• 한국자원식물학회지
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• 제31권5호
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• pp.531-537
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• 2018

국내 재배종 마늘을 대상으로 상처(wound) 처리에 특이적으로 발현되는 Cyt. P450 cDNA (ORF 1,419 bp) 중 1,210~1,240 bp 사이에 존재하는 heme-binding domain (HB-domain)의 염기서열 다형성을 바탕으로 국내산 재배마늘의 HB-domain의 다형성 분포를 조사하였다. 국내 재배마늘에서 7개의 각각 다른 염기서열을 가진 HB-domain 마커를 탐색하였고, 전국 6개 지역의 재배농가에서 임의로 수집한 120개 마늘의 마커 종류별 분포도를 조사하였다. 경북, 충남, 충북, 강원지역에서 재배되는 한지형 마늘은 아미노산서열 FGGGRRICPG, DNA서열 5'-TTT/GGC/GGT/GGA/CGG/AGA/ATA/TGT/CCT/GGA-3'인 KP2형의 HB-domain을 가진 재배종이 51.3%로 가장 많이 분포하였고, KP1형 13.7%, CP형 11.3%, CM형 8.8%, KW2형 5% 및 기타 1.3%인 것으로 나타났다. 경남지역 재배지에서 수집한 난지형 마늘은 아미노산서열 FGAGRRICPG, DNA서열 '5-TTT/GGC/GCA/GGA/CGG/AGA/ATT/TGT/CCT/GGA-3'인 KM형이 52.5%로 가장 많았고, KP2형 22.5%, KW2형 5%, KP1 및 CP형이 각각 2.5%가 분포하는 것으로 나타났으나 CM형은 존재하지 않았다. 이 결과는 우리나라에 재배되는 마늘은 유전적으로 상당히 혼재된 상태로 존재하며, 특정 지역을 대표하는 유전적 특징을 가진 재배종을 단정하기는 어려운 것으로 판단된다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제34권4호
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• pp.323-329
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• 2007

토마토 형질전환체에서 NPTII 및 TPSP 유전자의 발현양상을 조사하였다. 4개 line 토마토 형질전환체가 선발배지에서 kanamycin에 저항성을 보이며 생산되었다. 그러나, 1번 line과 11번 line의 후대에서 NPTII 유전자의 발현이 억제되었으며, Kanamycin 저항성을 보이지 못했다. Southern 분석 결과, 1번 11번 line은 여러 copy의 외래 유전자를 가지고 있었으며, 2번, 10번 line은 1-2 copy의 외래유전자를 가지고 있었다. 형질전환 line 11번은 methylation sensitive 제한효소처리 후 DNA methylation 분석 결과, TPSP coding부위 및 도입유전자의 발현을 조절하는 CaMV35S 프로모터 주위에서 CpG methylation이 축적되었음이 확인되었다. 따라서 여러 copy의 외래유전자를 가진 토마토 형질전환 line 11번에서 NPTII 유전자 및 TPSP유전자의 발현이 억제된 것은 transcriptional gene silencing 기작에 의한 것으로 추정되었다.

• 한국수산과학회지
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• 제35권6호
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• pp.682-685
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• 2002

노래미와 쥐노래미의 유전적인 종 동정의 확립과 우량 품종 개발을 위한 유전 육종학적 연구의 기초 자료를 얻고자, 최근 양식 대상어로 대두되고 있는 두 어종을 대상으로 적혈구 세포와 핵의 크기, DNA 함량, 핵형 분석 등의 세포유전학적 연구를 수행하였다. 노래미의 적혈구 세포의 크기는 장, 단축이 각각 $9.76{\pm}0.27{\mu}m^2$, $6.35{\pm}0.07{\mu}m$로, 쥐노래미의 $9.17{\pm}0.05{\mu}m$, $6.2424{\pm}0.04{\mu}m$ 보다 크게 나타났으며 , 표면적과 부피 역시 노래미가 $48.62{\pm}1.74{\mu}m^2$, $213.67{\pm}7.51{\mu}m^3$로 쥐노래미의 적혈구 세포 표면적 $44.85{\pm}0.44{\mu}m^2$, 부피 $187.57{\pm}2.45{\mu}m^3$보다 큰 것으로 나타났다. 또한 노래미의 DNA 함량은 2.15$\pm$0.04pg, 쥐노래미는 2.10$\pm$0.03pg으로 핵의 크기와 유사한 양상을 나타내었다. 노래미와 쥐노래미의 염색체수는 48개로 동일한 핵형으로 구성되어 있었으며, NOR분석 결과 역시 두 종에서 1쌍의 acrocentric chromosome의 short arm에서 NOR이 확인되었다. 성별에 따른 염색체의 수적 차이나 hetero-morphic한 염색체, 그리고 개체간 염색체 다형 현상은 관찰되지 않았다.

• 미생물학회지
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• 제38권3호
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• pp.221-229
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• 2002

일본뇌염바이러스(Japanese encephalitis virus, JEV) Nakayama strain을 초기 multiplicity of infection 5.0으로 Vero세포에 감염하여 1년 이상 안정적으로 바이러스를 방출하는 지속감염(persistently-infected)세포주를 확립하였다. 지속감염 세포에서 지속적으로 방출되는 총 11 개의 Plaque 형태 변이바이러스(morphology mutants)클론을 확보하였다. 분리된 변이바이러스의 복제효율을 분석한 결과 생물학적 표현형과 복제효율은 유의하게 상관하였다. 변이바이러스 RNA 게놈 양 말단의 non-coding region 및 envelop 단백질의 ORF에서는 유의한 염기서열 변화가 관찰되지 않아 JEV 약독화에 새로운 인자가 추가로 관여할 가능성을 제시하였다. 변이바이러스에 감염된 신선한 Vero세포는 wild-type JEV의 일반적 감염성상과 다르게 대다수의 세포가 유의할 만한 세포병변현상을 나타내지 않았다. 감염된 Vero세포에서 wild-type JEV 및 large plaque을 형성하는 변이바이러스의 경우 mRNA와 함께 Bcl-2의 발현은 모두 유의하게 감소하였으며 p53은 뚜렷하게 증가하였다. 반면 small plaque을 형성하는 변이바이러스의 감염세포에서는 Bcl-2와 p53 모두 유의한 변화를 볼 수 없었다. 이상의 결과들과 함께, 감염된 Vero세포의 internucleosomal DNA fragmentation과DNA profile의 유형분석에 따르면 궁극적 인 세포병변효과의 변화는 변이바이러스의 복제효율과 더불어 p53에 비의존적인 apoptosis 수위의 전반적인 감소에 기인하는 것으로 판단된다.

• 화훼연구
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• 제18권4호
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• pp.278-283
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• 2010

본 시험은 국화에서의 기형화 발생과 DNA 메틸레이션에 관여하는 S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (SAHH) 유전자 발현과의 관련성을 검토하기 위해 수행하였다. 스프레이 국화 'Lerbin'은 단일후 14일에서 27일 사이에 고온과 장일 조건에서 기형화가 발생되어, $35/20^{\circ}C$의 고온과 14시간의 장일 처리 할 경우 $25/20^{\circ}C$(12 h/12 h)에 비해 설상화가 2배 이상 증가하는 양상을 보였다. 스프레이 국화 'Lerbin'에서 분리한 전장 cDNA (DgSAHH)는 크기가 1455 bp로 다른 작물과 90%이상의 높은 상동성을 나타내었다. 국화의 DgSAHH 유전자 발현은 기형화 발생을 유도하는 고온과 장일 조건에서 크게 감소하였다. 이러한 결과를 통해 국화의 화아 발달에 있어서 DgSAHH 유전자 발현은 온도와 일장의 영향을 받으며, 억제된 이 유전자의 발현이 기형화 발생에 관여할 수 있을 것으로 판단된다.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제4권2호
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• pp.84-87
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• 2001

Multimeric angiotensin-converting-enzyme-inhibitor (ACE}) containing a trypsin cleavable linker peptide between ACEI was constructed. We made synthetic DNA coding for the ACEI peptide with asymmetric and complementary cohesive ends of linker nucleotides. A tandemly repeated DNA cassette for the expression of concatameric short peptide multimers was constructed by ligating the basic units. The resultant multimeric peptide expressed as soluble and trypsin treated peptide was shown at the same retention time with chemically synthetic ACEI by HPLC. The present results showed that the technique developed for the production of the ACEI multimers with trypsin cleavable linker peptides can be generally applicable to the production of short peptide.

• Journal of Microbiology
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• 제44권6호
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• pp.607-616
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• 2006

Molecular characterization of ten marine cyanobacterial isolates belonging to the order Oscillatoriales was carried out using the phycocyanin locus (cpcBA-IGS) and the 16S-23S internally transcribed spacer region. DNA sequences from the phycocyanin operon discriminated ten genotypes, which corresponded to seven morphotypes identified by traditional microscopic analysis. The cpcB coding region revealed 17% nucleotide variation, while cpcA exhibited 29% variation across the studied species. Phylogenetic analyses support the conclusion that the Phormidium and Leptolyngbya genera are not monophyletic. The nucleotide variations were heterogeneously distributed with no or minimal informative nucleotides. Our results suggest that the discriminatory power of the phycocyanin region varies across the cyanobacterial species and strains. The DNA sequence analysis of the 16S-23S internally transcribed spacer region also supports the polyphyletic nature of the studied oscillatorian cyanobacteria. This study demonstrated that morphologically very similar strains might differ genotypically. Thus, molecular approaches comprising different gene regions in combination with morphological criteria may provide better taxonomical resolution of the order Oscillatoriales.

• International Journal of Oral Biology
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• 제32권1호
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• pp.7-11
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• 2007

It is difficult to introduce DNA in non-invasive manner into oral cancer cells as well as primary cells for gene manipulation and expression in vivo. So far, several methods for a gene delivery have been performed to solve this problem. Magnetofection is one of the recent methods for gene transfer, and nanoparticles are applied under a magnetic field for DNA delivery. We investigated whether the magnetofection increases the efficiency of a gene delivery into several oral cell lines. By using a plasmid coding the green fluorescent protein (GFP), the efficiency of gene transfer by magnetofection was compared with those by using the calcium phosphate and the commercial transfection agent. Indeed, the magnetofection increased the green fluorescent signal in cells, suggested that this method apparently enhance the efficiency of gene delivery without any defects in various oral cancer cell lines. Finally, we have shown that magnetofection can be a useful technique for gene delivery to difficult-to-transfect cells to perform a functional study of genes in vivo.

• Genomics & Informatics
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• 제12권3호
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• pp.87-97
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• 2014

Although the number of protein-coding genes is not highly variable between plant taxa, the DNA content in their genomes is highly variable, by as much as 2,056-fold from a 1C amount of 0.0648 pg to 132.5 pg. The mean 1C-value in plants is 2.4 pg, and genome size expansion/contraction is lineage-specific in plant taxonomy. Transposable element fractions in plant genomes are also variable, as low as ~3% in small genomes and as high as ~85% in large genomes, indicating that genome size is a linear function of transposable element content. Of the 2 classes of transposable elements, the dynamics of class 1 long terminal repeat (LTR) retrotransposons is a major contributor to the 1C value differences among plants. The activity of LTR retrotransposons is under the control of epigenetic suppressing mechanisms. Also, genome-purging mechanisms have been adopted to counter-balance the genome size amplification. With a wealth of information on whole-genome sequences in plant genomes, it was revealed that several genome-purging mechanisms have been employed, depending on plant taxa. Two genera, Lilium and Fritillaria, are known to have large genomes in angiosperms. There were twice times of concerted genome size evolutions in the family Liliaceae during the divergence of the current genera in Liliaceae. In addition to the LTR retrotransposons, non-LTR retrotransposons and satellite DNAs contributed to the huge genomes in the two genera by possible failure of genome counter-balancing mechanisms.

• 식물병연구
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• 제23권4호
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• pp.372-378
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• 2017

In this study, we identified the causative agent of post-harvest gray mold on broccoli that was stored on a farmers' cooperative in Pyeongchang, Gangwon Province, South Korea, in September 2016. The incidence of gray mold on broccoli was 10-30% after 3-5 weeks of storage at $3^{\circ}C$. Symptoms included brownish curd and gray-to-dark mycelia with abundant conidia on the infected broccoli curds. The fungus was isolated from infected fruit and cultured on potato dextrose agar. To identify the fungus, we examined the morphological characteristics and sequenced the rDNA of the fungus and confirmed its pathogenicity according to Koch's postulates. The results of the morphological examination, pathogenicity test, and sequencing of the 5.8S rDNA of the internal transcribed spacer regions (ITS1 and ITS4) and three nuclear protein-coding genes, G3PDH, HSP60, and RPB2, revealed that the causal agent of the post-harvest gray mold on broccoli was Botrytis cinerea. To our knowledge, this is the first report of post-harvest gray mold on broccoli in Korea.