• 제목/요약/키워드: Detection Mechanism

검색결과 850건 처리시간 0.025초

A Comprehensive Review of Lipidomics and Its Application to Assess Food Obtained from Farm Animals

  • Song, Yinghua;Cai, Changyun;Song, Yingzi;Sun, Xue;Liu, Baoxiu;Xue, Peng;Zhu, Mingxia;Chai, Wenqiong;Wang, Yonghui;Wang, Changfa;Li, Mengmeng
    • 한국축산식품학회지
    • /
    • 제42권1호
    • /
    • pp.1-17
    • /
    • 2022
  • Lipids are one of the major macronutrients essential for adequate growth and maintenance of human health. Their structure is not only complex but also diverse, which makes systematic and holistic analyses challenging; consequently, little is known regarding the relationship between phenotype and mechanism of action. In recent years, rapid advancements have been made in the fields of lipidomics and bioinformatics. In comparison with traditional approaches, mass spectrometry-based lipidomics can rapidly identify as well as quantify >1,000 lipid species at the same time, facilitating comprehensive, robust analyses of lipids in tissues, cells, and body fluids. Accordingly, lipidomics is now being widely applied in various fields, particularly food and nutrition science. In this review, we discuss lipid classification, extraction techniques, and detection and analysis using lipidomics. We also cover how lipidomics is being used to assess food obtained from livestock and poultry. The information included herein should serve as a reference to determine how to characterize lipids in animal food samples, enhancing our understanding of the application of lipidomics in the field in animal husbandry.

Investigation of Immunostimulatory Effects of Heat-Treated Lactiplantibacillus plantarum LM1004 and Its Underlying Molecular Mechanism

  • Bae, Won-Young;Jung, Woo-Hyun;Shin, So Lim;Kwon, Seulgi;Sohn, Minn;Kim, Tae-Rahk
    • 한국축산식품학회지
    • /
    • 제42권6호
    • /
    • pp.1031-1045
    • /
    • 2022
  • Postbiotics are defined as probiotics inactivated by heat, ultraviolet radiation, sonication, and other physical or chemical stresses. Postbiotics are more stable than probiotics, and these properties are advantageous for food additives and pharmacological agents. This study investigated the immunostimulatory effects of heat-treated Lactiplantibacillus plantarum LM1004 (HT-LM1004). Cellular fatty acid composition of L. plantarum LM1004 isolated form kimchi was analyzed by gas chromatography-mass spectrometry detection system. The nitric oxide (NO) content was estimated using Griess reagent. Immunostimulatory cytokines were evaluated using enzyme-linked immunosorbent assay. Relative protein expressions were evaluated by western blotting. Phagocytosis was measured using enzyme-labelled Escherichia coli particles. L. plantarum LM1004 showed 7 kinds of cellular fatty acids including palmitic acid (C16:0). The HT-LM1004 induced release of NO and upregulated the inducible NO synthase in RAW 264.7 macrophage cells. Tumor necrosis factor-α and interleukin-6 levels were also increased compared to control (non-treated macrophages). Furthermore, HT-LM1004 modulated mitogen-activated protein kinase (MAPK) subfamilies including p38 MAPK, extracellular signal-regulated kinase 1/2, and c-Jun N-terminal kinase. Therefore, these immunostimulatory effects were attributed to the production of transcriptional factors, such as nuclear factor kappa B (NF-κB) and the activator protein 1 family (AP-1). However, HT-LM1004 did not showed significant phagocytosis of RAW 264.7 macrophage cells. Overall, HT-LM1004 stimulated MAPK/AP-1 and NF-κB expression, resulting in the release of NO and cytokines. These results will contribute to the development of diverse types of food and pharmacological products for immunostimulatory agents with postbiotics.

Protective effect of Buddha's Temple extract against tert-butyl hydroperoxide stimulation-induced oxidative stress in DF-1 cells

  • Eun Hye Park;Sung-Jo Kim
    • Animal Bioscience
    • /
    • 제36권7호
    • /
    • pp.1120-1129
    • /
    • 2023
  • Objective: This study aimed to determine the protective efficacy of Buddha's Temple (BT) extract against tert-butyl hydroperoxide (t-BHP)-induced oxidative stress in Gallus gallus chicken embryo fibroblast cell line (DF-1) and its effects on the cell lipid metabolism. Methods: In this experimental study, Gallus gallus DF-1 fibroblast cells were pretreated with BT 10-7 for 24 hours, followed by their six-hour exposure to t-BHP (100 μM). Water-soluble tetrazolium salt-8 (WST-8) assays were performed, and the growth curve was computed. The intracellular gene expression changes caused by BT extract were confirmed through quantitative polymerase chain reaction (qPCR). Flow cytometry, oil red O staining experiment, and thin-layer chromatography were performed for the detection of intracellular metabolic mechanism changes. Results: The WST-8 assay results showed that the BT pretreatment of Gallus gallus DF-1 fibroblast cell increased their cell survival rate by 1.08%±0.04%, decreased the reactive oxygen species (ROS) level by 0.93%±0.12% even after exposure to oxidants, and stabilized mitochondrial activity by 1.37%±0.36%. In addition, qPCR results confirmed that the gene expression levels of tumor necrosis factor α (TNFα), TIR domain-containing adapter inducing IFN-beta (TICAM1), and glucose-regulated protein 78 (GRP78) were regulated, which contributed to cell stabilization. Thin-layer chromatography and oil red O analyses showed a clear decrease in the contents of lipid metabolites such as triacylglycerol and free fatty acids. Conclusion: In this study, we confirmed that the examined BT extract exerted selective protective effects on Gallus gallus DF-1 fibroblast cells against cell damage caused by t-BHP, which is a strong oxidative inducer. Furthermore, we established that this extract significantly reduced the intracellular ROS accumulation due to oxidative stress, which contributes to an increase in poultry production and higher incomes.

단백질 2차 구조를 이용한 유사 GPCR 검출에 관한 연구 (A Study on the Detection of Similarity GPCRs by using protein Secondary structure)

  • 구자효;한찬명;윤영우
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
    • /
    • 제14권1호
    • /
    • pp.73-80
    • /
    • 2009
  • GPCR(Gprotein-coupled receptors) 패밀리(family)는 세포막 단백질로서, 외부 신호를 세포막을 경유하여 세포 내로 전달하는 신호전달 기전에서 중요한 역할을 담당한다. 그러나 GPCR마다 다양하고 복잡한 조절기전을 보이며 매우 특이적인 신호전달 기전을 가지는 것으로 알려져 있다. GPCR의 구조적인 특징과 패밀리 및 서브패밀리 등은 기능별로 잘 알려져 있는데 과거 GPCR을 찾아내는 연구 중에 가장 기본이 되는 일이 주어진 단백질 서열로부터 GPCR을 분류하는 일이다. 이미 발견된 GPCR들을 가지고 수학적인 모델을 이용하여 보다 정확하게 분류하는 연구가 주로 진행되어 왔다. 본 논문에서는 단백질의 기능이 입체적 구조에 의해 결정되는 점에 착안하여 두 GPCR의 아미노산 서열의 유사도가 낮은 경우에 그 2차 구조의 서열을 비교함으로써 기존의 발견된 GPCR의 데이터베이스에서 동일한 기능을 가졌을 것으로 추정되는 미지의 GPCR을 검출하는 방법을 제안한다.

CCN 실시간 스트리밍 환경에서 효율적인 중간노드 이동성 관리 기법 (Efficient Intermediate Node mobility Management Technique in CCN Real-time Streaming Environment)

  • 김윤영;권태욱
    • 한국전자통신학회논문지
    • /
    • 제18권6호
    • /
    • pp.1073-1080
    • /
    • 2023
  • 인터넷 네트워크의 발전과 속도 개선, 이를 배경으로 한 각종 플랫폼의 발전은 다양한 콘텐츠의 생산과 소비의 급속한 확장을 불러왔다. 하지만 기존의 IP를 기반으로 한 인터넷 체계는 이런 급속한 데이터의 증가에 효율적으로 대처할 수 없는 현황이다. 이에, 콘텐츠 중심 네트워크(CCN, Contents Centric Network)라는 대안이 등장해 호스트 중심이 아닌 콘텐츠를 중심으로 보다 효율적인 데이터 송수신이 가능해졌다. 본 논문에서는 CCN의 주요 연구 분야 중 하나인 실시간 스트리밍 서비스에서의 중간노드 이동성에 대해 다룰 것이며, RSSI 감지를 통한 보다 효율적인 경로 전환을 통해 네트워크 과부하를 최소화할 것이다. 즉, 정보요청자와 정보제공자 사이에 위치한 중간노드가 이동했을 때 예비 경로를 선택하고 전환하는 방법을 개선함으로써 데이터 전송의 단절은 없으면서도 네트워크에 경로 전환으로 인한 불필요한 부하가 발생하지 않도록 관리하는 매커니즘을 제안한다.

LockPickFuzzer: ADB 기반 퍼징 기법을 활용한 안드로이드 잠금 화면 메커니즘의 취약점 탐색 (LockPickFuzzer: Exploring Vulnerabilities in Android Lock Screen Mechanisms through ADB-Based Fuzzing)

  • 고대훈;김형식
    • 정보보호학회논문지
    • /
    • 제34권4호
    • /
    • pp.651-666
    • /
    • 2024
  • 안드로이드 디바이스는 다양한 인증 방식을 제공하는 잠금 화면으로 사용자 데이터를 보호한다. 그러나 잠금 화면이 활성화된 상태에서도 Android Debug Bridge(ADB)를 통해 디바이스에 접근할 수 있다. 본 연구에서는 ADB의 특성을 활용하여 잠금 화면 보안 메커니즘을 우회할 수 있는 방법을 탐색하고자 한다. 이를 위해 ADB 명령어를 분석하고, 잠금 화면 보안을 무력화할 수 있는 명령어 조합을 자동으로 탐색하는 퍼징 테스트 도구인 LockPickFuzzer를 제안한다. LockPickFuzzer의 성능을 평가하기 위해 안드로이드 14를 탑재한 갤럭시 S23과 픽셀 8을 대상으로 실험을 진행하였다. 실험 결과, 잠금 화면의 인증 정보를 탈취하거나 우회할 수 있는 두 가지 ADB 명령 조합을 발견하였다. 이 발견된 취약점에 대해 삼성 보안팀에 리포트를 제출하였고, 한 가지 ADB 명령어 조합에 대해 삼성전자에서 공식적으로 인정받았다 (SVE-2023-1344). LockPickFuzzer는 자동으로 작동하며, 안드로이드 디바이스에서 ADB 명령어 조합으로 인한 보안 취약점을 효과적으로 탐지하는 데 기여할 것으로 기대된다.

벗김전압전류법을 이용한 카본나노튜브 전극에서의 구리 분석 (Analysis of Trace Copper Metal at The Electrode Consisting of Carbon Nanotube using Stripping Voltammetry)

  • 최장군;정영삼;김낙주;박대원;정건용;김래현;권용재
    • Korean Chemical Engineering Research
    • /
    • 제50권5호
    • /
    • pp.933-937
    • /
    • 2012
  • 본 연구에서는 환경오염을 발생시키는 주요한 중금속 물질의 하나인 구리를 상대적으로 쉽게 검출하기 위해, CNT 전극 및 벗김전압전류법을 이용하여 구리 금속의 감도 향상을 위한 최적조건 및 민감도를 평가하였다. 또한 구리의 벗김반응이 발생될 때의 반응 메카니즘에 대한 연구도 수행하였다. 이를 위해, 네모파 벗김전압전류법 및 선형주사 전압 전류법등의 전기화학적 분석법이 이용되었다. 평가 결과, 네모파 벗김전압전류법의 최적조건으로, 15 mV의 네모파증폭율, 60 Hz의 주파수, -1.0V vs. Ag/AgCl의 석출전위 및 200초의 석출시간이 결정되었다. 구리 금속의 민감도를 측정한 결과 $1.824{\mu}A/{\mu}M$의 민감도를 얻을 수 있었다. 선형주사 전압전류법을 이용하여 구리의 벗김반응에 영향을 끼치는 인자를 평가하였을 때, 확산반응 보다는 표면반응이 구리의 벗김반응 성능에 영향을 끼치는 것으로 측정되었다. 이러한 전기화학적 분석 결과가 다른 참고문헌들과 비교되어졌고, 구리금속의 민감도 측면에서 본 연구에서 제안한 CNT 전극의 우수함이 입증되었다.

급성 족 관절 골절에서 잠재 손상에 대한 족 관절경 (Ankle Arthroscopy for Occult Injuries in the Acute Ankle Fracture)

  • 최종혁;양규현;박성진
    • 대한관절경학회지
    • /
    • 제5권2호
    • /
    • pp.124-130
    • /
    • 2001
  • 목적 : 급성 족 관절 골절에서 족 관절경을 이용하여 관절내 잠재 손상의 관찰 및 발생을 예측하기 위한 인자를 알아보고자 하였다. 대상 및 방법 : 50명의 전위가 심하지 않은 급성 족 관절 환자 50명을 대상으로 전향적인 방법으로, 족 관절경을 시행하여 관절내 각 부위에서의 잠재 손상의 종류를 조사하였으며, 족 관절 골절을 Lauge-Hansen, AO 및 골절의 해부학적 위치에 따라 분류하여 특정한 유형에서 잠재 손상의 빈도가 증가되는가를 관찰하였다. 결과 : 50례의 족 관절 골절 중 37례에서 잠재 손상이 관찰되었으며, 전위된 골편을 포함한 유리체가 25례에서 관찰되었고, 31례에서 다양한 종류의 연골 손상이 관찰되었다. 방사선 사진상 관찰되지 않는 잠재 골절이 3례에서, 전하 경비 인대의 경골 부착부에서의 견열 골편이 6례에서 각각 관찰되었다. 환자의 연령, 성별, 수상기전 및 족 관절 골절의 여러 유형과 잠재 손상 발생 빈도와의 연관성은 관찰되지 않았다(p>0.05). 결론 : 단순 족 관절 골절에서 다양한 종류의 잠재 손상이 관찰되었으며, 족 관절경은 잠재 손상의 관찰뿐만 아니라 그 치료에도 매우 유용한 방법으로 사료되었으나, 족 관절 골절에서 잠재 손상의 발생을 정확히 예측하기는 어려웠다.

  • PDF

인체 S100A2 단백질에 특이적인 단일클론 항체 (Characterization of the Monoclonal Antibody Specific to Human S100A2 Protein)

  • 김재화;윤선영;김주헌;주종혁;김진숙;이영희;염영일;최용경;최인성
    • IMMUNE NETWORK
    • /
    • 제3권1호
    • /
    • pp.16-22
    • /
    • 2003
  • Background: The S100A2 gene, also known as S100L or CaN19, encodes a protein comprised of 99-amino acids, is a member of the calcium-binding proteins of EF-hand family. According to a recent study, this gene was over-expressed in several early and malignant carcinomas compared to normal tissues. To elucidate the role of S100A2 protein in the process during carcinogenesis, production of monoclonal antibody specific to the protein is essential. Methods: First, cDNA sequence coding for ORF region of human S100A2 gene was amplified and cloned into an expression vector to produce GST fusion protein. Recombinant S100A2 protein and subsequently, monoclonal antibody to the protein were produced. The specificity of anti-S100A2 monoclonal antibody was confirmed by immunoblot analysis of cross reactivity to other recombinant proteins of S100A family (GST-S100A1, GST-S100A4 and GST-S100A6). To confirm the relation of S100A2 to cervical carcinogenesis, S100A2 protein in early cervical carcinoma tissue was immunostained using the monoclonal antibody. Results: GST-S100A2 recombinant protein was purified by affinity chromatography and then fusion protein was cleaved and S100A2 protein was isolated. The monoclonal antibody (KK0723; Korean patent pending #2001-30294) to the protein was produced and the antibody did not react with other members of EF-hand family proteins such as S100A1, S100A4 and S100A6. Conclusion: These data suggest that anti-S100A2 monoclonal antibody produced in this study can be very useful for the early detection of cervical carcinoma and elucidation of mechanism during the early cervical carcinogenesis.

Cloning and Expression of Partial Japanese Flounder (Paralichthys olivaceus) IgD

  • Choi, Dae-Han;Jang, Han-Na;Ha, Dae-Mang;Kim, Jae-Wha;Oh, Chan-Ho;Choi, Sang-Hoon
    • BMB Reports
    • /
    • 제40권4호
    • /
    • pp.459-466
    • /
    • 2007
  • The cDNA sequence of the Japanese flounder (Paralychthys olivaceus) IgD has been previously reported (GenBank accession no. AB052658) and this was followed by the detection of IgD mRNA expression in some flounder organ tissues. However, it has not been determined whether the flounder IgD gene is virtually expressed into IgD protein. To characterize the flounder immunoglobulins utilized in elucidating the mechanism, evolution and diversity of the flounder immune system, antibodies specific to IgD and IgM were necessary. In the present study, partial flounder recombinant IgD (rIgD), IgM (rIgM) and the conserved regions of IgD and IgM (rCIg) were produced by cloning the cDNA sequence using isotype specific primers which were designed to produce unique fragments of IgD and IgM specific amino acid sequences. The production of recombinant Igs was ascertained by SDS-gel electrophoresis and immunoblot analysis using anti-T7$\cdot}$Taq antibody. The produced recombinant Igs were purified using affinity columns, and used as immunogens. Antibodies specific to the isotype of flounder Igs were generated by immunizing rabbits with rfIgs and the antibodies produced were identified by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and immunoblotting. Specificities of the generated antibodies were evaluated by testing cross-reactivity between recombinant IgM and IgD. By ELISA, rabbit antibodies against the rfIgD fragment (anti-rfIgD) failed to recognize any kind of flounder serum Igs, whereas respective antibodies against rfCIg (anti-rfCIg) and rfIgM fragments (anti-rfIgM) reacted with serum Igs. Likewise, in immunoblot assays, though anti-rfIgD did not, both anti-rfCIg and anti-rfIgM bound with the ~85 kd flounder IgM heavy chain. By flow cytometry analysis, anti-rfCIg, anti-rfIgD and anti-rfIgM reacted with 6%, 3% and 6.5% of cells, respectively, suggesting that flounder IgD is not secreted in serum but expressed on flounder B-like cell surfaces as in mammals. Antibodies produced against recombinant flounder Igs could be used to develop sandwich assay systems for detecting flounder Igs and for further investigating the flounder immune system.