• 제목/요약/키워드: DNA: DNA hybridization

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균류 Coprinus cinereus에서 DNA 회복에 관여하는 RAD3 유사유전자의 분리와 특성 (Characterization of RAD3 Homologous Gene from Coprinus cinereus)

  • 최인순
    • 생명과학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.1023-1027
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    • 2004
  • 본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복(excision repair) 유전자로 알려진 RADS의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RADS 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RADS DNA를 probe로 하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RADS유사 유전자는 3.4kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RADS 유사 유전자의 전사체 크기는 2.8kb 였으며, 자외선의 상해시 전혀 자외선에 대한 유도성이 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RADS 유사유전자는 세포의 생존에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

미소전극어레이형 DNA칩을 이용한 유전자다형의 전기화학적 검출 (Electrochemical Detection of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Using Microelectrode Array on a DNA Chip)

  • 최용성;권영수;박대희
    • 대한전기학회논문지:전기물성ㆍ응용부문C
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    • 제53권5호
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    • pp.286-292
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    • 2004
  • In this study, an integrated microelectrode array was fabricated on glass slide using microfabrication technology. Probe DNAs consisting of mercaptohexyl moiety at their 5-end were spotted on the gold electrode using micropipette or DNA arrayer utilizing the affinity between gold and sulfur. Cyclic voltammetry in 5mM ferricyanide/ferrocyanide solution at 100 ㎷/s confirmed the immobilization of probe DNA on the gold electrodes. When several DNAs were detected electrochemically, there was a difference between target DNA and control DNA in the anodic peak current values. It was derived from specific binding of Hoechst 33258 to the double stranded DNA due to hybridization of target DNA. It suggested that this DNA chip could recognize the sequence specific genes. It suggested that multichannel electrochemical DNA microarray is useful to develop a portable device for clinical gene diagnostic System.

비수식화 바이오칩 및 유전자 검출 (Genome Detection Using an DNA Chip Array and Non-labeling DNA)

  • 최용성;이경섭
    • 한국전기전자재료학회:학술대회논문집
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    • 한국전기전자재료학회 2006년도 하계학술대회 논문집 Vol.7
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    • pp.402-403
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    • 2006
  • This research aims to develop the multiple channel electrochemical DNA chip using microfabrication technology. At first, we fabricated a high integration type DNA chip array by lithography technology. Several probe DNAs consisting of thiol group at their 5-end were immobilized on the gold electrodes. Then target DNAs were hybridized and reacted. Cyclic voltammetry showed a difference between target DNA and control DNA in the anodic peak current values. Therefore, it is able to detect a plural genes electrochemically after immobilization of a plural probe DNA and hybridization of non-labeling target DNA on the electrodes simultaneously. It suggested that this DNA chip could recognize the sequence specific genes.

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Epidermal growth factor 발현을 위한 화분립의 이용 (Utilization of pollen grains for the expression of epidermal growth factor)

  • 최병진;박희성
    • KSBB Journal
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    • 제23권5호
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    • pp.460-462
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    • 2008
  • 개화시기의 수술로부터 수집한 백합화분을 aluminum oxide 미세입자와 섞어 교반에 의해 상해를 발생시켰다. 이어서 이들 화분은 signal peptide-fused epidermal growth factor (EGF) DNA를 지니는 Agrobacterium 세포로 vacuum infiltration을 시켰으며 24 hr 화분신장을 통한 배양을 실시하였다. 이들 신장 화분에서의 EGF mRNA 및 단백질 발현은 성공적으로 확인되었으며 이는 cDNA blot hybridization 및 immuno-blotting의 분석결과이다.

Follow-Up of Exogenous DNA by Sperm-Mediated Gene Transfer Via Liposome

  • Jo Hwang-Yun;Jo Seong-Geun;Yun Hui-Jun;Park Mi-Ryeong;Im Yeo-Jeong;Park Jong-Ju;Kim Jin-Hoe
    • 한국동물번식학회:학술대회논문집
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    • 한국동물번식학회 2002년도 춘계학술발표대회 발표논문초록집
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    • pp.86-86
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    • 2002
  • To examine the feasibility of using a sperm vector system for gene transfer, we have investigated the binding and the uptaking of foreign DNA into the sperm nucleus by PCR, in situ hybridization and LSC. We have also examined the transportation of exogenous DNA into oocytes by immunofluorescene via PCR. Sperm cells were incubated with DNA/liposome complexes (1:4 ratio) in fertilization medium with BSA or without BSA. (omitted)

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PCR을 이용한 Plasmodiophora brassicae의 검출 (Detection of Plasmodiophora brassicae by Using Polymerase Chain Reaction)

  • 지희윤;김완규;조원대;지형진;최용철
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.589-593
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    • 1998
  • DNA amplification by polymerase chain reaction (PCR) was used to specifically detect Plasmodiophora brassicae, causing clubroot of crucifers. On the basis of DNA sequence informations, an oligonucleotide primer set specific for the pathogen was designed form small subunit gene (18S-like) and internal transcribed spacer (ITS) region of ribosomal DNA. Primer ITS 5/PB-C produced an amplification product of approximately 520 bp in length with DNA from P. brassicae. However, no amplification product was produced with DNAs from several soil-borne fungi, Didymella bryoniae and Rhizopus stolonifer. Using these primers, the clubroot pathogen was readily detected from infected roots of crucifers, but not from healthy roots. Southern hybridization analysis further confirmed that the amplification product was originated from P. brassicae.

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Characterization of a New Leuconostoc Species Isolated from Fresh Garlic

  • Lee, Se-Hi;Choi, Jong-Hoon;Kim, Youn-Soon;Kyung, Kyu-Hang
    • Food Science and Biotechnology
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    • 제14권3호
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    • pp.416-419
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    • 2005
  • Unknown bacterium isolated from garlic was characterized using phenotypic methods, phylogenetic analysis, DNA-DNA hybridization, and cultural methods. The strain was identified as typical leuconostoc; Gram-positive, non-sporeforming, heterofermentative, catalase-negative and spherical. Although its 16S rRNA gene sequence showed high homology to Leuconostoc argentinum DSM $8581^T$(99.8%), DNA-DNA hybridization experiments indicated it represents novel genomic species in the genus Leuconostoc. The garlic-specific leuconostoc was more resistant to antimicrobial activity of garlic compared to other common laboratory lactic acid bacteria, and was even stimulated by low concentrations (1-2%) of garlic extract supplemented in trypticase soy broth. Growth stimulation was concentration-dependent when tested with residual aqueous layer after solvent extraction of fresh whole garlic extract.

Brevibacterium lactofermentum의 dapD 유전자의 Cloning 및 E. coli에서의 발현 (Cloning and Expression of the dapD Gene from Brevibacterium lactofermentum in E. coli)

  • 김옥미;박선희;박혜경;이승언;하대중;이갑랑
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제30권5호
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    • pp.802-805
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    • 2001
  • 산업적으로 lysine 발효 산업에 이용되고 있는 B. lactofermentum으로부터 lysine 생합성에 관여하는 tetrahyrodipicolinate N-succinyl transferase를 지령하는 dapD 유전자를 E. coli의 dapD 결손변이주와의 complementation test를 통하여 cloning하였다. 재조합 plamid는 3.6 kb의 DNA 단편을 함유하고 있었으며 Southern blot hybridization을 통하여 dapD 유전자는 B. lactofermentum으로부터 유래하였으며 염색체 DNA내에 single copy로 존재함을 알 수 있었다. 또한 lysine 생성량 분석을 통하여 E. coli에서 B. lactofermentum dapD 유전자의 발현을 확인하였다.

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Aspergillus nidulans의 tRNA 유전자의 구성과 발현에 관한 연구 II. Aspergillus nidulans 총 tRNA 유전자의 cloning (Studies on the Organization and Transcription of Aspergillus nidulans tRNA Genes)

  • 이병재;강현삼
    • 미생물학회지
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    • 제21권4호
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    • pp.229-237
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    • 1983
  • Aspergillus nidulans의 tRNA 유전자의 구성과 발현기착을 연구하기 위하여 우선 Aspergillus의 총 tRNA 유전자를 cloning 하였다. Aspergillus의 핵 DNA롱 포자로 부터 분리해 내고 본질 형성에서 분리한 BamHI과 T4 DNA ligase를 사용하여 pBR322플라스미드에 재조합시켜서 cloning하였다. 15벤의 transformation을 하여 30,000개 의 transformants 얻었고, 이 중 Aspergillus DNA를 가지고 있는 colony는 5,300켜개였다. In vivo에 서 S2p로 표지 된 total tRNA를 probe로 하여 colony hybridization 실험 결과, 105개의 total tRNA유전자 clone을 얻었다. 위의 결과와 cohybridization 실험 결과를 분석해 보면, Asprgillus의 tRNA 유전자는 yeast의 그것보다는 좀 더 밀집되어 존재한다고 생각된다.

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