• 한국동물학회지
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• 제33권2호
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• pp.183-190
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• 1990

본 연구는 prolactin(PRL)유전자 발현, 분비의 생리적 변화와 성주기 특정 시기의 PRL mRNA수준 및 분비에 미치는 내인성 오피오이드의 영향을 조사하였다. 최소한 두번의 연속적인 성주기를 거친 성숙한 흰쥐에서 성주기의 각 시기(10:00시)에, proestrus시기에는 10:00-20:00 시동안에는 2시간 간격으로 도살하였고, naloxone (2mg/kg b.w.)은 도살 30분전에 피하주사 하였다. PRL mRNA의 수준의 흰쥐의 PRL cDNA를 probe로 하여 RNA-blot hybridization방법에 의해서, 혈중 PRL농도 변화는 방사면역측정법에 의해 측정하였다. 뇌하수체 PRL mRNA의 수준과 혈중 PRL수준은 diestrus I, II and proestrus그리고 estrus시기의 10:00시에는 급격한 변화를 보이이 않았다. 이때 naloxone처리는 영향을 미치지 못했다. proestrus시기를 세분화하여 조사한 결과 PRL mRNA의 수준은 정오에 최고 수준에 도달하였고, 오후 6:00까지 점차적으로 감소하였다. 그후 8:00시에 다시 증가하였다. estrus동안 naloxone은 혈중의 PRL수준을 명백히 억제하였으나 PRL mRNA수준에는 영향이 없었다. proestrus시기 동안 혈중 PRL변화와 뇌하수체 PRL mRNA변화는 서로 상이하게 조절되며,PRL mRNA수준이 흰쥐 성주기 동안 변화하고 있는 사실에서 PRL 유전자 발현이 생리적으로 조절되고 있음을 시사한다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제21권3호
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• pp.237-247
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• 2017

Mammalian spermatogenesis occurs in a precise and coordinated manner in the seminiferous tubules. One of the attempts to understand the detailed biological process during mammalian spermatogenesis at the molecular level has been to identify the testis specific genes followed by study of the testicular expression pattern of the genes. From the subtracted cDNA library of rat testis prepared using representational difference analysis (RDA) method, a complimentary DNA clone encoding type III member of a DnaJ family protein, DnaJC18, was cloned (GenBank Accession No. DQ158861). The full-length DnaJC18 cDNA has the longest open reading frame of 357 amino acids. Tissue and developmental Northern blot analysis revealed that the DnaJC18 gene was expressed specifically in testis and began to express from postnatal week 4 testis, respectively. In situ hybridization studies showed that DnaJC18 mRNA was expressed only during the maturation stages of late pachytene, round and elongated spermatids of adult rat testis. Western blot analysis with DnaJC18 antibody revealed that 41.2 kDa DnaJC18 protein was detected only in adult testis. Immunohistochemistry study further confirmed that DnaJC18 protein, was expressed in developing germ cells and the result was in concert with the in situ hybridization result. Confocal microscopy with GFP tagged DnaJC18 protein revealed that it was localized in the cytoplasm of cells. Taken together, these results suggested that testis specific DnaJC18, a member of the type III DnaJ protein family, might play a role during germ cell maturation in adult rat testis.

• Journal of Photoscience
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• 제8권3_4호
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• pp.93-97
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• 2001

Heterosigma akashiwo has been reported as red-tide causing phytoplankton in the Korean coastal area during summer when they are exposed to high light. It also shows photosynthetic adaptability to strong light during culture in the laboratory. On the basis of these observations, we tried to find out some genes specifically expressed in Heterosimga akashiwo during exposure to high light, assuming that they might have some resistant mechanisms associated with light adaptation. For this purpose, we carried out DD-PCR to detect differentially expressed mRNAs from cells that had been illuminated under high light for 3 days. We found eight cDNA clones that had been expressed specificically for high light. When they were further screened by reverse Northern hybridization, three of them were identified to be positive cDNA clones. When these cDNA fragments were subjected to DNA sequencing and then their base sequences were compared to GenBank database, one of them showed sequence homology 86% identical to the partial sequence of 16S rRNA gene of eubacterium CRO-18.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제7권4호
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• pp.175-183
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• 2004

The dinoflagellate Alexandrium tamiyavanichii Balech, a producer of toxins causing paralytic shellfish poisoning (PSP), has recently been considered as one of main organisms responsible for toxication of shellfish in Japan. In this study, A. tamiyavanichii was subjected to a molecular phylogenetic analysis inferred from 28S rDNA D1-D2 sequences and a species-specific LSU rRNA-targeted oligonucleotide DNA probe was designed to identify A. tamiyavanichii using the whole cell-FISH (fluorescence in situ hybridization). The sequences of the 28S rDNA D1-D2 region of A. tamiyavanichii showed no difference from A. cohorticular AF1746l4 (present name A. tamiyavanichii) and formed a distinct clade from the 'tamarensis species complex'. The probe, TAMID2, reacted specifically with A. tamiyavanichii cultured cells, without any cross-reaction with other species belonging to the same genus, including A. tamarense, A. catenella, A. affine, A. fraterculus, A. insuetum and A. pseudogonyaulax. In a test of cross-reactivity with a field sample, TAMID2 reacted consistently with only A. tamiyavanichii, indicating that the present protocol involving the TAMID2 probe might be useful for detecting toxic A. tamiyavanichii in a simple and rapid manner.

• 한국식물병리학회지
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• 제12권3호
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• pp.285-290
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• 1996

3-hydroxy-3-methyglutaryl coenzyme A reductase (HMGR)는 phytoalexin을 포함하는 수 많은 isoprenoid화합물의 생합성을 조절하는 효소이다. 토마토의 경우 sesquiterpenoid phytoalexin류가 식물방어를 위한 반응산물로서 축적되는 것이 알려져 있다. Verticil-lium albo-atrum이나 Fusarium oxysporum으로부터 추출한 elicitor를 토마토의 배양세포에 처리하는 경우 처리량의 증가에 따른 2.7kb 크기의 HMGR mRNA의 상당한 유도증가가 토마토의 HMG2 DNA를 이용한 northern hybridization에 의해 관찰되었다. 토마토의 잎, 뿌리, 줄기 등에 기계적 상해를 가하는 경우에서도 HMGR mRNA는 2단계를 걸쳐 증가함이 관찰되었다. HMGR mRNA는 양 실험의 경우 모두 9시간에서 12시간 사이에서 최대발현됨이 관찰되었다.

• 대한수의학회지
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• 제35권3호
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• pp.515-530
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• 1995

Coronaviridae에 속하는 transmissible gastroenteritis virus(TGEV)와 porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)를 specific하게 detection할 수 있는 방법을 개발하고자 본 연구를 수행하였다. 두 바이러스 모두 RNA 바이러스이기 때문에 reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR)으로 nucleocapsid(N) protein gene의 cDNA를 증폭시켰다. SmaI으로 처리한 pTZ19R에 ligation시킨 후 염기서열을 밝히고자 sequencing하였다. 각각의 prototype virus와 비교하여 상동성을 밝혔다. 두 바이러스에 대한 cDNA probe를 제작하여 Southern blot hybridization을 실시하였다. TGEV의 경우 백신주인 P45와 병독주인 Miller strain을 사용하였다. cDNA를 증폭시키기 위해 N1/N1R과 N2/N2R 두 가지 primer를 이용한 결과, N1/N1R primer의 경우 586bp 크기의 PCR product를 얻을 수 있었고, N2/N2R primers로 582bp의 cDNA를 증폭시킬 수 있었다. PEDV 실험을 위하여 PED 임상 증상을 나타내는 분변을 이용하여 RT-PCR을 실시하였다. P2/P2R primer로 753bp의 PCR product를 얻을 수 있었다. TGEV의 두 가지 strain의 N protein gene을 sequencing하여 prototype인 Purdue strain과 염기서열 상동성을 조사한 결과, 97%이상의 높은 homology를 나타내었다. PED-V 역시 N protein gene을 sequencing하여 CV777과 염기서열 상동성을 조사한 결과 97%이상의 homology로 PEDV임을 알 수 있었다. TGEV와 PEDV의 염기서열을 비교한 결과 29%의 낮은 homology를 관찰할 수 있었다. 두 가지 바이러스의 N protein gene에 대한 cDNA probe를 제작하여 Southern blot hybridization을 한 결과, 각 바이러스에 매우 특이적 반응을 나타내었다.

• 한국수산과학회지
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• 제35권6호
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• pp.676-681
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• 2002

우리나라 주요 해산 어종인 쥐노래미 (Hexagrammos otakii)로부터 성장호르몬 유전자 CDNA를 클로닝하고 이의 염기서열과 발현 특성을 분석하였다. 뇌하수체 조직으로부터 CDNA library를 제작하였으며 membrane filter hybridization 및 expressed sequence tag기술을 이용하여 성장호르몬 CDNA transcript들을 대량 발굴하였다. 총 확보된 full-length clone 39개중 31개가 동일한 형태로 나타났으나 나머지 클론들에서는 5'쪽의 염기서열 변이, ORF내의 염기서열 삽입, 3'쪽의 여기서열의 변이 등이 검출되었다. RT-PCR과 RNA dot blot 분석을 수행한 결과 본 연구에서 얻어진 쥐노래미 성장호르몬 transcript들은 뇌하수체 특이적인 전형적인 어류 성장호르몬 발현 특성을 나타내었다.

• Radiation Oncology Journal
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• 제23권1호
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• pp.43-50
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• 2005

목적 : 자경경부암세포에서 polymeric chain reaction (PCR)원리를 이용한 suppression subtractive hybridization (SSH) 방법으로 방사선조사 시 차등 발현되는 유전자를 동정하고자 하였다. 대상 및 방법 : 자궁경부암세포주인 HeLa세포주에 방사선조사 전과 후 총 RNA와 poly $(A)^+$ mRNA를 분리였다. SSH방법으로 forward 및 reverse-subtracted cDNA libraries를 만들었다. 차등 발현된 유전자를 screening하기 위해 reverse Northern blotting (dot blot analysis)을 이용하여 각각의 library에서 88개의 클론을 선택하였고 Nothern blotting으로 확인 후 sequencing하였다. 결과 : screening상 176개 클론 중 forward-subtracted library에서 10개의 유전자가 reverse-subtracted library에서 9개의 유전자가 동정되었다. forward-subtracted library로부터 3개의 유전자가 Northern blotting에 의하여 확인되었고 이중 telomerase catalytic subunit and sodium channel-like protein 유전자와 1개의 ESTs (expressed sequence tags) 유전자가 방사선선량에 따라 증가하쳐다. 결론 : 본 연구를 통해 자궁경부암세포주에서 방사선에 의해 유도되는 유전자를 SSH 방법을 통해 동정할 수 있었다. 그러나 이러한 유전자가 어떤 생물학적인 기능을 갖고 있는지에 대한 계속적인 연구가 필요하다

• BMB Reports
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• 제36권6호
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• pp.580-585
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• 2003

Subtractive library hybridization was used to isolate the cDNA clones that corresponded to the transcripts that were specifically up-regulated during wheat embryo germination. The clones with numbers 5, 6, 7, 8, 24, and 26 appeared to be more abundant in germinating wheat embryos. Among the isolated clones, we identified four new members of the wheat "germin" gene family. We also identified two novel sequences which exhibited distinct germination up-regulation, and displayed characteristic spatial patterns of expression. One of these, represented by clone pSB10, was principally expressed in the root tissue of germinating embryos. The second was represented by the pSB7 clone and was expressed in both the root and shoot primordia of the embryonic axis, as well as within the coleoptile.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제30권1호
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• pp.15-20
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• 2002

Diacylglycerol Kinase (DGK)는 E. coli 및 진핵세포에서의 신호전달에 관여하며, 또한 미생물에서 생리적 자극에 따라 다른 발현 양상을 보이는 것으로 밝혀져 있다. Bacillus subtilis에서 이 유전자에 대한 환경에서의 자극 신호들, 즉 pH 변화, 삼투압의 변화 및 온도의 변화에 따른 발현양상을 연구하였다. 이미 동정된 dgk locus의 KpnI-HindIII의 0.45 kb의 DNA fragment를 probe로 하여 Dot blot, Northern blot analysis를 통해 발현량을 조사해 본 결과 dgk 유전자는 pH변화, 삼투압의 변화 및 온도의 변화에 대응하여 발현되는 유전자임을 알 수 있었다. 특히 낮은 pH, 고 삼투압, 및 저온에서 dgk 유전자의 발현량이 많아짐을 확인 할 수 있었다. Northern hybridization에서 약 2.5kb의 mRNA가 관찰되었다. dgk gene의 ORF size는 약 0.4 kb로 관찰된 transcript size와는 일치하지 않았다. 따라서 Streptococcus mutans의 dgk gene과 마찬가지로 B. subtilis의 dgk 유전자도 polycistronic mRNA로 발현되는 것을 추정할 수 있었으며, 염색체상의 dgk gene에서 상류의 ORF2까지의 크기가 약 2.5 kb로 관찰된 mRNA size와 동일하였다. dgk gene 상류의 ORF2영역의 0.6 kb의 DNA fragment를 probe로 하여 northern blot hybridization을 수행한 결과, 2.5 kb의 mRNA가 관찰되었으며 발현되는 형태도 dgk probe를 이용한 결과와 동일하였다. 따라서 dgk gene은 상류부위의 ORF2 gene과 operon을 형성하여 polycistronic mRNA로 전사되는 것으로 판단된다.