Thus, E. asburiae ObRS-5 could be used as a potential agent for the biological control of Phytophthora root rot infecting gom-chwi.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권6호
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• pp.968-975
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• 2018

In the course of screening for microbes with nematicidal activity, we found that Enterobacter asburiae HK169 displayed promising nematicidal activity against the root-knot nematode Meloidogyne incognita, along with plant growth-promoting properties. Soil drenching of a culture of HK169 reduced gall formation by 66% while also increasing root and shoot weights by 251% and 160%, respectively, compared with an untreated control. The cell-free culture filtrate of the HK169 culture killed all juveniles of M. incognita within 48 h. In addition, the nematicidal activity of the culture filtrate was dramatically reduced by a protease inhibitor, suggesting that proteolytic enzymes contribute to the nematicidal activity of HK169. In order to obtain genomic information about the HK169 isolate related to its nematicidal and plant growth-promoting activities, we sequenced and analyzed the whole genome of the HK169 isolate, and the resulting information provided evidence that the HK169 isolate has nematicidal and plant growth-promoting activities. Taken together, these observations enable the future application of E. asburiae HK169 as a biocontrol agent for nematode control and promote our understanding of the beneficial interactions between E. asburiae HK169 and plants.

• The Plant Pathology Journal
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• 제25권4호
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• pp.333-343
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• 2009

Here, we show that an endophytic bacterial strain, Enterobacter asburiae B1 exhibits the ability to elicit ISR in cucumber, tobacco and Arabidopsis thaliana. This indicates that strain B1 has a widespread ability to elicit ISR on various host plants. In this study, E. asburiae strain B1 did not show antifungal activity against tested major fungal pathogens, Colletotrichum orbiculare, Botrytis cinerea, Phytophthora capsici, Rhizoctonia solani, and Fusarium oxysporum. Moreover, the siderophore production by E. asburiae strain B1 was observed under in vitro condition. In greenhouse experiments, the root treatment of strain B1 significantly reduced disease severity of cucumber anthracnose caused by fungal pathogen C. orbiculare compared to nontreated control plants. By root treatment of strain B1 more than 50% disease control against anthracnose on cucumber was observed in all greenhouse experiments. Simultaneously, under the greenhouse condition, the soil drench of strain B1 and a chemical inducer benzothiadiazole (BTH) to tobacco plants induced GUS activity which is linked with activation of PR promoter gene. Furthermore, in Arabidopsis thaliana plants the soil drench of strain B1 induced the defense gene expression of PR1 and PDF1.2 related to salicylic acid and jasmonic acid/ethylene signaling pathways, respectively. In this study, for the main focus on root colonization by strain B1 associated with defense responses, bacterial cells of strain B1 was tagged with the gfp gene encoding the green fluorescent protein in order to determine the colonization pattern of strain B1 in cucumber. The gfp-tagged B1 cells were found on root surface and internal colonization in root, stem, and leaf. In addition to this, the scanning electron microscopy observation showed that E. asburiae strain B1 was able to colonized cucumber root surface.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제35권3호
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• pp.191-195
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• 2007

탄닌 분해균 선발배지를 이용하여 탄닌 분해활성 보유 유산균을 발효 침채류로부터 분리하는 과정에서 오이소박이, 파김치, 총각김치로부터 다당류로 추정되는 점질물질을 생산하는 균주 4종을 선발하였다. 이들 균주의 165 rDNA 염기서열에 의한 계통유전학적 동정 결과, CK31은 Enterobacter cowanii, CK32는 Escherichia senegalensis, YK5는 Enterobacter asburiae, GK23은 Enterobacter ludwigii와 99% 이상의 매우 높은 상동성을 나타내었다. 가장 많은 양의 점질 물질을 세포 외로 생성하는 CK3l 균주는 rhamnose, fucose, arabinose, mannose, galactose, glucose의 중성당 조성을 가지고 있는 분자량 약 420 kDa heteropolysaccharide를 생산하는 것으로 나타났다.

• 한국신재생에너지학회:학술대회논문집
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• 한국신재생에너지학회 2006년도 춘계학술대회
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• pp.470-473
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• 2006

생물학적 수소생산을 위해 토양으로부터 새로운 균주인 Enterobacter asburiae SNU-1이 분리되었다 이 균주의 경우 다른 균주와는 달리 미생물 생장과 수소생산 phase가 분리되는 특징을 가지고 있다. 이러한 정지기에서의 수소생산은 미생물 내에 존재하는 formate hydrogen lyase를 사응하여 formate 분해에 의해 일어난다. 따라서 본 연구에서는 미생물 생장 phase에서 formate hydrogen lyase가 발현된 미생물을 얻고 이를 formate만 있는 배지에서 수소생산 가능성에 대한 연구를 수행하였다. 앞으로 formate분해를 위한 조건을 최적화한다면 높은 수소생산성을 나타낼 것이라 기대된다. 또한, 이는 formate로부터 미생물촉매를 이용하여 수소를 생산하고 이를 연료전지로 공급하는 생물학적 reformer로써의 이용 가능성을 보여준다.

• 한국토양비료학회지
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• 제42권1호
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• pp.29-36
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• 2009

14종의 인산용해미생물을 근권으로부터 분하였고, 16S rRNA gene 염기서열에 의하여 동정하였다 그 중 hydroxyapatite를 첨가한 배지에서 인산용해능력이 가장 뛰어난 Acinetobacter sp., Pseudomonas orientalis, Enterobacter asburiae 3종을 선택하였다. 선택된 3종의 미생물에 의해 용해된 인산의 농도는 $200\;mg\;L^{-1}$에서부터 $2300\;mg\;L^{-1}$까지 이르렀으며, 증가된 인산 농도는 배양액의 pH와 역으로 비례하였다. HPLC를 사용하여 유기산을 측정한 결과 Acinetobacter sp.는 gluconic acid를, P. orientalis는 gluconic acid와 2-ketogluconic acid를 그리고 E. asburiae는 acetic acid와 succinic acid를 분비하였다. 한편 P. orientalis와 E. asburiae는 각각 $372\;mg\;L^{-1}$와 $191\;mg\;L^{-1}$의 IAA 분비하였고, Acinetobacter sp.는 IAA를 생성하지 못했다. 인산용해미생물이 오이의 생장에 미치는 효과를 조사한 결과, P. orientalis를 처리한 시험구가 가장 높았고, E. asburiae, Acinetobacter sp., control 순으로 나타났다. 이러한 식물생장 효과는 인산용해미생물에 의한 불용성 인산용해와 IAA 생산과 관련이 있다고 생각된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제40권2호
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• pp.135-143
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• 2012

본 연구는 독도에 자생하는 개밀의 야생군락지의 근권으로부터 분리된 균 중 식물의 생장을 촉진하고, 식물의 병원균을 억제하는 것으로 알려져 있는 Enterobacter 속 세균에 초점을 맞추어 실험을 진행하였다. 개밀 근권으로부터 총124종의 세균을 분리하였으며 16S rDNA sequence를 이용하여 부분 동정한 결과, 13종의 Enterobacter 속 세균을 확인할 수 있었다. 분리된 Enterobacter 속 세균들의 식물생장촉진 근권 세균으로서의 특징을 밝히기 위해 식물의 생장호르몬인 auxin의 생산능력과 난용성인의 가용능, siderophore 생산능을 측정하였다. 식물생장호르몬인 auxin을 형성하는 균주12종, 난용성 인을 분해할 수 있는 균주 12종, siderophore를 형성할 수 있는 균주 11종이 각각 확인되었다. 분리된 균주들은 대표적인 식용작물인 고추에 직접 적용하여 식물의 생장촉진 효과와 병원균에 대한 전신유도저항성을 확인하였다. 그 중 KUDC5002와 KUDC5013의 경우 식물의 생장을 촉진시키는 균주로 확인되었다. 특히 KUDC5007, KUDC5008 및 KUDC5010의 경우, 지금까지 보고된 바 없었던 고추 유묘의 흰별무늬병에 대한 식물의 저항성을 증가시키는 것으로 확인되어 새로운 생물학적 제재로서 매우 가치 있을 것으로 기대된다.