• Communications for Statistical Applications and Methods
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• 제16권4호
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• pp.579-586
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• 2009

통계모형의 상호작용 효과를 분석하기위해 비모수적인 방법인 다중인자 차원 축소(MDR)방법을 사용해 왔다. MDR 방법은 사례-대조 데이터에만 적용 할 수 있다. 본 논문에서는 Regression tree 알고리즘과 더미 변수를 활용한 회귀분석 알고리즘을 사용하여 다중 범주를 High 범주와 Low범주로 분류함으로써, MDR방법에서 연속형 데이터에 적용 할 수 없는 문제를 해결하는 방법으로 제시된 Expanded MDR방법과 Dummy MDR방법을 한우의 주요 경제형질(longissimus muscle dorsi area: LMA, carcass cold weight: CWT, average daily gain: ADG)데이터에 적용하여 한우의 경제형질에 영향을 주는 주요 SNPs 마커를 규명하고, Permutation test를 통해 그 결과를 비교한다.

• 응용통계연구
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• 제23권4호
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• pp.693-703
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• 2010

대개 인간의 질병과 관련된 유전자나 가축의 경제적인 특성과 관련된 유전자는 주로 상호작용으로 일어난다. 유전자의 상호작용을 찾기 위한 방법으로 다양한 방법들이 제시되었다. 본 논문에서는 유전자의 상호작용 효과를 규명하기 위해 개발된 확장된 MDR방법(E-MDR)과 더미변수를 활용한 MDR방법(D-MDR), 대규모 유전자들 중에서 주요 유전자 조합을 선별하는 SNPHarvester방법을 비교하여 인간의 질병이 아닌 한우의 경제적인 특성에 적용하여 우수한 유전자 조합을 선별하고 우수 유전자형을 밝힌다.

• 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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• 제2권3호
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• pp.161-172
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• 2013

메타데이터 레지스트리(Metadata Registry, MDR)는 데이터베이스 간 데이터 교환 및 공유를 위해 ISO/IEC에서 개발한 국제 표준이며, 의료 서비스, 서지, 환경 등 다양한 도메인에서 데이터 공유 및 통합을 위해 사용되고 있다. 그러나 MDR 표준은 메타데이터 등록 및 저장을 위한 메타모델만을 정의하고 있기 때문에 이 시스템들은 서로 다른 물리적 구조를 가지게 된다. 이로 인해 MDR 시스템 간 불일치가 발생하고 메타데이터의 상호운용을 위해 추가적인 비용이 발생한다. 이러한 문제를 해결하기 위해 ISO/IEC 13249-8 Metadata Registry Access (MRA)가 개발 중에 있으며, MRA는 상이한 MDR 시스템에 일관된 방법으로 접근할 수 있는 표준 인터페이스이다. 그러나 MRA는 MDR 표준에 정의되어 있는 개념 즉, 클래스 간 관계성을 고려하지 않는다. 이는 부정확한 결과를 생성할 수 있으며, 각 MDR 시스템의 물리적 구조를 고려하여 질의를 모델링하고 재작성하는 추가적인 비용이 발생한다. 이 논문에서는 클래스 간 관계성을 고려한 확장된 인터페이스 eMRA(Extened MRA)를 제안하며, 비교 평가를 통해 확장 인터페이스의 장점을 기술한다. eMRA는 MDR의 개념간 관계성을 정의하여 질의 모델링과 시스템의 참조무결성 측면에서 MRA보다 우수한 성능을 가진다.

• 대한의생명과학회지
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• 제13권1호
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• pp.47-53
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• 2007

Due to wide abuse of antibiotics both in human and livestock use, the advent and spread of multidrug resistant (MDR) pathogens becomes a serious health problem all over the world. Since the development of new antibiotics is at a standstill in pharmaceutical industry, the choice of therapeutic antibiotics is getting narrower. In this study, in an effort to search new antibiotics, the antimicrobial activity of Paenibacillus DY1 isolated from Korean soil was characterized on its growth inhibition spectrum against various health threatening MDR strains, with its stability and chemical structure. Extracellular culture filtrate of Paenibacillus DY1 effectively inhibits the growth of all the tested MDR enteropathogenic Eshcherichia coli, enterohemolytic E. coli, and enterotoxigenic E. coli strains, at a similar level to that on the nonresistant control E. coli strains. It showed significant growth inhibition effect against the causative agents of class one legal communicable disease, MDR Salmonella typhi, MDR Salmonella paratyphi A, food poisoning bacteria, MDR Salmonella typhimurium, and other MDR Salmonella spp. The growth of all of 10 different MDR Shigella spp. strains and 6 different Vibrio spp. strains tested was also inhibited. The antimicrobial activity of Paenibacillus DY1 was well preserved after heat treatment, and was also stable in both alkaline and acidic environment. The antimicrobial activity was partially purified with Diaion HP20 column and TLC. By NMR study, the putative structure of the activity was postulated as an alkane having hydroxyl groups.

• 응용통계연구
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• 제22권6호
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• pp.1239-1247
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• 2009

인간의 질병 또는 가축의 경제적인 특성에 관한 유전자의 규명은 매우 중요한 관심사이며, 우리나라 축산업을 대표하는 한우의 유전자원 보존과 능력향상은 매우 중요한 과제이다. 이를 연구하기 위해 기존 EST_based SNP 연관지도를 사용하여 발굴한 유전자로 연구되어왔으나 이는 통계학적 모델에 기반한 연관지도 작성법으로 실제 위치와는 차이가 있을 수 있다. 따라서 Lee (2009)에 의해 EST_based SNP 연관지도와 염기서열 분석으로 작성되어지는 Gene on sequence를 함께 고려하여 한우의 경제형질 연관 후보 DNA marker들이 발견되었다. 한편, 통계모형의 상호작용 효과를 고려할 때, 유전자와 같은 범주형 data에서 범주가 많을 경우 상호작용의 조합이 많아지므로 종종 모수들의 상호작용에 대한 해석과 모형을 결정하는 것이 어려울 수 있다. 그래서 비모수적인 방법으로 다중인자 차원축소방법 (MDR)을 사용해왔으며, 사례_대조 데이터에만 적용가능 MDR방법을 연속형 데이터에도 적용하기 위해 CART알고리즘을 적용한 확장된 다중인자 차원축소방법(E-MDR)이 제안되었다. 본 연구에서는 새롭게 발견된 단일염기다형성 (SNP)으로부터 E-MDR방법을 적용하여 한우의 경제형질(일당중체량, 근내지방도)에 영향을 주는 우수 유전자 단일염기다형성을 규명하였다.

• Communications for Statistical Applications and Methods
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• 제15권2호
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• pp.265-271
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• 2008

It is commonly believed that diseases of human or economic traits of livestock are caused not by single genes acting alone, but multiple genes interacting with one another. This issue is difficult due to the limitations of parametric-statistic methods of gene effects. So we introduce multifactor-dimensionality reduction(MDR) as a methods for reducing the dimensionality of multilocus information. The MDR method is nonparametric (i. e., no hypothesis about the value of a statistical parameter is made), model free (i. e., it assumes no particular inheritance model) and is directly applicable to case-control studies. Application of the MDR method revealed the best model with an interaction effect between the SNPs, SNP1 and SNP3, while only one main effect of SNP1 was statistically significant for LMA (p < 0.01) under a general linear mixed model.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2002년도 가을 학술발표논문집 Vol.29 No.2 (3)
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• pp.67-69
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• 2002

인터넷과 정보통신기술을 배경으로 한 전자상거래 확산은 유례가 없을 정도의 빠른속도로 이루어지고 있다. 특히 XML이 W3C의 공식 표준으로 공식화 된 이후, XML의 확장성, 호환성, 정보의 구조화와 같은 장점으로 XML은 전자상거래 프레임워크의 새로운 페러다임이 되었다. 이러한 XML 전자상거래 프레임워크로는 xCBL을 필두로, eCo 프레임워크, cXML, BizTalk, ebXML등 많은 국제 표준이 있다. 그러나 이러한 다양한 프래임워크들은 메시지규칙에 대한 정의와 전송 프로토콜 정의, 비즈니스 프로세스의 수평적 통합만을 고려하고 있다. 즉 비즈니스 객체간의 상호작용을 위한 일반된 표준을 제공해주지 못하고 새로운 비즈니스 상대자가 등장할 경우 새로운 규칙을 설정해야 하는 부담을 해결하지 못한다.본 논문에서는 ISO/IEC 11179에 기반을 둔 MDR(Metadata Registry)를 이용한 MDR 기반하이브리드(Hybrid) 프레임워크 (Framework)를 제안한다 본 하이브리드 구조의 프레임워크를 통하여 기존의 수평적 관계의 프레임워크가 갖고 있는 비즈니스 프로세스 및 메시지 규칙의 문제점들을 해결할 수 있다.

• 전자공학회논문지A
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• 제32A권7호
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• pp.36-42
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• 1995

In this paper, the CAD program for designing the microwave waveguide narrow-band bandpass filters has been developed by the passband correction method with filter synthesis for the MDR(Microwave Digital Relay) system. Here, the modified double E-plane structures are employed in the filter structure which is analyzed by the variational method. Using the developed CAD program, 0.01dB equi-ripple chebyshev type 6-section bandpass filters used in the MDR system operating nationally is designed at the center frequency of 11.0GHz, fabricated with tunable type and then measured by tuning process. The experimantal results show good agreements with the theoretical results.

• Communications for Statistical Applications and Methods
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• 제17권5호
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• pp.667-678
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• 2010

인간의 유전자 상호작용을 분석하기 위해 제시된 다중인자 차원축소방법은 연속형자료에는 적용할 수 없다. 그래서 이를 보완한 CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법이 제안되었다. 하지만 CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법의 검정력이 밝혀지지 않았다. 따라서 본 연구에서는 모의실험을 통하여 CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법의 우수한 검정력을 평가하고, 확인된 검정력을 바탕으로 실제 한우 데이터에 적용하여 한우의 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자조합을 규명하였다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권9호
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• pp.4807-4814
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• 2012

Purpose: The chemoresistance of human hepatocellular carcinoma (HCC) to cytotoxic drugs, especially intrinsic or acquired multidrug resistance (MDR), still remains a major challenge in the management of HCC. In the present study, possible mechanisms involved in MDR of HCC were identified using a 5-fluorouracil (5-FU)-resistant human HCC cell line. Methods: BEL-7402/5-FU cells were established through continuous culturing parental BEL-7402 cells, imitating the pattern of chemotherapy clinically. Growth curves and chemosensitivity to cytotoxic drugs were determined by MTT assay. Doubling times, colony formation and adherence rates were calculated after cell counting. Morphological alteration, karyotype morphology, and untrastructure were assessed under optical and electron microscopes. The distribution in the cell cycle and drug efflux pump activity were measured by flow cytometry. Furthermore, expression of potential genes involved in MDR of BEL-7402/5-FU cells were detected by immunocytochemistry. Results: Compared to its parental cells, BEL-7402/5-FU cells had a prolonged doubling time, a lower mitotic index, colony efficiency and adhesive ability, and a decreased drug efflux pump activity. The resistant cells tended to grow in clusters and apparent changes of ultrastructures occurred. BEL-7402/5-FU cells presented with an increased proportion in S and G2/M phases with a concomitant decrease in G0/G1 phase. The MDR phenotype of BEL-7402/5-FU might be partly attributed to increased drug efflux pump activity via multidrug resistance protein 1 (MRP1), overexpression of thymidylate synthase (TS), resistance to apoptosis by augmentation of the Bcl-xl/Bax ratio, and intracellular adhesion medicated by E-cadherin (E-cad). P-glycoprotein (P-gp) might play a limited role in the MDR of BEL-7402/5-FU. Conclusion: Increased activity or expression of MRP1, Bcl-xl, TS, and E-cad appear to be involved in the MDR mechanism of BEL-7402/5-FU.