• 제목/요약/키워드: Differential display

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감자로부터 Eukaryotic Translation Initiation Factor 5A (elF-5A) 유전자의 동정 및 발현 분석 (Isolation and Characterization of Eukaryotic Translation Initiation Factor 5A (eIF-5A) from Potato)

  • 인준교;신동호;최관삼;양덕춘
    • 식물조직배양학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.283-287
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    • 2001
  • 감자 (Solanum tuberosum L. cv. Irish Cobbler)의 괴경형성과정 (tuberization) 동안에 발현하는 유전자들의 발현양상을 조사하고자 differential display법을 실시하였다. Differential display를 이용하여 분리된 eIF5A DNA단편을 probe로 사용하여 감자의 cDNA library screening을 통하여 eIF5A full-length cDNA를 감자에서 처음으로 분리하였다. 감자의 eIF5A, clone은 토마토의 eIF5A cDNA 염기서열과 94.8%. 아미노산 서열에서는 97.5%로 매우 높은 유사성을 나타내었다. 감자의 eIF5A 유전자는 길이가 716 bp로 하나의 단백질 code영역 (ORF)을 포함하고 있었다. 이 영역은 분자량 17.4 kD, pI 5.5로 추정되는 160개의 아미노산으로 구성된 eIF5A단백질을 code하고 있었다. eIF5A 단백질들에서 12개의 아미노산 서열 (STSKTGKHGHAK)은 효모에서 사람에 이르기까지 완벽하게 보존되어 있는 것으로 알려져 있는데, 감자에서도 또한 잘 보존되어 있었다. 이 영역은 eIF5A 단백질의 활성을 나타내는 데 있어서 필수적인 hypusine을 생성하는 전사 후 수식 부위가 들어 있는 아주 중요한 곳이다. 감자에서 eIF5A 유전자의 발현양상을 조사한 결과 감자의 전조직에서 발현을 보였는데, 성숙잎이나 괴경보다는 세포분열 및 물질축적이 활발히 일어나고 있는 꽃기관들 (stamen, ovary, petal. sepal), 과실 (fruit)과 stolen 등의 조직들에서 비교적 활발히 발현되고 있었다.

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Thermal Properties of Phosphate Glass with Additives for Barrier-Ribs in Plasma Display Panel

  • Lee, Chung-Yong;Kim, Dong-Sun;You, Young-Jin;Lee, Sang-Ho;Hwang, Seong-Jin;Kim, Hyung-Sun
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
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    • 한국정보디스플레이학회 2008년도 International Meeting on Information Display
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    • pp.823-826
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    • 2008
  • Phosphate glass added the various alkali additives is one of the substitutive materials for the barrier-ribs in plasma display panel. The results of differential thermal analysis and coefficient of thermal expansion show that the alkali oxides affect the thermal properties of phosphate glass.

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정상, 낭종 및 법랑아세포종 세포에서의 유전자 발현 차이 분석 (ANALYSIS OF DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION IN NORMAL, CYST AND AMELOBLASTOMA CELLS)

  • 양철희;백병주;양연미;김재곤
    • 대한소아치과학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.75-88
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    • 2005
  • 법랑아세포종은 1868년에 처음 보고된 이래 명칭, 발생기전, 분류 그리고 치료 방법 등에 관하여 수 많은 논란이 있어 왔는데 이는 법랑세포종이 양성종양임에도 불구하고 종양자체의 진행이 파괴적이고, 외과적 처치를 한 후에도 재발이 잘되며, 흔하지는 않지만 악성종양과 유사하게 전이를 보이는 등 독특한 특성을 지니고 있기 때문이다. 정상세포와 암 세포 간에 차이를 보이는 유전자 혹은 정상세포에서 변형이 일어날 때 특이적으로 발현하는 유전의 분리 및 분석하는 것은 암세포의 생성과정을 이해하는데 있어서 중요한 열쇠를 제공할 수 있다. 이에 본 연구는 RNA differential display 방법 중 재연성과 반복성이 개선된 Ordered differential display(ODD)RT-PCR과 보다 개선된 $GeneFishing^{TM}$기술을 이용하여 악성과 양성종양 사이의 유전자 발현의 차이를 조사하고, 특이 유전자의 profile을 확보하고자 하였다. $GeneFishing^{TM}$기술과 RT-PCR을 수행한 결과 nasopharyngeal carcinoma gene을 제외한 9개의 유전자는 악성에서 특이적으로 발현되는 것을 확인하였다. 따라서 $GeneFishing^{TM}$을 이용하면 각 시료간의 mRNA 상에서 발현차이를 보이는 DEG를 비교 분석하면 암관련 유전자, 항생제 태성 유전자, 그리고 분화 관련 유전자들에 대한 연구가 용이하게 수행할 수 있을 것으로 생각된다.

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디스플레이포트1.1a 표준 기반 멀티플 비디오 스트리밍 컨트롤러 설계 (DisplayPort 1.1a Standard Based Multiple Video Streaming Controller Design)

  • 장지훈;임상순;송병철;강진구
    • 대한전자공학회논문지SD
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    • 제48권11호
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    • pp.27-33
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    • 2011
  • 최근 디스플레이 시장이 성장하며 많은 디스플레이 장치에서 디지털 디스플레이 인터페이스를 지원하고 있는 추세다. 디스플레이포트는 차세대 디스플레이 인터페이스로서 PC, 프로젝터 및 고해상도 콘텐츠 응용 프로그램 등에 광범위하게 사용되는 연결 솔루션으로 개발이 되었으며 본 논문은 디스플레이포트 v1.1a 표준에 적합한 메인 링크의 동작을 기초로 하여 멀티플 비디오 스트리밍을 구현함으로써 디스플레이 포트의 한계점으로 지적되고 있는 Source Device와 Sink Device간의 인터페이스뿐만이 아닌 Sink Device와 Sink Device간의 인터페이스를 통해 2개 이상의 다른 이미지 데이터를 디스플레이 포트 v1.1a 표준에서 명시되어있는 4개의 Lane에서 별도의 Lane의 추가 없이 한 번에 전송함으로 2대 이상의 디스플레이 장치에 출력이 가능하도록 구현하였다. 설계된 시스템은 Verilog HDL로 설계 되었으며, 설계된 멀티플 비디오 스트리밍 IP는 Altera Audio/Video 개발 보드(Stratix II GX FPGA Chip)를 이용하여 Quartus II 소프트웨어를 이용해 합성한 결과 6,222 ALUTs와 6,686 레지스터, 999,424 비트의 메모리를 사용하였으며, 최대 동작 속도는203MHz의 성능을 확인 하였다.

가상환경에서 VDU와 HMD에 대한 생리학적 영향에 관한 연구 (Physiological Effects of the VDU & HMD in Virtual Environments)

  • 이창민;박시현
    • 산업공학
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    • 제16권2호
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    • pp.149-155
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    • 2003
  • The focus of this study is to investigate how personal display systems - a VDU (Visual Display Unit) and an HMD (Head Mounted Display) physiologically affect the body in virtual environments, and to evaluate differential effects of using the VDU and the HMD on physiological responses to mental stressful tasks (virtual reality flight simulation). As physiological variables, autonomic measures (heart rate, blood pressure), immune cells (leukocyte, neutrophil, lymphocyte), and hormones (catecholamine) were measured before and after experiments. Physiological data were measured in order to compare a level of mental stress on the VDU and the HMD. Increments in blood pressure (systolic (p<0.05), diastolic (p<0.1)), norepinephrin (catecholamine) (p<0.005), and neutrophils (p<0.2) of the group using the HMD showed a significant difference with the group using the VDU. Although, the heart rate was not statistically significant between two environments, differences of them quietly increased on the HMD more than on the VDU.

Identification of Differentially Expressed Genes in Murine Hippocampus by Modulation of Nitric Oxide in Kainic Acid-induced Neurotoxic Animal Model

  • Suh, Yo-Ahn;Kwon, O-Min;Yim, So-Young;Lee, Hee-Jae;Kim, Sung-Soo
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제11권4호
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    • pp.149-154
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    • 2007
  • Kainic acid (KA) causes neurodegeneration, but no consensus has been reached concerning its mechanism. Nitric oxide may be a regulator of the mechanism. We identified differentially expressed genes in the hippocampus of mice treated with kainic acid, together with or without L-NAME, a nonselective nitric oxide synthase inhibitor, using a new differential display PCR method based on annealing control primers. Eight genes were identified, including clathrin light polypeptide, TATA element modulatory factor 1, neurexin III, ND4, ATPase, $H^+$ transporting, V1 subunit E isoform 1, and N-myc downstream regulated gene 2. Although the functions of these genes and their products remain to be determined, their identification provides insight into the molecular mechanism(s) involved in KA-induced neuronal cell death in the hippocampal CA3 area.

Cloning and Characterization of Genes Controlling Flower Color in Pharbitis nil Using AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) and DDRT (Differential Display Reverse Transcription)

  • Kim, Eun-Mi;Jueson Maeng;Lim, Yong-Pyo;Yoonkang Hur
    • Journal of Photoscience
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    • 제7권2호
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    • pp.73-78
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    • 2000
  • To analyze molecular traits determining pigmentation between Pharbitis nill violet and white, Amplified Fragment Length Polymorphism(AFLP) and Differential Display Reverse Transcription(DDRT) experiments were carried out with either genomic DNAs or total RNAs isolated from both plants. Results of AFLP experiment in combination of 8 EcoRⅠ primers with 6 MseⅠ primers showed 41 violet-and 60 white-specific DNA bands. In the subsequent experiment, 22 violet-and 22 white-specific DNA fragments were amplified by PCR with DNAs eluted. The sizes of the fragments range from 200 to 600bp. DDRT using total RNA produced 19 violet-and 17 white-specific cDNA fragments, ranging from 200 to 600bp. The fragments obtained by both AFLP and DDRT had been cloned into pGEM T-easy vector, amplified and subjected to the nucleotide sequence analyses. As a result of Blast sequence analysis, most of them sequenced up to date showed no similarity to any Known gene, while few has similarity to known animal or plant genes. An AFLP clone V6, for example, has a strong sequence similarity to the human transcription factor LZIP-alpha mRNA and a DDRT clone W19 to Solanum tuberosum 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase mRNA.

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Identification of An Antibacterial Gene by Differential Display from Lipopolysaccharide-Stimulated Dung Beetle, Copris tripartitus

  • Suh, Hwa-Jin;Kim, Yeon-Ju;Bang, Hea-Son;Yun, Eun-Young;Kim, Seong-Ryul;Park, Kwan-Ho;Kang, Bo-Ram;Kim, Ik-Soo;Jeon, Jae-Pil;Hwang, Jae-Sam
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제17권2호
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    • pp.223-228
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    • 2008
  • A novel beetle antimicrobial protein from stimulated Copris tripartitus and the corresponding gene were isolated in parallel through differential display-PCR and expression in Escherichia coli. To find cDNA clones responsible for bacteria resistance, the suppression subtractive hybridization and GeneFishing differentially expressed genes system were employed in the dung beetle, Copris tripartitus immunized with lipopolysaccaride. One cDNA clone from eight subtracted clones was selected through dot blot analysis and confirmed by northern blot analysis. The 516-bp, selected cDNA clone was determined by 5' and 3' rapid amplication of cDNA ends and cloned into the GST fusion expression vector pGEX-4T-1 for expression of the protein. The expressed protein was predicted 14.7 kDa and inhibited the growth of gram-negative bacteria such as Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa. These results implied that the expressed protein is related to immune defense mechanism against microorganism.

옻추출물 처리에 의한 U937 세포에서의 특정 RNA 발현 양상 (Isolation and Elucidation of Specific RNAs by Treatment of Rhus verniciflua Stokes Extract to U937 Cell)

  • 정미영;오세욱
    • 한국식품과학회지
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    • 제40권5호
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    • pp.593-598
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    • 2008
  • 사람의 혈액 내의 단핵구 U937을 모델시스템으로 이용하여 옻추출물 처리에 의해 발현이 조절되는 특정 유전자를 탐색하였다. DDRT-PCR을 이용하여 옻 추출물 처리 시 발현이 감소되는 클론을 하나 얻을 수 있었으며 이를 클로닝하고 염기서열 분석을 실시하였다. 그 결과 얻어진 유전자는 H2A histone family의 member Z와 100% 유사성이 있는 것으로 나타났다. 이 단백질은 특정 조건 하에서 특정한 유전자 발현을 증가시키는 역할을 하는 것으로 보고되고 있으나, 보다 정확한 작용기작을 알아내기 위해서는 유전자 관계 파악을 위하여 향후 계속적인 연구가 필요함을 알 수 있었다.