우리나라의 울릉도와 독도에 분포하는 한국특산종인 섬기린초는 해안암석지대를 터전으로 넓게 분포하여 울릉도 생태계의 중요한 부분을 차지하고 있다. 본 연구는 섬기린초에 대한 엽록체 DNA의 trnL/F intergenic spacer 염기서열을 총 32개체에 대하여 조사하였다. 그 결과, 정렬된 염기서열 중 하나의 6-bp indel (-ATTCAC-)에 의하여 두 개의 type (TYPE01: 297bp과 TYPE02: 291bp)을 확인하였다. 확인된 두 개의 엽록체 DNA type은 울릉도와 독도에서 뚜렷한 지리적 분포양상을 보여주었다. TYPE01은 울릉도(15개체)에서만 관찰되었고 TYPE02는 울릉도(12개체)와 독도(5개체)에서 확인되었다. 섬기린초는 하나의 6-bp indel에 의하여 서로 다른 두 개의 엽록체 DNA haplotype이 확인되고 뚜렷한 지리적 분포양상을 보여주기 때문에, 울릉도와 독도에 자생하는 개체군 내에 진화적으로 서로 다른 두 개의 계통이 있음을 추정할 수 있고 울릉도와 독도 간 원거리 분산 기작의 가능성을 지지하였다.
어류의 insulin-like growth factor-I (IGF-I)의 생화학적 작용기작을 연구하기 위하여 한국산 조피볼락의 IGF-I cDNA 유전자 cloning을 행하였다. 완전한 cDNA 유전자 염기서열은 PCR과 RACE 방법을 통하여 얻어진 DNA로부터 결과를 얻을수 있었다. 결정된 IGF-I의 염기서열은 flounder, chinook salmon, human IGF-I의 염기서열과 비교한 결과 각각 93.6%, 90.7%, 85.4%의 높은 상동성을 보였다. 생화학적으로 활성이 있는 재조합 IGF-I을 얻기 위하여 IGF-I의 B-C-A-D domain 부분을 PCR로 얻은 뒤 E. coli BL21(DE3)에 넣어 overexpression 시켰다. Ni-NTA colummn을 사용하여 순수한 재조합 단백질을 정제할수 있었다. 정제된 단백질은 SDS-PAGE 상에서 7 kDa의 단일 band를 보여 주었으며 [$^3H$]-thymidine 결합정도를 측정하는 방법으로 활성을 가지고 있음을 확인할수 있었다.
곤충자원의 대량사육을 위한 병 발생 예방과 해충의 효과적인 방제를 위하여 흰점박이꽃무지 이병충으로부터 곤충병원 사상균을 분리하였다. 전자현미경 관찰 결과 분리균주 KMA-1은 Metharizium속의 전형적인 쇠사슬형의 분생자를 paliside-like masse에 형성하였다. 따라서, 정확한 동정을 위하여 28S rRNA와 ITS염기 서열을 바탕으로 제작한 특이 프라이머쌍을 사용하여 PCR 반응을 수행하였다. 각각의 프라이머쌍을 사용한 PCR반응으로부터 특이 밴드가 검출되었으며 이 증폭 산물들의 염기 서열을 결정, 비교하였다. 분리 균주 KMA-1의 PCR산물인 28S rRNA와 ITS DNA염기서열을 GenBank데이터베이스에 등록된 염기서열 정보와의 상동성을 검색한 결과, 모두 Metarhizium anisopliae와 가장 높은 서열 상동성을 보였다. 이상의 결과로서 본 실험에서 분리 명명된 KMA-1는 M. anisopliae로 동정되었다.
DNA 복제과정에서의 오류(error)에 의한 유전적 변이(genetic variation)를 통해 개개인이 가지고 있는 유전변이형을 조사하고 특정 질환에 대한 감수성의 차이를 밝히는 유전체 연관성 연구가 의학계 전반에 활발히 진행되고 있다. 개인 간의 DNA 상에 존재하는 염기서열의 차이를 보이는 유전적 변이를 통해 개인간의 형질이 다르게 표현 되는 것을 다형성이라고 하는데 다형성의 원인 중 염기 서열 한 쌍의 변이에 의하여 다른 형질로 표현되는 것을 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism; SNP)이라고 정의한다. 유전자 분석 기술의 놀랄만한 발전과 컴퓨터를 이용한 분석 프로그램의 개발에 의해 SNP과 질병의 연관성에 관한 연구는 의학계 모든 분야에서 가속화 되고 있다. 최근 급격하게 빨리 진척되는 연구들에 힘입어 특정 질병에 대한 특정 유전자가 가지는 위험도를 분석하고 환자를 유전적 위험도에 따라 분류하여 진단, 예방 및 치료하는 환자 맞춤식의 진료가 모든 의약학 분야에 적용 될 것으로 생각 된다. 치과 영역에서는 충치와 치주 질환과의 관련성에 대해서 초기 단계의 연구가 진행되고 있는 수준이다. 본 종설에서는 유전체 질병 연구의 현황과 치과 영역에서 시작된 연구를 소개 하고자 한다.
본 연구는 페카리와 돼지간의 내인성 리트로 바이러스의 연관성을 조사하기 위하여 실시되었으며 페카리의 리트로 바이러스의 DNA 염기서열을 알기위해 degenerate primers를 이용하였다. 두개의 리트로 바이러스의 클론이 이 연구에 의해 만들어 졌으며 DNA 염기서열을 분석하여 본 결과 기존에 알려진 쥐와 돼지의 리트로 바이러스 염기서열과 높은 상동성을 보였다. 이 페카리 리트로 바이러스는 페카리 종에 있어서 처음으로 밝혀진 내인성 리트로 바이러스인 동시에 페카리 종은 C형 리트로 바이러스 염기서열을 가지고 있지 않다는 기존의 연구결과와 상반된 것으로 그 중요성이 있다.
Pleurotus ostreatus에서는 10.2 kb와 7.2 kb의 미토콘드리아 선상 플라스미드 DNA가 존재함이 발견되었다. 이 플라스미드 DNA의 양쪽 5'말단에는 단백질이 공유 결합되어있다고 알려져 있다. 최근에 P.ostreatus의 10.2 kb 미토콘드리아 선상 플라스미드 DNA를 다른 곰팡이의 선상 플라스미드 DNA에 존재하는 open reading frame(ORF)와 비교 분석하여 Podospora anserina의 플라스미드 pAL2의 DNA polymerase 및 RNA polymerase 암호부위와 유사성이 있음이 확인되었다. 본 연구에서는 7.2 kb선상 DNA를 HindIII잘라서 얻은 2조각의 절편(4.7 kb, 2.3 kb)을 클로닝하고 염기 서열을 분석하였다. 클로닝된 7 kb 절편에는 3개의 ORF,즉 ORF1(2982 bp, 993 amino acids), ORF2(2703 bp, 900 amino acids), ORF3(771 bp, 256 amino acids)가 존재함을 확인하였다 또한, 이들의 ORF를 분석한 결과, DNA polymerase와 RNA polymerase 암호부위와 유사성 이 있음을 확인하였다.
번역개시 및 인산화의 조절에 관여하는 RNA와 단백질의 결합 및 인식기작을 연구하기 위해서[$\alpha$^{-32}$P] UMP-labeled HIV Rev-responsive element(RRE) RNA를 이용한 affinity screening에 이해서 Hela ZA-PII cDNA library로부터 이중선RNA결합단백질의 cDNA (RBFII)를 분리하였다. RBFII의 cDNA에 대한 염기서열을 결정하였으며 기존에 연구된 바 있는 RBFII(RBF 또는 TRBP로 보고되었으며 본 연구에서는 RBFII와 구분하기 위해 RBFI으로 명명)과 대부분의 경우 공통적인 ORF를 지니는 것으로 나타났다. 그러나 5’말단에서는 공통적인 ORF 가 RBFI의 경우 21개의 아미노산을 의미하는 63 nt가 Lac-Z의 N-말단에 연결된데 비해서 특이한 46개 아미노기를 의미하는 138nt가 존재함이 밝혀졌다. 5’-말단에 처음 나타나는 ATG 및 부근의 염기서열을 분석해 볼 때 양 cDNA는 5’말단이 완전하지 않은 것으로 사료된다.
Park, Gab-Man;Younghun Jung;Kim, Jae-Jin;Chung, Pyung-Rim
한국패류학회지
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제13권2호
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pp.91-96
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1997
한국산 논우렁이(CIpangopaludina chinensis malleata)와 큰논우렁이 (C. japomica)는 형태학적으로 유사하여 그 감별이 용이치 않다. 본 연구는 이 두 종을 대상으로 28S rDNA DI유전자를 7종의 제한효소로 처리하여 PCR-RDLP기법으로 그 절편을 비교하였다. 절편 상호간에는 차이점을 관찰할 수 없었으나, 두 종으로부터 분석된 28S rDNA DI 유전자의 염기서열에서는 4 부위에서 종간 차이를 보였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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