• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권1호
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• pp.405-408
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• 2013

Oncoprotein Bcl-3 is perceived as an unusual member of $I{\kappa}B$ family since it can both stimulate and suppress NF-${\kappa}B$ activation. Aberrant Bcl-3 results in increased cell proliferation and survival, suggesting a contribution to malignant potential and elevated levels of Bcl-3 have been observed in many HTLV-1-infected T cell lines and ATL cells. To investigate the specific roles of Bcl-3 in HTLV-1-infected cells, we knocked down Bcl-3 expression using shRNA and then examined the consequences with regard to DNA damage and cell proliferation, as well as NF-${\kappa}B$ activation. The HTLV-1 encoded protein Tax promotes Bcl-3 expression and nuclear translocation. In HTLV-1-infected cells, Bcl-3 knockdown obviously induced DNA damage. Cell growth and NF-${\kappa}B$ activation were reduced in HTLV-1-infected or Tax positive cells when Bcl-3 expression was decreased. Together, our results revealed positive roles of Bcl-3 in DNA stabilization, growth and NF-${\kappa}B$ activation in HTLV-1-infected cells.

• International Journal of Oral Biology
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• 제38권1호
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• pp.29-36
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• 2013

Mitis group streptococci (MGS) were classified based on the nucleotide sequences 16S rRNA gene (16S rDNA) and comprised 13 Streptococcus species. However, 16S rDNA homogeneity among MGS was too high to discriminate between clinical strains at the species level, notably between Streptococcus mitis, Streptococcus oralis, Streptococcus pneumoniae, and Streptococcus pseudopneumoniae. The purpose of this study was to discriminate between 37 strains of MGS isolated from Korean oral cavities using phylogenetic analysis of the DNA-dependant RNA polymerase beta-subunit gene (rpoB). 16S rDNA and rpoB from clinical strains of MGS were sequenced using the dideoxy chain termination method and analyzed using MEGA version 5 software. The resulting phylogenetic data showed that the rpoB sequences could delineate clinical strains of MGS at the species level. Phylogenetic analysis of rpoB is therefore a useful approach for identifying MGS at the species level.

• KSBB Journal
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• 제17권6호
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• pp.577-581
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• 2002

풍부한 식물의 화분을 이용하여 재조합단백질의 생산연구를 위하여 UreB 단백질 정보를 지닌 1.7 kb DNA를 Helicobacter pylori urease gene cluster를 지니는 pH808로보터 PCR을 통하여 증폭하고 이를 CaMV35S promoter에 연결하여 백합(Lilium longiflorum)화분내로 도입하고 기내배양을 실시하였다. 발아초기의 화분을 Agrobacterium과 함께 진공침윤시켜 ureB DNA를 형질전환시키고 kanamycin을 지니는 화분배지에서 16-24시간 배앵하여 완전한 화분관신장을 이루도록 하였다. 이들 형질전환화분의 유전자도입 및 발현을 분석하였으며 그 결과 기내배양하는 하분을 일회성의 단백질공장으로 이용할 수 있다는 가능성을 제시하였다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제30권5호
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• pp.802-805
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• 2001

산업적으로 lysine 발효 산업에 이용되고 있는 B. lactofermentum으로부터 lysine 생합성에 관여하는 tetrahyrodipicolinate N-succinyl transferase를 지령하는 dapD 유전자를 E. coli의 dapD 결손변이주와의 complementation test를 통하여 cloning하였다. 재조합 plamid는 3.6 kb의 DNA 단편을 함유하고 있었으며 Southern blot hybridization을 통하여 dapD 유전자는 B. lactofermentum으로부터 유래하였으며 염색체 DNA내에 single copy로 존재함을 알 수 있었다. 또한 lysine 생성량 분석을 통하여 E. coli에서 B. lactofermentum dapD 유전자의 발현을 확인하였다.

• 생명과학회지
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• 제25권11호
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• pp.1204-1213
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• 2015

도루묵은 우리나라 동해에서 어획되는 상업적으로 중요한 수산자원으로 동해안의 자원회복관리 대상어종이며, 자원량의 회복 및 보전과 관리가 필요한 어종이다. 하지만 우리나라 도루묵 자원의 관리를 위한 유전학적 분석에 따른 연구는 매우 미비한 실정이다. 따라서 본 연구는 mitochondrial DNA의 Cytochrome b (Cyt b) 유전자 서열과 5개의 microsatellite marker의 유전자형을 토대로 우리나라 동해안 도루묵과 일본 도루묵의 유전적 다양성과 집단 구조를 분석하여 유전학적 유연관계를 파악하고, 도루묵 자원의 보전과 관리를 위한 과학적 자료를 제공하기 위해 실시하였다. 한국 3개 지역(독도, 동해, 감포)과 일본의 2개 지역(북해도와 에리모)에서 채집된 총 83개 개체의 mtDNA Cyt b 영역을 분석하여 27개의 haplotype을 확인하였다. 유전적 다양성은 에리모에서 가장 높고 감포에서 가장 낮았다. Pairwise F_ST값과 유전적 거리, UPGMA와 주성분분석, AMOVA test 및 structure 분석 결과, 한국의 동해안 도루묵 집단 간 유전적 차이는 거의 없었으나 일본 도루묵 집단과는 유의적인 차이가 나타났으며(p<0.05), 한국의 동해안 집단과 일본의 집단으로 그룹을 형성하며 구분되는 유연관계를 확인하였다. 본 연구에서 확인된 도루묵의 유전적 특성 및 집단 간 유연관계는 중요한 수산유전자원으로서의 도루묵에 대한 중요한 과학적인 근거자료가 될 것이며, 앞으로 도루묵의 보존, 평가 및 이용에 활용 가능한 정보를 제공할 것이라 사료된다.

• BMB Reports
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• 제34권6호
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• pp.489-495
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• 2001

DNA damage by UV and environmental agents are the major cause of genomic instability that needs to be repaired, otherwise it give rise to cancer. Accordingly, mammalian cells operate several DNA repair pathways that are not only responsible for identifying various types of DNA damage but also involved in removing DNA damage. In mammals, nucleotide excision repair (NER) machinery is responsible for most, if not all, of the bulky adducts caused by UV and chemical agents. Although most of the proteins involved in NER pathway have been identified, only recently have we begun to gain some insight into the mechanism by which proteins recognize damaged DNA. Binding of Xeroderma pigmentosum group C protein (XPC)-hHR23B complex to damaged DNA is the initial damage recognition step in NER, which leads to the recruitment of XPA and RPA to form a damage recognition complex. Formation of damage recognition complex not only stabilizes low affinity binding of XPA to the damaged DNA, but also induces structural distortion, both of which are likely necessary for the recruitment of TFIIH and two structure-specific endonucleases for dual incision.

• Journal of Ginseng Research
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• 제13권1호
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• pp.37-41
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• 1989

Benzo(a)pyrene(BP)의 monooxygenase(AHH)에 의해서 생성된 반응성 대사물질들의 in vitro DNA와의 결합 및 BP 대사에 관여하는 효소들의 활성도에 미치는 인삼 물추출물의 영향을 조사하였으며, DNA-BP metabolite adduct들은 Sephadex LH-20 column으로 chromatography하여 5개의 major peak 들을 얻었다. 이 peak 들을 극성이 큰 순서대로 A부터 E까지 임의로 정하고 5개의 peak들을 7,8-diol-9,10-oxide(A), 7,8-oxide(B). 4,5-oxide(C), 9-HO-BP(D & E) adduct들로 잠정적으로 확인하였다. Peak A, C, D 그리고 E는 각각 대조군의 30, 15, 20 그리고 30%로 감소되었으며 peak B는 의미있는 변화를 보이지 않았다. DNA-BP 결합 억제와 관련하여 in vitro와 in vivo 투여시의 경향이 유사하여 EH의 활성도만 BP투여 대조군보다 38%정도 의미있게 유도되었다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제49권9호
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• pp.983-986
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• 2006

목 적 : 소아 임파선염의 흔한 원인균의 하나로 잘 알려진 Bartonella henselae는 주로 고양이 벼룩에 감염된 고양이와의 접촉을 통하여 병을 일으키는 것으로 알려졌지만, 최근에는 개도 보유 숙주임이 확인되었다. 국내의 CSD증례 보고들에서는 고양이보다 개와 접촉한 경우가 더 많은 것으로 보고되었다. 하지만 국내에서는 개나 고양이 또는 매개체인 고양이 벼룩 등에서 B. henselae가 확인된 경우가 아직 없었다. 이에 저자들은 개에게서 얻은 벼룩을 대상으로 B. henselae DNA가 존재하는지 알아보기 위하여 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 전체 22마리의 개에서 얻은 총 42마리의 벼룩을 대상으로 연구를 시행하였다. 각각의 벼룩에서 DNA를 추출한 다음 B. henselae의 pap31 부위 유전자를 이용한 시발체를 사용하여 seminested PCR을 시행하였다. 결 과 : B. henselae DNA는 전체 22마리 중 4마리의 개(18.2%)에서 추출되었던 벼룩 42마리 중 7마리(16.7%)에서 확인되었다. PCR 결과를 확인하기 위하여 7개의 PCR 산물에 대한 염기서열 분석을 시행하였다. 염기서열 분석에 의하면 6개는 Huston-1 유전자형이었으며, 한 개는 Marseille 유전자형이었다. 결 론 : 국내 개에서 추출된 벼룩에서 Houston-1유전자형과 Marseille 유전자형을 포함한 B. henselae DNA가 존재하는 것으로 확인할 수 있었다. 국내에서 개가 CSD의 중요한 감염 경로일 가능성을 제시한 점에 의의가 있지만, 충분한 수의 고양이 및 개에서 얻은 혈청과 벼룩을 대상으로 한 추가적인 연구가 필요할 것으로 생각된다.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제49권4호
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• pp.143-147
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• 2006

A rapid PCR-based assay for detecting hepatitis B viral DNA(HBV DNA) in serum and plasma was developed using a new PCR instrument named GenSpector(TMC-1000, Samsung electronics). PCR was carried out using a chip-based platform, which enabled 50 PCR cycles with internal controls, and melting-curve analysis in 30 minutes. Verification of the amplified HBV DNA product and the internal control was based on specific melting temperatures(Tm) analysis, executed by the GenSpector software. Primers were designed within the region conserved through HBV genotypes A to F. The lower limit of detection was 840 copies/ml serum, conducted with serial dilutions of a HBV DNA positive control(ACCURUN 325 series 700, Boston Biomedica Inc.). The assay was also compared to another assay for HBV DNA(Versant HBV DNA 3.0 assay, Bayer HealthCare) for 200 samples(each 100 clinical negative and positive samples). The sensitivity and specificity were 100% matched. This rapid PCR-based assay is specific, reproducible, and enables qualitative detection of HBV DNA.

• 대한화장품학회지
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• 제48권1호
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• pp.33-38
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• 2022

자외선인 ultraviolet B (UVB)는 피부각질세포의 DNA 잔기에 손상을 준다. 특히, DNA의 pyrimidine 잔기 손상인 cyclobutane pyrimidine dimers (CPD)의 형성은 피부 광노화의 대표적인 지표로 여겨진다. 본 연구에서는 피부 각질세포에서 UVB에 의한 DNA 손상을 완화 시키는 소재로 감초추출물(Glycyrrhiza glabra extract, G. glabra extract)의 효능을 확인하였다. 먼저 피부각질세포에서 UVB 의존적으로 CPD형성이 증가하는 것을 확인하였다. 이후 감초추출물에 의해 UVB 유발 CPD 형성이 유의하게 줄어드는 것을 확인할 수 있었다. 추가로 DNA 손상회복 인자의 mRNA 발현이 감초추출물에 의해 증가하는 것도 확인하였다. 결론적으로 본 연구를 통해 감초추출물의 피부각질세포에서의 DNA 보호 효과를 확인할 수 있었다.