Moslemi, Azam;Mahjub, Hossein;Saidijam, Massoud;Poorolajal, Jalal;Soltanian, Ali Reza
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제17권1호
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pp.95-100
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2016
Background: Survival time of lymphoma patients can be estimated with the help of microarray technology. In this study, with the use of iterative Bayesian Model Averaging (BMA) method, survival time of Mantle Cell Lymphoma patients (MCL) was estimated and in reference to the findings, patients were divided into two high-risk and low-risk groups. Materials and Methods: In this study, gene expression data of MCL patients were used in order to select a subset of genes for survival analysis with microarray data, using the iterative BMA method. To evaluate the performance of the method, patients were divided into high-risk and low-risk based on their scores. Performance prediction was investigated using the log-rank test. The bioconductor package "iterativeBMAsurv" was applied with R statistical software for classification and survival analysis. Results: In this study, 25 genes associated with survival for MCL patients were identified across 132 selected models. The maximum likelihood estimate coefficients of the selected genes and the posterior probabilities of the selected models were obtained from training data. Using this method, patients could be separated into high-risk and low-risk groups with high significance (p<0.001). Conclusions: The iterative BMA algorithm has high precision and ability for survival analysis. This method is capable of identifying a few predictive variables associated with survival, among many variables in a set of microarray data. Therefore, it can be used as a low-cost diagnostic tool in clinical research.
Li, Chun-Hong;Liu, Mei-Yan;Liu, Wei;Li, Dan-Dan;Cai, Li
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제15권2호
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pp.731-736
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2014
Objective: To observe the short-term efficacy, long-term survival time and adverse responses with nedaplatin (NDP) or cisplatin (DDP) concomitant with other chemotherapy in treating non-small cell lung cancer. Materials and Methods: A retrospective, randomized, control study was conducted, in which 619 NSCLC patients in phases III and IV who were initially treated and re-treated were randomly divided into an NDP group (n=294) and a DDP group (n=325), the latter being regarded as controls. Chemotherapeutic protocols (CP/DP/GP/NP/TP) containing NDP or DDP were given to both groups. Patients in both groups were further divided to evaluate the clinical efficacies according to initial and re-treatment stage, pathological pattern, type of combined chemotherapeutic protocols, tumor stage and surgery. Results: The overall response rate (ORR) and disease control rate (DCR) in the NDP group were 48.6% and 95.2%, significantly higher than in the DDP group at 35.1% and 89.2%, respectively (P<0.01). In NSCLC patients with initial treatment, squamous carcinoma and phase III, there were significant differences in ORR and DCR between the groups (P<0.05), while ORR was significant in patients with adenocarcinoma, GP/TP and in phase IIIa (P<0.05). There was also a significant difference in DCR in patients in phase IIIb (P<0.05). According to the statistical analysis of survival time of all patients and of those in clinical phase III, the NDP group survived significantly longer than the DDP group (P<0.01). The rates of decreased hemoglobin and increased creatinine, nausea and vomiting in the NDP group were evidently lower than in DDP group (P<0.05). Conclusion: NDP concomitant with other chemotherapy is effective for treating NSCLC, with higher clinical efficacy than DDP concomitant with chemotherapy, with advantages in prolonging survival time and reducing toxic and adverse responses.
In order to study process of spermiogenesis of the Korean greater horseshoe bat, Rhinolophus ferrumequinum korai, the cycle of seminiferous epithelium was examined by the light and electron microscope and the following results were obtained based on the epithelial cell differentiation. 1. Spermiogenesis occurred from early July to mid-Octber, and spermatogenic activity was vigorous from mid-August to late September. Spermatocytes including spermatogonia were found to be degenerated in only July. It is deduced that the degeneration serves as the mechanism to regulate effective use of energy to prepare for mating and hibernating periods, and regulation of breeding cycle. 2. Spermiogenesis of the Korean greater horseshoe bat was divided according to differentiation of the cell structure, into Golgi, cap, acrosome, maturation and spermiation phases; Golgi, cap and spermiation phases were further divided into two steps of early and late phase respectively, and acrosome phase into three steps of early, mid and late phases, and maturation phase has only one step. Hence, the spermiogenesis consists of ten phases. The first research was done in this article on the changes of chromatin with nucleus, the time of appearance and disappearance of chromatin granules, in case of Korean greater horseshoe bat (Rhinolophus ferrumequinum korai). Chromatin granule began to be condensed in late Golgi and the condensation proceeded to form an irregular mass of a electron-dense chromatin in a form of circular cylinder in the center of nucleus at the phase of maturation. Finally, the chromatin condensation proceeded and perfect nucleus of sperm with homogeneous density was formed when the sperm was separated from Sertoli cell. Therefore, appearance and disappearance of chromatin granules occurred in the period of time between late Golgi and maturation phase, The tail of sperm began to develop in early cap phase, Numerous lipid droplets were obseved in the cytoplasm of spermatids during the maturation phase, which seemed to be used as energy source necessary to make mature sperm during spermiogenesis.
Thyroid hormones are important for the development of the brain including the cerebellum. In the present study, we investigated the effect of treadmill exercise on the survival of Purkinje neurons and the activation of astrocytes in the cerebellar vermis of hypothyroidism-induced rat pups. On the day of perinatal 14, pregnant rats were divided into two groups (n = 5 in each group): the pregnant control group and the pregnantmethimazole (MMI)-treated group. For the induction of hypothyroidism in the rat pups, MMI was added to the drinking water (0.02% wt/vol), from the day of perinatal 14 to postnatal 49. After delivery, male rat pups born from the pregnant control group were assigned to the control group. Male rat pups born from the MMI-treated group were divided into the hypothyroidism-induction group, the hypothyroidism-induction with treadmill exercise group, and the hypothyroidism-induction with thyroxine (T4) treatment group (n = 10 in each group). The rat pups in the exercise group were forced to run on a treadmill for 30 min once a day for 4 weeks, starting on postnatal day 22. In the hypothyroidism-induced rat pups, motor coordination was reduced and Purkinje cell death and reactive astrocytes in the cerebellar vermis were increased. Treadmill exercise enhanced motor coordination, increased the survival of Purkinje neurons, down-regulated reactive astrocytes, and enhanced brain-derived neurotrophic factor (BDNF) and receptor tyrosine kinase B (TrkB) expressions in the hypothyroidism-induced rat pups. These results suggest that treadmill exercise has beneficial effects in terms of protecting against thyroid dysfunction by increasing T3 and T4 and the related protein, BDNF, as well as TrkB, inhibition on astrocyte activation and the reduction of Purkinje cell loss regarding the cerebellum in hypothyroidism rat pups.
임베디드 시스템의 저장매체 시장의 플래시 메모리의 점유율이 증가되고 반도체 산업이 성장함에 따라 플래시 메모리의 수요와 공급이 큰 폭으로 증가하고 있다. 특히 스마트폰, 테블릿 PC, SSD등 SoC(System on Chip)산업에 많이 사용되고 있다. 플래시 메모리는 셀 배열 구조에 따라 NOR-형과 NAND-형으로 나뉘고 NAND-형은 다시 Cell당 저장 가능한 bit수에 따라서 SLC(Single Level Cell)과 MLC(Multi Level Cell)로 구분된다. NOR-형은 BIST(Bulit-In Self Test), BIRA(Bulit-In Redundancy Analysis)등의 많은 연구가 진행되었지만 NAND-형의 경우 BIST 연구가 적다. 기존의 BIST의 경우 고가의 ATE 등의 외부 장비를 사용하여 테스트를 진행해야한다. 하지만 본 논문은 MLC NAND-형 플래시 메모리를 위해 제안되었던 MLC NAND March(x)알고리즘과 패턴을 사용하며 내부에 필요한 패턴을 내장하여 외부 장비 없이 패턴 테스트가 가능한 유한상태머신(Finite State Machine) 기반구조의 MLC NAND-형 플래시 메모리를 위한 BIST를 제안하여 시스템의 신뢰도 향상과 수율향상을 위한 시도이다.
This study was performed to investigate the effects of infrared and visible light laser irradiation on cell viability of human gingival fibroblast. For the present study, the author used cultured fibroblast originated from sound gingiva which were fifth of sixth passage. Laser machine utilized here were stomalaser which irradiate infrared (GaAs diode) and red (HeNe) laser in turn with pulse wave pattern or continuous wave pattern, and the machine had several frequency mode presented by regeneration, relaxation and analgesic modalities. Cultured fibroblast samples were divided by this modalities of cell counts and laser exposure time which were 7-seconds of 150 seconds, respectively. 1 day after laser irradiation, each cell-well was treated with MTT and measured optical density with ELISA. The obtained results were as follows : 1. There was a tendency of increasing optical density in proportion to irradiation time in groups of $1\times10^4$ cell per well but in groups of $5\times10^3$ cell per well, reverse phenomena were observed. 2. The difference of optical density according to frequency modalities were not showed significantly except several cases in groups of $5\times10^3$ cell per well. 3. In general, cell viability of cultured human gingival fibroblast wer not showed consistent feature by low level laser irradiation.
This study was performed to examine the anti-cancer effect of Red Ginseng in the DENGalN-PH-induced hepatic tumor model system in rats. One hundred of male SPF Sprague-Dawley rats(6weeks old) were randomly divided into five groups. Rats in groups 1, 2, 3, and 4 were administered to diethylnitrosamine intraperitoneally 200 mg/kg body weight for the caner initiation. Rats in group 5 were given to saline as a control. On two weeks after cancer initiation, rats in groups 1 and 3 were fed on diet containing 0.01% of acethylaminofiuorene(AAF) which is strong cancer-promotor for 6 weeks, while rats in groups 2 and 4 were fed on water containing 0.05% of phenobarbital which is weak cancer.promotor for 6 weeks. Rats in groups 1 and 2 were treated with diet containing 3% of Red Ginseng for six weeks(from 9th week till 15th week after cancer initiation). Rats in all groups were necropsied time-sequencially at 8, 15, and 36 weeks. The hepatic lesions of rat treated with carcinogens expressed glutathione S-transferase placental form(GST-P) at 8 week. The GST-P positive foci of rats treated with AAF were larger than that of any other rats, while the GST-P positive foci of rats treated with AAF and red ginseng were significantly decreased. This anti-cancer effect of Red ginseng might be involved in the enhacement of natural killer cell activity. To know whether there is direct relationship between Red Ginseng and natural killer cell activity, the activity of natural killer cell was examined after treatment AAF, AAF+Red ginseng and Red ginseng only, respectively. Comparing with natural killer cell activity in AAF-treated group, natural killer cell activity was significantly activated in AAF+ Red ginseng-treated group. This indicated that Red ginseng might enhance natural killer activity after treatment carcinogen in rats. These results suggested that Red ginseng might have a cancer prevention ability by promoting natural killer cell activity during hepatocarclnogenesis.
In this work, we conducted a study on cell strings of high efficiency and high power solar cell modules via simulation. In contrast to the conventional module manufacturing method, the simulation was performed by connecting cutting cells divided into four parts from 6-in size using the electrically conductive adhesive (ECA). The resistance of the ECA added in series connection was extracted using an experimental method. This resistance was found to be $3m{\Omega}$. Based on this simulation, we verified the change in efficiency of the string as a function of the number of cutting cell connections. Consequently, the cutting cell efficiency of the first 20.08% was significantly increased to 20.63% until the fifth connection; however, for further connections, it was confirmed that the efficiency was saturated to 20.8%. Connecting cutting cells using ECA improves the efficiency of the string; therefore, it is expected that it will be possible to fabricate modules with high efficiency and high power.
Purpose: These experiments were undertaken to evaluate the effect of Onpoeum on ovarian functions and differential gone expressions related with cell viabilities caspase-3, MAPK and MPG in female mice. Methods: We administered the Onpoeum to 6-week-old female ICR mice for 4, 8, or 12 days. With different concentration of Onpoeum, the female mice were injected PMSG and hCG for ovarian hyperstimulation. The mice divided into 3 different groups for each experiment. We chose the Caspase-3 for cell apoptosis, MAPK and MPG genes for cell viability and DNA repair. Results: In case of 4, 8, 12 day of Onpoeum, we were examined the mean number of total ovulated oocytes and the number of morphologically normal oocytes. We were also examined the embryonic developmental competence in vitro. In audition we were examined the differential expression of cell apoptosis, viability and DNA repair related genes, Caspase-3, MAPK and MPG according to concentration and duration of Onpoeum. From these results showed that the administration of Onpoeum played a role of prevention of cell apoptosis and DNA damages and also increased cell proliferation resulted in ovarian functions. Conclusion: It is suggested that the medication of Onpoeum may have beneficial effect on reproductive functions of female mice via prevention of cell apoptosis and DNA damaging and promotion of cell proliferation.
The purpose of this study was to detect cell death in the liver of mice treated with thioacetamide (TAA) using fluorescence bioimaging and compare this outcome with that using conventional histopathological examination. At 6 weeks of age, 24 mice were randomly divided into three groups: group 1 (G1), control group; group 2 (G2), fluorescence probe control group; group 3 (G3), TAA-treated group. G3 mice were treated with TAA. Twenty-two hours after TAA treatment, G2 and G3 mice were treated with Annexin-Vivo 750. Fluorescence in vivo bioimaging was performed by fluorescence molecular tomography at two hours after Annexin-Vivo 750 treatment, and fluorescence ex vivo bioimaging of the liver was performed. Liver damage was validated by histopathological examination. In vivo bioimaging showed that the fluorescence intensity was increased in the right upper part of G3 mice compared with that in G2 mice, whereas G1 mice showed no signal. Additionally ex vivo bioimaging showed that the fluorescence intensity was significantly increased in the livers of G3 mice compared with those in G1 or G2 mice (p < 0.05). Histopathological examination of the liver showed no cell death in G1 and G2 mice. However, in G3 mice, there was destruction of hepatocytes and increased cell death. Terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling staining confirmed many cell death features in the liver of G3 mice, whereas no pathological findings were observed in the liver of G1 and G2 mice. Taken together, fluorescence bioimaging in this study showed the detection of cell death and made it possible to quantify the level of cell death in male mice. The outcome was correlated with conventional biomedical examination. As it was difficult to differentiate histological location by fluorescent bioimaging, it is necessary to develop specific fluorescent dyes for monitoring hepatic disease progression and to exploit new bioimaging techniques without dye-labeling.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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